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Heatmap: Cluster_80 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
- - -0.33 - -1.06 0.68 -0.19 - -1.54 -1.26 1.25 2.35
0.43 -0.15 -0.32 -0.32 -0.14 -0.2 -0.38 0.08 0.2 -0.03 0.18 0.36
-0.04 -0.08 -0.12 -0.27 -0.15 -0.28 -0.04 0.23 -0.07 0.07 0.32 0.28
-0.46 -0.8 -0.58 -0.98 -0.31 -0.61 -0.2 0.39 0.12 -0.07 0.39 1.34
- - - - - 0.26 0.78 -0.27 - - - 3.05
-0.38 -0.13 0.02 0.45 0.16 -0.66 -0.2 -0.58 -0.15 0.13 0.25 0.57
0.05 -0.19 -0.13 -0.22 -0.12 -0.18 -0.06 -0.09 0.11 0.14 0.21 0.34
-0.18 0.11 0.42 - -0.37 1.32 -0.21 - -2.37 - -0.47 1.87
-0.03 -0.15 -0.17 -0.13 0.02 -0.05 -0.11 0.08 -0.02 0.14 0.16 0.2
-0.01 0.02 -0.16 -0.09 -0.09 -0.3 -0.01 0.01 0.11 0.05 0.12 0.27
0.79 -0.56 -0.34 - -0.56 -0.02 - - -1.78 -0.51 -0.44 2.44
-0.47 -0.55 -0.18 -0.36 -0.39 -0.13 0.0 -0.03 0.15 0.28 0.37 0.74
-0.1 0.03 -0.16 -0.16 -0.05 -0.0 -0.05 0.06 0.06 0.06 0.11 0.16
- -0.37 -2.4 - -1.4 0.4 -0.7 -0.47 - -0.77 1.68 2.07
-0.72 -0.03 -0.6 -1.08 0.03 0.79 -0.11 -0.45 -0.35 -0.43 0.29 1.09
-3.25 -0.74 0.06 -0.15 0.03 -1.05 -0.94 -2.64 0.13 0.73 0.93 1.33
0.12 -0.07 -0.06 -0.09 -0.02 -0.13 -0.18 -0.07 0.03 0.04 0.13 0.24
-1.3 0.1 -0.9 -3.0 -0.47 -3.19 -0.33 0.22 -0.67 0.65 0.88 1.6
-0.04 -0.19 -0.08 -0.04 0.07 -0.17 -0.06 0.14 0.13 0.12 0.03 0.05
-0.04 -0.21 0.11 0.13 -0.09 -0.43 -0.19 -0.22 -0.32 0.27 0.01 0.65
-0.63 -0.14 -0.86 -0.17 0.01 -0.9 -0.42 -0.39 0.43 0.38 0.35 1.03
-0.23 -0.28 -0.43 -0.2 -0.36 -0.73 -0.02 -0.43 -0.01 0.44 0.31 1.01
-0.14 -0.13 -0.17 -0.27 0.07 -0.01 -0.07 0.07 0.04 0.01 0.18 0.32
- - -0.83 - -1.92 -1.63 -1.5 -1.32 - -1.96 0.05 3.14
-0.51 -0.16 -0.52 0.23 -0.21 -1.57 -0.96 -0.67 -0.64 0.15 0.93 1.33
- 0.88 -0.95 -1.55 -0.22 1.43 - - -1.89 - -1.58 2.37
-2.47 - -0.32 0.12 -0.72 -0.72 -0.65 -2.2 0.03 -0.26 0.3 2.25
-1.27 -2.4 -0.18 0.41 0.43 -0.57 -0.1 -0.18 0.29 0.71 -0.32 0.76
0.07 -0.23 -0.52 -0.4 0.25 -0.13 -0.35 -0.25 -0.75 0.04 0.23 1.09
- - - - - - - 0.74 - 1.04 1.17 2.59
-0.29 -0.34 -0.27 -0.09 -0.22 -0.01 0.09 -0.02 0.1 0.23 0.38 0.23
-0.8 0.16 -0.04 0.17 0.02 -1.23 -0.2 -0.38 -0.28 -0.18 -0.08 1.31
- -0.3 -1.57 - -1.46 -2.26 - - - -0.02 - 3.22
-0.5 -0.68 -0.1 -0.03 0.05 -0.08 0.04 0.08 -0.01 0.03 0.13 0.66
0.08 0.01 -0.12 -0.17 -0.06 -0.04 -0.18 -0.02 0.09 0.08 0.03 0.25
-0.92 0.43 -2.27 0.64 -2.11 -0.5 -0.37 - -1.0 - 1.27 1.9
-0.33 -0.31 0.02 -0.1 -0.05 -0.09 -0.14 0.16 0.14 0.19 -0.02 0.38
-0.17 -0.05 0.01 -0.31 -0.07 -0.24 -0.2 -0.25 0.06 0.19 0.44 0.36
-0.74 -1.39 - -0.64 -1.93 - -1.91 - 0.32 0.08 0.13 2.69
0.7 0.06 -1.62 - 0.64 -0.23 - 0.76 -0.36 -2.23 -2.11 1.88
-0.67 -0.68 -0.42 -1.26 0.07 -0.78 -0.17 -0.33 -0.22 0.31 0.68 1.36
-0.37 -0.45 -0.08 -0.19 0.07 -0.01 -0.23 0.04 0.06 0.45 0.06 0.37
0.16 -0.09 -0.32 -0.52 -0.25 -0.39 -0.06 -0.07 0.08 0.22 0.33 0.54
-0.97 -0.7 -0.12 -0.42 0.04 -0.61 0.07 -0.37 0.08 0.3 0.5 0.99
- - -2.51 -0.89 -1.19 -0.45 0.07 0.74 -2.25 -0.07 -0.33 2.44
0.09 -0.56 -0.8 -0.19 -0.31 -0.4 -0.62 -0.15 -0.72 -0.14 -0.0 1.67
- -1.52 -2.01 - 0.89 - 0.63 -0.11 - -1.0 -0.13 2.5
-0.15 -0.63 -0.72 0.5 0.08 -2.77 -0.5 0.2 0.27 0.01 0.01 1.11
-0.29 -1.07 -0.35 0.07 -0.14 -0.47 0.31 -0.32 -0.15 0.56 0.62 0.37
-0.74 -0.96 -1.44 -0.63 -0.26 -0.49 -0.1 -0.36 0.34 0.22 0.87 1.23
-0.38 -0.12 -0.12 -0.45 0.03 0.08 0.04 -0.11 0.02 -0.01 0.23 0.53
-0.22 -0.17 -0.23 -0.27 -0.11 -0.07 0.0 -0.23 0.03 0.1 0.33 0.57
0.04 -0.08 -0.13 -0.12 -0.07 -0.03 -0.07 -0.01 0.08 0.11 0.12 0.13
-0.16 -0.06 -0.07 -0.17 -0.0 -0.03 -0.07 0.04 -0.06 0.09 0.15 0.27
0.16 -0.35 -0.95 -0.23 -0.76 -0.33 0.18 -0.85 -0.12 0.39 -0.0 1.28
- - - - -0.38 0.85 - - -0.7 -0.46 0.06 2.82
-0.65 -0.48 -0.62 -0.46 -0.07 0.02 -0.17 -0.42 0.01 0.35 0.58 0.92
-0.54 -0.34 0.07 -0.47 0.02 -0.03 -0.51 -0.01 -0.35 0.21 0.56 0.72
-0.47 -0.99 -0.26 -0.28 -0.09 -0.7 0.12 -0.48 0.13 0.62 0.47 0.8
-0.04 -0.02 0.2 -0.15 -0.1 -0.45 0.15 -0.6 -0.19 0.04 0.3 0.52
0.01 0.01 -0.12 -0.32 -0.07 -0.27 0.0 -0.08 -0.04 0.11 0.23 0.4
-2.34 0.61 -0.75 0.26 -0.23 -2.82 0.08 0.32 -1.08 -0.88 -0.11 1.69
- - -0.14 - -0.19 - -2.63 0.91 -0.46 -0.31 -1.22 2.64
-0.03 -0.08 0.04 -0.06 -0.21 -0.24 -0.28 -0.27 0.09 0.13 0.38 0.33
-0.25 -0.06 0.05 -0.08 -0.02 0.03 -0.04 -0.09 -0.01 0.06 0.28 0.06
- -0.36 - -0.61 -0.68 -0.73 - -1.4 0.26 0.12 1.08 2.19
0.23 -0.54 -0.24 -0.26 0.27 -0.49 -0.13 0.04 0.08 0.4 0.28 -0.01
-0.05 -0.05 -0.04 -0.12 -0.14 -0.12 -0.11 0.07 0.05 0.09 0.08 0.28
0.05 0.12 -0.48 -0.66 -0.15 -0.36 -0.27 0.07 0.12 -0.05 0.44 0.64
-0.32 -0.21 -0.18 -0.4 -0.04 0.06 -0.31 -0.1 0.15 0.18 0.33 0.53
- - - - 1.52 - 0.57 - -1.07 -1.26 -0.89 2.64
-0.19 -0.23 -1.04 -0.95 0.17 -0.02 -0.38 -0.18 0.43 0.05 0.31 0.91
-0.1 -0.03 -0.02 -0.11 -0.08 -0.11 0.1 -0.07 -0.06 0.13 0.05 0.25
-0.09 -0.01 -0.06 -0.2 -0.03 -0.05 -0.09 -0.06 0.05 0.05 0.06 0.35
-0.58 0.52 -0.33 - -0.0 -0.57 0.04 -1.64 -0.68 -0.85 - 2.3
0.32 0.02 -0.53 -0.98 -0.96 0.05 -0.15 -0.87 -0.85 0.04 0.37 1.42

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.