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Heatmap: Cluster_163 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.11 -0.08 -0.15 -0.06 0.03 -0.02 0.03 0.17 -0.06 -0.03 0.13 0.12
-0.16 -0.54 -0.32 -0.48 -0.07 0.02 -0.09 -0.1 0.13 0.41 0.1 0.65
-1.36 -0.89 -0.09 -0.98 -0.02 0.04 -0.11 0.44 0.31 0.02 0.62 0.63
-0.62 -0.36 -0.01 0.22 0.2 0.02 0.12 -0.13 0.17 0.01 -0.03 0.19
-0.13 -0.19 -0.13 -0.16 -0.05 0.08 0.06 0.07 0.07 0.12 0.08 0.12
-0.51 -0.32 -0.36 -0.37 -0.01 0.19 -0.09 0.02 0.16 0.2 0.26 0.49
-0.5 0.03 -0.07 0.16 0.03 -0.01 -0.28 0.18 0.13 0.06 0.12 0.02
-0.08 -0.06 -0.11 -0.16 -0.09 0.02 0.05 0.19 0.07 0.01 -0.01 0.12
-0.26 -0.38 -0.18 -0.27 -0.05 0.01 0.08 -0.03 0.23 0.18 0.23 0.26
-0.2 -0.39 -0.21 -0.31 -0.08 -0.06 0.1 0.22 0.25 0.09 0.11 0.3
-0.33 -0.21 -0.21 -0.16 0.07 0.0 0.18 -0.01 0.17 0.12 0.07 0.19
-0.12 -0.08 -0.09 -0.17 -0.0 0.02 0.08 -0.04 0.16 0.01 0.11 0.09
-0.37 -0.42 -0.53 -0.19 0.23 -0.44 -0.24 0.45 0.24 0.27 0.14 0.38
-0.18 0.01 -0.02 -0.19 0.07 -0.08 -0.01 0.15 0.04 -0.01 0.09 0.09
-0.45 -0.51 -0.34 -0.4 0.11 0.19 0.21 0.24 0.3 0.04 0.09 0.18
-0.12 -0.12 -0.21 -0.01 0.03 -0.07 -0.04 0.08 0.08 0.14 0.1 0.09
-0.07 -0.13 -0.17 -0.28 -0.13 -0.07 0.04 -0.06 0.09 0.13 0.15 0.38
0.03 -0.15 -0.12 -0.12 0.07 0.01 0.04 0.17 0.07 -0.12 0.02 0.07
-0.56 0.02 -0.29 -1.41 0.06 0.06 0.14 0.02 0.36 -0.04 0.36 0.45
-0.84 -0.48 -0.05 -0.4 -0.08 0.41 -0.12 -0.05 0.12 0.14 0.5 0.3
0.0 -0.23 -0.08 -0.03 0.01 0.0 0.02 0.17 0.06 -0.01 0.0 0.05
-0.13 -0.19 -0.14 -0.22 -0.04 0.13 0.07 0.11 0.28 0.08 -0.01 -0.02
-0.68 -0.32 -0.32 -0.29 0.02 0.1 -0.1 0.02 0.16 0.07 0.4 0.52
-0.38 -0.24 -0.15 -0.17 0.05 0.0 0.01 0.24 0.11 0.01 0.13 0.24
-0.09 -0.34 -0.36 -0.59 -0.48 -0.0 -0.05 0.23 0.11 0.31 0.18 0.6
-0.28 -0.57 -0.26 -0.21 -0.03 -0.03 -0.05 0.01 0.25 0.31 0.37 0.21
-0.18 -0.18 -0.18 -0.2 -0.03 0.08 0.12 0.07 0.08 0.09 0.1 0.15
-0.71 -0.65 -0.09 -0.32 -0.1 -0.06 0.26 0.35 0.23 0.31 0.2 0.12
-0.9 -0.19 -0.5 -0.65 -0.13 0.09 -0.07 0.35 0.16 0.41 0.15 0.56
-0.12 -0.09 -0.17 -0.18 -0.01 -0.09 -0.07 0.11 0.08 0.13 0.14 0.21
-0.04 -0.1 -0.11 -0.24 -0.02 0.12 0.05 -0.01 0.1 0.16 0.06 -0.01
-0.1 -0.41 -0.12 0.02 0.03 -0.04 0.12 0.29 0.12 -0.0 -0.07 0.06
-0.29 -0.13 -0.2 -0.24 0.05 0.12 0.06 0.2 0.03 0.1 0.07 0.14
-0.82 -0.7 -0.4 -0.33 -0.06 0.01 -0.03 -0.18 0.06 0.27 0.38 0.91
-0.54 -0.38 -0.06 -0.26 0.14 0.15 0.02 -0.23 0.09 0.24 0.27 0.29
-0.18 -0.14 -0.15 -0.18 -0.05 0.1 0.02 -0.04 0.19 0.09 0.2 0.06
-0.17 -0.31 -0.16 -0.14 -0.05 0.11 -0.0 0.14 -0.02 0.18 0.15 0.17
-0.36 -0.26 -0.31 0.07 0.12 -0.03 -0.18 0.21 0.11 0.11 0.19 0.18
-0.15 -0.23 -0.17 -0.15 -0.04 0.13 0.07 0.13 0.06 0.06 0.07 0.16
-0.5 -0.11 -0.18 -0.24 -0.01 0.09 0.09 0.08 0.35 0.19 0.03 0.04
-0.55 -0.32 -0.2 -0.08 0.07 0.07 0.1 -0.04 0.22 0.13 0.08 0.32
-0.33 -0.12 -0.16 -0.18 0.04 0.21 0.04 0.0 0.06 0.01 0.14 0.18
-0.62 -0.45 -0.23 -0.12 0.43 0.08 0.29 0.17 0.23 0.2 -0.04 -0.3
-0.04 -0.28 -0.19 -0.42 -0.0 -0.04 -0.33 0.53 0.18 -0.08 0.07 0.32
-0.25 -0.37 -0.18 -0.11 -0.1 -0.07 -0.03 0.1 0.15 0.16 0.3 0.24
-0.46 -0.35 -0.29 -0.23 0.14 0.08 0.1 0.16 0.19 0.02 0.14 0.28
-0.29 -0.1 -0.04 -0.17 0.07 -0.06 -0.03 0.03 0.04 0.06 0.15 0.27
-0.54 0.2 -0.05 -1.09 0.24 -0.11 0.05 0.0 0.3 0.19 0.07 0.21
-0.24 -0.22 -0.13 -0.09 -0.04 0.03 0.01 0.06 0.16 0.08 0.11 0.2
-0.29 -0.15 -0.13 -0.07 -0.01 0.11 0.09 0.04 0.12 0.04 0.02 0.17
-0.28 -0.29 -0.04 -0.12 0.08 0.03 -0.04 0.03 0.19 0.22 -0.08 0.17
-0.24 -0.24 -0.06 -0.08 0.01 0.12 0.04 0.03 0.12 0.04 0.06 0.14
-0.54 -0.63 -0.03 -0.35 0.06 0.15 0.17 0.35 0.22 0.05 0.11 0.1
-0.22 -0.36 -0.19 -0.2 -0.04 -0.02 -0.15 0.34 0.24 -0.0 0.18 0.22
-0.88 -0.52 -0.24 -0.59 0.03 -0.12 -0.1 -0.07 0.19 0.29 0.53 0.69
-0.48 -0.76 -0.23 -0.44 0.18 0.55 0.03 0.24 0.03 0.19 0.12 0.06
-0.24 0.11 -0.09 -0.3 -0.07 -0.13 0.12 0.08 -0.04 0.18 0.12 0.16
-0.18 -0.39 -0.09 -0.51 -0.13 0.14 0.1 0.41 -0.18 0.13 0.09 0.34
-0.23 -0.24 -0.14 -0.1 0.02 0.06 0.12 0.12 0.13 0.06 0.03 0.11
-0.21 -0.24 -0.18 -0.19 0.05 0.18 0.16 0.05 0.05 0.09 0.06 0.11
-0.12 -0.09 -0.12 -0.07 0.07 -0.02 -0.01 0.2 0.09 -0.03 -0.02 0.09
-0.28 -0.33 -0.18 -0.05 0.19 0.03 0.05 0.22 0.17 0.02 0.11 -0.06
-0.31 -0.58 -0.32 -0.28 -0.05 0.03 0.07 0.22 0.45 0.3 0.18 -0.06
-1.17 -0.26 -0.5 -0.39 -0.07 0.24 -0.08 0.04 0.37 0.33 -0.02 0.69
-0.6 -0.25 -0.59 -0.4 0.03 0.06 0.2 0.19 0.36 0.27 0.16 0.17
-0.24 -0.17 -0.15 -0.08 -0.01 0.01 0.1 0.01 0.17 0.12 0.08 0.1
-0.16 -0.32 -0.01 0.0 0.0 0.02 -0.1 -0.01 0.2 0.15 0.1 0.05
-0.46 -0.18 -0.16 -0.22 0.11 0.2 0.01 -0.03 0.1 0.15 0.13 0.21
-0.26 -0.35 -0.16 -0.17 -0.06 0.13 -0.02 0.05 0.23 0.15 0.13 0.18
-0.58 -0.29 -0.08 0.13 0.12 -0.01 0.01 -0.02 0.18 0.21 0.1 0.06
-0.13 -0.39 -0.35 -0.25 -0.17 0.17 0.04 0.09 0.25 0.2 0.24 0.1
-0.31 -0.17 -0.21 -0.16 -0.09 0.08 -0.06 0.07 0.17 0.12 0.17 0.27
-0.13 -0.32 -0.44 -0.2 -0.08 -0.03 -0.02 -0.03 0.15 0.23 0.31 0.34
-0.22 -0.36 -0.49 -0.35 0.06 -0.11 -0.27 0.55 0.02 0.14 0.26 0.35
-0.37 -0.32 -0.2 -0.1 0.15 0.09 -0.03 -0.01 0.12 0.1 0.2 0.22
-0.13 -0.25 -0.15 -0.15 0.04 -0.0 0.08 0.05 0.2 0.05 0.08 0.12
-0.2 -0.36 -0.42 -0.43 -0.13 0.25 0.03 0.0 0.17 0.2 0.17 0.42
-0.33 -0.3 -0.1 -0.15 0.11 0.09 0.06 0.04 0.13 0.12 0.03 0.2
-0.2 -0.1 -0.13 -0.18 0.01 -0.02 0.01 0.21 0.13 0.08 0.02 0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.