Heatmap: Cluster_68 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-2.36 -1.41 -0.08 0.39 0.58 0.58 0.51 0.45 0.17 0.03 -0.51 -0.89
-1.24 -0.86 -0.49 0.03 0.55 0.62 0.27 0.09 0.18 -0.07 -0.07 -0.03
-0.61 -0.66 -0.33 -0.09 0.28 0.26 0.22 0.14 0.21 0.3 -0.02 -0.12
-0.6 -0.76 -0.03 0.29 0.36 0.48 0.11 0.0 0.15 -0.26 0.02 -0.28
-0.64 -0.34 0.02 0.23 0.14 0.16 0.17 0.12 0.19 -0.08 -0.06 -0.13
-0.53 -0.46 -0.14 0.03 0.26 0.19 0.3 0.33 0.23 0.01 -0.2 -0.36
-0.39 -0.56 -0.02 0.1 0.51 0.36 0.09 0.08 0.1 -0.09 -0.3 -0.25
-0.71 -0.4 -0.02 0.12 0.21 0.15 0.21 0.22 0.13 0.15 -0.12 -0.24
-0.65 -0.39 0.0 0.17 0.13 0.1 0.2 0.17 0.13 0.1 -0.02 -0.2
-1.16 -1.4 -0.7 0.03 0.47 0.57 0.45 0.38 0.56 0.16 -0.4 -0.62
-0.91 -0.7 -0.19 0.11 0.35 0.23 0.13 0.23 0.25 0.1 -0.06 -0.05
-0.48 -0.44 -0.14 0.09 0.44 0.35 0.33 0.14 0.11 -0.19 -0.29 -0.31
-1.53 -1.6 -0.78 -0.02 0.62 0.74 0.52 0.16 0.4 0.2 -0.33 -0.43
-0.5 -0.45 -0.08 0.21 0.24 0.29 0.2 0.04 0.21 0.03 -0.23 -0.23
-0.4 -0.18 0.07 0.11 0.1 0.07 0.13 0.07 0.17 -0.01 -0.03 -0.19
-0.92 -0.96 -0.3 0.03 0.48 0.4 0.34 0.23 0.25 0.05 -0.2 -0.18
-0.72 -1.13 -0.77 -0.56 0.42 0.49 0.31 0.39 0.42 0.25 0.0 -0.26
-0.53 -1.02 -0.6 -0.02 0.48 0.47 0.33 -0.01 0.32 0.21 -0.14 -0.26
-0.54 -0.4 -0.07 0.19 0.24 0.13 0.22 0.11 0.12 -0.01 -0.06 -0.13
-0.76 -0.6 -0.09 0.09 0.22 0.23 0.22 0.09 0.19 0.11 0.03 -0.09
-0.58 -0.43 0.03 0.22 0.12 0.05 0.2 0.1 0.14 0.03 -0.02 -0.08
-0.67 -0.54 -0.27 -0.04 0.22 0.37 0.2 0.04 0.07 0.22 0.07 -0.01
-3.45 -4.37 -3.14 -0.95 0.31 1.23 0.79 0.25 0.33 0.5 0.33 -0.34
-0.47 -0.1 0.1 0.15 0.16 0.06 0.11 0.0 0.06 -0.03 -0.06 -0.1
-0.52 -0.39 -0.06 0.11 0.18 0.09 0.2 0.12 0.14 0.08 -0.07 -0.06
-1.19 -1.23 -0.6 0.04 0.54 0.52 0.21 -0.02 0.24 0.33 0.05 -0.09
-0.55 -0.89 -0.4 0.01 0.36 0.45 0.39 0.32 0.24 -0.05 -0.24 -0.3
-0.56 -0.35 0.17 0.21 0.36 0.08 0.08 0.01 -0.04 0.05 -0.11 -0.14
-1.96 -1.78 -0.88 0.19 0.77 0.86 0.62 0.29 0.32 0.01 -0.42 -1.0
-1.7 -1.45 -0.37 0.16 0.83 0.61 0.59 0.18 0.4 -0.06 -0.63 -0.82
-1.19 -0.41 0.09 -0.05 0.39 0.26 0.11 0.25 0.05 0.12 0.06 -0.26
-0.7 -0.45 -0.06 0.18 0.45 0.41 0.28 0.32 0.05 -0.09 -0.35 -0.65
-1.21 -1.46 -0.46 0.2 0.59 0.59 0.44 0.26 0.31 0.07 -0.24 -0.65
-0.75 -0.32 0.09 0.14 0.26 0.05 0.13 0.12 0.17 0.04 -0.08 -0.12
-0.96 -1.34 -0.61 0.1 0.6 0.59 0.41 0.23 0.23 -0.02 -0.19 -0.3
-0.35 -0.27 -0.07 0.17 0.19 0.13 -0.01 -0.01 0.03 0.05 0.05 -0.01
-2.26 -1.46 -0.53 0.01 0.46 0.7 0.65 0.34 0.32 0.26 -0.33 -0.6
-0.5 -0.37 -0.16 0.19 0.23 0.09 0.17 0.06 0.14 0.09 -0.06 -0.07
-0.85 -0.64 -0.09 0.47 0.32 0.07 0.16 0.18 0.13 0.14 -0.01 -0.44
-0.81 -0.69 -0.11 0.19 0.27 0.29 0.35 0.19 0.14 0.14 -0.15 -0.33
-0.25 -0.42 -0.36 0.11 0.33 0.25 0.27 0.03 0.02 -0.05 -0.05 -0.1
-2.52 -1.32 -0.04 0.45 0.85 0.67 0.57 0.42 -0.17 -0.2 -0.78 -0.96
-0.68 -0.4 -0.01 0.15 0.42 0.08 0.03 -0.03 0.21 0.23 -0.05 -0.28
-0.43 -0.54 -0.2 0.04 0.29 0.39 0.36 0.21 0.14 -0.05 -0.2 -0.39
-0.74 -0.56 0.07 0.13 0.28 0.23 0.37 0.17 0.13 -0.11 -0.1 -0.27
-0.7 -0.8 -0.2 0.21 0.6 0.42 0.1 -0.0 0.01 0.04 0.01 -0.3
-0.56 -0.81 -0.35 0.05 0.5 0.46 0.42 0.14 0.24 -0.15 -0.3 -0.3
-0.34 -1.17 -0.96 -0.32 0.18 0.46 0.41 0.46 0.4 0.12 -0.02 -0.25
-0.93 -0.71 -0.04 0.31 0.31 0.23 0.17 0.06 0.18 0.06 0.0 -0.16
-1.4 -1.29 -0.47 0.28 0.73 0.75 0.68 0.46 0.02 -0.27 -0.77 -0.92
-1.26 -0.27 0.49 0.81 0.4 0.48 0.02 -0.15 -0.05 -0.4 -0.61 -0.78
-0.87 -0.63 -0.39 -0.05 0.32 0.34 0.29 0.12 0.25 0.09 -0.02 0.02
-1.16 -0.95 0.17 0.26 0.45 0.51 0.21 0.29 0.33 -0.36 -0.44 -0.37
-0.46 -0.55 -0.22 -0.14 0.32 0.22 0.24 0.14 0.21 0.22 0.02 -0.34
-0.49 -0.38 -0.03 0.12 0.13 0.04 0.12 0.27 0.06 -0.01 0.02 -0.01
-1.04 -0.91 -0.25 0.27 0.52 0.43 0.26 0.06 0.24 0.19 -0.24 -0.43
-1.48 -1.23 -0.17 0.45 0.46 0.08 0.42 0.34 0.21 0.18 -0.21 -0.38
-0.79 -1.14 0.23 0.69 0.39 0.53 -0.25 0.22 0.06 -0.14 -0.18 -0.79
-0.37 -0.52 -0.09 0.11 0.3 0.29 0.23 0.26 0.11 -0.03 -0.22 -0.4
-0.1 -0.41 -0.12 0.18 0.29 0.17 0.15 0.1 0.07 -0.06 -0.23 -0.22
-0.92 -1.13 -0.29 0.21 0.63 0.42 0.32 0.11 0.22 -0.02 -0.16 -0.37
-0.54 -0.76 -0.13 0.19 0.46 0.22 0.26 0.3 0.04 -0.11 -0.26 -0.14
-0.67 -0.62 -0.33 -0.06 0.29 0.24 0.3 0.35 0.25 0.19 -0.1 -0.34
-0.85 -0.75 -0.39 0.2 0.32 0.45 0.39 0.1 0.3 0.07 -0.18 -0.37
-0.57 -0.45 0.02 0.06 0.36 0.21 0.11 0.14 0.21 0.09 -0.2 -0.29
-1.88 -1.7 -0.36 0.51 0.6 0.27 0.45 0.44 0.3 -0.01 -0.18 -0.59
-0.88 -1.25 -0.37 0.33 0.56 0.4 0.11 -0.01 0.35 0.32 -0.12 -0.54
-1.48 -1.41 -0.51 0.11 0.6 0.53 0.33 0.08 0.19 0.2 -0.07 -0.05
-1.63 -1.85 -1.42 -0.63 0.53 0.78 0.8 0.57 0.42 0.23 -0.29 -0.59
-1.35 -1.31 -0.91 -0.06 0.59 0.82 0.24 0.26 0.19 0.04 0.08 -0.25
-0.82 -0.43 0.07 0.27 0.32 0.2 0.06 0.18 0.14 -0.1 -0.01 -0.26
-0.5 -0.48 0.06 0.17 0.36 0.16 0.07 0.12 0.12 -0.04 -0.04 -0.26
-1.87 -0.55 0.04 0.26 0.34 0.2 0.26 0.2 0.16 0.09 0.06 -0.27
-0.86 -0.77 -0.34 0.02 0.36 0.39 0.43 0.35 0.18 0.09 -0.22 -0.35
-0.75 -0.59 -0.28 -0.1 0.23 0.43 0.23 0.25 0.17 0.11 -0.06 -0.09
-1.05 -1.72 -1.06 -0.35 0.42 0.65 0.52 0.5 0.56 0.26 -0.26 -0.52
-1.01 -0.66 -0.14 0.35 0.31 0.35 0.11 0.08 0.08 0.07 -0.11 0.0
-0.95 -0.29 0.0 0.21 0.32 0.3 0.05 0.11 0.14 0.05 -0.02 -0.34
-1.73 -1.53 -0.46 0.18 0.55 0.6 0.32 0.38 0.27 0.23 -0.16 -0.55
-0.74 -1.09 -0.48 0.13 0.49 0.43 0.33 0.23 0.22 0.06 -0.11 -0.31
-0.44 -0.23 0.01 0.12 0.11 0.14 0.16 0.06 0.11 0.07 0.01 -0.25
-1.03 -0.95 -0.29 -0.07 0.41 0.51 0.43 0.37 0.38 -0.08 -0.14 -0.55
-1.69 -1.6 -0.72 -0.13 0.5 0.71 0.69 0.39 0.52 0.12 -0.45 -0.7
-0.48 -0.47 -0.47 -0.36 0.21 0.21 0.26 0.26 0.3 0.28 0.09 -0.26
-0.67 -0.38 -0.01 0.2 0.2 0.12 0.16 0.11 0.33 0.03 -0.24 -0.15
-1.14 -0.73 -0.2 0.27 0.25 0.29 0.22 0.02 0.37 0.34 -0.08 -0.36
-1.65 -0.76 -0.08 0.26 0.3 0.51 0.43 0.0 0.26 0.15 -0.11 -0.45
-1.25 -0.98 -0.31 -0.16 0.3 0.88 0.26 0.32 -0.06 -0.07 0.27 -0.43
-0.63 -0.16 0.31 0.33 0.3 0.11 0.09 -0.02 -0.02 -0.02 -0.22 -0.35
-0.65 -0.47 -0.0 0.21 0.3 0.17 0.09 0.22 0.17 0.05 -0.19 -0.23
-0.38 -0.29 0.03 0.17 0.15 0.13 0.14 0.12 0.15 -0.02 -0.14 -0.21
-0.47 -0.43 -0.02 0.21 0.37 0.03 0.28 0.25 0.01 -0.16 -0.22 -0.12
-0.46 -0.13 0.15 0.23 0.18 0.01 -0.0 0.08 0.01 -0.04 -0.02 -0.12
-0.43 -0.35 0.0 0.17 0.19 0.38 0.11 0.23 -0.07 -0.19 -0.02 -0.25
-0.33 -0.54 -0.35 -0.28 0.2 0.25 0.31 0.26 0.21 0.05 -0.02 -0.06
-0.71 -0.2 0.17 0.24 0.31 -0.02 0.13 0.05 0.21 0.02 -0.18 -0.31
-0.67 -0.93 -0.4 -0.19 0.25 0.29 0.34 0.25 0.37 0.28 -0.05 -0.2
-0.76 -1.14 -0.83 -0.1 0.49 0.55 0.35 0.15 0.11 0.07 -0.02 0.13
-0.68 -0.35 0.11 0.24 0.21 0.22 0.15 0.13 0.17 -0.0 -0.18 -0.31
-0.43 -0.43 -0.04 0.06 0.16 0.13 0.26 0.19 0.15 0.08 -0.07 -0.27
-0.43 -0.34 0.0 0.09 0.27 0.16 0.14 0.17 0.1 -0.08 -0.2 -0.07
-0.67 -0.38 -0.08 -0.0 0.37 0.3 0.18 0.08 0.11 0.22 -0.07 -0.43
-0.44 -0.26 0.0 0.12 0.2 0.13 0.11 0.07 0.19 0.1 -0.13 -0.24
-0.68 -1.21 -0.71 -0.38 0.39 0.54 0.55 0.42 0.26 0.09 -0.05 -0.39
-0.41 -0.27 -0.08 0.05 0.19 0.12 0.1 0.06 0.2 0.06 -0.11 -0.03
-0.66 -0.48 -0.03 0.22 0.25 0.23 0.22 0.2 0.21 -0.01 -0.15 -0.34
-0.56 -0.28 0.03 0.04 0.15 0.04 0.24 0.09 0.13 0.1 0.03 -0.19
-0.64 -0.62 -0.09 0.35 0.31 0.4 0.21 0.1 0.12 0.02 -0.22 -0.44
-1.08 -0.71 -0.09 0.24 0.32 0.36 0.21 0.1 0.18 0.15 -0.13 -0.19
-0.63 -0.8 -0.49 0.17 0.46 0.62 0.4 0.19 -0.01 -0.24 -0.25 -0.16
-0.32 -0.31 0.02 -0.01 0.18 0.1 0.11 0.18 0.16 0.01 -0.03 -0.2
-1.48 -1.25 -0.41 0.05 0.45 0.45 0.42 0.24 0.39 0.21 -0.12 -0.32
-0.63 -0.52 -0.03 0.17 0.38 0.29 0.28 0.23 0.09 -0.19 -0.13 -0.34
-0.41 -0.27 0.03 0.06 0.13 0.17 0.18 0.14 0.08 0.02 -0.12 -0.14
-4.64 -4.87 -3.18 -0.98 0.52 1.04 0.87 0.47 0.75 0.61 -0.09 -1.12
-1.8 -1.31 -0.35 0.21 0.56 0.31 0.3 0.03 0.38 0.25 0.04 -0.18
-1.03 -0.69 -0.11 0.07 0.32 0.22 0.23 0.05 0.34 0.21 -0.05 -0.16
-0.77 -0.54 -0.01 0.27 0.4 0.23 0.09 0.07 0.13 -0.02 -0.08 -0.16
-0.57 -0.95 -0.46 -0.21 0.42 0.53 0.49 0.36 0.13 0.04 -0.23 -0.37
-0.71 -1.5 -1.3 -0.65 0.35 0.62 0.66 0.3 0.31 0.21 -0.05 0.0
-0.47 -0.36 -0.08 0.17 0.1 0.21 0.29 0.16 0.05 -0.09 0.12 -0.32
-0.49 -0.37 -0.01 0.16 0.3 0.17 0.2 -0.01 0.14 0.03 -0.12 -0.2
-1.08 -0.72 -0.21 0.07 0.4 0.41 0.53 0.22 0.17 -0.06 -0.29 -0.26
-1.22 -0.3 0.06 0.15 0.25 0.2 0.35 0.13 0.2 0.03 -0.01 -0.43
-0.75 -0.35 0.03 0.25 0.15 0.19 0.1 0.04 0.18 0.09 -0.05 -0.15
-0.51 -0.29 0.25 0.36 0.36 0.06 0.11 -0.21 0.14 -0.04 -0.17 -0.35
-0.63 -0.38 0.02 0.11 0.26 0.18 0.13 0.15 0.17 0.03 -0.14 -0.15
-0.96 -0.42 0.11 0.35 0.3 0.24 0.16 0.02 0.08 -0.01 -0.07 -0.23
-0.22 -0.34 -0.04 0.0 0.18 0.16 0.06 0.1 0.05 0.03 -0.05 -0.02
-0.82 -0.36 0.02 0.14 0.14 0.1 0.11 0.1 0.21 0.15 0.01 -0.1
-0.98 -0.83 -0.27 0.29 0.53 0.45 0.21 -0.01 0.2 0.21 -0.17 -0.45
-1.4 -1.2 -0.39 0.03 0.52 0.51 0.39 0.27 0.26 0.11 -0.17 -0.22
-0.62 -0.52 0.06 0.15 0.41 0.31 0.23 0.2 0.15 -0.04 -0.33 -0.45
-0.78 -0.51 -0.07 0.03 0.21 0.18 0.28 0.21 0.16 0.11 0.02 -0.19
-2.7 -2.28 -0.51 0.42 0.97 0.62 0.26 0.14 0.12 0.16 -0.13 -0.54
-0.86 -0.66 -0.17 0.13 0.4 0.31 0.26 0.19 0.22 0.05 -0.24 -0.18
-1.48 -1.38 -0.39 0.45 0.72 0.51 0.45 0.16 0.53 0.05 -0.61 -1.21
-1.4 -0.59 -0.05 0.17 0.17 0.21 0.18 0.17 0.09 0.34 0.09 -0.1
-1.44 -0.82 0.03 0.36 0.29 0.26 0.09 0.26 0.5 0.22 -0.3 -0.55
-1.3 -0.8 -0.02 0.33 0.51 0.28 0.05 -0.05 0.07 0.07 0.11 -0.07
-0.59 -0.81 -0.43 -0.02 0.32 0.45 0.25 0.08 0.18 0.17 0.04 -0.15
-1.88 -2.28 -1.45 -0.59 0.75 0.87 0.8 0.47 0.39 0.13 -0.34 -0.58
-0.89 -0.62 0.05 0.35 0.31 0.15 0.15 0.27 0.15 -0.08 -0.04 -0.3
-0.62 -0.28 0.08 0.18 0.14 0.11 0.08 0.04 0.1 0.07 -0.04 -0.03
-0.52 -0.52 -0.5 -0.26 0.38 0.54 0.33 0.26 0.03 0.13 -0.07 -0.34

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.