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Heatmap: Cluster_190 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.22 -0.36 -0.23 0.03 -0.16 0.27 0.16 0.19 0.18 0.22 -0.05 -0.2
-1.62 -0.47 -0.56 -0.14 -0.08 0.94 -0.0 -0.12 -0.17 0.64 0.66 -0.83
- 0.58 -1.1 - -0.09 2.13 -1.49 1.51 -0.09 -0.82 - -
0.7 0.16 -0.23 0.4 -0.12 -0.09 -0.02 0.06 -0.23 -0.36 -0.47 -0.25
-0.17 -0.07 0.01 -0.04 -0.05 0.1 0.1 0.05 0.03 0.11 -0.07 -0.04
- -0.55 0.22 - - 2.7 - 0.77 0.43 -0.75 - -
-0.23 -0.22 -0.1 -0.09 0.08 0.09 0.04 0.09 0.15 0.19 -0.04 -0.02
-0.01 -0.09 -0.1 0.04 -0.04 0.15 -0.03 0.16 -0.03 0.03 0.05 -0.16
-0.18 -0.21 -0.14 0.02 0.03 0.2 0.1 0.17 0.05 0.17 -0.08 -0.22
-0.09 -0.23 -0.04 -0.06 -0.05 0.09 0.0 0.1 0.05 0.12 0.12 -0.07
-1.7 -0.14 -0.12 -0.33 0.1 0.3 0.6 0.29 0.3 0.21 -0.16 -0.45
-0.08 -0.21 -0.09 -0.07 -0.03 0.22 0.13 0.0 0.23 0.1 -0.07 -0.22
-1.47 -1.08 -0.75 0.25 -0.09 1.34 0.41 0.1 0.28 0.37 -0.55 -1.6
-0.29 -0.13 -0.14 -0.4 0.07 0.35 0.08 0.05 0.09 0.24 0.01 -0.1
-0.02 -0.02 -0.18 0.01 0.0 0.19 0.07 0.16 0.12 0.01 -0.07 -0.37
-0.3 -0.42 -0.24 0.18 0.06 0.19 0.14 0.11 0.13 0.13 0.18 -0.36
0.04 -0.23 0.02 -0.04 0.01 -0.14 -0.14 0.18 -0.02 0.03 0.32 -0.11
0.31 -1.77 -0.46 -0.71 -0.06 0.27 -0.46 0.16 0.35 0.07 1.35 -2.05
-0.05 0.05 -0.11 0.01 -0.08 0.02 -0.24 -0.03 0.08 0.26 0.24 -0.24
0.3 -0.43 -0.24 -0.54 -0.35 0.09 0.26 0.35 0.4 0.15 -0.13 -0.29
-0.13 -0.35 0.48 -0.44 0.1 0.61 0.39 -0.16 -0.18 -0.03 -0.12 -0.79
- - - - - 2.47 - - 2.69 - - -
0.43 - -0.49 -2.09 -0.95 1.16 - -0.59 1.1 0.67 1.22 -2.21
0.05 -0.17 -0.01 -0.08 -0.11 0.02 -0.08 0.1 -0.02 0.06 0.05 0.15
-0.09 0.12 0.09 -0.0 0.09 0.31 -0.07 0.14 -0.03 -0.15 -0.21 -0.33
-0.29 -0.28 -0.14 0.08 0.09 0.34 0.05 0.1 0.28 -0.08 -0.08 -0.24
-0.15 -0.09 -0.05 0.04 -0.19 0.09 0.0 0.13 0.13 0.06 0.04 -0.06
- -0.58 -1.68 - 0.24 1.75 -0.36 2.09 -1.32 -1.61 -0.5 -
0.38 -0.3 0.06 -3.58 -0.06 1.25 0.01 0.7 -0.54 -1.12 0.44 -1.89
-0.37 -0.37 -0.2 0.12 0.02 0.16 -0.1 -0.01 0.17 0.32 0.05 0.04
-0.89 -0.4 0.77 -0.01 0.51 1.12 -0.52 0.34 0.12 -2.36 -0.81 -0.74
- -0.84 0.79 0.64 -0.15 1.41 0.31 -1.07 -0.31 0.12 -0.58 -1.62
0.23 -0.04 0.06 -0.04 0.08 0.49 -0.14 -0.03 -0.18 -0.27 -0.11 -0.22
0.11 -0.26 -0.2 -0.22 0.11 0.07 0.02 -0.05 0.24 0.08 0.02 -0.01
-0.23 -0.2 -0.08 0.1 0.2 0.28 -0.0 0.06 0.16 0.0 -0.06 -0.36
0.56 -0.12 -0.11 0.39 0.1 0.09 -0.14 0.39 -0.07 -0.38 -0.84 -0.43
-1.09 -0.35 -0.16 -0.25 0.66 1.41 0.04 -1.28 -0.57 0.02 0.58 -2.81
- - 1.07 - 0.32 2.21 -1.69 -0.2 0.4 0.2 -1.44 -
-0.84 -0.26 -0.12 -0.26 0.02 0.62 -0.01 0.16 0.17 0.35 0.01 -0.36
-0.19 -0.41 -0.27 0.01 -0.05 0.43 0.03 0.08 0.29 0.18 0.0 -0.35
-0.04 -0.08 -0.05 -0.14 -0.15 0.3 0.01 0.15 0.09 0.15 -0.03 -0.3
-0.12 -0.1 -0.09 -0.15 -0.14 0.49 -0.19 0.13 -0.01 -0.08 0.19 -0.09
0.13 -0.22 -0.11 -0.33 0.02 0.22 0.21 0.21 0.07 0.03 -0.04 -0.34
0.05 -0.07 -0.05 -0.01 -0.04 -0.02 -0.07 -0.08 0.1 0.1 0.15 -0.08
0.01 0.09 -0.08 -0.01 -0.23 0.09 0.08 0.16 -0.03 0.14 -0.09 -0.2
-1.32 0.04 -0.28 -0.46 0.1 1.11 -0.18 -0.25 0.51 -0.01 0.38 -1.57
-0.1 -0.03 -0.07 0.01 -0.04 0.23 -0.05 0.06 0.02 0.08 0.12 -0.29
-0.14 -0.04 -0.21 -0.18 -0.07 0.19 0.11 0.11 0.16 0.04 -0.05 0.0
-0.19 -0.17 0.17 -0.07 0.04 0.21 0.04 0.12 -0.03 -0.02 0.02 -0.21
-0.03 -0.37 -0.17 -0.05 0.03 0.34 0.0 0.06 0.18 0.22 0.03 -0.42
0.3 -0.58 -0.25 0.16 0.26 0.42 0.19 0.15 -0.06 -0.04 -0.27 -0.76
- - - - 1.49 2.62 - - 1.61 - - -
-0.44 -0.19 -0.17 -0.06 0.18 0.24 0.25 0.19 0.15 0.03 -0.24 -0.12
-0.06 -0.11 -0.14 -0.07 -0.04 0.15 0.03 0.06 0.06 0.15 0.01 -0.08
-0.18 -0.12 -0.07 0.08 -0.07 0.18 0.05 -0.04 0.06 0.17 0.03 -0.13
-0.13 -0.14 -0.45 -0.13 0.15 0.36 0.01 0.3 0.22 0.04 -0.01 -0.48
-0.24 0.01 0.02 -0.0 -0.03 0.1 -0.06 0.08 0.09 0.12 0.02 -0.14
-0.05 -0.18 0.13 0.13 0.24 0.62 -0.1 0.3 -0.17 -0.36 -0.5 -0.51
-0.05 -0.33 -0.07 -0.54 -0.0 0.31 0.45 0.21 0.67 0.02 -0.79 -0.62
-2.38 -0.72 0.33 0.16 -0.09 0.86 -0.59 -0.3 -0.34 0.57 0.53 -0.17
-0.29 -0.55 -0.68 0.32 -0.56 1.09 -0.0 0.11 -0.32 0.13 0.55 -1.38
-0.04 -0.2 -0.15 -0.06 -0.06 0.07 0.14 0.01 0.14 0.16 -0.02 -0.06
-0.0 -0.34 -0.12 0.32 -0.4 0.4 -0.04 0.1 0.2 -0.24 0.08 -0.23
-1.24 -0.96 -0.96 -0.94 -0.07 0.84 0.76 0.68 0.23 0.03 -0.11 -0.2
1.04 0.38 -3.03 -1.25 -2.71 1.5 -1.03 - 1.11 -0.26 0.43 -1.73
- - -1.9 0.59 0.51 1.9 0.87 -0.07 -0.27 0.29 -2.34 -4.36
-0.1 -0.02 -0.17 -0.16 -0.03 0.35 0.09 0.13 0.03 0.06 -0.09 -0.19
- -0.48 -0.84 0.09 -0.35 1.55 0.59 -0.09 -0.92 0.51 0.28 -1.56
- -1.57 1.4 0.35 0.63 1.85 -1.96 - -0.88 0.19 - -0.59
-0.0 -0.54 -0.44 0.17 0.44 0.91 0.21 -0.41 -0.18 -0.27 -0.35 -0.32
- - -0.23 0.7 0.58 2.18 -0.48 -1.6 -0.58 0.1 -0.78 -2.97
-0.58 -0.41 -0.22 0.28 -0.06 0.35 0.05 0.06 0.05 0.23 0.09 -0.12
- - -0.11 - 0.19 2.1 1.44 -0.28 0.1 -1.47 -1.85 -1.26
-0.8 -0.29 0.01 -0.97 -0.28 0.58 -0.05 -0.16 0.23 0.51 0.41 -0.03
-0.1 -0.26 -0.18 -0.11 0.06 0.42 0.16 0.26 0.11 -0.05 -0.08 -0.45
-0.29 -0.12 0.01 -0.22 -0.06 0.16 0.35 0.23 0.15 -0.03 -0.12 -0.21
0.16 -0.2 -0.21 -0.06 -0.02 0.14 0.19 0.21 0.08 -0.09 -0.14 -0.18
0.24 0.0 -0.01 -0.1 -0.18 0.33 0.11 0.17 -0.02 -0.28 0.02 -0.47
-4.22 -3.46 -1.55 -0.48 0.1 1.49 0.77 1.16 0.14 -0.2 -0.42 -1.95
-3.73 -1.52 -1.34 0.07 1.1 1.97 0.63 0.43 -0.64 -1.95 -3.05 -2.53
0.21 -0.31 -0.34 -0.54 0.04 -0.05 0.05 -0.02 0.3 0.12 0.4 -0.15
-0.12 -0.22 -0.02 -0.1 0.02 0.37 0.06 0.22 -0.15 0.03 0.18 -0.45
0.01 -0.14 -0.06 -0.05 -0.07 0.07 -0.02 0.05 0.05 0.07 0.09 -0.01
- -1.04 0.74 0.57 0.59 1.39 -0.31 0.58 -0.27 -1.37 -1.33 -1.71
-0.09 -0.31 -0.04 -0.48 0.19 0.45 -0.0 0.22 0.2 0.19 0.1 -0.91

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.