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Heatmap: Cluster_87 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.1 0.06 -0.08 0.0 -0.13 0.09 -0.09 -0.07 -0.03 0.11 0.02 0.01
0.11 -0.23 -0.32 -0.25 -0.41 -0.15 -0.08 0.03 0.18 0.31 0.31 0.25
0.08 0.11 0.0 -0.01 -0.03 -0.12 -0.03 -0.11 -0.01 -0.03 0.05 0.07
0.33 0.81 -0.03 0.14 -0.56 0.04 -1.0 0.06 -0.22 -0.34 -0.38 0.3
-0.02 -0.13 -0.13 -0.06 -0.13 0.03 -0.05 -0.03 0.2 0.13 0.1 0.04
0.42 0.15 0.15 0.2 -0.06 -0.06 -0.08 -0.23 -0.5 0.04 -0.1 -0.12
-0.13 0.03 -0.08 -0.06 -0.1 0.02 -0.06 0.09 0.06 -0.01 -0.04 0.25
0.49 -0.24 -0.13 0.28 -0.39 0.19 -0.4 0.06 -0.12 0.09 -0.26 0.15
-0.08 0.12 -0.13 -0.18 -0.18 0.22 -0.05 -0.04 -0.01 0.11 0.06 0.11
0.16 -0.13 0.07 -0.03 0.01 0.0 -0.07 0.05 -0.03 0.01 -0.02 -0.04
-0.15 -0.37 -0.58 -0.45 -0.21 0.08 0.31 0.32 0.14 0.2 0.23 0.12
0.06 0.15 0.09 -0.05 -0.18 0.11 -0.04 -0.06 0.03 -0.08 -0.0 -0.05
0.14 0.08 -0.06 0.03 -0.07 0.03 -0.01 -0.06 -0.06 0.02 -0.04 -0.01
1.34 0.44 -0.46 -1.5 -0.25 -1.2 -0.69 -0.74 -0.14 0.06 0.17 0.56
0.24 0.05 -0.06 0.01 -0.15 -0.11 -0.13 -0.1 -0.13 0.04 0.07 0.2
0.15 0.04 -0.02 0.09 -0.12 -0.1 0.04 -0.01 -0.13 -0.01 0.01 0.03
0.12 0.07 -0.02 0.07 -0.06 -0.0 -0.07 -0.04 -0.13 -0.05 0.07 0.01
0.16 -0.0 -0.01 0.11 0.0 0.04 -0.07 -0.0 -0.16 -0.14 0.03 0.02
0.05 -0.0 -0.11 -0.03 -0.04 0.0 -0.04 -0.04 0.02 0.01 0.13 0.05
0.0 -0.23 -0.16 0.09 -0.14 0.27 -0.1 0.13 -0.19 -0.02 0.15 0.1
0.07 -0.04 -0.15 -0.04 -0.17 0.13 -0.15 0.0 -0.03 0.1 0.1 0.13
0.13 0.01 -0.29 -0.34 -0.13 -0.17 0.07 0.01 0.01 0.11 0.22 0.24
1.13 1.6 -1.55 - 0.11 - 0.12 - 0.79 1.04 -1.06 -
1.47 0.16 -0.36 -0.46 -0.06 -1.33 -0.68 -0.78 -0.37 -0.8 -0.03 0.79
0.14 0.02 -0.04 -0.01 -0.08 0.02 -0.06 -0.07 -0.02 0.01 -0.05 0.12
0.26 0.04 -0.06 0.1 -0.07 -0.01 -0.08 -0.1 -0.11 -0.14 0.05 0.08
0.05 0.14 0.02 -0.03 -0.1 -0.0 -0.08 -0.04 -0.01 0.01 0.07 -0.05
0.06 0.04 -0.04 -0.08 -0.0 0.01 -0.11 -0.04 0.01 0.05 0.05 0.04
0.17 0.01 -0.17 -0.07 -0.1 0.01 0.04 0.02 -0.05 -0.05 0.06 0.1
1.37 0.07 -0.13 -1.03 0.34 -0.17 0.44 -3.59 0.28 -0.78 -3.65 0.56
0.14 0.05 -0.0 0.11 -0.09 -0.05 -0.11 -0.09 -0.01 -0.0 0.05 -0.01
0.12 0.12 -0.01 -0.0 -0.05 -0.06 -0.07 -0.13 0.0 -0.01 0.03 0.05
0.81 0.38 -0.18 -1.09 -0.25 -0.45 -0.53 -0.3 -0.09 0.16 0.17 0.43
0.25 0.07 0.01 0.06 -0.16 0.01 -0.12 -0.13 -0.05 -0.05 0.01 0.04
0.14 -0.06 -0.01 0.06 -0.05 0.13 -0.04 0.05 -0.07 -0.14 -0.05 0.01
-1.31 -1.1 -0.75 -0.93 -0.42 -0.21 -2.39 -0.15 1.62 0.72 0.97 -0.67
-0.05 0.02 -0.13 0.16 -0.02 0.06 -0.1 0.01 -0.06 0.01 0.04 0.03
0.16 0.02 0.02 0.07 -0.02 -0.03 -0.07 -0.03 -0.03 -0.02 -0.04 -0.04
0.14 0.12 0.03 0.09 -0.09 -0.07 -0.09 -0.05 -0.12 -0.04 0.03 0.02
-0.18 0.02 -0.06 -0.14 -0.13 0.03 -0.13 0.03 -0.01 0.11 0.14 0.27
0.04 0.07 -0.04 -0.04 -0.09 0.04 -0.06 -0.05 -0.02 0.1 0.02 0.01
0.28 0.19 -0.13 -0.06 -0.13 -0.06 -0.14 -0.16 -0.02 -0.03 0.02 0.16
0.09 0.12 -0.02 0.07 -0.11 0.04 -0.06 -0.07 -0.04 -0.02 -0.01 -0.0
0.18 0.07 0.01 0.15 -0.07 -0.06 -0.15 -0.09 -0.11 -0.05 0.01 0.06
0.14 0.05 -0.06 0.07 -0.06 -0.0 -0.06 -0.06 -0.02 -0.04 0.06 -0.03
-0.0 0.01 -0.08 -0.07 -0.04 0.01 -0.01 -0.02 0.04 0.06 0.05 0.04
0.18 0.19 0.17 0.27 -0.0 -0.03 -0.18 -0.03 -0.3 -0.15 -0.3 0.03
0.16 0.02 -0.05 0.13 -0.0 -0.01 -0.06 -0.04 -0.05 -0.09 -0.0 -0.02
0.16 0.06 -0.03 0.08 -0.09 -0.07 -0.1 -0.04 -0.11 -0.07 0.03 0.15
0.09 0.11 -0.03 0.03 -0.03 0.09 -0.1 -0.04 -0.04 -0.0 0.0 -0.08
0.01 0.06 -0.26 -0.26 -0.27 0.15 -0.03 0.29 0.07 0.08 0.04 0.01
0.19 -0.03 -0.03 0.04 -0.03 -0.02 -0.04 -0.07 -0.02 0.0 -0.03 0.02
0.11 0.07 0.0 0.13 -0.16 -0.02 -0.08 0.01 -0.14 -0.04 0.02 0.07
0.16 0.01 -0.02 0.14 -0.13 -0.06 -0.07 -0.05 -0.09 -0.05 -0.0 0.12
0.46 -0.55 -0.98 -0.41 -1.2 -0.36 0.09 0.28 0.12 0.46 0.48 0.4
0.2 0.06 0.01 0.06 -0.08 -0.05 -0.15 -0.08 -0.12 -0.06 0.02 0.15
0.33 0.06 -0.0 -0.09 -0.12 -0.1 -0.05 0.0 -0.12 -0.05 0.04 0.05
0.19 0.08 -0.03 -0.01 -0.07 -0.02 -0.13 -0.09 -0.05 -0.02 0.01 0.11
0.04 0.01 -0.09 0.07 -0.03 0.02 -0.09 0.01 -0.03 -0.03 0.06 0.04
0.14 -0.07 -0.09 -0.06 0.01 0.01 -0.02 0.03 0.08 -0.01 -0.09 0.06
0.12 0.13 -0.02 0.06 -0.03 -0.07 0.02 -0.05 -0.06 -0.04 -0.07 -0.02
0.25 0.14 -0.04 -0.3 -0.15 -0.1 -0.03 -0.08 0.02 -0.0 -0.0 0.2
1.75 1.0 -1.01 0.18 -0.66 -0.46 -2.08 -2.17 -1.49 -1.63 0.19 0.45
0.08 -0.02 -0.09 -0.09 -0.08 -0.01 -0.05 -0.03 0.01 0.11 0.14 0.0
0.18 0.02 -0.05 0.02 0.0 -0.01 -0.07 -0.03 -0.09 -0.03 -0.03 0.06
0.57 0.08 0.34 0.35 -1.26 0.21 -1.35 -0.6 -0.45 -0.34 0.31 0.62
0.19 0.06 -0.01 0.01 -0.1 -0.0 -0.06 0.04 -0.08 -0.12 -0.04 0.1
0.24 0.1 -0.03 0.1 -0.06 -0.01 -0.05 -0.14 -0.14 -0.14 -0.06 0.13
0.24 -0.04 -0.01 0.1 -0.17 0.0 -0.05 0.01 -0.03 0.03 -0.12 -0.01
0.16 -0.04 0.04 0.23 -0.07 0.05 -0.0 -0.0 -0.33 -0.11 0.01 -0.01
-0.06 0.17 0.09 0.06 -0.05 0.02 -0.04 -0.07 -0.01 -0.0 0.01 -0.15
0.17 -0.29 -0.36 -0.51 -0.32 -0.11 -0.04 0.14 0.03 0.22 0.31 0.44
0.27 0.12 -0.03 0.02 -0.11 -0.13 -0.09 -0.12 -0.02 -0.02 -0.05 0.11
0.11 0.02 -0.19 0.05 -0.16 -0.04 -0.01 -0.09 -0.01 -0.12 0.09 0.27
0.56 -0.01 -0.09 0.07 -0.3 -0.13 -0.64 -0.18 0.07 -0.19 0.04 0.42
0.21 0.07 -0.03 0.02 -0.04 -0.04 -0.09 -0.07 -0.05 -0.05 -0.02 0.07
0.08 0.11 -0.05 -0.06 -0.06 -0.03 -0.09 -0.05 0.03 0.01 0.05 0.05
0.22 0.01 0.02 -0.18 -0.13 -0.06 -0.03 0.07 0.07 -0.04 -0.01 0.03
0.02 -0.17 -0.27 -0.13 -0.15 -0.08 -0.01 0.06 -0.02 0.27 0.24 0.12
0.13 -0.15 -0.24 -0.24 -0.29 -0.14 -0.13 0.03 0.18 0.21 0.27 0.21
0.07 -0.09 -0.23 -0.1 -0.27 0.08 -0.03 0.04 -0.07 0.25 0.15 0.12
0.08 0.01 -0.06 0.08 -0.04 -0.01 -0.09 -0.08 0.02 0.0 0.03 0.04
0.11 0.2 -0.05 -0.05 -0.08 -0.03 0.0 -0.01 0.06 0.02 -0.09 -0.11
0.17 0.09 -0.02 0.03 -0.09 -0.14 -0.03 -0.04 -0.08 -0.05 0.09 0.04
0.16 0.04 -0.08 0.04 -0.05 -0.06 -0.12 -0.08 -0.0 0.01 0.06 0.04
0.15 0.18 -0.01 0.13 -0.14 -0.03 -0.08 -0.09 -0.14 -0.07 0.08 -0.02
0.19 0.02 0.03 0.1 -0.09 0.03 -0.1 -0.09 -0.1 -0.1 0.01 0.07
0.23 0.02 -0.19 -0.21 -0.22 -0.11 -0.05 0.06 -0.02 0.1 0.09 0.2
0.29 0.09 -0.23 0.48 -0.24 -0.4 -0.14 -0.04 -0.3 0.19 0.01 0.02
- 1.61 1.86 -2.13 0.05 -2.7 -0.3 - -1.04 0.01 -0.29 -0.36
-0.13 -0.11 -0.32 -0.09 -0.22 0.01 -0.02 -0.03 0.09 0.27 0.26 0.17
0.18 -0.03 -0.01 0.0 -0.06 -0.09 -0.09 -0.07 -0.09 0.02 0.09 0.12
0.19 0.02 -0.2 -0.09 -0.22 -0.15 -0.16 -0.09 -0.11 0.37 0.11 0.19
0.16 0.06 -0.04 0.06 -0.09 -0.04 -0.05 -0.08 -0.07 0.02 0.01 0.06
0.24 0.01 -0.04 0.03 -0.0 -0.03 -0.06 -0.08 -0.06 -0.01 0.01 -0.04
0.09 -0.02 -0.08 0.05 -0.08 0.03 -0.11 -0.06 0.06 0.05 0.09 -0.04
0.27 -0.04 -0.11 0.0 -0.0 -0.04 -0.08 -0.09 0.02 -0.07 -0.04 0.14
- 1.49 0.71 - - - -0.52 1.24 0.99 0.9 - -0.63
0.2 0.01 -0.02 0.01 -0.04 -0.06 -0.05 -0.05 -0.1 -0.01 0.05 0.03
0.18 0.02 -0.04 0.11 -0.02 -0.01 -0.04 -0.05 -0.09 -0.06 -0.01 -0.0
0.1 -0.01 -0.02 0.03 -0.03 -0.03 -0.09 -0.1 0.05 0.02 0.04 0.02
0.13 0.11 -0.02 0.08 -0.08 0.02 -0.15 -0.03 -0.05 -0.04 0.03 -0.02
0.19 0.03 -0.04 0.11 -0.04 -0.08 -0.07 -0.09 -0.09 -0.12 0.01 0.15
0.19 -0.07 -0.06 0.02 -0.07 -0.03 -0.0 0.02 -0.1 -0.02 0.02 0.07
0.03 0.08 0.06 0.08 -0.02 0.0 -0.06 -0.01 -0.06 -0.01 -0.04 -0.05
0.1 0.02 -0.01 0.01 -0.08 0.05 -0.06 -0.05 -0.01 0.0 0.0 0.03
0.17 -0.15 -0.19 -0.05 -0.09 0.09 -0.03 0.04 -0.08 0.03 0.1 0.12
0.18 -0.01 -0.05 0.04 -0.05 0.02 -0.09 -0.08 -0.03 -0.07 0.04 0.07
0.18 0.02 -0.04 0.03 -0.02 0.05 -0.1 -0.06 -0.09 -0.09 0.05 0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.