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Heatmap: Cluster_105 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
- - - - - - 1.49 - 2.12 1.17 - 1.38
-0.59 -0.73 -0.07 0.04 0.27 0.5 0.41 -0.11 -0.15 0.1 -0.35 0.16
-0.73 -0.35 0.03 -0.38 0.0 0.14 0.04 0.04 0.47 0.22 0.11 0.05
-0.25 -0.21 -0.03 0.01 0.08 -0.02 0.15 0.0 0.2 0.09 0.08 -0.19
-0.79 -0.56 -0.22 0.1 -0.27 -0.53 0.2 -0.24 0.19 0.4 0.37 0.62
-0.23 -0.28 0.05 -0.03 0.03 -0.04 0.03 -0.01 0.14 0.27 0.04 -0.04
0.08 -0.68 0.04 0.12 -0.13 0.06 0.06 -0.4 0.09 0.14 -0.06 0.41
-0.17 -0.06 -0.1 -0.15 -0.05 0.05 0.1 0.01 0.2 0.11 0.01 0.01
-0.63 -0.12 -0.16 -0.26 0.22 0.3 0.12 0.12 0.45 0.04 -0.14 -0.26
-0.24 -0.13 -0.13 -0.12 0.05 0.1 0.04 0.01 0.18 0.1 0.12 -0.03
-0.08 -0.12 -0.23 -0.12 -0.03 0.07 0.06 0.04 0.21 0.21 0.05 -0.14
-0.38 -0.16 0.03 -0.03 0.09 0.1 -0.02 -0.11 0.15 0.13 0.1 0.02
-0.45 -0.26 -0.38 -0.68 -0.01 0.18 0.28 0.16 0.43 0.05 0.21 0.07
-0.38 -0.17 -0.16 -0.38 0.05 0.16 0.03 0.13 0.18 0.16 0.15 0.08
-0.39 -0.17 -0.04 -0.04 0.06 0.19 0.02 -0.02 0.25 -0.03 0.01 0.05
-0.06 -0.53 -0.13 0.04 -0.04 0.22 0.06 -0.02 0.2 -0.05 0.1 0.07
-0.62 -0.13 -0.06 -0.43 -0.07 0.19 -0.02 0.06 0.4 0.13 0.18 0.09
-0.1 -0.77 -0.13 0.11 0.25 0.22 0.34 -0.08 0.15 0.1 -0.15 -0.25
-0.38 -0.1 0.06 -0.04 -0.12 0.28 0.11 0.08 0.21 -0.07 -0.04 -0.09
-0.16 -0.32 -0.2 -0.09 0.13 0.32 0.42 0.25 0.24 -0.4 0.05 -0.64
-0.35 -0.15 -0.02 -0.17 0.0 0.08 0.27 0.23 0.2 -0.08 -0.12 -0.01
-0.71 -0.83 -0.18 -0.28 0.1 -0.33 0.35 0.43 0.31 0.18 0.39 -0.08
-0.34 -0.12 -0.0 -0.04 -0.05 -0.03 0.01 0.18 0.24 0.09 0.08 -0.1
-0.29 -0.27 -0.01 -0.16 0.08 0.12 0.04 0.03 0.15 0.2 0.19 -0.21
-0.39 -0.18 -0.26 -0.05 -0.03 -0.09 0.08 0.23 0.33 0.15 0.07 -0.02
-0.5 -0.01 -0.13 -0.02 -0.07 0.32 0.1 0.25 0.32 -0.03 -0.28 -0.17
-0.99 -0.52 -0.02 -0.36 0.19 0.39 0.12 0.14 0.42 0.23 0.02 -0.21
-0.44 0.04 -0.02 0.03 0.04 0.07 0.04 0.13 0.11 0.15 -0.02 -0.23
-0.19 -0.43 -0.22 -0.26 0.14 0.12 -0.12 0.01 0.3 0.23 0.16 0.07
-1.02 - -0.17 - 0.16 0.61 0.42 0.28 1.38 0.57 -0.05 -1.42
-1.16 - - - - 0.98 0.84 0.94 1.82 0.39 -0.77 -1.18
-1.09 -0.93 -0.87 -0.01 -0.24 0.08 -0.09 0.17 0.41 0.55 0.33 0.54
-0.14 -0.36 -0.21 0.09 0.1 0.02 -0.03 -0.12 0.14 0.33 0.03 0.02
-0.46 -0.38 0.32 -0.25 0.02 -0.17 -0.13 -0.11 0.45 0.32 -0.11 0.17
-0.86 -0.06 0.03 -0.26 0.32 0.25 0.15 -0.02 0.35 0.16 0.08 -0.62
-0.27 -0.18 0.03 -0.16 -0.08 0.13 0.18 0.18 0.2 0.04 -0.15 -0.02
-0.5 -0.05 0.02 0.01 0.05 0.08 0.03 -0.03 0.19 0.08 0.08 -0.07
-0.21 -0.25 -0.1 0.01 0.07 0.11 0.02 -0.02 0.21 0.12 -0.01 -0.01
-0.36 -0.12 0.01 -0.02 0.03 -0.02 0.07 0.03 0.18 0.08 -0.08 0.14
-0.57 -0.47 -0.29 0.22 0.07 -0.07 0.15 -0.08 0.34 0.24 0.04 0.13
-0.19 -0.16 -0.01 -0.12 0.06 0.07 0.11 0.1 0.09 0.0 0.04 -0.05
-0.25 -0.15 -0.11 -0.0 -0.06 0.18 0.02 0.08 0.29 0.15 -0.03 -0.23
-0.12 -0.15 -0.07 0.07 0.08 -0.07 -0.07 -0.04 0.06 0.12 0.01 0.15
-0.14 -0.1 -0.1 -0.15 0.01 0.1 0.05 0.06 0.09 0.1 0.09 -0.03
-0.1 -0.75 -0.24 -0.51 0.05 0.3 0.21 -0.12 0.62 0.05 0.16 -0.16
-0.25 -0.29 -0.11 -0.1 0.11 -0.01 0.12 0.21 0.1 0.19 0.12 -0.19
-0.44 -0.48 0.03 -0.2 -0.0 0.38 0.18 -0.03 0.36 -0.03 0.2 -0.28
-0.22 -0.38 -0.11 -0.08 0.13 0.18 -0.01 0.07 0.16 0.06 0.08 0.03
-0.19 -0.17 -0.24 -0.14 -0.02 0.06 0.07 0.04 0.03 0.15 0.21 0.11
-0.31 -0.37 -0.03 -0.01 0.03 0.13 0.13 0.09 0.22 -0.02 0.0 0.04
-0.2 -0.17 0.01 -0.12 0.09 0.01 0.04 0.15 0.12 0.06 0.05 -0.1
-0.01 -0.37 -0.18 0.07 0.06 0.17 0.08 -0.11 0.04 -0.08 0.2 0.03
- -0.96 -0.46 - -0.96 -1.22 -2.8 - 1.28 1.58 1.33 0.8
-0.08 -0.12 -0.03 0.0 -0.05 -0.07 0.02 0.03 0.06 0.07 0.09 0.06
-0.3 -0.23 -0.17 -0.14 -0.23 0.19 0.06 0.3 0.04 0.09 0.16 0.07
-0.48 -0.16 0.03 0.02 0.09 0.08 0.16 -0.08 0.28 0.08 0.04 -0.2
-0.3 -1.17 -0.42 -0.38 0.4 0.44 0.3 0.22 0.25 0.16 0.01 -0.24
-0.25 -0.36 0.09 -0.01 0.1 -0.07 0.14 -0.05 0.23 0.17 -0.07 -0.04
-0.3 -0.04 -0.16 -0.46 -0.09 0.24 0.02 0.03 0.57 0.15 -0.09 -0.13
-1.45 0.0 0.01 -0.08 -0.19 -0.14 0.04 0.3 0.47 0.26 0.21 -0.15
-0.36 -0.21 0.04 -0.35 0.05 0.09 0.1 0.21 0.21 0.09 0.12 -0.15
-0.21 -0.24 -0.08 -0.02 0.07 0.21 0.02 0.09 0.21 0.07 -0.15 -0.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.