Heatmap: Cluster_126 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-1.18 -2.09 -0.51 0.62 0.53 0.57 0.66 0.82 0.01 -0.16 -0.74 -1.67
- - -3.44 - - - - 2.75 - - 2.37 -
-0.51 -0.07 0.16 0.18 0.35 0.14 0.0 0.32 -0.17 -0.23 -0.15 -0.27
- - 2.06 - - - - 2.57 - 0.93 - -
-0.41 -0.19 0.23 0.18 0.28 0.16 0.13 0.04 -0.03 -0.05 -0.18 -0.36
-0.74 -0.24 0.38 0.33 0.15 0.14 0.2 0.36 -0.05 -0.14 -0.27 -0.65
-0.47 -0.52 -0.15 -0.1 0.14 0.26 0.21 0.41 0.17 0.08 -0.07 -0.28
-0.56 -0.34 -0.31 0.02 0.18 0.16 0.21 0.48 0.08 0.15 -0.14 -0.25
-0.34 -0.22 0.17 0.2 0.11 0.05 0.1 0.34 -0.01 -0.11 -0.21 -0.24
-0.16 -0.79 -0.39 -0.01 0.1 0.29 0.12 0.35 0.19 0.14 0.12 -0.34
-0.06 -0.47 -0.34 -0.41 0.24 0.12 0.09 0.43 -0.03 0.06 0.34 -0.3
-3.97 -2.68 -0.31 -0.61 0.24 0.62 0.62 1.24 0.24 0.03 -0.02 -0.97
-0.14 -0.11 0.19 0.03 0.24 0.03 0.2 0.23 0.14 -0.15 -0.37 -0.49
-0.56 - - - -1.59 -1.08 -0.72 2.01 0.93 0.74 1.2 -
-0.53 -0.67 -0.17 -0.17 0.3 0.24 0.2 0.38 0.12 0.05 0.04 -0.18
-1.36 -0.46 0.13 -0.07 0.27 -0.08 0.09 0.4 0.25 0.25 0.09 -0.21
-0.37 -0.19 0.08 0.03 0.17 0.02 0.06 0.01 0.08 -0.08 -0.04 0.15
-0.55 -0.79 -0.04 0.03 0.1 -0.38 -0.12 0.45 0.49 0.52 0.13 -0.54
-0.42 -0.07 0.32 -0.02 0.21 0.08 0.21 0.29 -0.16 -0.17 -0.19 -0.29
-0.29 -0.28 0.04 0.12 0.25 0.13 0.18 0.33 0.01 -0.14 -0.19 -0.37
-1.03 -0.79 -0.24 -0.15 0.08 0.32 0.34 0.49 0.27 0.23 -0.02 -0.23
- - 1.4 -0.4 0.39 - -0.27 1.91 1.43 - - -
-0.61 -0.37 -0.01 -0.11 0.19 0.37 0.38 0.16 0.14 0.04 -0.16 -0.36
-1.0 -0.47 0.12 -0.05 0.35 0.04 0.14 -0.08 0.26 0.15 -0.03 0.12
-1.55 -1.21 -0.53 -0.22 0.32 0.58 0.7 0.74 0.25 0.04 -0.28 -0.72
-3.6 -0.93 -0.2 -0.13 0.35 0.65 0.42 0.82 -0.28 0.41 0.02 -1.04
- - 0.25 - - - - 2.76 - - 2.02 -
-1.01 -0.43 0.28 0.15 0.3 0.32 0.12 0.65 -0.08 -0.09 -0.4 -0.6
-1.02 -0.63 -0.28 -0.39 0.35 0.25 0.07 0.69 0.57 0.08 -0.02 -0.69
-0.27 -0.25 -0.13 -0.04 0.11 0.16 0.1 0.12 0.11 0.04 0.07 -0.11
-0.41 -0.28 0.07 0.01 0.07 -0.18 0.09 -0.12 0.1 0.22 0.24 0.05
-1.94 -1.66 -1.19 -0.37 0.41 0.83 0.78 0.89 0.13 0.03 -0.24 -0.82
-1.98 -0.45 0.15 -0.21 0.02 -0.2 0.12 0.58 0.43 0.37 0.13 -0.26
-0.43 -0.25 -0.02 0.13 0.15 -0.05 0.16 -0.08 0.1 0.17 -0.06 0.05
-0.59 -0.2 0.19 0.09 0.25 0.12 0.19 0.07 0.06 -0.11 -0.15 -0.09
-0.99 -0.73 0.24 0.03 0.6 0.28 0.32 0.78 0.33 -0.13 -1.13 -1.38
-0.7 -0.56 -0.15 -0.14 0.19 0.45 0.45 0.61 -0.03 -0.28 -0.17 -0.32
- - 2.15 - - - - 2.12 - -0.57 0.8 -0.31
-0.88 -0.64 -0.03 0.1 0.09 0.16 0.18 0.33 0.24 0.13 -0.0 -0.12
-0.21 -0.03 0.03 -0.07 0.08 0.19 0.15 0.14 0.05 -0.04 -0.2 -0.14
-0.33 -0.24 -0.16 -0.35 -0.07 -0.2 -0.02 0.41 0.25 0.22 0.21 0.04
-0.45 -0.28 -0.07 -0.07 0.11 0.02 0.08 0.41 0.11 -0.01 0.12 -0.16
-0.3 -0.45 -0.19 -0.07 0.11 0.19 0.21 0.33 0.18 -0.05 0.04 -0.2
-2.19 -0.89 -0.16 -0.21 0.47 0.56 0.76 0.75 0.24 -0.11 -0.57 -1.11
-0.24 -0.1 0.05 0.09 0.1 0.0 0.03 -0.03 0.01 0.03 -0.01 0.05
-6.55 -0.91 -0.81 -1.14 -0.49 0.22 0.13 0.81 0.9 0.73 0.54 -0.45
-0.09 -0.16 -0.11 0.03 0.2 0.11 0.2 0.2 0.08 -0.08 -0.16 -0.3
-0.01 -1.33 -0.39 -0.77 0.29 -0.06 0.04 0.98 0.18 -0.0 0.31 -0.53
- - 1.27 - - - - 2.78 - - 1.46 -
-2.67 -1.57 -0.24 -0.03 0.44 0.57 0.54 0.96 0.5 -0.1 -0.61 -1.21
-0.63 -0.37 -0.29 -0.32 0.17 0.17 0.17 0.41 0.29 0.22 0.08 -0.3
-0.43 -0.42 0.02 0.04 0.05 -0.01 0.11 0.23 0.12 0.15 0.06 -0.08
-2.01 -1.65 -0.12 -0.92 -0.2 -0.36 0.05 0.8 0.54 0.71 0.81 -0.48
-0.47 -0.05 0.15 0.06 0.18 0.07 0.23 0.15 -0.02 -0.16 -0.15 -0.13
-0.59 -0.52 -0.09 -0.09 0.15 0.28 0.31 0.23 0.25 0.11 -0.1 -0.28
-0.86 -0.71 -0.09 -0.05 0.25 0.37 0.37 0.38 0.28 0.17 -0.16 -0.7
-1.01 -0.44 0.01 0.12 0.2 0.08 0.24 0.18 0.11 0.13 -0.09 0.06
-1.49 -1.03 -0.26 -0.55 -0.35 -0.3 0.1 0.74 0.37 0.45 0.49 0.29
-0.96 -0.36 -0.01 0.07 0.1 0.05 0.05 0.31 0.15 0.17 -0.05 0.12
-0.39 -0.1 0.1 -0.31 -0.05 -0.13 0.03 0.33 0.25 0.19 -0.01 -0.09
-2.31 -1.77 -1.07 -0.31 0.22 0.77 0.8 1.0 0.27 -0.06 -0.18 -0.83
-0.34 -0.29 -0.17 0.04 0.08 -0.01 0.05 0.33 0.09 0.04 0.11 -0.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.