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Heatmap: Cluster_1 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.28 0.14 -0.03 -0.08 -0.12 -0.13 -0.07 0.09 0.04 -0.04 -0.04 -0.12
0.16 0.17 0.39 -0.37 -0.08 -0.73 0.12 0.41 0.22 -0.06 -0.17 -0.51
0.27 0.28 0.23 -0.19 -0.22 -0.11 -0.1 -0.05 -0.16 0.02 -0.01 -0.08
1.18 0.33 0.04 -0.24 0.01 -0.53 -0.33 -0.58 -0.02 -0.23 -0.17 -0.5
0.45 0.15 -0.11 -0.06 -0.13 -0.25 -0.25 0.05 0.01 0.05 0.01 -0.06
0.38 0.19 -0.08 -0.2 -0.27 -0.25 -0.05 0.05 0.06 0.17 0.07 -0.23
0.55 0.06 -0.2 -0.22 -0.01 -0.14 -0.26 -0.05 0.16 0.08 -0.1 -0.07
0.47 0.21 -0.16 -0.32 -0.29 -0.14 0.09 0.28 0.13 -0.12 -0.12 -0.27
-0.04 0.11 -0.06 -0.07 0.08 -0.11 -0.02 0.04 0.11 0.09 0.01 -0.17
0.03 0.1 -0.06 -0.22 -0.01 0.06 -0.06 0.09 0.01 0.16 0.07 -0.22
0.48 0.19 -0.12 -0.22 -0.1 -0.28 -0.14 0.06 0.06 0.01 -0.03 -0.07
2.16 - - - - - - 2.12 1.66 - - -
0.51 0.26 -0.06 -0.09 -0.13 -0.48 0.01 0.09 0.03 -0.04 -0.12 -0.21
0.44 0.31 -0.04 -0.22 -0.16 -0.1 -0.04 0.08 -0.02 -0.01 -0.07 -0.38
0.63 0.08 -0.03 -0.28 -0.22 -0.26 -0.03 0.11 0.15 -0.05 -0.11 -0.24
0.45 0.24 0.11 -0.39 -0.04 -0.17 0.09 0.11 0.05 -0.05 -0.35 -0.3
0.29 0.41 0.29 -0.79 -0.05 -0.64 0.09 0.44 -0.05 -0.15 -0.14 -0.25
1.79 2.01 - - - - 1.63 - - 0.52 - -
0.46 0.06 0.04 0.06 -0.01 0.04 -0.04 0.2 -0.2 -0.29 -0.28 -0.24
0.19 0.07 0.11 0.0 -0.05 0.05 -0.02 0.08 -0.06 -0.1 -0.08 -0.22
0.35 0.09 -0.08 -0.02 -0.01 -0.1 0.04 0.04 -0.02 -0.1 -0.06 -0.21
0.44 -0.1 -0.06 -0.33 -0.27 -0.18 -0.25 0.1 0.27 0.15 0.02 0.02
-0.06 -0.1 0.1 -0.21 -0.01 -0.13 0.09 0.07 0.14 0.15 0.1 -0.2
0.06 -0.09 -0.0 -0.04 0.04 -0.35 0.05 0.19 0.25 -0.08 -0.08 -0.03
0.43 0.23 0.06 -0.11 -0.02 -0.16 -0.1 0.04 -0.08 -0.17 -0.07 -0.19
0.48 0.37 0.07 -0.05 -0.16 -0.29 -0.04 0.01 0.02 -0.2 -0.35 -0.09
0.32 0.03 -0.03 -0.03 -0.04 -0.11 -0.03 0.12 0.09 -0.07 -0.13 -0.2
0.32 0.19 0.02 -0.02 -0.15 -0.1 -0.11 -0.05 -0.04 -0.05 -0.06 -0.02
0.29 0.66 0.69 -1.04 -0.76 -0.77 0.27 -0.04 0.26 0.3 -0.56 -0.68
0.54 0.28 -0.04 -0.22 -0.15 -0.13 -0.11 0.13 -0.15 -0.18 -0.11 -0.07
0.25 0.34 0.16 -0.11 -0.09 -0.12 -0.08 0.13 -0.14 -0.16 -0.15 -0.13
0.4 0.04 0.02 0.05 -0.2 -0.2 -0.25 -0.07 -0.05 -0.05 0.13 0.05
0.14 0.25 0.14 -0.29 0.02 -0.23 -0.06 0.26 -0.11 -0.23 -0.22 0.17
0.06 -0.02 0.02 -0.09 0.01 -0.14 0.15 0.1 0.02 0.07 -0.09 -0.14
0.85 0.12 -0.25 -0.36 -0.37 -0.3 -0.3 -0.27 0.44 0.18 -0.08 -0.26
0.53 0.39 0.17 0.02 -0.2 -0.29 -0.14 0.22 -0.07 -0.2 -0.45 -0.35
0.36 0.15 -0.03 -0.08 -0.02 -0.29 -0.02 0.0 0.03 -0.1 -0.05 -0.03
1.05 0.47 -0.26 -0.15 -0.19 -0.43 -0.53 0.01 0.23 -0.18 -0.41 -0.52
0.17 -0.11 -0.02 -0.01 0.05 -0.16 0.1 0.15 0.19 0.02 -0.15 -0.32
0.24 0.31 0.21 0.03 -0.09 -0.15 -0.15 -0.06 0.01 -0.06 -0.3 -0.15
0.25 0.07 0.03 -0.07 -0.0 -0.14 0.04 0.08 0.02 -0.1 -0.09 -0.13
0.23 0.05 -0.05 -0.06 -0.08 0.01 -0.04 0.09 -0.05 0.07 -0.0 -0.21
0.27 -0.14 -0.01 0.02 -0.15 -0.07 -0.09 0.17 0.13 -0.03 -0.07 -0.09
2.4 1.63 - - 0.41 - 0.24 - - 0.13 - -
0.81 0.19 -0.13 -0.14 -0.11 -0.52 -0.13 -0.06 0.2 -0.12 -0.05 -0.42
0.38 0.17 0.26 -0.08 -0.12 -0.01 -0.23 -0.07 -0.05 -0.09 -0.1 -0.21
0.33 0.17 -0.0 0.1 -0.04 -0.09 -0.05 0.1 0.01 -0.21 -0.3 -0.13
0.84 0.29 0.07 -0.14 -0.59 -0.42 0.41 -0.04 -0.08 -0.16 -0.39 -0.48
-1.66 -0.56 -0.27 0.08 -0.74 0.3 0.13 0.8 0.68 0.87 -1.6 -0.51
0.33 0.01 -0.13 -0.11 -0.13 -0.11 -0.01 0.06 0.17 -0.0 -0.13 -0.02
0.75 0.33 -0.17 -0.68 -0.24 -0.2 -0.06 0.16 0.15 0.06 -0.18 -0.47
1.49 1.71 0.65 - - - 0.72 - 1.2 -1.32 - -
-1.92 -0.98 -0.77 0.46 -1.53 1.08 0.88 0.08 1.06 -0.16 -2.83 -0.35
0.63 0.1 -0.29 -0.02 -0.12 -0.34 -0.12 0.06 0.01 0.01 -0.14 -0.03
1.64 1.89 1.65 - - - - - -1.15 - 0.66 -
1.65 1.39 -0.67 - -0.76 - 0.48 1.06 - - - 0.63
0.32 0.16 -0.05 -0.02 -0.11 -0.16 -0.03 0.05 -0.04 -0.01 -0.08 -0.09
0.27 0.01 -0.19 -0.35 0.09 0.01 0.05 -0.04 0.11 0.17 -0.01 -0.25
0.66 0.16 0.06 0.08 -0.22 -0.12 0.01 0.03 -0.07 -0.13 -0.18 -0.62
0.06 0.01 -0.01 -0.03 -0.01 -0.22 0.06 0.11 0.08 0.17 0.02 -0.31
1.14 0.02 -0.37 -0.32 -0.67 -0.41 -0.36 -0.11 0.64 0.3 -0.6 -0.58
0.28 0.3 0.16 0.1 -0.16 -0.23 -0.07 0.2 0.06 -0.3 -0.26 -0.28
0.46 0.16 -0.11 -0.21 -0.21 -0.19 -0.04 0.05 0.17 0.11 -0.09 -0.28
0.29 0.17 0.09 -0.17 -0.04 -0.02 0.03 0.01 -0.09 -0.06 -0.07 -0.21
0.09 -0.27 0.05 -0.06 0.05 -0.18 0.23 -0.05 0.26 0.14 -0.02 -0.38
0.24 0.37 0.2 -0.39 -0.12 -0.12 -0.05 0.0 -0.03 -0.06 -0.06 -0.14
0.51 0.06 -0.07 -0.26 -0.01 -0.21 0.21 0.12 0.15 -0.29 -0.1 -0.33
2.5 - - - - - - 2.22 0.72 - - -
0.81 0.31 -0.1 -0.15 -0.12 -0.12 -0.29 0.07 -0.02 -0.05 -0.29 -0.54
0.45 0.21 -0.03 -0.02 -0.05 -0.17 -0.06 -0.05 0.05 -0.07 -0.27 -0.15
0.48 0.23 -0.2 -0.21 -0.38 -0.31 0.14 0.15 0.05 -0.04 -0.02 -0.14
0.47 -0.08 -0.14 -0.05 -0.19 -0.08 0.07 -0.07 0.1 -0.01 0.04 -0.2
0.58 0.06 0.01 -0.12 -0.02 -0.33 -0.11 0.19 -0.05 -0.01 -0.13 -0.31
0.35 0.55 0.17 -0.28 0.04 -0.03 0.02 -0.06 -0.21 -0.29 -0.15 -0.41
0.36 0.18 -0.04 0.13 -0.07 -0.31 -0.07 0.13 -0.01 -0.1 -0.2 -0.13
0.36 0.12 0.04 -0.15 -0.1 -0.13 -0.13 -0.01 0.08 -0.06 -0.0 -0.1
0.55 0.12 -0.13 -0.14 -0.3 -0.25 -0.02 0.18 0.01 -0.0 -0.1 -0.13
0.98 -0.09 -0.03 -0.17 -0.14 -0.26 -0.33 -0.08 0.25 0.02 -0.36 -0.41
1.32 -1.33 0.06 - - - 0.68 0.07 0.97 0.09 0.98 -1.28
0.46 0.17 -0.12 -0.29 -0.18 -0.11 -0.06 0.03 0.28 -0.06 -0.17 -0.15
0.09 0.04 -0.01 -0.1 0.1 -0.24 0.1 0.1 0.15 -0.09 -0.03 -0.18
0.95 0.41 0.18 -0.38 -0.22 -0.32 0.01 0.36 -0.43 -0.38 -0.59 -0.5
0.23 0.05 -0.09 -0.09 -0.13 -0.09 0.03 0.13 0.15 -0.02 -0.1 -0.13
1.05 0.08 -0.2 -0.32 -0.29 -0.27 -0.11 -0.2 0.25 -0.02 -0.41 -0.28
0.41 0.73 -0.18 -0.21 -0.07 -0.22 -0.31 -0.17 0.04 -0.31 -0.22 0.09
0.32 0.22 -0.12 -0.17 -0.06 -0.09 -0.04 0.0 -0.03 -0.01 -0.03 -0.07
2.98 1.21 - - - - 0.82 - - - - -
0.43 0.25 -0.04 -0.12 -0.03 -0.19 -0.16 -0.03 0.15 -0.1 -0.11 -0.21
2.85 - - - - - - 2.26 - - - -
2.37 1.35 -1.06 - 0.05 - 0.75 0.11 - - - -
0.28 0.17 0.11 0.03 -0.1 -0.13 -0.05 0.07 -0.02 -0.18 -0.18 -0.09
2.46 2.22 - - - - 0.11 - - -0.39 - -
1.46 0.1 -0.24 -0.28 -0.24 0.1 -0.41 -0.0 0.11 -0.67 -0.69 -0.95
0.4 0.03 -0.0 -0.19 -0.1 -0.32 0.19 0.29 0.18 -0.08 -0.26 -0.38
0.94 -0.06 0.04 -0.03 -0.21 -0.19 -0.16 -0.23 0.01 0.04 -0.38 -0.27
0.05 -0.04 0.05 -0.01 -0.08 0.15 -0.07 0.13 -0.0 0.04 -0.06 -0.2
0.63 0.29 0.13 -0.33 -0.42 -0.45 -0.23 0.12 0.23 0.16 -0.26 -0.35
0.16 -0.02 -0.01 -0.24 0.05 0.02 -0.03 0.18 0.08 0.06 -0.02 -0.32
0.61 -0.01 -0.09 -0.07 -0.06 0.0 0.01 0.3 -0.08 -0.02 -0.32 -0.62
2.41 - -0.53 - - -0.17 0.57 1.14 - 0.5 - -
0.94 0.42 0.24 -0.1 -0.17 -1.0 -0.25 -0.03 0.03 -0.12 -0.53 -0.36
- 1.05 - - - - - 1.7 2.2 1.06 - -
1.23 - 0.5 1.42 -1.13 -0.85 - 1.64 -1.01 -1.21 - -0.96
2.54 1.77 - - - - - - 1.47 - - -
0.25 0.12 -0.01 -0.12 0.01 -0.23 0.08 0.06 0.1 -0.13 -0.07 -0.14
0.38 0.1 0.06 0.17 -0.05 -0.12 -0.14 0.14 0.02 -0.33 -0.11 -0.27
0.35 0.12 -0.05 -0.03 -0.1 -0.14 -0.07 0.09 0.17 -0.03 -0.17 -0.22
0.34 0.13 0.35 0.24 -0.01 -0.09 0.01 0.28 -0.31 -0.61 -0.19 -0.56
1.24 -0.99 -1.44 - -0.36 - -0.37 1.04 1.37 - 0.48 0.22
0.41 0.18 0.01 -0.24 -0.01 -0.4 -0.22 0.16 0.03 0.03 -0.06 -0.06
0.77 0.57 -0.0 0.12 -0.28 -0.46 -0.05 -0.07 -0.08 -0.07 -0.6 -0.54
0.39 0.15 -0.1 -0.12 -0.07 -0.12 -0.02 -0.0 0.09 0.04 -0.09 -0.23
1.19 -0.0 -0.39 -0.15 -0.65 -0.57 -0.55 -0.76 0.52 0.14 -0.12 0.03
0.14 -0.0 0.01 -0.19 -0.05 -0.15 -0.04 0.23 0.1 -0.06 0.01 -0.06
0.16 0.01 0.01 0.06 0.05 -0.3 -0.0 0.11 0.2 -0.06 -0.07 -0.25
2.25 1.38 0.62 -0.07 -0.9 -2.44 -1.91 -0.84 - -2.65 -1.65 -3.0
0.34 0.18 -0.04 0.03 -0.16 -0.27 0.1 -0.04 0.08 -0.02 -0.22 -0.11
0.42 0.17 -0.14 -0.14 -0.14 -0.07 0.04 0.07 0.05 -0.06 -0.1 -0.23
0.35 0.13 -0.04 -0.22 -0.09 -0.21 -0.1 -0.05 0.12 0.11 0.01 -0.1
0.23 0.02 -0.03 -0.21 -0.09 -0.06 0.07 0.1 0.13 0.06 -0.03 -0.27
0.37 -0.05 -0.04 -0.06 0.02 -0.1 0.02 0.24 0.01 -0.03 -0.16 -0.36
0.82 0.1 -0.17 -0.43 -0.59 -0.75 -0.41 -0.16 0.59 0.44 -0.0 -0.38
0.69 -0.01 -0.26 -0.42 -0.37 -0.45 -0.22 0.03 0.23 0.22 0.03 0.08
0.03 0.03 -0.09 -0.15 0.05 0.07 0.08 0.1 0.04 -0.0 -0.07 -0.12
0.28 0.21 -0.04 -0.14 -0.14 -0.25 -0.05 0.11 0.25 0.01 -0.13 -0.23
1.09 0.03 1.0 - - - - 1.51 2.0 - - -
0.34 0.35 0.29 -0.07 -0.16 -0.4 -0.0 0.02 -0.22 -0.06 -0.22 -0.09

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.