Heatmap: Cluster_18 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	13 h after light	15 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark
Pp1s100_198V6	0.27	-0.21	0.16	0.52	0.5	0.41	0.21	0.02	-0.34	-0.93	-0.96	-0.64
Pp1s100_200V6	0.64	0.32	0.16	0.44	0.26	0.35	0.1	0.06	-0.38	-1.28	-0.97	-1.17
Pp1s100_202V6	0.59	0.23	0.57	0.53	0.28	-0.03	0.19	0.11	-0.34	-1.16	-1.15	-1.72
Pp1s105_249V6	-4.74	-2.58	0.12	0.8	1.46	1.25	-0.14	0.48	-1.12	-1.24	-1.86	-1.42
Pp1s107_77V6	0.14	0.41	0.35	0.28	-0.02	-0.0	0.01	0.22	-0.31	-0.4	-0.51	-0.61
Pp1s109_70V6	0.32	0.22	0.12	0.01	0.01	-0.05	0.03	0.17	-0.12	-0.24	-0.27	-0.37
Pp1s112_141V6	0.04	0.09	0.19	0.27	0.1	0.09	0.04	0.16	-0.15	-0.38	-0.23	-0.38
Pp1s114_54V6	0.3	0.17	0.07	0.01	-0.02	-0.23	0.14	0.14	-0.02	-0.22	-0.23	-0.25
Pp1s114_57V6	-0.56	-1.9	-0.43	0.57	1.17	0.78	0.35	0.52	-0.24	-1.03	-1.19	-1.43
Pp1s116_100V6	0.12	0.06	0.19	0.16	-0.02	0.0	-0.03	0.11	-0.09	-0.07	-0.11	-0.39
Pp1s121_11V6	0.34	-0.13	-0.01	0.09	0.01	0.02	0.03	0.08	-0.08	-0.12	-0.11	-0.21
Pp1s121_71V6	0.02	-0.04	0.06	0.16	0.07	0.11	0.07	-0.0	-0.04	-0.11	-0.21	-0.13
Pp1s123_2V6	0.75	0.09	-0.09	0.02	0.01	0.14	0.1	0.02	-0.25	-0.54	-0.4	-0.27
Pp1s125_63V6	0.16	-0.05	0.01	0.24	0.15	0.22	0.05	0.05	-0.15	-0.28	-0.25	-0.3
Pp1s128_141V6	-0.05	0.07	0.06	0.09	0.11	0.14	-0.0	0.08	-0.1	-0.08	-0.14	-0.22
Pp1s12_262V6	0.15	0.17	0.22	0.32	-0.06	0.01	0.19	0.14	-0.18	-0.23	-0.43	-0.58
Pp1s130_79V6	-0.04	0.05	0.18	0.08	0.2	0.18	0.3	0.13	-0.02	-0.4	-0.5	-0.43
Pp1s136_27V6	0.15	-0.14	-0.0	0.03	0.19	0.23	0.2	0.17	-0.14	-0.26	-0.37	-0.24
Pp1s136_9V6	0.45	0.22	0.1	0.03	-0.06	-0.02	0.02	0.11	-0.07	-0.23	-0.27	-0.51
Pp1s137_199V6	0.09	0.02	0.11	0.13	0.16	-0.11	0.02	-0.04	0.1	-0.02	-0.24	-0.31
Pp1s144_158V6	0.05	-0.01	0.02	0.05	-0.0	0.11	0.03	0.12	-0.03	-0.11	-0.08	-0.18
Pp1s145_47V6	0.26	0.19	0.29	0.18	0.08	-0.36	0.27	0.35	-0.03	-0.24	-0.88	-0.67
Pp1s146_117V6	0.75	0.08	0.58	0.42	-0.06	0.25	0.3	0.29	-0.38	-1.23	-1.14	-2.57
Pp1s14_277V6	-0.16	0.08	0.41	0.29	0.24	0.21	0.12	0.25	-0.14	-0.37	-0.56	-0.92
Pp1s152_140V6	0.27	0.12	-0.01	0.16	0.06	0.12	0.12	0.17	-0.06	-0.18	-0.42	-0.61
Pp1s158_160V6	-0.06	-0.17	0.01	0.1	0.34	0.44	0.42	0.32	-0.09	-0.56	-0.65	-0.71
Pp1s159_5V6	0.08	0.1	0.14	0.05	0.08	0.08	0.12	0.17	-0.13	-0.33	-0.24	-0.23
Pp1s15_232V6	-0.25	0.09	0.29	0.06	0.23	-0.03	0.18	0.04	-0.03	-0.12	-0.23	-0.4
Pp1s15_417V6	-0.26	-0.23	-0.12	0.0	0.12	0.1	0.17	0.25	0.07	0.09	-0.1	-0.2
Pp1s160_137V6	-0.09	-0.07	-0.11	-0.08	0.12	0.13	0.15	0.11	-0.01	-0.05	-0.07	-0.06
Pp1s168_71V6	0.4	0.17	0.37	0.29	0.02	-0.24	-0.11	-0.08	-0.19	-0.32	-0.16	-0.42
Pp1s173_101V6	0.27	0.24	0.16	0.08	0.15	0.17	0.08	0.19	-0.11	-0.42	-0.52	-0.64
Pp1s177_46V6	0.09	-0.06	-0.0	0.19	0.33	0.18	0.17	0.2	-0.08	-0.25	-0.57	-0.49
Pp1s17_63V6	0.09	0.24	0.35	0.32	0.08	0.06	-0.18	0.17	-0.08	-0.41	-0.59	-0.38
Pp1s17_86V6	-0.09	-0.07	0.07	0.22	0.19	0.38	0.44	0.2	-0.32	-0.45	-0.56	-0.44
Pp1s184_42V6	0.07	-0.1	-0.01	0.26	0.15	0.06	0.12	0.28	-0.07	-0.25	-0.33	-0.35
Pp1s18_283V6	0.02	0.06	0.14	0.02	0.15	0.12	-0.08	0.04	-0.0	-0.22	-0.2	-0.12
Pp1s18_3V6	-0.39	0.53	0.22	0.02	0.14	0.22	0.34	0.53	-0.44	-0.52	-0.65	-0.85
Pp1s192_46V6	-0.07	-0.1	0.01	0.12	0.19	0.11	0.12	0.14	0.04	-0.08	-0.23	-0.35
Pp1s198_9V6	0.03	-0.43	-0.15	0.19	0.46	0.49	0.47	0.32	-0.07	-0.59	-0.72	-0.82
Pp1s199_72V6	-0.84	0.29	0.59	0.56	0.45	0.28	0.19	0.38	-0.5	-0.72	-0.92	-1.42
Pp1s19_293V6	-0.01	0.04	0.14	0.26	0.13	-0.03	0.07	0.04	0.0	-0.15	-0.38	-0.24
Pp1s1_782V6	0.37	0.2	0.38	0.42	0.1	0.11	0.23	0.28	-0.25	-0.75	-0.92	-1.31
Pp1s20_129V6	0.29	0.2	0.12	0.08	0.24	-0.78	0.21	0.5	-0.15	-0.9	0.06	-0.54
Pp1s20_346V6	0.33	0.09	-0.08	0.03	0.2	0.23	0.3	0.25	-0.24	-0.3	-0.55	-0.65
Pp1s211_74V6	0.29	0.28	0.16	-0.05	0.02	-0.04	0.18	0.31	0.1	-0.39	-0.63	-0.63
Pp1s214_65V6	-0.22	-0.16	0.12	0.13	0.28	0.11	0.16	0.09	0.06	-0.1	-0.39	-0.24
Pp1s214_75V6	-0.07	-0.03	0.04	0.13	0.19	0.15	0.31	0.21	0.1	-0.28	-0.44	-0.58
Pp1s222_99V6	-0.28	-0.11	-0.09	-0.02	0.14	0.33	0.38	0.48	-0.05	-0.16	-0.39	-0.61
Pp1s225_68V6	0.09	0.1	0.17	0.14	0.08	0.04	0.05	-0.0	-0.1	-0.08	-0.2	-0.37
Pp1s227_136V6	0.41	0.61	-0.1	-0.24	0.02	0.04	0.34	0.29	-0.58	-0.57	-0.47	-0.38
Pp1s22_56V6	-0.14	-0.46	0.13	0.57	0.53	0.29	0.22	0.47	-0.11	-0.68	-0.89	-1.06
Pp1s23_225V6	0.08	0.02	0.13	0.26	0.13	0.08	0.03	0.19	-0.08	-0.25	-0.29	-0.47
Pp1s23_96V6	0.3	-1.59	-0.65	0.18	0.95	0.71	0.8	0.7	-0.06	-1.42	-2.66	-2.01
Pp1s243_67V6	-0.07	0.01	-0.07	-0.04	0.02	0.07	0.08	0.08	0.04	-0.04	-0.05	-0.04
Pp1s248_77V6	0.75	-0.19	-0.21	0.12	-0.21	-0.06	0.26	0.16	-0.08	-0.38	-0.46	-0.13
Pp1s24_14V6	-0.21	0.81	0.69	0.21	0.32	0.01	0.27	0.27	-0.69	-1.7	-0.94	-1.04
Pp1s251_36V6	-0.12	-0.1	0.03	0.13	0.1	0.2	0.1	0.19	0.07	-0.15	-0.24	-0.33
Pp1s25_296V6	-0.01	-0.03	0.12	0.03	0.1	0.09	0.08	0.1	-0.02	-0.13	-0.24	-0.15
Pp1s276_72V6	0.34	0.15	0.44	0.43	0.12	-0.09	0.19	0.51	-0.28	-0.84	-0.7	-1.57
Pp1s27_171V6	-0.09	0.02	0.15	0.14	0.14	0.16	-0.02	0.11	0.03	-0.12	-0.26	-0.34
Pp1s286_22V6	0.11	0.38	0.48	-0.01	0.07	0.17	-0.08	0.29	-0.2	-0.2	-0.95	-0.64
Pp1s299_51V6	-0.37	0.21	0.25	0.32	0.32	0.2	0.2	0.13	-0.24	-0.34	-0.38	-0.77
Pp1s299_53V6	-0.23	0.12	0.24	0.36	0.22	0.16	0.07	0.01	-0.19	-0.33	-0.36	-0.33
Pp1s2_383V6	0.31	0.13	0.21	0.03	0.13	0.05	0.06	-0.02	-0.11	-0.27	-0.45	-0.25
Pp1s300_28V6	0.13	0.15	0.23	0.16	0.02	0.13	-0.09	0.06	-0.2	-0.26	-0.28	-0.17
Pp1s300_6V6	0.82	0.45	0.31	0.09	-0.03	-0.02	-0.03	-0.03	-0.23	-0.7	-0.61	-0.95
Pp1s30_175V6	0.49	0.05	0.07	0.18	0.2	0.36	0.37	0.18	-0.37	-0.92	-0.74	-0.7
Pp1s30_342V6	-0.03	-0.01	0.12	0.17	0.34	0.29	0.43	0.24	-0.17	-0.61	-0.62	-0.74
Pp1s310_4V6	0.09	-0.03	-0.09	-0.02	0.03	-0.05	0.08	0.08	0.06	-0.06	-0.06	-0.04
Pp1s310_52V6	-0.1	0.04	0.08	0.16	0.02	0.05	0.06	0.03	-0.0	-0.11	-0.17	-0.1
Pp1s31_335V6	-0.47	-0.27	-0.37	-0.16	0.28	0.44	0.28	0.21	0.06	-0.01	-0.01	-0.29
Pp1s31_351V6	-0.24	0.06	0.09	0.12	0.09	0.02	0.13	0.03	-0.02	-0.05	-0.17	-0.12
Pp1s33_139V6	0.12	0.21	0.11	0.34	0.11	-0.08	0.21	0.32	-0.05	-0.32	-0.7	-0.74
Pp1s341_67V6	-0.13	0.12	0.21	0.06	0.02	0.06	0.1	0.01	0.01	-0.13	-0.14	-0.25
Pp1s346_22V6	-0.03	0.08	0.11	0.13	0.03	-0.01	0.01	0.11	-0.02	-0.11	-0.11	-0.23
Pp1s347_12V6	0.28	0.22	0.17	0.21	0.03	-0.09	-0.03	-0.01	-0.16	-0.24	-0.21	-0.31
Pp1s347_37V6	0.43	0.03	0.41	0.43	0.33	0.05	0.36	0.48	-0.16	-1.11	-1.57	-1.79
Pp1s35_328V6	0.05	0.22	0.2	0.05	0.11	0.16	-0.0	0.18	-0.08	-0.28	-0.37	-0.42
Pp1s36_263V6	0.24	0.14	0.19	0.2	0.04	0.01	-0.04	0.12	-0.08	-0.2	-0.36	-0.43
Pp1s376_9V6	0.12	0.12	0.23	0.15	0.12	0.06	0.12	0.08	-0.19	-0.22	-0.44	-0.33
Pp1s39_104V6	0.01	0.19	0.06	-0.01	0.06	0.0	0.13	0.27	-0.16	-0.23	-0.19	-0.25
Pp1s412_38V6	0.1	-0.11	0.11	0.32	0.58	0.51	0.44	0.4	0.05	-1.08	-1.58	-2.08
Pp1s438_15V6	0.52	-0.07	0.01	-0.22	0.29	0.29	0.29	0.36	-0.02	-0.52	-0.68	-1.02
Pp1s444_4V6	0.26	-0.06	-0.11	0.02	0.2	0.04	0.09	0.15	0.05	-0.24	-0.25	-0.26
Pp1s45_155V6	-0.08	-0.01	0.26	0.31	0.08	0.11	0.07	0.22	-0.07	-0.43	-0.39	-0.3
Pp1s45_67V6	0.11	0.15	0.1	-0.0	0.06	0.09	0.01	0.17	0.07	-0.15	-0.26	-0.48
Pp1s49_34V6	0.88	0.46	0.55	0.2	0.19	0.04	0.08	0.38	-0.41	-1.37	-1.73	-2.38
Pp1s4_134V6	0.28	0.18	0.09	0.05	0.04	-0.02	0.12	0.18	-0.1	-0.22	-0.32	-0.45
Pp1s4_432V6	0.2	-0.63	-0.14	0.31	0.55	0.52	0.45	0.26	-0.36	-0.7	-0.82	-0.63
Pp1s53_215V6	-0.32	0.0	-0.02	-0.09	0.13	0.07	0.33	0.24	0.0	-0.07	-0.18	-0.23
Pp1s54_246V6	-0.54	-0.24	0.17	0.41	0.33	0.58	0.47	0.61	-0.21	-0.7	-0.91	-1.54
Pp1s54_91V6	0.87	-0.55	-0.56	0.08	0.6	0.25	0.32	0.46	-0.55	-0.98	-0.86	-0.55
Pp1s5_404V6	-0.24	-0.03	0.13	0.13	0.16	0.17	0.07	0.07	-0.1	-0.14	-0.07	-0.25
Pp1s61_5V6	0.32	0.18	0.08	-0.01	-0.03	-0.07	0.2	0.18	-0.02	-0.22	-0.29	-0.5
Pp1s62_162V6	0.1	0.01	0.17	0.13	0.17	0.17	0.16	0.26	-0.07	-0.36	-0.42	-0.59
Pp1s63_179V6	-0.01	0.22	0.38	0.24	0.15	0.06	0.19	0.09	-0.0	-0.34	-0.62	-0.83
Pp1s64_184V6	-0.16	0.08	0.08	-0.06	0.17	0.04	0.22	0.17	-0.06	-0.21	-0.19	-0.17
Pp1s64_37V6	0.42	0.19	0.16	0.06	-0.0	-0.03	0.02	0.19	-0.03	-0.27	-0.36	-0.65
Pp1s663_3V6	0.49	-0.06	-0.05	-0.06	0.04	0.09	0.14	0.02	-0.11	-0.24	-0.16	-0.24
Pp1s66_193V6	0.25	-0.02	0.08	-0.02	0.16	0.03	0.14	0.29	-0.06	-0.42	-0.35	-0.27
Pp1s66_87V6	-0.04	0.06	0.2	-0.05	0.14	0.23	0.01	0.35	-0.27	-0.17	-0.19	-0.47
Pp1s68_190V6	-0.47	-0.11	-0.1	0.04	0.29	0.24	0.11	0.33	0.02	-0.08	-0.18	-0.27
Pp1s69_113V6	0.19	0.02	0.17	0.16	0.25	0.06	0.02	-0.04	-0.17	-0.2	-0.26	-0.33
Pp1s6_446V6	0.09	0.28	0.13	0.26	0.09	-0.1	0.02	0.08	-0.13	-0.16	-0.41	-0.31
Pp1s72_227V6	0.16	-0.04	0.12	0.08	-0.05	-0.07	0.07	0.31	0.02	-0.16	-0.25	-0.32
Pp1s74_258V6	0.44	0.2	0.33	0.05	-0.03	-0.05	-0.16	0.18	-0.42	-0.39	-0.3	-0.13
Pp1s74_64V6	-0.38	-0.21	0.15	-0.15	0.1	0.05	0.2	0.15	0.03	0.07	-0.05	-0.07
Pp1s76_119V6	0.11	0.3	0.56	0.29	0.41	0.23	0.38	0.1	-0.53	-0.84	-1.39	-1.05
Pp1s81_131V6	-0.05	0.49	0.47	0.44	0.43	0.32	0.25	0.24	0.05	-0.88	-2.43	-2.63
Pp1s84_82V6	0.52	-0.13	-0.25	0.04	0.06	0.09	0.16	-0.13	0.04	-0.11	-0.27	-0.21
Pp1s85_111V6	0.7	0.22	0.44	0.38	0.11	-0.18	-0.2	-0.22	-0.42	-0.59	-0.45	-0.46
Pp1s86_160V6	0.03	-0.16	0.07	0.01	0.15	0.02	0.17	0.05	-0.06	-0.1	-0.17	-0.05
Pp1s89_265V6	0.2	0.15	0.22	0.08	0.12	0.04	0.2	0.14	-0.18	-0.39	-0.36	-0.45
Pp1s8_146V6	0.12	0.03	0.08	0.17	0.12	0.01	0.06	0.14	0.11	-0.25	-0.28	-0.46
Pp1s8_277V6	-0.37	0.46	-0.07	0.19	0.63	0.25	0.68	0.25	-0.66	-1.03	-0.76	-0.9
Pp1s90_78V6	0.14	0.21	0.48	0.28	0.26	0.36	0.15	0.38	-0.36	-0.65	-1.0	-1.58
Pp1s91_181V6	0.24	0.22	0.15	0.11	0.02	0.06	0.11	0.17	-0.11	-0.29	-0.52	-0.37
Pp1s93_117V6	0.06	0.04	0.26	0.4	0.25	0.12	0.1	0.05	-0.11	-0.37	-0.53	-0.65
Pp1s98_14V6	-0.1	-0.08	0.05	0.21	0.17	0.14	0.03	-0.0	0.14	-0.25	-0.14	-0.27
Pp1s98_2V6	-0.4	-0.05	0.29	0.12	0.23	0.2	0.26	0.3	-0.15	-0.34	-0.38	-0.42

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.