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Heatmap: Cluster_118 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.25 0.36 0.24 -0.52 -0.44 -0.8 -0.68 -0.51 0.24 0.47 0.18 0.4
0.19 -0.02 -0.06 -0.21 -0.11 -0.35 -0.19 -0.18 0.09 0.15 0.18 0.35
-0.02 0.15 0.05 -0.34 -0.25 -0.2 -0.03 0.05 0.01 0.21 0.21 0.04
0.23 0.31 0.15 -0.12 -0.13 -0.24 -0.06 -0.21 0.09 0.04 -0.05 -0.13
0.28 -0.03 -0.12 -0.2 -0.06 -0.12 -0.11 -0.28 0.0 0.11 0.13 0.27
0.21 0.26 -0.01 -0.25 -0.21 -0.34 -0.28 -0.15 -0.05 -0.0 0.22 0.38
0.2 -0.16 0.1 -0.14 -0.16 -0.3 -0.23 -0.2 -0.04 0.22 0.25 0.28
0.09 0.08 -0.03 -0.18 -0.14 -0.16 -0.16 -0.23 -0.12 0.2 0.24 0.28
-0.21 -0.11 -0.32 -0.66 -0.29 -0.13 -0.07 -0.39 0.36 0.33 0.36 0.59
0.61 0.65 0.66 -0.35 -0.61 -1.52 -0.77 -0.38 -0.57 0.33 0.13 0.23
0.2 0.13 -0.05 -0.36 -0.15 -0.65 -0.38 -0.44 -0.14 0.24 0.46 0.59
0.05 0.12 0.02 -0.18 -0.12 -0.38 -0.13 -0.09 0.14 0.11 0.22 0.13
0.36 0.88 0.26 -1.19 -1.0 -1.08 -1.06 -0.27 -0.28 0.41 0.37 0.59
0.06 0.07 -0.02 -0.33 -0.24 -0.21 -0.05 0.07 0.01 0.14 0.19 0.19
0.22 0.04 -0.11 -0.28 -0.14 -0.45 -0.18 -0.15 -0.04 0.26 0.29 0.32
0.34 0.29 0.13 -0.26 -0.25 -0.58 -0.45 -0.69 0.03 0.3 0.19 0.42
0.47 0.45 -0.32 -0.84 -0.7 -0.39 -0.42 -0.31 0.15 0.16 0.32 0.57
0.23 0.01 -0.01 -0.19 0.01 -0.1 -0.19 -0.19 -0.16 0.01 0.19 0.27
0.15 0.12 0.07 -0.18 -0.19 -0.13 -0.19 -0.26 -0.14 0.09 0.19 0.33
1.04 0.56 -0.0 -0.11 -0.73 -0.2 -0.55 -0.19 -0.76 -0.75 -0.02 0.42
0.56 1.02 -0.51 -0.78 -1.4 -2.06 -0.33 -1.06 -0.46 0.69 1.13 -0.32
0.65 0.15 -0.22 -1.18 -1.23 -1.3 -0.47 -0.26 -0.18 0.92 0.72 0.27
0.42 -0.01 -0.16 -0.71 0.07 -0.43 -0.16 -0.18 0.19 0.27 0.31 0.01
0.24 0.12 -0.11 -0.12 -0.2 -0.4 -0.26 -0.2 0.02 0.13 0.29 0.29
0.14 0.03 0.13 -0.3 -0.14 -0.24 -0.04 0.06 0.11 0.05 -0.01 0.13
0.24 0.07 0.07 -0.73 -0.33 -0.33 -0.17 -0.11 0.19 0.32 0.26 0.17
0.26 0.24 -0.16 -0.32 -0.32 -0.31 -0.09 -0.16 -0.09 0.13 0.1 0.46
0.08 0.12 -0.13 -0.16 -0.07 -0.36 -0.08 -0.02 0.03 0.16 0.15 0.19
0.06 0.14 -0.0 -0.15 -0.19 -0.13 -0.19 -0.08 -0.09 0.03 0.19 0.32
-0.07 -0.1 -0.08 -0.1 0.04 -0.14 -0.08 -0.33 -0.1 0.15 0.2 0.46
0.15 -0.09 -0.01 -0.19 -0.05 -0.2 -0.04 0.04 0.07 0.08 0.01 0.18
0.42 0.52 0.43 -0.1 -0.32 -0.63 -0.3 -0.4 -0.29 -0.0 0.11 0.06
0.05 0.02 0.12 -0.37 -0.11 -0.47 -0.4 -0.02 -0.03 0.23 0.17 0.51
0.09 -0.02 -0.04 -0.21 -0.06 -0.12 -0.09 0.02 0.01 0.04 0.14 0.18
0.29 0.37 0.06 -0.48 -0.56 -0.68 -0.59 -0.59 -0.0 0.29 0.4 0.63
0.24 0.19 -0.07 -0.1 -0.25 -0.3 -0.3 -0.2 -0.17 0.09 0.24 0.4
0.14 -0.16 0.03 -0.41 0.07 -0.22 0.0 0.08 0.1 -0.02 -0.04 0.3
1.01 1.43 -0.64 - -1.78 -1.3 -2.38 -1.97 0.7 0.7 0.5 -0.23
0.23 0.27 -0.32 -0.88 -0.56 -0.33 -0.3 -0.43 0.34 0.41 0.37 0.44
0.22 0.13 -0.14 -0.17 -0.18 -0.27 -0.13 -0.1 0.01 0.12 0.22 0.16
0.17 0.01 0.03 -0.09 -0.14 -0.14 -0.13 -0.08 0.01 0.09 0.01 0.2
0.13 0.05 0.11 -0.23 -0.12 -0.22 -0.11 -0.16 0.1 0.17 0.08 0.11
0.22 0.1 -0.04 -0.22 -0.07 -0.26 -0.02 -0.19 -0.05 -0.03 0.13 0.31
0.05 0.03 -0.07 -0.27 -0.19 -0.14 -0.09 -0.18 -0.01 0.12 0.24 0.37
0.8 0.54 -0.05 0.02 -0.41 -0.56 -0.36 -0.14 -0.3 -0.14 -0.13 0.12
0.23 0.31 0.04 -0.14 -0.27 -0.3 -0.02 -0.09 -0.06 0.09 0.13 -0.06
0.33 -0.74 -0.3 -0.53 0.0 -1.14 -0.39 0.41 0.61 0.33 -1.16 0.9
0.22 0.29 0.08 -0.62 -0.51 -0.29 -0.17 0.04 0.09 0.24 0.17 0.14
0.24 0.11 -0.07 -0.12 -0.08 -0.18 -0.3 -0.35 -0.16 0.15 0.26 0.31
0.12 0.13 -0.05 -0.45 -0.31 -0.42 -0.12 -0.14 0.14 0.24 0.2 0.38
0.12 -0.03 -0.04 -0.16 -0.01 -0.21 -0.18 -0.14 0.02 0.11 0.24 0.2
0.26 0.18 -0.13 -0.12 -0.24 -0.35 -0.11 -0.15 0.01 0.06 0.22 0.21
0.29 0.48 0.17 -0.14 -0.12 -0.37 -0.1 -0.32 -0.21 -0.13 0.08 0.12
0.19 0.11 -0.17 -0.26 -0.17 -0.19 -0.22 -0.27 -0.0 0.22 0.26 0.31
0.05 0.19 0.13 -0.09 -0.09 -0.18 -0.1 -0.15 0.05 0.09 0.03 0.02
-0.07 0.09 0.16 -0.19 -0.09 -0.26 -0.09 0.03 0.09 0.04 0.08 0.15
0.44 0.08 0.08 -0.51 -0.22 -0.61 -0.62 -0.49 -0.19 0.33 0.38 0.59
0.24 0.18 0.18 -0.34 -0.31 -0.55 -0.42 -0.16 -0.0 0.24 0.2 0.37
0.07 0.35 0.34 -0.34 -0.23 -0.31 -0.33 0.01 -0.2 0.08 -0.18 0.44
0.28 0.06 -0.19 -0.16 -0.15 -0.1 -0.18 -0.37 -0.06 -0.01 0.31 0.37
0.68 0.54 0.53 0.1 -0.27 -1.44 -0.91 -0.66 -0.97 -0.05 0.17 0.54
0.3 0.14 0.04 -0.24 -0.23 -0.35 -0.24 -0.29 -0.0 0.18 0.2 0.27
0.56 0.4 -0.12 -0.11 -0.5 -0.47 -0.32 -0.1 0.18 0.12 0.02 -0.05
-0.05 -0.11 0.02 -0.19 -0.05 -0.18 -0.1 -0.23 0.0 0.22 0.26 0.29
0.43 0.27 0.1 -0.1 -0.19 -0.2 -0.02 -0.18 -0.31 -0.16 0.03 0.14
0.17 0.16 -0.15 -0.13 -0.13 -0.18 -0.09 -0.15 -0.06 0.1 0.19 0.18
0.02 0.06 -0.03 -0.16 -0.04 -0.18 -0.14 -0.21 -0.07 0.11 0.22 0.31
0.21 0.16 -0.13 -0.09 -0.1 -0.1 -0.08 -0.17 -0.06 -0.08 0.05 0.3
0.1 -0.08 0.1 -0.11 -0.12 -0.2 -0.29 -0.29 -0.03 0.16 0.27 0.33
0.38 0.12 -0.08 -0.12 -0.31 -0.43 -0.6 -0.44 0.13 0.12 0.3 0.47
0.25 0.31 0.15 -0.17 -0.3 -0.54 -0.34 -0.21 0.03 0.2 0.14 0.2
0.14 0.27 0.58 -0.57 -0.26 -0.57 -0.25 -0.41 -0.28 0.31 0.24 0.24
0.44 0.01 -0.18 0.17 -0.79 -0.77 -0.04 -0.61 0.54 -0.8 -0.61 1.1
0.34 0.21 0.09 -0.49 -0.34 -0.57 -0.23 -0.14 0.08 0.26 0.35 0.07
0.24 0.2 0.08 -0.18 -0.27 -0.35 -0.3 -0.21 -0.06 0.01 0.27 0.35

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.