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Heatmap: Cluster_24 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.11 -0.12 -0.19 -0.16 -0.16 -0.15 -0.19 0.04 0.12 0.23 0.17 0.19
0.26 -0.92 -0.22 -0.87 0.1 -0.45 0.01 0.07 0.45 0.18 0.04 0.56
0.32 0.04 -0.6 -0.41 -0.37 0.1 0.12 -0.08 0.04 0.14 0.22 0.19
0.87 -0.9 -1.07 -0.47 0.16 -0.7 -0.2 0.36 0.24 0.37 0.21 -0.12
0.59 -0.4 -0.3 -0.08 0.08 -0.34 0.09 -0.17 0.16 -0.14 0.03 0.19
0.17 -0.36 -0.6 -0.33 0.36 0.22 -0.03 -0.52 0.02 -0.05 0.09 0.55
0.91 -0.89 -1.36 -1.83 -0.18 0.09 -0.4 0.23 0.53 0.18 0.28 0.32
0.79 -1.0 -2.34 -4.7 -0.59 -0.2 -1.05 -0.18 0.4 0.41 0.43 1.4
0.41 -0.93 -0.69 -0.55 -0.39 -0.38 -0.35 -0.33 0.21 0.51 0.58 0.73
0.28 0.06 -0.21 -0.26 -0.18 0.01 0.05 0.02 -0.02 0.06 0.1 -0.0
0.16 -0.31 -0.14 -0.38 -0.05 -0.09 -0.05 -0.02 0.15 0.19 0.16 0.23
1.43 -0.39 -0.84 -0.65 -0.42 -0.33 -0.68 -0.6 0.35 0.18 0.46 -0.41
-0.41 -0.13 -0.06 -0.23 -0.07 -0.08 0.07 0.19 0.05 0.26 0.25 0.01
0.29 0.21 -0.13 -0.55 -0.26 -0.34 -0.11 0.12 0.18 0.0 0.13 0.2
-0.06 -0.29 -0.01 0.06 0.11 -0.07 -0.05 -0.13 0.02 0.06 0.11 0.18
0.14 -0.03 -0.18 -0.12 -0.19 -0.07 -0.16 -0.18 0.12 0.13 0.18 0.26
0.02 -0.78 -0.6 -0.33 0.55 0.08 -0.14 -0.52 0.49 0.16 0.07 0.34
-0.12 -0.11 -0.3 -0.3 -0.26 -0.1 -0.04 -0.01 0.23 0.35 0.38 0.06
0.31 -0.37 -0.34 -0.1 0.15 0.04 -0.25 -0.18 0.54 0.07 0.14 -0.33
0.75 -0.17 -0.12 0.05 -0.04 -0.25 -0.1 0.31 -0.03 -0.38 -0.31 -0.11
0.22 -0.3 0.43 -1.5 0.27 -0.42 -0.13 -0.79 -0.24 0.28 0.14 0.77
0.31 -0.74 0.27 -0.3 -0.44 -0.67 -0.33 -0.24 0.16 0.58 0.24 0.43
-0.85 -1.35 0.07 -0.25 0.0 -0.45 0.04 -0.19 0.24 0.65 0.49 0.45
0.47 -1.28 -0.03 -0.24 0.12 -0.14 0.0 0.14 0.33 0.06 0.2 -0.27
0.3 0.27 -0.01 -0.08 0.25 -0.55 -0.18 -0.88 -0.34 0.23 -0.43 0.69
0.46 -0.42 -0.27 -0.13 0.37 -0.0 0.02 -0.4 -0.18 0.06 0.12 0.09
0.45 0.02 -0.2 0.22 0.15 -0.23 -0.57 0.16 -0.17 -0.15 0.05 0.02
1.09 -0.88 -0.67 -0.9 0.04 0.44 -0.88 0.29 0.61 0.2 -0.29 -0.92
-0.03 -0.7 -0.78 -0.62 0.32 0.07 0.03 -0.16 0.46 0.37 0.17 0.22
0.03 -0.04 -0.16 -0.12 -0.19 0.04 0.07 0.09 0.08 0.09 0.08 -0.0
0.55 -0.69 -0.53 -0.39 -0.09 -0.29 -0.07 0.23 0.12 -0.01 0.28 0.36
0.34 0.0 -0.29 -0.04 -0.2 -0.06 -0.18 -0.17 -0.1 0.01 0.08 0.43
0.01 -0.24 -0.22 -0.3 0.03 0.11 0.02 0.01 0.23 0.22 0.1 -0.08
-0.67 -0.23 -0.37 -0.72 -0.2 0.2 -0.0 0.18 0.02 0.41 0.42 0.39
- - - - - 1.01 - - 1.82 - 2.69 -
0.85 -1.78 -1.15 -2.74 0.71 -0.28 -0.41 -1.04 0.28 0.14 0.28 1.05
-0.03 -0.0 -0.12 -0.15 -0.02 0.06 -0.07 0.09 -0.02 0.09 0.11 0.05
0.58 -0.69 -0.66 0.07 -0.27 -0.29 -0.71 0.08 -0.17 0.36 0.64 0.22
-0.06 -0.07 -0.31 -0.37 0.25 0.18 0.0 0.07 0.13 0.17 0.02 -0.14
1.21 -0.68 -2.4 -1.63 -0.63 0.2 -0.22 0.24 0.49 0.58 -0.15 -0.13
1.06 -0.8 -0.58 -0.58 0.55 0.21 0.08 -0.41 -0.21 0.05 -0.32 -0.19
-0.03 -0.27 -0.11 -0.18 -0.09 -0.04 0.11 -0.09 -0.02 0.15 0.21 0.26
0.29 -1.28 -1.4 -2.45 0.23 0.09 -0.18 0.12 0.39 0.32 0.54 0.66
-0.36 -0.36 -0.7 -3.82 0.06 -0.46 -0.41 0.5 0.84 0.52 0.29 0.46
0.33 -0.57 -0.39 -0.18 0.16 -0.18 -0.1 0.04 0.31 -0.13 0.14 0.27
-0.36 -0.74 -0.34 -0.23 0.06 -0.21 -0.07 0.16 0.25 0.09 0.35 0.55
0.13 -0.02 -0.22 -0.14 -0.08 -0.04 0.06 -0.05 0.12 0.04 0.14 0.01
0.25 -0.17 -0.13 -0.0 -0.1 -0.27 0.01 -0.16 0.09 0.06 0.16 0.15
-0.82 -1.3 -1.01 -0.76 -0.05 0.01 -0.02 0.34 0.38 0.4 0.39 0.84
1.19 -0.67 -2.15 -0.54 -0.35 -0.98 -0.26 -0.59 -0.02 0.34 0.43 0.84
0.27 0.11 -0.1 -0.31 -0.33 -0.52 0.03 -0.02 0.2 0.09 -0.05 0.38
1.06 -1.47 -0.62 -0.4 0.32 -0.69 -0.31 0.3 -0.0 -0.37 0.21 0.4
1.65 -1.14 -1.34 -0.71 0.26 0.11 -0.26 -2.54 -0.6 0.02 0.15 0.41
1.39 -0.54 -0.25 -0.7 -0.15 0.77 -0.45 0.46 -0.28 -1.05 0.01 -2.25
0.28 -0.61 -0.62 -0.07 0.34 0.12 -0.01 -0.45 0.0 0.07 0.07 0.43
0.67 0.02 -0.29 -0.92 -0.61 -0.27 -0.46 -0.84 -0.12 0.17 0.4 0.94
0.01 0.22 -0.21 -0.27 -0.24 -0.04 0.08 -0.07 0.07 -0.14 0.21 0.26
1.02 -3.28 -2.0 -0.73 -0.06 0.77 -0.76 -0.23 -0.01 -0.55 0.95 0.37
-0.54 -1.37 -1.75 -1.89 -0.3 0.02 -0.0 -0.12 0.7 0.36 0.81 0.97
0.78 -1.15 -1.08 -0.79 -0.1 -0.3 -0.24 0.36 0.35 0.08 0.18 0.53
0.42 0.02 -0.06 -0.18 0.18 -0.21 -0.22 0.04 -0.27 0.01 0.09 0.03
1.96 - - -2.5 -0.02 0.53 -1.18 -1.51 -0.48 -1.11 0.15 1.28
0.6 -0.56 -0.49 -0.73 -0.07 -0.18 0.04 0.2 0.13 0.33 0.23 -0.06
-0.02 -0.24 -0.08 -0.03 -0.03 0.09 -0.07 -0.06 0.04 0.15 0.1 0.11
0.01 -0.34 -1.07 -0.5 0.06 -0.4 -0.11 0.19 0.01 0.33 0.74 0.27
0.06 -0.2 -0.22 -0.58 -0.05 -0.05 -0.14 0.07 0.33 0.2 -0.04 0.36
0.02 -0.27 -0.26 -0.57 -0.06 -0.11 0.09 0.31 0.4 0.32 -0.02 -0.17
-0.01 -0.71 -0.79 -0.66 -0.17 0.08 -0.03 -0.01 0.44 0.29 0.18 0.64
0.91 -0.34 -0.92 -0.81 -0.06 -0.28 -0.35 -0.06 0.24 -0.21 0.61 0.18
0.28 -0.1 -0.74 -0.33 -0.43 -0.1 -0.1 -0.24 0.17 0.31 0.38 0.41
0.02 -0.86 -0.36 -1.01 -0.56 -1.49 -0.83 0.39 1.13 -0.27 0.77 0.59
-0.35 -0.56 -0.36 -0.48 0.41 -0.4 -0.04 0.23 0.24 0.22 0.09 0.49
0.14 -0.13 -0.3 -0.05 -0.09 0.12 -0.1 0.01 -0.14 0.01 0.2 0.23
0.33 -0.34 -0.39 -0.46 0.08 -0.2 -0.01 -0.01 0.26 0.02 0.25 0.2
0.16 -0.15 0.07 -0.21 0.18 -0.28 -0.11 0.03 -0.1 0.04 0.04 0.23
0.07 -0.16 0.01 -0.1 -0.01 0.07 -0.01 -0.1 0.0 0.03 0.05 0.11
0.58 -0.09 -0.66 -0.56 -0.27 -0.17 0.12 -0.14 -0.02 0.43 0.2 0.08
0.8 0.26 -0.8 -1.7 -1.02 -0.26 -0.95 -0.33 0.64 -0.01 0.35 0.79
1.13 -0.07 -0.52 -0.37 -0.16 -0.3 -0.0 -0.72 0.11 -0.2 0.6 -0.72
0.24 -0.07 -0.11 -0.24 0.03 -0.08 -0.1 0.12 0.12 0.02 0.02 -0.02
-0.54 -0.52 -0.35 -0.61 0.36 0.38 0.33 -0.05 0.49 0.3 -0.13 -0.3
0.92 0.01 0.03 -0.08 0.07 -0.06 0.07 -0.06 -0.09 -0.45 -0.53 -0.41
0.26 -0.83 -2.12 -0.44 -0.44 -0.29 -0.3 0.36 0.21 0.05 1.24 0.09
0.59 -0.5 -0.72 -0.01 -0.1 -0.41 -0.12 0.24 0.18 -0.04 0.19 0.22
0.81 -0.84 -0.39 -0.53 0.58 -0.25 -0.12 -0.63 -0.11 0.34 0.25 -0.08
0.01 - -0.58 - 0.51 -2.7 -0.9 0.54 1.1 -0.82 1.3 0.66
-0.16 -0.33 -0.37 -0.4 0.18 -0.09 0.07 0.07 0.06 0.24 0.23 0.28
1.3 -1.18 -1.6 -1.62 -0.2 -0.07 -0.66 0.09 0.79 -0.18 0.2 0.23
1.18 -2.4 -1.21 -2.92 0.13 0.85 0.16 0.83 -0.14 -0.39 0.11 -1.22
0.33 -0.11 -0.12 -0.2 -0.14 -0.18 0.07 0.04 0.09 -0.03 0.08 0.08
- - 1.04 - - 0.1 - - 1.05 - 2.77 -
-0.05 -0.55 -0.72 -0.39 0.08 -0.05 -0.08 0.07 0.39 -0.1 0.2 0.65
-1.54 - - - -2.57 - - -0.16 1.2 -2.27 1.94 2.09
0.52 0.14 -0.53 -1.36 -0.52 -0.37 0.21 0.13 0.3 0.22 0.06 0.29
0.17 -0.9 -0.62 -0.23 -0.12 -2.0 -0.37 -0.24 0.5 0.59 0.46 0.81
0.18 -0.33 -0.68 -0.11 0.08 0.01 -0.17 -0.11 0.23 0.07 0.08 0.45
0.8 -1.76 -1.92 -0.64 -0.42 0.01 -0.02 -0.03 0.57 0.4 1.02 -0.98
0.96 -0.34 -0.65 -0.38 -0.08 -0.06 -0.32 -0.1 0.15 -0.13 0.05 0.23
0.28 0.19 -0.17 -0.49 -0.42 -0.35 0.04 -0.16 -0.05 0.17 0.27 0.36
0.93 -0.16 -0.04 -0.51 0.5 -0.73 -0.22 -0.66 -0.02 -1.71 -0.06 0.82
-0.71 -0.74 -0.64 -0.23 -0.1 -0.16 -0.42 0.21 0.03 0.05 0.66 0.94
0.11 -1.0 -0.86 -0.69 0.29 -0.67 -0.22 -0.2 0.46 0.15 0.33 0.93
0.87 -0.2 -0.47 -0.63 0.16 0.53 -0.1 0.81 -0.27 -0.67 -0.45 -1.0
-0.92 -1.05 -0.22 -0.95 0.09 -0.55 0.23 0.22 0.19 0.98 0.33 0.2
1.36 -0.33 -0.23 0.09 0.4 -0.75 -0.72 0.44 -0.42 -0.96 -0.43 -0.25
0.6 -0.62 -0.9 -0.49 -0.15 -0.15 -0.08 0.01 0.23 0.11 0.53 0.19
-0.07 -1.88 -1.34 -0.5 0.6 0.31 0.05 -0.18 0.44 0.42 0.38 0.01
0.03 -0.1 -0.06 -0.02 -0.04 -0.13 -0.04 0.01 0.01 0.12 0.1 0.09
0.3 -0.16 -0.21 -0.12 0.02 -0.1 -0.03 0.0 0.09 0.04 0.03 0.07
1.01 -0.8 -1.51 -3.38 -0.02 0.39 -0.87 0.2 0.03 -0.03 0.55 0.6

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.