Heatmap: Cluster_78 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	13 h after light	15 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark
Pp1s102_41V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.73	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0
Pp1s109_124V6	0.0	0.38	1.0	0.0	0.78	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0
Pp1s113_57V6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78	0.52
Pp1s116_19V6	0.0	0.0	0.85	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.0	0.0
Pp1s120_172V6	0.0	0.0	0.34	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s128_32V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.97	0.0	0.0	0.0
Pp1s129_37V6	0.0	0.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s131_3V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.91	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0
Pp1s144_133V6	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s145_117V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0
Pp1s145_90V6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s14_225V6	0.0	0.2	0.26	0.0	0.39	0.09	0.0	1.0	0.0	0.78	0.25	0.0
Pp1s14_312V6	0.0	0.0	0.0	0.34	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s14_372V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	0.0	0.0
Pp1s156_51V6	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s156_99V6	0.0	0.0	0.14	0.0	1.0	0.17	0.0	0.24	0.69	0.42	0.27	0.32
Pp1s178_49V6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s180_136V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0
Pp1s183_110V6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s187_115V6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s18_146V6	0.0	0.4	1.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0
Pp1s191_63V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.91	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s194_41V6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s198_130V6	0.0	0.32	0.3	0.0	1.0	0.0	0.1	0.77	0.21	0.52	0.12	0.11
Pp1s1_462V6	0.0	0.0	0.42	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0
Pp1s209_131V6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.99	0.0	0.0
Pp1s20_9V6	0.0	0.44	1.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0
Pp1s219_21V6	0.0	0.0	0.49	0.0	0.92	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s21_248V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.97	0.0	0.0	0.0
Pp1s220_102V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s221_96V6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.59	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s224_40V6	0.0	0.0	0.85	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s251_61V6	0.0	0.28	1.0	0.3	0.66	0.42	0.28	0.07	0.42	0.61	0.25	0.28
Pp1s252_104V6	0.0	0.61	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	1.0	0.0	0.0
Pp1s266_47V6	0.0	0.0	0.26	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.97	0.99	0.0	0.0
Pp1s27_180V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0
Pp1s2817_1V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0
Pp1s281_100V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	0.0	0.0
Pp1s285_28V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.2	0.26	0.24
Pp1s299_15V6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0
Pp1s2_184V6	0.0	0.0	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s309_93V6	0.0	0.0	0.21	0.3	0.49	0.0	0.22	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s30_349V6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.99	0.58	0.0
Pp1s310_68V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0	0.0
Pp1s335_19V6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s336_58V6	0.0	1.0	0.93	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.22	0.0	0.0
Pp1s34_166V6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.62	0.0	0.0
Pp1s34_251V6	0.0	0.0	0.21	0.0	1.0	0.0	0.68	0.0	0.24	0.0	0.0	0.25
Pp1s34_350V6	1.0	0.48	0.0	0.0	0.98	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0
Pp1s34_440V6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s354_27V6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0	0.0
Pp1s36_235V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0
Pp1s382_39V6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s408_22V6	0.79	0.0	0.37	0.0	0.77	0.0	0.0	0.0	0.28	1.0	0.0	0.0
Pp1s41_45V6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.99	0.0	0.0
Pp1s448_18V6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s44_195V6	0.0	0.0	0.37	0.0	1.0	0.28	0.0	0.53	0.42	0.0	0.0	0.58
Pp1s452_9V6	0.0	0.33	0.22	0.0	1.0	0.0	0.23	0.15	0.24	0.41	0.0	0.13
Pp1s4617_4V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.0	0.0
Pp1s480_8V6	0.0	1.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s49_71V6	0.48	0.0	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.96	0.23	1.0	0.0	0.0
Pp1s503_8V6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	1.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0
Pp1s53_265V6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.99	0.0	0.0
Pp1s54_31V6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.41	0.0
Pp1s56_197V6	0.0	1.0	0.51	0.0	0.42	0.26	0.18	0.24	0.25	0.3	0.0	0.27
Pp1s58_45V6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.99	0.0	0.0
Pp1s59_102V6	0.0	0.0	0.66	0.0	1.0	0.0	0.0	0.28	0.16	0.39	0.0	0.0
Pp1s59_165V6	0.53	0.0	0.7	0.1	1.0	0.3	0.57	0.21	0.57	0.21	0.41	0.17
Pp1s59_234V6	0.0	1.0	0.47	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.1	0.1	0.0	0.0
Pp1s5_173V6	0.0	0.45	1.0	0.0	0.34	0.0	0.49	0.15	0.11	0.4	0.0	0.12
Pp1s5_197V6	0.0	1.0	0.22	0.27	0.26	0.0	0.0	0.0	0.43	0.65	0.34	0.0
Pp1s5_372V6	0.0	0.0	1.0	0.0	0.34	0.41	0.06	0.0	0.26	0.26	0.32	0.82
Pp1s61_281V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.23	0.61	0.0	0.63	0.6	0.25
Pp1s62_49V6	0.0	0.0	0.51	0.0	0.0	0.0	0.54	0.8	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s68_52V6	0.0	0.0	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s71_234V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0
Pp1s73_117V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.97	0.0	0.0	0.0
Pp1s74_217V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.72	0.85	0.0	0.0
Pp1s74_248V6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.0	0.0
Pp1s7_311V6	0.0	0.0	0.85	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp1s7_370V6	0.0	0.0	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	1.0
Pp1s81_39V6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.65	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s83_203V6	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s88_50V6	0.0	1.0	0.13	0.0	0.15	0.0	0.61	0.18	0.31	1.0	0.18	0.0
Pp1s93_154V6	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Pp1s95_154V6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.77	0.0	0.0
Pp1s98_115V6	0.0	0.0	0.22	0.0	0.71	0.0	1.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0
Pp1s98_117V6	0.0	0.27	0.0	0.46	0.63	0.23	1.0	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)