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Heatmap: Cluster_76 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.22 -0.07 -0.18 -0.36 -0.22 -0.07 0.17 0.33 0.4 0.11 -0.11 0.0
-0.35 -0.41 -0.46 -0.84 0.03 0.28 0.03 0.47 0.52 0.3 -0.03 -0.18
-1.09 -0.32 -0.4 0.11 -0.05 0.18 0.65 0.66 0.57 -0.1 -0.7 -0.71
-0.16 -0.3 -0.2 -0.22 0.04 0.26 0.12 0.41 0.26 -0.08 -0.07 -0.26
-0.0 -0.08 -0.15 -0.14 -0.08 -0.05 -0.02 0.15 0.14 0.04 0.03 0.12
-0.06 -0.28 -0.29 -0.32 -0.14 -0.01 0.14 0.28 0.34 0.22 0.03 -0.11
-0.13 -0.35 -0.26 -0.08 -0.05 0.2 0.29 0.35 0.34 -0.06 -0.12 -0.41
-0.34 -0.52 -0.36 -0.34 -0.1 0.17 0.41 0.37 0.27 0.1 0.07 -0.09
-0.7 -0.89 -0.72 -0.52 -0.05 0.5 0.61 0.52 0.3 0.1 -0.0 -0.15
-0.06 -0.37 -0.22 -0.04 0.17 0.25 0.23 0.28 0.01 0.02 -0.19 -0.26
-0.11 -0.26 -0.05 -0.12 -0.04 0.28 0.04 0.28 0.09 0.05 -0.03 -0.23
-0.32 -0.36 -0.21 -0.16 -0.13 0.21 0.08 0.11 0.27 0.17 0.15 0.02
-0.07 -0.23 -0.23 -0.36 -0.13 0.02 0.15 0.21 0.3 0.19 0.1 -0.12
-2.7 -2.96 -2.51 -1.19 -0.17 0.51 1.12 1.09 0.88 0.37 -0.17 -1.09
-0.9 -0.93 -0.59 -0.45 0.01 0.47 0.63 0.69 0.49 -0.17 -0.17 -0.32
-0.21 -0.15 0.04 -0.09 -0.04 0.08 0.1 0.21 0.19 0.03 0.0 -0.24
0.01 -0.08 -0.2 -0.15 -0.09 0.04 0.06 0.19 0.19 0.12 -0.04 -0.11
-0.27 -0.36 -0.4 -0.21 0.05 0.16 0.34 0.33 0.18 -0.05 0.02 -0.04
-0.2 -0.46 -0.48 -0.25 0.08 -0.03 0.23 0.26 0.24 0.28 0.07 -0.02
-0.35 -0.25 -0.21 -0.11 -0.09 0.04 0.19 0.29 0.25 0.07 0.13 -0.12
-0.23 -0.19 -0.04 -0.0 0.0 0.06 0.11 0.27 0.17 0.01 -0.07 -0.19
-0.35 -0.23 -0.46 -0.48 -0.13 0.05 0.35 0.4 0.39 0.24 -0.01 -0.16
-0.04 -0.09 -0.12 -0.17 0.01 0.01 -0.06 0.13 0.17 0.08 -0.03 0.06
-0.26 -0.4 -0.02 -0.02 0.02 0.19 0.32 0.43 0.08 -0.0 -0.11 -0.52
-0.33 -0.55 -0.47 -0.29 -0.01 0.12 0.34 0.48 0.26 0.06 0.04 -0.05
-0.17 -0.17 -0.05 -0.15 -0.06 0.07 0.11 0.17 0.14 0.07 0.06 -0.07
-0.29 -0.14 -0.07 -0.1 -0.03 -0.04 0.1 0.17 0.16 0.04 0.1 0.05
-0.38 -0.16 -0.05 -0.18 0.16 -0.04 0.03 0.12 0.17 0.11 0.16 -0.05
-0.43 -0.62 -0.49 -0.41 0.02 0.39 0.52 0.59 0.23 -0.02 -0.19 -0.26
-0.1 -0.22 -0.11 0.1 0.09 0.09 0.08 0.1 0.13 0.05 -0.02 -0.25
-0.25 -0.12 -0.04 -0.16 -0.01 -0.01 -0.07 0.14 0.12 0.08 0.07 0.17
-0.04 -0.15 -0.17 0.01 0.1 0.0 0.06 0.17 0.09 0.01 0.05 -0.17
-0.18 -0.01 -0.16 0.0 -0.17 0.12 0.21 0.26 0.08 -0.04 0.02 -0.23
-0.5 -0.4 -0.34 -0.11 -0.05 0.16 0.4 0.37 0.32 0.07 -0.03 -0.23
-0.07 -0.28 -0.28 -0.22 -0.03 0.12 0.19 0.25 0.19 0.1 0.06 -0.17
-0.22 -0.34 -0.23 -0.06 0.04 0.2 0.16 0.31 0.08 -0.02 -0.0 -0.06
-0.02 -0.16 -0.36 -0.23 -0.2 -0.0 0.03 0.19 0.31 0.21 0.06 0.01
-0.84 -0.21 -0.1 -0.04 -0.15 0.06 0.27 0.39 0.45 0.25 -0.27 -0.29
0.08 -0.42 -0.34 -0.34 -0.1 0.06 0.06 0.35 0.26 0.15 0.07 -0.02
-0.05 -0.12 -0.17 -0.08 -0.09 0.11 0.08 0.19 0.1 0.08 -0.01 -0.08
-0.17 -0.06 0.01 -0.12 0.01 0.11 0.07 0.28 0.08 -0.04 -0.01 -0.25
-1.05 -0.64 -0.22 -0.11 -0.1 0.27 0.34 0.5 0.48 0.13 -0.02 -0.31
-0.4 -0.27 -0.21 -0.19 -0.0 0.29 0.32 0.24 0.14 -0.07 -0.01 -0.03
-0.02 -0.13 -0.18 -0.14 -0.04 0.05 0.08 0.17 0.2 0.03 -0.05 -0.03
-0.27 -0.35 -1.07 -1.21 -0.88 0.08 0.48 0.79 0.79 0.41 -0.02 -0.5
-0.27 -0.39 -0.24 -0.25 -0.02 0.09 0.23 0.24 0.28 0.14 0.01 -0.02
-0.28 -0.69 -0.23 -0.49 -0.25 0.39 0.11 0.36 0.31 0.28 0.31 -0.34
-1.22 -1.54 -1.18 -0.95 -0.12 0.04 0.69 0.69 0.55 0.3 0.43 0.06
-1.31 -1.45 -0.79 -0.87 0.22 0.65 0.69 0.79 0.59 0.2 -0.59 -0.49
-0.1 -0.17 -0.24 -0.06 0.01 0.03 0.11 0.22 0.06 0.03 0.12 -0.08
-0.32 -0.07 -0.09 -0.14 -0.1 0.16 0.02 0.25 0.14 0.23 0.06 -0.26
-0.24 -0.39 -0.14 -0.35 -0.07 0.15 0.18 0.25 0.27 0.12 0.08 -0.04
-0.64 -0.71 -0.49 -0.24 -0.09 0.27 0.5 0.57 0.49 0.07 -0.11 -0.39
-0.08 -0.22 -0.22 0.05 0.09 0.1 0.03 0.16 0.2 0.11 -0.04 -0.28
-0.12 -0.22 -0.06 -0.02 -0.04 0.07 -0.04 0.17 0.13 0.11 0.11 -0.13
-0.14 -0.3 -0.19 -0.13 -0.02 0.06 0.09 0.26 0.23 0.05 0.05 -0.07
-0.18 -0.16 -0.21 -0.39 -0.2 0.2 0.19 0.32 0.3 0.2 -0.09 -0.2
-0.69 -0.78 -0.25 -0.31 -0.16 0.26 0.15 0.67 0.4 0.16 0.09 -0.22
-0.07 -0.1 -0.0 -0.1 -0.07 0.03 -0.07 0.2 0.15 0.12 0.05 -0.19
-0.05 -0.27 -0.16 -0.18 -0.06 0.11 0.13 0.33 0.17 0.04 0.09 -0.29
-0.34 -0.6 -0.34 -0.03 0.03 0.26 0.35 0.45 0.18 0.0 -0.12 -0.22
-0.06 -0.19 -0.2 -0.18 0.03 0.1 0.06 0.2 0.12 0.08 0.01 -0.04
-0.07 -0.44 -0.17 -0.32 -0.25 0.18 0.17 0.33 0.27 0.09 0.03 -0.03
-0.32 -0.2 -0.16 -0.15 -0.09 0.09 0.03 0.29 0.16 0.16 0.08 -0.01
-0.03 -0.06 -0.1 0.02 0.12 0.16 0.08 0.23 0.09 -0.08 -0.27 -0.25
-0.26 -0.15 -0.16 -0.26 -0.06 0.0 0.01 0.15 0.13 0.14 0.19 0.16
-0.21 -0.24 -0.15 -0.13 -0.0 0.08 0.18 0.36 0.15 -0.04 0.03 -0.17
-0.03 -0.34 -0.18 -0.17 -0.09 0.04 0.11 0.23 0.27 0.18 0.04 -0.22
-1.09 -0.81 -1.21 -0.89 -0.73 0.04 0.46 0.94 0.31 0.58 0.32 0.1
-0.45 -0.45 -0.33 -0.24 -0.01 0.15 0.25 0.39 0.24 0.23 0.06 -0.16
-0.17 -0.24 -0.26 -0.0 -0.13 -0.0 0.15 0.25 0.18 0.15 -0.05 0.01
-0.06 -0.12 -0.11 -0.15 -0.02 0.03 0.04 0.21 0.08 0.09 0.05 -0.08
-0.61 -0.23 -0.25 -0.18 -0.07 0.24 0.37 0.36 0.26 0.02 -0.01 -0.24
-0.22 -0.62 -0.52 -0.33 -0.05 0.2 0.35 0.4 0.16 0.17 0.16 -0.1
-0.05 -0.22 -0.18 -0.23 0.03 -0.03 0.14 0.16 0.14 0.09 0.05 0.03
-0.12 -0.33 -0.06 -0.3 -0.17 0.08 0.18 0.32 0.11 0.18 0.08 -0.12
-0.14 -0.35 -0.23 -0.14 -0.23 0.05 -0.05 0.42 0.42 0.21 0.13 -0.37
-0.47 -0.47 -0.22 -0.18 0.05 0.21 0.25 0.16 0.28 0.23 0.05 -0.15
-1.52 -0.48 -0.32 -1.14 -0.07 -0.57 0.23 0.55 0.43 0.3 0.38 0.62
-0.55 -0.59 -0.33 -0.16 -0.16 -0.07 0.2 0.57 0.4 0.25 -0.02 -0.02
-0.23 -0.09 -0.27 -0.12 -0.11 -0.11 0.03 0.23 0.12 0.15 0.19 0.09

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.