Heatmap: Cluster_4 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
1.0 0.54 0.55 0.49 0.53 0.57 0.42 0.46 0.47 0.44 0.5 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.51 1.0 0.0 0.16 0.25 0.0
0.99 0.69 0.89 0.71 0.82 0.99 0.77 0.74 1.0 0.96 0.92 0.96
1.0 0.54 0.66 0.79 0.75 0.65 0.66 0.78 0.57 0.53 0.67 0.53
1.0 0.4 0.43 0.37 0.44 0.51 0.46 0.47 0.54 0.46 0.45 0.38
1.0 0.11 0.07 0.0 0.04 0.05 0.37 0.62 0.19 0.29 0.2 0.04
1.0 0.41 0.55 0.6 0.48 0.22 0.35 0.42 0.31 0.34 0.26 0.35
1.0 0.58 0.56 0.49 0.5 0.64 0.86 0.75 0.74 0.62 0.39 0.39
1.0 0.65 0.88 0.85 0.76 0.91 0.56 0.53 0.73 0.61 0.67 0.43
1.0 0.66 0.09 0.39 0.36 0.12 0.28 0.0 0.09 0.14 0.79 0.1
1.0 0.68 0.68 0.63 0.79 0.79 0.76 0.66 0.87 0.87 0.84 0.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.32 0.27 1.0 0.21 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.17 0.0 1.0 0.0 0.16 0.71 0.13 0.0 0.0 0.0
1.0 0.67 0.56 0.95 0.62 0.67 0.58 0.55 0.74 0.59 0.74 0.3
0.72 0.0 1.0 0.62 0.54 0.0 0.83 0.88 0.07 0.52 0.13 0.38
1.0 0.33 0.42 0.34 0.41 0.53 0.45 0.56 0.39 0.35 0.48 0.41
0.82 0.61 0.77 0.82 0.8 0.85 0.93 1.0 0.71 0.81 0.85 0.8
1.0 0.72 0.47 0.93 0.5 0.8 0.29 0.7 0.52 0.32 0.18 0.35
1.0 0.42 0.39 0.44 0.43 0.41 0.44 0.58 0.57 0.55 0.5 0.4
0.97 0.55 0.54 0.42 0.86 0.8 0.62 0.62 0.82 1.0 0.93 0.51
1.0 0.0 0.05 0.39 0.05 0.0 0.0 0.13 0.45 0.2 0.12 0.11
1.0 0.59 0.54 0.46 0.47 0.6 0.51 0.82 0.59 0.57 0.68 0.55
1.0 0.22 0.32 0.42 0.29 0.29 0.35 0.17 0.49 0.4 0.45 0.49
1.0 0.56 0.49 0.45 0.5 0.49 0.41 0.48 0.54 0.54 0.72 0.54
1.0 0.66 0.46 0.6 0.54 0.6 0.53 0.61 0.68 0.54 0.7 0.67
1.0 0.19 0.0 0.0 0.32 0.13 0.19 0.0 0.27 0.14 0.38 0.0
0.72 0.69 0.78 0.75 0.87 0.76 0.95 1.0 0.79 0.87 0.87 0.84
1.0 0.68 0.69 0.56 0.65 0.56 0.67 0.75 0.91 0.74 0.74 0.61
0.81 0.73 0.88 0.83 0.88 0.83 1.0 0.92 0.82 0.81 0.81 0.86
1.0 0.4 0.19 0.13 0.0 0.12 0.23 0.86 0.11 0.19 0.0 0.0
1.0 0.71 0.64 0.66 0.63 0.66 0.64 0.73 0.73 0.69 0.72 0.53
1.0 0.6 0.48 0.6 0.52 0.55 0.56 0.41 0.53 0.56 0.6 0.47
1.0 0.37 0.32 0.28 0.25 0.28 0.39 0.4 0.37 0.42 0.44 0.53
0.78 0.8 0.99 0.6 0.79 0.7 1.0 0.96 0.63 0.71 0.76 0.66
1.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
0.8 0.26 1.0 0.95 0.49 0.63 0.49 0.66 0.76 0.61 0.45 0.13
1.0 0.47 0.49 0.59 0.56 0.68 0.63 0.65 0.6 0.56 0.72 0.59
1.0 0.31 0.43 0.35 0.41 0.59 0.33 0.76 0.52 0.56 0.55 0.26
1.0 0.5 0.54 0.58 0.67 0.65 0.63 0.77 0.59 0.56 0.6 0.44
1.0 0.49 0.25 0.05 0.0 0.0 0.26 0.57 0.0 0.2 0.06 0.0
1.0 0.28 0.39 0.34 0.36 0.56 0.18 0.27 0.39 0.29 0.29 0.42
0.75 0.63 0.6 0.49 0.65 0.55 0.84 0.7 0.74 0.87 1.0 0.89
0.66 0.38 0.21 0.34 0.35 0.47 0.73 1.0 0.6 0.72 0.49 0.48
1.0 0.24 0.07 0.02 0.31 0.0 0.09 0.0 0.13 0.06 0.52 0.03
1.0 0.6 0.52 0.54 0.47 0.39 0.4 0.43 0.65 0.5 0.41 0.39
0.72 0.42 0.7 0.58 0.67 1.0 0.61 0.74 0.76 0.75 0.75 0.77
1.0 0.56 0.49 0.53 0.54 0.49 0.48 0.49 0.57 0.64 0.89 0.59
0.28 0.0 0.74 0.25 0.0 0.0 0.63 0.87 0.32 1.0 0.0 0.23
0.75 0.23 0.29 0.11 0.76 1.0 0.69 0.54 0.46 0.24 0.58 0.05
1.0 0.0 0.0 0.1 0.08 0.44 0.07 0.0 0.17 0.16 0.34 0.08
0.43 0.26 0.48 0.42 0.48 1.0 0.85 0.66 0.47 0.62 0.37 0.5
1.0 0.74 0.67 0.74 0.46 0.52 0.59 0.81 0.5 0.47 0.58 0.61
1.0 0.64 0.61 0.76 0.71 0.61 0.58 0.51 0.73 0.72 0.79 0.72
1.0 0.73 0.65 0.76 0.65 0.82 0.69 0.71 0.8 0.78 0.89 0.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.67 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.58 0.45 0.49 0.5 0.43 0.42 0.42 0.44 0.42 0.55 0.48
1.0 0.0 0.22 0.54 0.2 0.06 0.25 0.13 0.09 0.02 0.2 0.02
1.0 0.77 0.59 0.71 0.68 0.73 0.59 0.55 0.66 0.72 0.81 0.58
0.88 0.71 0.86 0.65 0.75 0.67 1.0 0.97 0.72 0.8 0.84 0.67
1.0 0.08 0.05 0.0 0.13 0.07 0.06 0.09 0.12 0.0 0.0 0.13
1.0 0.47 0.41 0.49 0.45 0.51 0.43 0.51 0.41 0.41 0.57 0.44
0.75 0.76 0.91 0.82 0.91 0.89 0.94 0.97 1.0 0.96 0.94 0.92
1.0 0.14 0.26 0.39 0.42 0.14 0.36 0.68 0.47 0.18 0.51 0.05
1.0 0.75 0.83 0.5 0.46 0.7 0.72 0.97 0.32 0.5 0.66 0.75
0.89 0.72 0.86 0.84 0.97 0.88 0.93 0.95 1.0 0.87 0.94 0.91
0.61 0.11 0.23 0.0 0.45 0.09 0.0 1.0 0.28 0.57 0.0 0.0
0.38 0.51 0.84 0.79 0.9 0.68 1.0 0.85 0.63 0.61 0.54 0.4
0.33 0.41 1.0 0.69 0.55 0.54 0.83 0.7 0.51 0.56 0.56 0.3
0.79 0.82 0.89 0.86 0.95 0.88 0.99 1.0 0.96 0.92 0.97 0.94
0.69 0.44 0.77 0.53 1.0 0.98 0.81 0.58 0.72 0.74 0.37 0.57
1.0 0.31 0.33 0.28 0.32 0.31 0.35 0.16 0.36 0.3 0.28 0.31
1.0 0.59 0.52 0.72 0.58 0.72 0.58 0.59 0.72 0.69 0.76 0.59
0.56 0.97 0.86 1.0 0.75 0.88 0.8 0.94 0.84 0.77 0.79 0.92
1.0 0.75 0.71 0.56 0.39 0.64 0.36 0.43 0.46 0.32 0.32 0.3
1.0 0.64 0.47 0.61 0.61 0.53 0.4 0.46 0.41 0.54 0.57 0.31
0.81 0.16 0.35 0.51 0.25 0.21 0.25 1.0 0.29 0.33 0.26 0.19
1.0 0.57 0.51 0.6 0.57 0.5 0.54 0.5 0.5 0.44 0.46 0.46
0.8 0.71 0.76 0.73 0.71 0.68 0.75 1.0 0.79 0.84 0.79 0.77
0.76 0.42 0.43 0.35 0.53 0.6 0.63 1.0 0.5 0.58 0.53 0.66
1.0 0.41 0.5 0.38 0.53 0.66 0.64 0.93 0.59 0.61 0.45 0.38
1.0 0.72 0.67 0.73 0.78 0.74 0.74 0.81 0.7 0.71 0.81 0.73
0.62 0.66 0.49 0.46 0.91 1.0 0.52 0.68 0.61 0.64 0.43 0.43
0.89 0.39 0.28 0.69 0.47 0.3 0.71 1.0 0.27 0.36 0.22 0.95
0.81 0.39 0.37 0.29 0.21 0.05 0.3 1.0 0.42 0.63 0.81 0.26
1.0 0.42 0.51 0.49 0.51 0.58 0.55 0.48 0.52 0.57 0.63 0.36
1.0 0.42 0.4 0.55 0.37 0.42 0.25 0.25 0.31 0.11 0.45 0.22
1.0 0.16 0.09 0.05 0.17 0.0 0.01 0.0 0.08 0.06 0.09 0.28
1.0 0.82 0.75 0.72 0.75 0.82 0.67 0.63 0.54 0.6 0.76 0.57
1.0 0.0 0.12 0.0 0.39 0.0 0.26 0.63 0.0 0.41 0.19 0.0
1.0 0.38 0.45 0.41 0.49 0.61 0.41 0.47 0.5 0.55 0.56 0.57
0.9 0.19 0.75 0.76 0.99 1.0 0.86 0.91 0.49 0.77 0.48 0.31
1.0 0.55 0.49 0.47 0.57 0.63 0.53 0.47 0.48 0.52 0.61 0.62
1.0 0.76 0.62 0.45 0.56 0.95 0.8 0.57 0.65 0.74 0.73 0.44
0.68 0.77 0.81 0.81 0.78 0.58 0.88 1.0 0.81 0.9 0.89 0.6
1.0 0.56 0.57 0.6 0.56 0.46 0.44 0.48 0.49 0.5 0.6 0.66
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0
1.0 0.31 0.51 0.83 0.55 0.68 0.78 0.55 0.6 0.73 0.64 0.52
0.97 0.74 0.64 0.64 0.75 0.67 0.58 0.67 0.77 0.79 1.0 0.8
0.72 0.81 0.87 0.61 0.66 0.93 0.61 0.72 0.62 0.63 1.0 0.49
0.99 0.55 0.58 0.72 0.67 0.63 0.69 0.8 0.83 0.77 1.0 0.72
1.0 0.76 0.84 0.83 0.77 0.89 0.88 0.89 0.81 0.88 0.78 0.87
1.0 0.28 0.36 0.42 0.29 0.61 0.38 0.44 0.39 0.35 0.24 0.37
1.0 0.54 0.52 0.7 0.53 0.7 0.42 0.54 0.51 0.5 0.56 0.39
1.0 0.59 0.59 0.46 0.48 0.4 0.53 0.45 0.62 0.57 0.44 0.48
1.0 0.33 0.48 0.58 0.53 0.69 0.53 0.58 0.54 0.49 0.63 0.41
1.0 0.42 0.05 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.16 0.07
0.62 0.18 0.39 0.15 0.28 0.3 0.36 1.0 0.29 0.79 0.42 0.5
1.0 0.91 0.49 0.56 0.4 0.55 0.53 0.59 0.35 0.68 0.53 0.45
0.93 1.0 0.96 0.97 1.0 0.99 0.95 0.98 0.89 0.93 0.98 0.87
1.0 0.55 0.53 0.67 0.57 0.57 0.52 0.51 0.55 0.5 0.62 0.44
1.0 0.23 0.14 0.1 0.24 0.0 0.08 0.6 0.13 0.53 0.0 0.0
1.0 0.41 0.41 0.25 0.44 0.2 0.44 0.37 0.22 0.36 0.55 0.12
1.0 0.4 0.45 0.38 0.42 0.51 0.45 0.48 0.46 0.45 0.57 0.5
0.95 0.64 0.73 0.76 0.86 0.84 0.89 0.91 1.0 0.91 0.96 0.93
0.72 0.64 0.83 0.73 0.87 0.94 1.0 0.81 0.81 0.75 0.76 0.67
1.0 0.2 0.29 0.35 0.35 0.33 0.3 0.3 0.35 0.29 0.3 0.3
1.0 0.45 0.33 0.63 0.38 0.48 0.43 0.39 0.42 0.4 0.46 0.3
0.72 0.46 0.48 0.98 0.93 1.0 0.75 0.86 0.84 0.81 0.67 0.38
0.75 0.87 1.0 0.88 0.87 0.83 0.86 0.89 0.79 0.78 0.7 0.82
1.0 0.83 0.83 0.89 0.79 0.92 0.79 0.83 0.75 0.78 0.73 0.72
0.48 0.5 0.6 0.5 0.59 0.45 0.74 1.0 0.52 0.55 0.41 0.49
1.0 0.5 0.48 0.63 0.56 0.63 0.55 0.58 0.61 0.55 0.66 0.54
0.7 0.44 0.65 0.45 0.8 0.8 0.83 1.0 0.6 0.62 0.72 0.56
1.0 0.77 0.45 0.0 0.19 0.3 0.12 0.0 0.18 0.18 0.82 0.41
1.0 0.65 0.51 0.6 0.57 0.6 0.55 0.5 0.6 0.65 0.71 0.56
1.0 0.37 0.25 0.07 0.23 0.3 0.76 0.61 0.4 0.19 0.28 0.22
0.77 0.51 0.6 0.65 0.79 1.0 0.46 0.89 0.71 0.69 0.72 0.57
1.0 0.35 0.24 0.14 0.22 0.06 0.23 0.0 0.05 0.17 0.64 0.0
1.0 0.3 0.22 0.28 0.34 0.36 0.33 0.36 0.36 0.3 0.37 0.27
1.0 0.16 0.23 0.36 0.34 0.37 0.3 0.32 0.28 0.31 0.28 0.26
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.71 0.77 0.67 0.82 0.82 0.78 0.9 0.86 0.8 0.88 0.57
0.86 0.67 0.15 0.0 0.95 0.36 0.64 1.0 0.94 0.49 0.68 0.52
1.0 0.63 0.51 0.44 0.47 0.42 0.48 0.37 0.42 0.42 0.53 0.37
1.0 0.2 0.46 0.67 0.39 0.83 0.55 0.49 0.5 0.5 0.37 0.56
0.6 0.08 0.28 0.0 0.09 0.0 0.4 1.0 0.8 0.6 0.0 0.0
1.0 0.81 0.72 0.8 0.69 0.71 0.62 0.78 0.7 0.67 0.69 0.66
1.0 0.68 0.55 0.55 0.59 0.52 0.59 0.68 0.6 0.54 0.67 0.53
0.05 0.24 0.58 0.39 0.74 0.22 0.62 1.0 0.2 0.5 0.24 0.18
1.0 0.66 0.32 0.44 0.36 0.46 0.5 0.35 0.43 0.34 0.57 0.55
1.0 0.52 0.41 0.22 0.53 0.37 0.47 0.29 0.19 0.4 0.55 0.29
1.0 0.66 0.63 0.55 0.63 0.62 0.63 0.71 0.58 0.59 0.67 0.67
0.92 0.13 0.71 0.69 0.82 1.0 0.65 0.25 0.61 0.33 0.31 0.11
1.0 0.59 0.55 0.65 0.52 0.69 0.5 0.62 0.57 0.51 0.67 0.57
1.0 0.73 0.67 0.82 0.63 0.81 0.66 0.72 0.72 0.62 0.94 0.8
1.0 0.28 0.0 0.08 0.06 0.0 0.08 0.0 0.3 0.0 0.0 0.07
1.0 0.55 0.56 0.43 0.52 0.61 0.69 0.82 0.64 0.48 0.72 0.51
1.0 0.65 0.48 0.51 0.55 0.51 0.47 0.48 0.52 0.51 0.76 0.66
1.0 0.75 0.56 0.64 0.58 0.67 0.65 0.51 0.67 0.62 0.69 0.59
0.8 0.72 0.86 0.86 0.94 0.83 0.92 0.91 0.98 1.0 0.92 0.95
1.0 0.77 0.52 0.64 0.62 0.6 0.58 0.52 0.49 0.5 0.72 0.5
1.0 0.33 0.48 0.49 0.58 0.49 0.57 0.63 0.83 0.66 0.56 0.56
1.0 0.39 0.26 0.34 0.21 0.35 0.43 0.26 0.28 0.29 0.36 0.23
1.0 0.85 0.64 0.7 0.71 0.85 0.65 0.63 0.6 0.71 0.83 0.82
1.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.29 0.0 0.55 0.0
1.0 0.57 0.63 0.75 0.61 0.69 0.51 0.63 0.52 0.45 0.61 0.58
1.0 0.26 0.3 0.32 0.28 0.34 0.32 0.33 0.3 0.32 0.28 0.22
1.0 0.71 0.56 0.43 0.46 0.48 0.55 0.64 0.53 0.59 0.69 0.58
1.0 0.0 0.08 0.4 0.1 0.0 0.11 0.61 0.22 0.0 0.0 0.0
1.0 0.44 0.39 0.47 0.43 0.44 0.43 0.43 0.43 0.5 0.48 0.49
1.0 0.19 0.13 0.3 0.11 0.0 0.0 0.0 0.05 0.14 0.0 0.32
0.91 0.79 0.85 0.82 0.94 0.84 0.83 0.86 0.95 0.98 1.0 0.94
0.67 0.56 0.71 0.42 0.71 0.61 1.0 0.91 0.52 0.62 0.63 0.34
0.5 0.55 0.7 0.57 0.82 0.73 0.85 1.0 0.58 0.68 0.68 0.7
1.0 0.66 0.51 0.65 0.6 0.55 0.48 0.56 0.46 0.5 0.64 0.5
1.0 0.49 0.71 0.42 0.56 0.72 0.75 0.9 0.59 0.74 0.53 0.42
1.0 0.57 0.47 0.66 0.52 0.69 0.59 0.59 0.63 0.55 0.69 0.42
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.73 0.91 0.45 0.57 0.69 0.95 0.8 0.83 0.88 0.85 0.46
1.0 0.55 0.38 0.57 0.58 0.9 0.77 0.66 0.76 0.67 0.67 0.31
0.62 0.45 0.53 0.66 0.79 1.0 0.78 0.63 0.74 0.73 0.72 0.66
0.95 0.91 0.87 0.85 0.9 0.91 0.98 1.0 0.97 0.91 0.89 0.97
0.48 0.77 0.53 0.6 0.56 0.43 0.6 1.0 0.43 0.5 0.47 0.62
1.0 0.5 0.47 0.53 0.54 0.51 0.49 0.49 0.44 0.49 0.53 0.51
1.0 0.0 0.0 0.29 0.14 0.05 0.11 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.73 0.6 0.68 0.72 0.74 0.61 0.74 0.72 0.71 0.84 0.62
1.0 0.65 0.6 0.59 0.58 0.64 0.47 0.7 0.58 0.57 0.64 0.5
1.0 0.93 0.68 0.6 0.71 0.69 0.51 0.54 0.49 0.62 0.67 0.56
1.0 0.29 0.2 0.3 0.11 0.0 0.13 0.0 0.12 0.0 0.32 0.0
1.0 0.61 0.53 0.64 0.53 0.57 0.52 0.52 0.44 0.5 0.68 0.49
0.69 1.0 0.52 0.26 0.48 0.62 0.56 0.51 0.6 0.99 0.69 0.83
1.0 0.21 0.31 0.38 0.35 0.6 0.36 0.2 0.34 0.34 0.24 0.3
1.0 0.44 0.47 0.5 0.46 0.49 0.48 0.62 0.56 0.48 0.57 0.56
1.0 0.6 0.45 0.4 0.35 0.24 0.45 0.29 0.49 0.4 0.5 0.69
1.0 0.84 0.78 0.81 0.8 0.8 0.8 0.91 0.92 0.87 0.95 0.9
1.0 0.85 0.84 0.81 0.93 0.85 0.91 0.92 0.93 0.92 0.88 0.87
1.0 0.75 0.71 0.88 0.54 0.61 0.57 0.74 0.57 0.55 0.5 0.36
1.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.73 0.47 0.33 0.43 0.25 0.51 0.39 0.49 0.51 0.9 0.28
1.0 0.65 0.45 0.45 0.58 0.51 0.47 0.49 0.44 0.46 0.54 0.45
1.0 0.48 0.46 0.3 0.63 0.5 0.42 0.37 0.5 0.46 0.51 0.52
1.0 0.74 0.53 0.67 0.58 0.57 0.64 0.84 0.61 0.53 0.78 0.53
1.0 0.27 0.22 0.29 0.14 0.28 0.14 0.15 0.05 0.02 0.15 0.11
1.0 0.88 0.85 0.8 0.8 0.84 0.85 0.9 0.94 0.93 0.93 0.93
0.78 0.24 0.21 0.27 0.23 0.21 0.15 0.64 0.25 0.33 1.0 0.13
0.77 0.58 0.56 0.31 0.53 0.43 0.88 1.0 0.39 0.67 0.7 0.45
1.0 0.65 0.54 0.55 0.57 0.59 0.62 0.64 0.7 0.66 0.76 0.71
1.0 0.35 0.4 0.27 0.38 0.61 0.38 0.43 0.44 0.47 0.35 0.57
0.64 0.7 0.89 0.93 0.98 0.9 0.99 0.94 1.0 0.93 0.89 0.83
1.0 0.81 0.88 0.78 0.84 0.92 0.82 0.93 0.97 0.94 0.98 0.94
1.0 0.61 0.54 0.62 0.61 0.6 0.66 0.64 0.62 0.64 0.56 0.5
0.51 0.51 0.69 0.39 0.68 0.5 0.87 1.0 0.37 0.57 0.41 0.34
0.65 0.46 0.6 0.42 0.6 0.4 0.83 1.0 0.31 0.53 0.45 0.37
1.0 0.46 0.53 0.51 0.41 0.37 0.4 0.98 0.49 0.49 0.76 0.39
1.0 0.07 0.11 0.09 0.12 0.03 0.06 0.06 0.05 0.09 0.23 0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)