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Heatmap: Cluster_89 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.23 -0.14 -0.48 0.32 -0.67 0.98 -0.51 0.13 -0.73 0.27 -0.16 0.23
0.05 0.09 -0.09 0.02 -0.13 0.26 -0.09 -0.01 -0.21 -0.17 -0.01 0.23
- 1.52 - 0.72 0.77 1.38 -0.9 -1.32 -0.37 -2.01 -0.65 -0.79
1.09 0.41 -0.03 -0.01 -0.61 0.46 -0.74 -0.47 -0.71 -0.21 -0.34 -0.07
0.62 -1.0 -0.47 -1.12 0.11 0.52 -0.31 0.37 0.04 -0.37 0.27 0.21
0.4 1.02 0.33 0.39 -1.0 0.55 0.05 -1.26 -0.78 -0.41 -0.61 -0.55
0.09 0.34 -0.2 -0.58 0.18 0.73 -0.73 0.43 0.34 -0.55 -0.78 -0.21
0.84 0.69 0.08 0.92 -0.53 0.59 -1.18 -0.7 -2.1 -1.89 -0.6 0.3
0.88 0.19 -0.12 0.02 0.02 0.9 -0.22 0.24 -1.42 -1.31 -1.46 0.03
1.76 0.93 - - -1.61 2.17 - - -0.5 -1.69 -1.03 -1.44
1.25 -0.48 0.33 -1.95 0.01 1.57 - - -2.73 0.89 -0.83 -0.25
1.57 -0.22 -0.64 - -0.39 1.94 -0.13 -1.85 -0.32 -2.33 -1.71 -1.16
0.07 0.12 0.04 -0.15 -0.15 0.18 -0.19 0.02 -0.07 0.07 0.01 -0.03
1.51 -0.1 -1.07 -2.35 -0.9 1.34 0.24 0.63 -2.55 -1.42 -0.57 -0.89
0.77 -1.6 1.01 -0.77 -0.97 1.21 -0.28 -0.16 -0.31 0.29 -0.7 -2.58
0.42 0.54 0.15 0.41 -0.74 0.5 -0.31 -0.23 -1.22 -0.37 -0.28 0.1
0.14 0.35 -0.09 0.02 -0.36 0.5 -0.14 -0.4 0.07 -0.09 -0.08 -0.2
0.3 0.08 0.04 -0.15 -0.17 0.11 -0.02 -0.02 -0.1 -0.1 -0.06 0.03
1.62 - -1.36 -0.17 0.67 1.33 - 1.29 -1.69 -2.87 - -0.62
0.52 0.99 0.81 -0.13 -1.41 0.96 -0.06 -0.09 -1.45 -2.39 - 0.17
2.08 0.87 -0.45 - - 1.6 -1.58 - - - 0.88 -
1.21 1.02 -0.69 0.49 -0.66 0.66 -0.49 -0.18 -1.22 -1.8 -1.88 -0.24
0.98 -0.25 0.14 0.32 0.2 1.05 0.47 -1.33 -1.29 -0.16 -2.0 -1.88
1.51 -0.25 -0.34 -0.39 -0.43 0.89 -0.77 -0.46 -0.85 0.09 -0.36 -1.17
0.21 -0.09 -0.2 -0.34 -0.31 0.41 -0.05 -0.22 -0.25 0.24 0.19 0.17
0.7 0.13 -0.13 0.23 -0.18 0.9 -0.06 -0.49 -0.98 -0.44 -0.38 -0.4
1.58 0.88 0.16 -1.07 0.08 0.3 -2.31 -0.05 -0.11 -1.04 -1.22 -1.81
0.53 -0.6 0.18 -0.32 -0.5 0.57 -0.91 0.56 0.01 0.04 0.21 -0.84
0.11 -0.07 -0.22 -0.36 0.11 0.26 0.1 -0.01 -0.07 -0.07 0.13 -0.03
1.78 -2.9 -0.47 -3.03 -0.86 1.78 -0.18 -0.05 -0.36 -0.69 -2.04 -3.15
0.24 0.25 0.11 0.17 -0.14 0.08 -0.09 -0.04 -0.14 -0.2 -0.29 -0.07
0.1 0.02 -0.14 -0.23 -0.13 0.15 0.04 -0.28 -0.14 0.1 0.22 0.19
0.1 0.02 -0.16 0.2 0.01 0.2 0.08 0.0 -0.0 0.02 -0.4 -0.17
- 2.03 0.25 0.24 -0.02 0.75 0.56 - -1.94 -0.85 -0.78 -
- 1.33 -1.71 0.25 -1.01 1.6 -2.22 1.28 - - 0.32 -0.8
- 1.25 -0.15 -0.22 -1.31 0.17 -0.57 -0.24 -0.56 0.54 0.7 0.08
-1.56 0.19 -0.62 -1.1 -0.05 1.15 -0.72 0.47 0.98 -0.53 0.14 -1.16
1.51 -0.78 -0.22 -1.6 -0.15 0.92 -0.93 -0.11 -0.27 -0.95 0.12 -0.52
1.49 0.02 -0.83 - 0.42 1.3 0.18 -3.07 -0.5 -1.02 0.34 -3.45
1.44 0.8 -0.11 0.42 0.09 0.12 -0.1 -0.78 -1.15 -1.28 -1.09 -1.82
- 2.91 - - - - 1.34 - - 0.97 - -
0.83 0.22 0.04 -0.83 0.2 0.57 -0.63 0.11 -0.67 -0.83 -0.21 0.09
0.67 0.8 -0.09 0.35 -0.28 0.19 -0.18 -0.11 -0.84 -0.69 -0.43 -0.4
- 2.3 -0.03 - - 2.34 -0.62 - -1.37 - - -
2.53 - - -0.17 - 1.2 1.23 - - -0.55 - -
0.36 -0.09 -0.21 -0.75 0.02 0.41 -0.02 0.13 -0.05 0.2 -0.08 -0.26
0.28 -0.0 -0.09 -0.16 -0.1 0.14 -0.07 -0.06 -0.05 0.1 -0.11 0.06
1.72 - -0.87 0.37 -0.08 1.79 0.07 -0.29 -1.73 -1.79 - -
0.4 0.2 -0.34 0.31 -0.85 1.08 -0.42 -0.12 -0.95 -0.37 -0.74 0.36
1.13 0.08 0.23 0.79 -0.34 -0.72 -0.46 -0.1 -1.07 -0.71 0.33 -1.15
0.41 0.85 -0.31 -0.24 -0.33 0.9 0.14 -0.51 -0.9 -0.92 -0.13 -0.38
0.24 -0.24 0.1 -0.34 -0.37 0.36 0.21 0.43 -0.0 -0.11 -0.03 -0.62
0.09 -0.16 -0.04 -0.11 -0.17 0.12 -0.12 0.06 -0.07 0.17 0.19 -0.03
0.19 -0.28 -0.28 -0.04 -0.09 0.59 0.01 -0.14 -0.14 0.02 -0.07 -0.0
0.34 0.64 -0.11 -0.11 -0.36 0.17 -0.13 -0.0 -0.55 -0.5 -0.03 0.19
1.0 -0.17 -0.18 -0.28 -0.32 0.35 -0.36 -0.44 -0.39 -0.15 0.32 -0.14
0.24 0.22 0.16 -0.09 -0.09 -0.07 -0.18 0.07 -0.15 -0.12 -0.11 0.01
0.1 0.52 -0.28 -0.99 -0.6 0.66 -0.83 0.32 -0.53 -0.34 0.39 0.4
-0.71 0.41 -0.29 -0.8 -0.59 1.02 -0.03 0.7 -0.38 -0.14 -0.07 -0.41
0.64 0.71 -1.08 0.25 0.23 1.25 -0.7 -0.92 -0.66 -0.96 -1.8 0.04
0.5 0.62 -2.76 -2.4 0.14 1.73 0.4 - - -0.29 0.67 -0.86
1.58 0.26 0.33 -1.48 0.41 -1.02 -0.71 -0.2 -0.8 0.29 -0.32 -1.71
- 1.46 - -0.69 -0.82 2.0 - -0.54 1.46 - -0.7 -
0.13 0.27 0.31 0.14 -0.43 0.26 -0.13 0.28 -0.45 -0.52 -0.29 0.08
0.12 0.09 0.03 -0.01 -0.03 0.02 -0.01 0.06 -0.07 -0.08 -0.09 -0.05
0.24 0.5 0.25 0.07 -0.06 0.53 -0.04 -0.14 -0.74 -0.67 -0.75 0.08
1.14 -0.03 1.01 -0.33 -1.31 0.6 -1.69 0.99 -1.57 -0.52 -1.51 -1.23
-0.04 -0.11 -0.08 -0.13 0.08 0.11 -0.08 -0.02 0.0 0.04 0.11 0.1
1.16 -0.28 0.43 0.37 0.08 0.81 -1.79 -0.76 -0.94 -0.51 -0.32 -0.74
0.09 0.42 -0.01 0.06 -0.05 0.28 -0.03 0.03 -0.25 -0.45 -0.28 -0.04
0.19 0.32 0.18 -0.08 -0.27 0.51 0.14 -0.12 -0.38 -0.26 -0.1 -0.47
0.76 -0.38 -0.49 -0.73 -0.27 0.78 -0.19 -0.52 -0.41 -0.11 0.18 0.36
0.21 0.13 -0.0 -0.14 -0.02 0.32 -0.02 -0.11 -0.38 -0.15 -0.02 0.06
0.12 0.15 0.13 0.06 -0.11 -0.02 -0.08 0.03 -0.04 -0.16 -0.17 0.04
0.9 -0.31 -0.11 0.13 -0.21 0.73 -0.97 -0.1 -0.18 -0.22 -0.15 -0.51
0.42 0.14 0.13 0.01 -0.07 0.03 -0.31 -0.03 -0.12 -0.16 -0.35 0.14
0.93 1.28 0.2 -0.51 -1.13 1.13 -0.35 -1.32 -1.08 -1.54 -1.12 -0.48
0.24 0.03 0.13 0.1 0.11 0.07 0.0 -0.01 -0.11 -0.32 -0.24 -0.09
- 1.98 -1.4 0.37 0.38 1.24 -0.92 -0.46 -1.95 -1.19 -0.67 -2.78
0.58 0.45 0.2 -0.72 -0.44 1.11 -1.24 0.24 -0.24 -1.84 -1.53 0.49
0.36 1.03 0.35 0.12 -1.16 0.33 -0.0 0.12 -1.32 -0.76 -0.68 -0.15
-0.02 0.22 0.14 0.07 -0.04 -0.05 -0.06 -0.06 -0.18 -0.11 0.05 -0.01
0.28 1.13 -0.1 -0.16 -0.11 0.5 0.76 -1.59 -0.71 -1.0 -1.77 -0.01
-0.77 1.27 -0.58 - 0.17 1.91 -1.93 -2.66 -0.66 0.23 -0.03 -2.01
1.17 -0.12 -0.08 -1.62 -0.31 0.59 -0.3 -1.12 -0.65 -0.28 0.63 -0.07
0.23 0.19 0.09 0.2 -0.13 0.04 0.12 0.14 -0.12 -0.46 -0.23 -0.23
0.67 1.35 0.38 0.33 -0.46 0.36 0.04 -0.33 -1.01 -0.61 -1.7 -
1.15 -0.03 0.45 0.19 -1.15 -0.15 0.02 0.96 -0.43 -0.98 -1.48 -1.46
0.43 0.27 0.4 0.31 -0.25 -0.14 -0.24 0.2 0.05 -0.41 -0.34 -0.81
0.26 0.11 0.09 0.11 -0.01 -0.08 -0.02 0.04 0.01 -0.25 -0.14 -0.18
0.55 -0.18 -1.07 -0.02 -0.5 1.39 -0.89 -0.68 -0.39 0.15 -0.08 -0.17
0.8 0.73 -0.19 -0.11 -0.5 1.54 -0.11 -0.41 -1.33 -1.37 -1.24 -1.76
0.58 -0.31 -0.08 -0.23 -0.84 1.29 -0.31 -0.11 -1.87 0.19 -0.55 0.09
1.28 -3.13 -1.47 0.17 0.36 1.38 -0.08 0.32 -0.65 -0.51 -0.86 -
1.29 1.27 -0.07 -0.14 -2.18 -0.22 -0.49 -0.23 -0.98 -0.52 0.07 -1.38
- 1.29 1.35 1.13 0.02 1.38 -1.21 -2.08 -1.46 -2.6 - -
0.79 0.39 -0.19 -0.42 -0.67 0.77 -0.53 -0.28 -0.92 -0.14 -0.02 0.08
0.57 0.29 -0.07 0.37 -0.22 0.47 -0.56 -0.21 -0.66 -0.37 -0.29 0.04
0.03 0.05 -0.0 -0.13 -0.05 0.18 -0.04 0.12 0.05 0.04 -0.04 -0.26
-0.31 0.73 0.14 0.74 -0.19 0.64 -1.1 -0.43 -1.75 -0.48 -0.94 0.67
-0.58 0.7 0.2 0.13 0.02 1.25 -0.65 -0.58 -0.05 -0.54 0.05 -3.92
-0.07 0.22 0.13 -0.09 -0.08 0.52 -0.13 -0.23 -0.64 -0.27 -0.37 0.53
0.1 0.04 -0.12 -0.06 -0.09 0.01 -0.09 0.08 -0.1 0.0 0.12 0.08
1.09 1.11 0.0 -0.32 -1.34 0.64 -1.08 0.24 -3.29 -1.31 0.15 -0.53
-0.36 0.74 -0.72 -2.17 -0.46 1.15 0.42 -0.38 0.06 -0.67 0.24 -0.31
1.51 0.12 -0.43 -1.67 -1.52 -0.06 -0.57 -0.61 -0.5 -0.47 0.47 0.64
-0.04 0.06 -0.33 -0.15 -0.14 0.13 -0.07 0.27 0.04 0.1 0.11 -0.08
0.03 0.05 -0.04 -0.15 -0.15 0.26 0.06 0.23 -0.01 -0.05 -0.17 -0.15
1.09 - - - -0.47 1.66 -0.6 1.44 -0.95 -1.28 -1.78 0.47
0.05 0.19 0.24 0.06 -0.19 0.04 0.08 0.09 -0.49 -0.26 -0.2 0.2
0.42 1.23 0.32 -0.62 -0.61 0.75 -0.08 -0.24 -0.39 -1.46 0.22 -
0.08 0.12 -0.11 -0.07 -0.07 0.15 -0.01 0.29 -0.35 -0.11 0.05 -0.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.