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Heatmap: Cluster_193 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.39 -0.43 -0.24 -0.45 0.11 0.34 -1.48 0.77 -0.46 0.09 0.31 -0.1
0.05 0.01 -0.07 -0.03 -0.08 0.0 0.04 0.15 0.02 -0.1 0.0 -0.01
-0.06 0.11 0.41 -0.5 0.11 -0.75 -0.16 -0.04 0.2 0.02 0.3 -0.02
-0.03 -0.02 -0.51 -0.86 0.32 -1.97 0.23 0.23 0.47 -0.11 -0.75 1.02
-0.01 0.07 -0.06 -0.05 -0.04 -0.05 0.08 0.09 0.04 -0.08 -0.02 0.02
0.24 0.09 0.02 -0.04 -0.08 -0.17 -0.16 -0.11 0.15 -0.02 0.02 -0.01
0.12 -0.02 -0.12 -0.14 -0.05 -0.2 0.1 0.08 0.1 -0.0 0.06 0.02
0.09 -0.06 0.05 -0.22 0.15 -0.1 0.17 0.01 0.1 -0.04 -0.06 -0.15
0.18 0.02 -0.13 -0.23 -0.06 -0.08 0.05 0.18 0.02 0.01 -0.01 0.0
0.25 0.13 -0.01 -0.2 -0.12 -0.12 -0.1 -0.04 0.03 0.0 0.03 0.1
0.22 0.13 0.04 0.03 0.0 -0.37 -0.14 -0.2 -0.02 -0.03 0.09 0.15
0.83 -0.33 0.89 - -0.07 -1.42 -0.1 0.3 0.63 -0.47 0.03 -0.36
0.07 0.11 0.04 -0.04 0.02 -0.16 -0.07 -0.14 -0.03 0.08 0.03 0.06
-3.03 -0.41 -0.9 -1.51 0.54 -0.98 0.08 0.78 0.39 -0.46 -0.15 1.36
0.2 0.54 0.16 -2.11 -0.42 -0.39 0.07 0.07 0.65 -1.45 1.27 -3.46
-0.01 0.01 0.08 -0.06 -0.02 -0.22 -0.03 0.08 -0.04 0.05 0.07 0.05
0.2 -0.05 -0.24 -0.18 -0.19 -0.15 0.03 0.01 -0.12 0.17 0.36 0.04
- 0.11 -0.25 -0.2 0.12 -0.24 -0.08 -0.3 0.33 0.5 0.62 0.4
-0.19 -0.18 0.17 -0.04 -0.19 0.01 -0.17 0.09 0.27 0.33 0.08 -0.35
0.21 -1.27 0.56 -1.16 -0.32 -1.24 -1.03 1.1 -0.92 -0.85 0.39 1.17
-0.15 0.15 0.51 -1.22 0.45 -0.79 0.45 -0.16 0.38 - 1.19 -1.51
0.06 -0.01 -0.02 -0.18 0.01 -0.26 -0.01 0.12 -0.05 0.13 0.14 0.02
0.35 0.03 -0.16 -0.16 -0.09 -0.1 -0.05 -0.02 0.03 0.06 -0.01 0.04
0.17 -0.06 0.11 -0.16 -0.07 -0.16 -0.08 0.04 0.09 0.0 -0.06 0.12
0.13 0.1 0.26 -0.18 -0.1 -0.25 -0.09 -0.1 0.0 0.06 0.04 0.05
0.19 -0.87 1.53 -0.71 -3.0 - -2.98 0.88 0.32 -3.09 0.02 1.24
0.07 0.05 0.23 -0.02 -0.04 -0.19 -0.05 0.06 -0.09 -0.02 -0.03 -0.0
-0.5 0.17 0.89 -0.72 0.32 -0.4 0.89 -0.07 -0.23 -0.3 -1.36 -0.24
2.57 - 0.95 - - - 1.11 - - 0.97 - -
0.27 0.14 -0.01 -0.65 -0.3 -0.7 0.12 0.35 -0.22 0.36 0.14 0.06
0.14 0.06 -0.0 -0.23 -0.19 -0.17 -0.0 0.09 0.08 0.02 0.03 0.11
0.29 0.28 0.03 -0.89 0.17 -0.67 -0.02 -0.11 0.54 -0.16 0.28 -0.4
-0.11 -0.05 0.1 -0.1 0.0 -0.07 0.12 -0.03 0.03 0.02 0.38 -0.4
0.08 0.16 0.05 -0.01 -0.24 -0.36 -0.11 -0.06 0.23 0.08 0.08 0.0
0.11 -0.02 -0.01 -0.11 -0.1 -0.18 0.03 0.01 -0.06 0.07 0.17 0.04
-2.4 -0.08 0.55 -1.18 0.95 -0.92 0.44 0.16 0.41 0.47 0.05 -1.91
-0.01 0.09 -0.05 -0.05 0.01 -0.07 0.08 0.14 -0.0 -0.14 -0.02 0.01
0.49 0.03 -0.82 -0.4 -0.02 -0.22 0.04 0.0 0.14 0.42 0.04 -0.14
-0.63 0.28 0.74 -1.33 0.46 -1.32 0.58 -0.23 0.47 -0.94 0.45 -0.58
0.52 0.22 0.12 -0.33 -0.23 -0.27 -0.08 0.34 -0.13 -0.18 -0.17 -0.08
-0.04 -0.11 -0.16 -0.17 -0.05 -0.19 0.1 0.03 0.15 0.08 0.08 0.21
0.23 0.04 0.01 -0.08 -0.26 -0.2 -0.06 -0.04 -0.03 0.18 0.12 0.02
0.41 0.12 0.02 0.02 -0.15 -0.09 -0.03 0.19 -0.01 -0.28 -0.29 -0.06
0.27 -0.08 0.13 -0.16 -0.23 -0.24 -0.04 0.16 0.16 0.05 -0.09 -0.04
-0.9 - 0.89 - -1.4 - -0.16 0.74 1.02 1.0 - 1.4
0.13 0.27 0.38 -0.2 0.07 -0.26 -0.11 0.03 -0.38 -0.01 -0.11 0.02
0.26 -0.06 -0.11 -0.07 -0.16 -0.14 -0.05 0.07 -0.04 0.07 0.11 0.06
0.02 0.08 0.13 0.06 0.02 -0.0 -0.12 0.05 -0.02 -0.07 -0.06 -0.09
- 0.67 -0.29 -0.32 0.36 -2.64 0.23 -0.01 1.1 -2.97 1.54 -
0.09 0.2 0.17 -0.07 0.08 -0.09 -0.18 -0.01 -0.13 -0.16 -0.06 0.1
0.03 0.16 -0.08 -0.24 -0.25 -0.07 0.2 -0.01 0.13 -0.15 0.13 0.06
0.18 -0.39 0.26 -0.43 -0.33 -1.47 0.15 0.56 0.19 0.5 -0.43 0.18
0.22 0.16 0.17 -0.89 -0.05 -0.58 0.17 0.03 0.06 0.2 0.11 0.0
-0.31 -0.27 -0.09 0.03 -0.16 0.12 -0.09 0.27 0.18 -0.13 0.2 0.12
-0.34 -0.04 -0.06 0.06 0.1 -0.33 -0.13 0.07 0.04 0.16 0.18 0.17
0.11 -0.03 -0.06 -0.09 -0.02 -0.08 0.03 0.0 0.05 -0.01 0.11 -0.03
0.24 -0.2 -0.01 0.02 -0.16 -0.35 -0.01 0.11 -0.1 0.14 0.18 0.03
0.1 -0.03 0.17 0.11 0.21 -0.38 0.16 -0.07 -0.1 -0.09 0.11 -0.32
0.73 0.67 0.02 -0.55 0.05 -0.76 -1.0 0.24 -0.5 -0.42 0.38 -0.02
-0.88 -0.99 0.32 -3.78 -0.25 -1.7 0.98 -0.28 0.37 0.12 1.21 -0.01
0.49 -0.7 0.21 -0.49 -0.3 -0.69 0.28 0.07 0.27 -0.27 0.68 -0.36
0.13 0.09 0.1 0.04 0.01 -0.28 0.07 0.04 0.01 -0.01 -0.02 -0.24
0.78 -0.13 0.11 -0.42 0.18 -0.2 -0.14 -0.11 -0.42 0.27 0.17 -0.67
-0.0 0.04 0.11 -0.06 -0.24 -0.26 -0.04 -0.01 0.16 0.15 0.1 -0.0
0.43 -0.03 -0.1 -0.08 -0.15 -0.3 -0.08 -0.07 0.17 -0.03 0.04 0.08
0.13 -0.22 -0.2 -0.08 0.12 -0.37 0.03 0.06 0.08 0.05 0.17 0.13
-0.01 -0.13 0.06 -0.06 -0.04 -0.21 0.06 0.1 0.06 -0.08 0.06 0.14
0.3 0.33 0.14 -0.11 -0.11 -0.26 -0.18 0.13 -0.18 -0.29 -0.09 0.15
0.05 0.04 0.06 0.03 -0.13 -0.18 0.03 0.15 -0.01 -0.01 -0.01 -0.06
-1.71 0.07 0.54 -0.45 0.3 -0.82 -1.19 0.93 -0.89 0.21 0.57 0.19
0.03 0.29 0.22 0.1 -0.29 -0.41 -0.47 -0.02 0.13 -0.02 0.02 0.19
0.13 0.06 -0.07 -0.14 -0.07 -0.24 -0.0 0.08 0.15 0.1 0.02 -0.08
0.7 0.24 -0.28 -1.48 0.0 0.21 0.18 0.26 -0.64 0.15 -0.2 -0.15
-0.11 0.05 0.1 -0.07 -0.11 -0.16 0.01 -0.02 0.01 0.11 0.09 0.06
0.45 -0.05 0.14 -0.04 -0.21 -0.2 -0.23 -0.22 0.04 0.14 0.09 -0.05
0.06 0.02 0.09 -0.12 -0.09 -0.19 -0.01 -0.01 0.12 0.03 0.06 0.0
0.07 0.04 0.04 -0.15 -0.1 -0.2 0.0 0.06 0.12 -0.0 0.05 0.04
1.5 0.19 0.83 - - - 0.7 0.19 -0.06 0.76 -1.7 -0.94
0.06 0.03 0.15 -0.18 -0.05 -0.17 -0.03 -0.16 0.04 0.1 0.11 0.05
0.21 0.13 0.39 -0.34 0.08 -0.96 -0.14 0.22 -0.31 0.2 -0.02 0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.