Heatmap: Cluster_60 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.59 0.95 0.72 -1.45 -0.07 0.75 -0.51 -0.69 -0.02 0.05 -0.72 -0.32
0.14 0.19 0.37 1.0 -0.07 0.01 -0.01 -0.11 -0.48 -0.67 -0.14 -1.56
0.29 -1.01 -0.04 1.33 0.23 0.49 -0.23 -0.32 -0.65 -0.49 -0.11 -1.86
0.08 -0.11 0.29 0.6 0.08 0.14 -0.35 0.01 -0.02 -0.2 -0.24 -0.69
-0.02 0.3 -0.1 0.97 -0.68 0.64 -0.07 -0.55 -0.05 -0.81 0.46 -2.6
- -0.18 -2.37 0.85 -0.51 2.05 0.51 - -0.03 -0.75 - 0.35
-0.16 -0.7 -0.0 0.17 0.02 0.37 0.17 0.02 0.1 0.06 -0.19 -0.09
0.05 -0.26 -0.17 0.3 -0.29 0.39 -0.02 0.38 0.13 -0.02 0.11 -1.19
-1.1 -2.59 -2.85 0.36 -0.43 1.55 - -0.73 -0.17 0.67 0.67 0.68
-0.18 -0.11 0.11 0.15 0.1 0.17 -0.03 -0.06 -0.03 -0.07 -0.04 -0.05
-0.7 1.99 0.44 - - 2.0 -1.86 - -1.78 -1.92 - 0.29
0.36 0.8 -0.46 -0.71 -0.15 0.89 -0.07 0.02 -0.58 -0.54 -0.57 -0.19
0.42 0.11 0.22 0.27 -0.01 0.28 -0.25 -0.1 -0.1 -0.32 -0.12 -0.79
-0.63 -0.92 0.43 0.35 -0.2 1.04 0.12 -0.39 -0.1 -0.26 0.15 -0.87
0.0 0.09 0.08 0.12 0.07 0.13 -0.14 0.04 0.0 -0.14 -0.03 -0.29
-0.28 -0.09 0.15 0.04 -0.31 0.73 0.01 -0.24 -0.13 -0.05 -0.3 0.12
-0.07 -0.09 -0.1 0.01 -0.06 0.48 -0.04 0.16 -0.22 -0.02 -0.04 -0.14
0.73 -0.39 0.2 -0.36 -0.03 0.92 -0.3 -0.35 -0.53 -0.48 -0.02 -0.34
0.1 0.08 0.13 0.01 -0.05 -0.08 -0.05 -0.05 0.08 -0.03 -0.16 -0.01
-0.32 0.66 0.36 0.37 -0.08 0.25 -0.41 -0.24 0.06 -0.46 -0.72 -0.11
0.1 -0.77 0.17 0.13 -0.18 0.48 -0.06 0.04 -0.11 -0.11 0.13 -0.11
-0.37 0.3 0.17 0.28 -0.32 0.05 -0.26 0.01 0.06 -0.29 -0.09 0.24
- - -0.81 2.18 -1.05 2.39 -2.45 - -0.04 - - -
-1.01 -1.51 0.2 0.84 -0.85 1.51 -0.88 -0.66 -0.94 -1.7 -0.07 0.89
-0.06 0.61 0.57 1.51 0.38 0.61 -0.26 -1.36 -0.78 -1.83 -2.48 -3.82
0.07 0.23 0.19 0.05 0.02 -0.01 -0.1 -0.09 -0.04 -0.06 -0.07 -0.26
- - -2.61 1.77 - 2.05 1.06 0.43 - -0.22 - -
-1.29 0.44 0.97 -0.24 -1.39 1.31 -0.11 -0.3 -0.17 -0.21 -1.76 -0.37
-2.23 0.51 0.85 -0.4 -0.38 1.42 -0.49 -0.19 -0.26 -0.19 -2.34 -0.2
-1.62 0.04 -0.13 0.17 -0.13 0.84 0.03 -0.07 -0.5 0.09 -0.03 0.24
-0.14 -0.27 0.08 0.31 0.25 0.28 -0.11 -0.1 -0.05 -0.27 -0.34 0.15
0.26 1.14 0.38 -0.1 -0.42 1.06 -2.14 0.77 -1.44 -0.35 -1.12 -
0.63 - 0.8 - - 1.58 -0.63 -2.38 -2.05 -1.05 1.02 1.09
-1.14 0.58 0.2 1.22 -0.39 0.55 -0.0 0.19 -0.18 -0.73 -1.31 -1.63
-0.52 -0.31 0.07 0.48 0.15 0.4 0.06 0.13 -0.16 -0.21 -0.2 -0.25
0.42 0.11 -0.16 -0.02 0.27 0.54 -0.21 0.21 0.34 -0.07 -0.96 -1.73
0.01 -0.12 -0.37 -0.24 -0.24 0.08 0.12 0.34 0.14 0.21 0.0 -0.09
0.04 0.32 0.21 0.23 -0.12 0.29 -0.26 -0.05 -0.08 -0.16 -0.08 -0.59
- 1.01 -0.54 1.73 -0.11 1.12 -0.34 - -0.87 0.23 - -1.4
-0.02 -0.01 0.07 0.33 0.19 0.15 -0.05 -0.09 -0.05 -0.08 -0.15 -0.43
0.17 -0.19 0.07 0.1 -0.06 0.24 -0.09 -0.08 0.2 -0.2 -0.2 -0.07
-0.62 1.34 -0.32 -0.6 -0.67 1.42 -1.89 -0.21 -1.75 -1.37 0.21 0.12
0.13 -0.43 -0.12 1.16 -0.07 0.38 -0.23 -0.01 -0.5 -0.27 -0.06 -1.25
0.23 0.49 0.56 0.77 -0.06 0.32 -0.64 -0.55 -1.04 -0.58 -0.52 -0.21
0.92 -0.08 0.06 -0.82 -0.55 0.53 -0.37 -0.09 -0.07 -0.01 -0.13 -0.22
-0.64 0.56 -0.45 0.69 -0.28 0.99 -0.81 -0.59 -0.63 -0.22 -0.5 0.37
-0.71 -0.0 -0.03 0.2 0.03 0.43 0.03 -0.06 -0.22 0.23 0.23 -0.48
0.22 -0.18 -0.08 -0.05 0.09 0.24 -0.06 0.05 0.13 0.05 -0.02 -0.55
0.1 -0.24 0.28 0.59 -0.04 0.24 -0.02 0.05 0.27 -0.05 -3.2 -0.14
- 1.24 1.02 - 0.85 1.07 0.18 -2.29 0.77 -1.64 -2.35 -2.61
0.35 -0.12 0.14 0.19 0.12 0.34 0.09 -0.08 -0.04 -0.23 -0.43 -0.66
-1.93 -0.31 0.23 0.85 0.11 0.93 0.5 0.66 -0.97 -0.85 -1.23 -1.07
-0.13 -0.09 0.2 0.39 -0.1 0.29 -0.15 0.2 -0.05 -0.27 -0.23 -0.27
- -0.15 0.61 0.77 -0.69 1.97 -2.84 -1.09 -1.34 0.32 -0.77 -1.01
-0.1 -0.06 -0.28 0.36 0.31 0.57 -0.73 -0.09 -0.19 -0.0 0.2 -0.48
- 0.65 1.56 0.91 - 2.08 - - -0.8 - -0.32 -
-0.18 -0.36 -0.33 -0.11 -0.04 0.27 -0.14 0.42 0.14 0.19 0.19 -0.31
0.01 -0.09 -0.05 0.06 -0.15 0.37 0.02 -0.26 -0.05 -0.09 0.12 0.01
-0.12 -0.12 -0.05 0.02 -0.18 0.3 -0.05 0.09 0.13 -0.04 -0.06 -0.0
- - -0.66 2.32 -0.4 0.65 0.28 -0.05 0.11 -0.36 - -
-0.4 -1.04 - 1.37 -0.59 2.43 - 0.49 -1.49 - - -1.48
0.05 0.2 0.2 0.11 -0.23 0.3 -0.02 -0.16 0.15 -0.09 -0.28 -0.4
0.11 0.6 0.42 0.25 -0.23 0.36 -0.17 -0.62 -0.41 -0.35 0.09 -0.71
0.79 0.57 0.05 1.14 -1.38 0.35 -0.64 -0.9 -0.7 -1.02 0.09 -0.91
-0.08 0.26 -0.23 0.4 -0.21 0.51 -0.22 -0.04 -0.05 -0.1 -0.12 -0.42
-0.23 -1.76 -0.16 1.44 0.05 1.62 -1.54 0.32 -0.96 -1.08 -1.1 -3.6
-0.25 -0.72 0.1 0.47 0.53 0.47 0.16 0.06 0.06 -0.14 -0.44 -1.25
-3.4 0.66 0.75 -0.12 -0.02 0.94 0.45 0.07 0.24 -0.53 -1.57 -2.35
-0.71 0.5 -0.46 1.24 -0.26 1.45 -0.17 -0.01 -1.53 -0.41 -1.63 -
0.1 -0.07 0.04 -0.03 -0.01 0.25 -0.14 0.25 -0.01 0.06 -0.31 -0.22
0.53 -0.16 -0.84 -0.19 -0.53 0.93 -1.34 0.95 -0.69 0.14 0.38 -1.81
-0.79 -0.15 -0.4 0.64 -0.21 1.13 -0.7 0.16 0.31 -0.67 -0.07 -0.74
0.03 -0.08 0.09 0.16 0.13 0.01 0.06 -0.05 -0.06 -0.16 -0.08 -0.1
-0.44 0.78 - -1.34 0.13 1.29 0.13 1.42 -0.21 -0.69 - -1.46
-0.71 - -0.23 0.61 -1.04 1.71 - 0.85 -1.1 -1.28 0.77 -0.21
-0.66 0.1 0.39 0.49 -0.11 0.56 0.06 -0.19 -0.22 -0.14 -0.07 -0.89
0.61 -0.14 0.64 0.88 0.13 0.35 -0.24 -0.06 -0.27 -0.95 -1.02 -2.92
-0.23 -0.11 0.08 0.26 -0.13 0.2 -0.07 0.15 0.03 -0.0 -0.1 -0.17
-1.18 0.23 0.33 0.55 -0.39 1.43 0.0 0.24 -0.94 -0.84 -0.5 -2.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.