1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_54 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.0 0.0 0.09 0.04 0.09 0.05 0.03 0.05 0.08 0.04 0.08 0.07
0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.12 0.06 0.11 0.06 0.05 0.0 0.2 0.05 0.21 0.0
15.12 12.71 14.72 12.85 14.89 15.04 16.85 15.1 17.51 20.0 18.35 16.05
7.25 6.39 7.94 6.76 8.08 7.66 8.5 8.84 8.58 9.04 9.52 7.42
7.89 6.62 7.41 6.8 7.77 7.65 8.03 8.06 8.59 8.57 7.62 6.99
85.76 94.31 101.73 85.92 105.64 95.9 106.03 105.58 103.68 102.22 103.56 82.15
0.27 0.61 0.41 0.54 0.45 0.5 0.53 0.65 0.38 0.34 0.61 0.25
0.56 0.54 1.01 0.51 1.18 0.43 1.49 1.05 0.72 0.79 0.99 1.17
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.94 0.6 0.76 0.1 0.46 0.09 1.72 0.63 1.03 0.57 1.27 0.48
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
13.25 10.96 12.38 12.22 13.83 11.74 13.76 15.11 14.94 12.36 13.34 9.68
0.32 0.36 0.34 0.09 0.69 0.44 0.44 0.89 1.33 1.15 0.68 0.25
0.14 0.08 0.46 0.0 0.62 0.17 0.42 0.08 0.74 0.86 0.87 0.3
6.26 5.94 7.98 7.72 8.05 6.05 7.5 7.65 7.68 6.83 7.09 5.92
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0
0.67 0.75 1.87 0.72 1.12 1.21 1.85 1.69 3.04 0.7 3.22 0.16
18.62 16.93 17.66 17.71 17.77 20.04 20.42 19.02 19.58 20.21 18.9 19.01
0.0 0.78 0.76 1.01 0.54 0.11 0.98 1.14 0.85 0.51 1.05 0.16
0.11 0.23 0.47 0.04 0.39 0.03 0.41 0.34 0.23 0.45 0.68 0.32
21.45 17.95 18.46 18.46 20.48 21.0 20.18 20.27 22.33 24.75 21.87 22.99
0.21 0.0 0.96 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.07 0.09 0.28 0.21
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.14 0.0 0.21 0.0
0.0 0.0 0.14 0.0 0.22 0.0 0.4 0.13 0.25 0.15 0.46 0.0
0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
90.34 106.1 102.23 110.85 109.0 98.05 127.05 124.04 112.12 112.12 123.46 93.15
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.72 0.47 0.99 1.49 1.7 0.28 0.83 2.12 1.21 0.34 0.6 0.74
5.66 5.45 5.68 4.73 5.43 5.56 7.24 5.72 6.63 7.37 5.89 5.44
8.81 8.96 9.3 8.94 10.38 8.0 10.16 10.84 10.81 12.21 10.97 10.12
0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.0 0.0 0.12 0.0 0.26 0.17 0.0 0.15 0.23 0.0
0.0 0.02 0.39 0.11 0.14 0.04 0.23 0.09 0.16 0.36 0.22 0.1
0.64 0.68 1.34 1.46 0.82 0.43 1.24 1.8 1.39 0.33 1.72 0.3
0.14 0.1 0.67 0.24 0.23 0.49 0.22 0.34 0.34 0.47 0.33 0.2
18.02 18.71 17.34 18.73 18.88 18.52 24.11 23.28 21.85 20.98 19.93 16.96
0.28 0.14 1.4 0.0 0.4 0.83 0.42 0.19 0.42 0.93 0.4 0.07
0.0 0.0 0.06 0.0 0.14 0.0 0.12 0.09 0.12 0.0 0.08 0.0
13.78 11.52 15.02 15.8 15.78 14.64 14.69 16.28 16.76 15.0 15.98 13.28
0.6 0.44 0.54 0.41 0.1 0.39 0.5 0.66 0.91 0.84 0.93 0.6
0.0 0.0 0.13 0.0 0.02 0.0 0.0 0.12 0.0 0.01 0.17 0.0
8.99 11.18 11.59 11.53 11.92 12.68 11.82 12.15 11.38 13.66 14.62 10.81
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02
0.71 0.83 1.55 0.23 1.53 0.29 1.04 0.09 1.87 1.97 1.82 0.35
0.0 0.3 1.02 0.3 1.42 0.91 1.52 0.92 1.36 0.85 1.18 0.2
0.0 0.0 0.13 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
3.71 3.33 3.91 3.38 3.9 4.66 4.49 5.89 5.47 4.35 4.28 3.1
0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0
0.07 0.1 0.27 0.0 0.08 0.0 0.07 0.0 0.12 0.0 0.14 0.0
9.07 7.14 7.14 8.3 8.69 9.54 10.05 9.63 9.32 10.47 9.42 9.58
0.04 0.02 0.4 0.13 0.24 0.1 0.17 0.27 0.33 0.03 0.08 0.02
0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.26 0.21 0.05
4.58 4.96 7.63 2.85 8.72 6.78 7.07 6.85 6.6 6.44 8.44 3.73
1.91 2.12 1.31 0.96 2.02 0.48 2.52 1.6 2.29 2.73 4.24 2.72
0.0 0.0 1.24 0.0 0.33 0.33 0.44 0.46 0.27 0.18 0.08 0.13
0.0 0.08 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.0 0.27 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.09 0.0
0.46 1.38 2.51 0.39 0.63 1.43 1.28 1.26 1.4 2.37 2.2 0.7
0.0 0.12 0.23 0.02 0.02 0.0 0.17 0.0 0.17 0.04 0.09 0.05
0.48 0.0 0.96 0.39 0.93 0.11 1.78 0.42 0.52 0.37 1.03 0.0
0.04 0.0 0.19 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.03 0.04 0.04 0.05
0.53 0.0 0.21 0.0 0.54 0.0 1.55 1.05 1.04 0.69 2.29 1.1
7.59 7.38 6.22 5.48 6.58 6.26 7.8 6.38 6.98 7.28 7.27 5.56
0.32 0.0 0.79 0.0 0.71 0.08 0.22 0.08 0.98 0.54 0.78 0.0
2.5 2.38 4.03 2.27 3.3 2.6 1.62 1.51 3.33 3.29 3.24 1.81
6.58 7.14 6.9 7.54 7.0 7.0 8.88 9.54 7.95 7.9 9.96 6.32
2.02 1.51 1.6 1.08 1.53 0.72 1.4 1.75 1.35 1.6 1.89 1.22
11.95 11.58 12.58 11.53 13.45 11.84 12.58 13.41 12.92 10.83 12.36 9.39
0.25 0.16 1.2 0.0 0.05 0.0 0.55 0.62 0.29 0.15 0.94 0.05
0.18 0.0 0.36 0.0 0.08 0.28 0.0 0.12 0.22 0.0 0.43 0.0
54.95 48.32 48.68 45.31 49.61 50.3 49.09 48.24 50.12 49.92 44.4 41.31
0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0
0.42 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.18 0.23 0.0
28.98 27.24 28.98 29.62 27.89 29.28 26.81 28.51 28.3 29.53 28.3 27.45
4.46 3.48 5.63 5.55 4.95 1.72 6.32 8.44 5.92 6.82 6.36 1.97
0.07 0.03 0.19 0.21 0.37 0.2 0.45 0.64 0.4 0.06 0.27 0.07
0.28 0.0 0.76 0.08 0.19 0.15 0.36 0.0 0.57 0.14 0.59 0.13
0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0
0.0 0.06 0.09 0.21 0.36 0.06 0.11 0.53 0.17 0.21 0.45 0.05
0.5 0.0 0.06 0.0 0.16 0.0 0.29 0.09 0.07 0.14 0.26 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.08 0.09 0.05 0.04 0.13 0.0
0.0 0.02 0.13 0.06 0.07 0.0 0.08 0.0 0.07 0.03 0.15 0.02
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.01 0.18 0.05 0.02 0.02 0.13 0.03 0.05 0.08 0.05
36.06 45.04 45.27 45.64 48.76 45.29 49.57 49.56 47.92 47.87 54.29 45.42
0.07 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02
4.55 4.76 6.52 5.08 5.51 5.17 4.82 5.01 5.82 6.06 6.6 4.18
0.14 0.4 0.74 0.04 0.22 0.13 0.18 0.08 0.44 0.15 0.5 0.04
0.36 0.14 0.16 0.04 0.17 0.05 0.12 0.11 0.03 0.09 0.07 0.12
8.97 8.38 9.39 7.01 9.83 8.23 8.96 10.32 9.69 9.73 8.88 8.47
0.5 0.45 1.15 0.17 1.09 0.52 0.54 1.21 0.51 0.75 1.49 0.6
0.11 0.05 0.36 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.32 0.09 0.0 0.0
0.55 0.52 0.58 0.52 0.57 0.17 0.33 0.48 0.3 0.44 0.62 0.27
6.68 7.04 7.71 6.43 5.71 5.45 7.51 8.35 6.47 6.8 7.91 6.45

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)