Heatmap: Cluster_287 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.16 -0.21 -0.02 0.03 0.01 0.01 0.08 0.18 0.13 0.15 -0.08 -0.18
-0.25 -0.74 -0.62 0.39 0.02 0.1 0.02 0.7 0.31 0.53 -0.82 -0.68
0.91 - - -0.98 -0.1 0.48 1.06 -0.67 0.44 -1.36 1.24 -1.1
-0.77 0.02 0.27 0.26 0.63 0.13 -0.07 0.32 -0.21 0.01 -0.33 -1.06
0.91 -0.02 0.17 0.29 0.13 -0.18 -0.51 -0.42 -0.35 0.12 -0.46 -0.41
-0.81 -0.77 0.29 - 0.82 -1.02 0.53 0.29 1.19 -1.39 0.66 -1.14
0.01 0.0 0.04 0.02 0.01 -0.14 0.02 0.11 0.13 -0.02 -0.07 -0.16
0.03 0.0 0.15 -0.13 0.01 -0.04 0.08 0.07 0.03 -0.01 -0.09 -0.15
-0.01 0.05 0.01 -0.08 0.01 -0.13 0.01 0.2 0.06 0.02 -0.01 -0.17
-0.31 -0.21 -0.07 0.13 0.43 -0.07 0.08 0.56 -0.27 0.36 -0.12 -1.21
-0.04 -0.05 0.21 -0.08 0.13 -0.15 0.12 0.18 -0.15 -0.06 0.06 -0.24
-0.05 -0.1 0.09 0.1 0.05 -0.05 0.09 0.11 0.05 -0.15 0.04 -0.22
-0.21 -0.23 0.03 0.13 0.12 0.01 0.01 0.08 -0.05 0.11 0.13 -0.22
0.08 -0.29 0.68 -0.71 -0.16 -1.44 0.59 0.0 0.23 0.4 0.19 -0.97
-0.17 -0.36 -0.08 -0.06 0.08 -0.36 0.26 0.15 0.04 0.37 0.27 -0.39
0.23 -0.02 -0.12 -0.08 0.01 -0.17 0.02 0.16 0.12 -0.02 -0.09 -0.1
0.1 -0.2 -0.13 -0.16 0.05 0.0 -0.03 0.21 0.24 0.21 0.02 -0.46
-0.14 -0.18 0.04 0.06 0.01 -0.01 0.11 0.13 0.09 0.06 -0.03 -0.19
0.69 -0.32 -0.09 0.15 0.08 -0.31 0.02 -0.0 -0.15 0.14 -0.31 -0.24
-0.07 -0.25 0.09 0.03 -0.06 -0.11 0.24 0.29 0.09 -0.12 -0.02 -0.22
-0.19 -0.41 -0.09 0.12 -0.01 0.12 0.1 0.34 0.11 0.0 0.06 -0.31
-0.5 -0.13 0.02 0.31 0.09 -0.05 0.35 0.37 0.09 -0.29 -0.17 -0.41
-0.23 -0.02 -0.03 0.15 0.3 0.05 0.06 0.02 0.05 -0.02 -0.01 -0.45
-1.06 -0.48 0.33 -0.47 0.63 -0.24 0.61 0.65 0.04 -0.11 -0.48 -0.59
0.22 -0.1 -0.18 -0.21 -0.14 0.09 0.17 -0.08 0.01 -0.32 -0.16 0.5
-3.06 -0.41 -0.02 0.43 0.44 0.17 0.41 0.17 0.6 -0.29 -0.47 -0.32
-0.44 -0.26 -0.09 0.24 0.11 -0.2 0.01 0.33 0.0 0.29 0.02 -0.23
-0.23 -0.17 0.18 0.22 0.19 -0.0 0.03 0.1 0.11 -0.05 -0.17 -0.33
-0.04 -0.06 0.16 -0.13 0.08 -0.24 0.14 0.26 -0.02 -0.0 0.04 -0.29
-1.15 -0.89 -0.12 0.53 -0.23 -0.53 -0.1 0.8 0.47 0.5 -0.05 -0.58
-0.41 -0.33 -0.15 0.0 -0.0 0.19 0.17 0.41 0.05 -0.09 0.01 -0.03
-0.37 0.06 -0.0 0.08 0.12 -0.13 0.06 0.17 0.2 -0.05 -0.03 -0.2
0.09 -0.03 -0.02 -0.11 -0.05 -0.03 -0.04 0.15 -0.04 0.01 0.03 0.03
0.16 -0.01 -0.14 -0.18 0.04 0.0 -0.06 0.14 0.08 0.03 0.03 -0.15
-0.41 -0.24 0.34 0.25 0.12 -0.13 0.18 0.21 0.09 -0.09 -0.08 -0.48
0.09 -0.06 -0.11 -0.13 0.14 -0.11 0.09 0.04 0.14 0.23 0.01 -0.45
-0.17 -0.15 -0.0 0.22 0.02 -0.0 -0.15 0.08 0.08 0.19 -0.01 -0.17
0.47 0.01 0.66 0.16 0.09 -0.42 -0.09 -0.11 0.08 -0.05 -0.19 -1.59
-0.32 -0.15 -0.01 0.11 0.06 -0.03 0.11 0.11 0.11 0.09 -0.04 -0.09
-0.14 0.01 -0.03 -0.15 0.1 -0.01 0.01 0.08 0.11 0.06 0.1 -0.16
0.24 -0.03 0.13 0.14 -0.0 -0.05 0.02 -0.19 -0.12 -0.2 0.06 -0.06
-0.22 -0.22 0.26 0.23 0.22 -0.05 0.09 0.02 0.07 -0.24 -0.07 -0.23
0.14 0.06 -0.11 -0.11 -0.04 -0.29 0.04 0.13 0.17 -0.04 0.05 -0.07
-0.5 -1.36 1.13 -0.35 0.84 0.0 0.74 0.22 0.01 -0.53 -0.72 -
-0.26 -0.2 0.14 0.16 0.33 -0.05 0.13 0.11 -0.0 -0.05 -0.23 -0.22
1.2 0.64 1.05 0.77 -0.43 - -0.68 -0.0 - -0.74 -2.65 0.33
0.0 -0.2 -0.13 -0.11 -0.01 -0.37 0.24 0.34 -0.1 0.17 0.17 -0.16
0.1 -0.65 -0.13 -0.53 0.28 -0.15 -0.02 0.33 0.02 0.33 0.3 -0.31
0.43 -1.8 -0.16 0.17 0.21 -0.39 0.59 0.56 -0.25 0.17 0.09 -1.26
-3.44 -0.71 0.12 0.1 1.03 0.06 0.26 0.54 0.19 0.33 -0.85 -1.16
- -0.21 0.22 0.76 -0.31 0.58 -0.29 1.37 0.25 -0.12 -1.11 -
-0.29 -0.26 0.17 0.08 0.29 -0.01 0.16 0.12 0.04 0.04 -0.07 -0.44
-0.16 -0.49 0.24 0.01 0.08 0.19 -0.08 0.2 0.05 0.35 -0.29 -0.33
-0.28 -0.26 -0.03 0.05 0.07 0.01 -0.03 0.19 0.15 0.11 -0.06 0.0
-0.99 -0.41 0.03 0.48 0.12 -0.08 0.46 0.54 0.29 -0.37 -0.29 -0.62
-0.03 -0.04 0.08 -0.05 0.29 -0.12 0.05 0.16 -0.11 0.06 -0.09 -0.28
-0.03 -0.11 -0.04 -0.11 0.13 -0.08 0.32 0.24 0.22 -0.0 -0.14 -0.59
0.01 0.02 0.3 -0.11 -0.04 -0.11 -0.06 0.03 0.18 -0.01 -0.09 -0.18
-0.22 -0.0 -0.04 -0.29 0.34 -0.0 -0.16 0.18 0.11 0.37 0.29 -1.11
-0.41 -0.01 0.09 0.14 0.24 -0.22 0.08 0.16 -0.05 0.01 0.03 -0.19
-0.54 -0.12 0.12 0.2 0.18 0.1 0.05 0.02 0.07 -0.03 -0.21 0.02
0.47 0.25 -0.27 0.32 0.38 0.1 -0.44 -1.11 -0.25 0.02 -1.08 0.53
-1.12 -0.22 0.13 0.14 0.42 -0.25 0.29 0.5 0.45 -0.43 -0.23 -0.49
-0.45 -0.43 0.11 -0.26 0.21 0.03 0.03 0.47 0.3 0.12 -0.02 -0.48
1.39 0.12 1.15 0.04 -0.34 -0.14 -0.4 - -1.3 - 1.12 -
-0.02 -0.3 -0.03 0.13 0.13 -0.19 0.17 0.24 0.37 0.2 -0.19 -0.88

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.