Heatmap: Cluster_125 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.0 0.02 -0.2 -0.16 -0.1 0.31 -0.21 0.11 -0.04 0.0 0.07 0.1
-1.05 0.03 1.24 0.05 -0.4 -0.24 -0.45 -0.8 -0.08 0.59 0.44 -1.41
0.08 1.04 -0.57 -0.5 -0.5 0.87 -0.91 -0.99 -0.07 0.22 0.37 -0.93
0.06 -0.22 0.02 0.01 -0.1 0.14 -0.12 0.18 0.2 0.0 -0.08 -0.16
0.09 -0.31 -0.41 -0.08 -0.57 0.26 -0.48 0.54 0.18 0.06 0.25 0.05
-0.35 0.06 -0.04 -0.04 -0.09 0.2 -0.07 -0.01 -0.1 0.12 0.29 -0.07
0.82 0.92 -3.48 -2.09 -0.95 0.81 -0.63 -0.35 0.17 0.88 -0.42 -0.71
- -0.91 -1.53 - 1.67 0.41 -0.43 1.01 1.34 -1.54 -0.03 -
0.06 0.29 -0.19 -0.93 0.1 0.16 -0.13 0.46 0.22 -0.16 -0.0 -0.33
0.04 0.06 -0.03 -0.07 -0.1 0.1 0.0 -0.07 0.15 0.06 0.01 -0.18
0.06 -0.39 0.01 -0.16 0.09 -0.0 0.17 0.57 0.19 -0.05 -0.12 -0.73
-0.24 -0.14 0.01 -0.32 0.11 0.22 0.05 -0.19 0.34 0.12 0.01 -0.1
-0.11 -0.11 0.1 -0.16 0.12 0.06 0.31 -0.11 0.23 0.1 -0.05 -0.55
-0.03 -0.1 0.15 -0.07 -0.23 0.11 -0.13 -0.12 0.15 0.01 0.13 0.08
- -1.39 -1.42 - 0.96 0.77 0.1 0.94 1.22 - 0.91 -1.34
0.56 0.38 -0.22 - -0.35 0.42 0.24 0.06 0.27 1.06 -1.1 -1.91
-1.22 0.21 -0.4 - -0.66 1.17 -0.29 0.87 0.45 -0.82 0.56 -0.5
0.43 0.02 -0.63 -0.39 0.2 0.43 0.07 0.32 0.18 0.06 -0.22 -1.35
-0.3 -0.03 0.17 0.06 -0.1 1.04 -1.33 -0.83 0.18 -0.57 -0.16 0.48
0.1 -2.11 -0.59 -0.25 -0.52 0.82 -0.34 0.41 0.15 0.06 0.42 0.16
-1.01 -0.96 0.04 0.76 -0.4 0.68 0.03 -0.07 0.66 -0.35 -0.28 -0.43
-0.53 0.27 -0.63 0.14 -0.2 0.76 -0.39 -0.02 0.06 -0.22 0.49 -0.46
0.48 0.06 -1.59 -0.96 0.71 -0.26 -0.02 0.31 0.38 0.74 -0.71 -1.23
-0.5 0.53 0.57 0.19 -0.51 0.69 -0.03 -0.21 0.18 -0.0 -0.72 -1.65
-0.03 -0.06 -0.12 -0.24 -0.07 0.08 0.02 0.14 0.11 0.1 0.07 -0.05
-0.08 0.22 -0.17 -0.51 0.02 0.29 0.17 -0.06 0.1 -0.06 0.1 -0.19
0.21 -0.06 -0.14 -0.03 -0.02 0.15 -0.09 0.08 0.02 -0.0 -0.02 -0.12
0.9 -0.25 0.36 -1.1 -0.16 0.61 -0.58 0.03 -0.19 -0.35 -0.19 -0.18
-0.77 0.59 0.06 0.12 -0.44 -0.44 -0.5 0.04 0.02 0.43 0.38 -0.15
0.28 -0.07 -0.06 -0.3 0.07 0.22 -0.14 0.14 0.1 -0.02 -0.11 -0.23
0.98 0.55 -0.26 -0.26 -0.63 0.48 -0.48 -1.07 -0.05 -0.03 0.13 -0.68
-0.04 -0.02 -0.02 -0.15 -0.03 0.08 0.02 0.1 0.1 0.05 -0.02 -0.08
-0.0 -0.01 -0.06 -0.18 -0.06 0.13 -0.07 0.15 0.07 0.05 0.02 -0.06
0.07 -0.15 -0.11 -0.1 -0.07 0.14 0.1 0.1 0.07 0.02 -0.09 -0.0
- - 1.2 - 0.36 1.84 - 1.38 -1.14 0.13 -0.53 -
-0.3 -1.1 -0.38 0.59 -0.52 0.65 -1.37 0.37 -0.16 -0.54 0.88 0.1
-0.53 0.69 0.09 -0.47 -0.24 0.44 0.33 -0.74 -0.27 0.23 0.07 -0.34
1.16 -0.81 -0.63 -0.18 0.24 0.75 -0.45 0.41 -0.19 0.03 -0.46 -3.0
0.07 -0.03 0.08 -0.37 -0.21 0.17 -0.02 0.42 0.32 0.05 -0.33 -0.45
-0.05 0.05 -0.22 -0.17 -0.04 0.04 -0.0 0.19 0.09 0.02 -0.13 0.17
0.03 -0.61 0.05 -0.18 0.06 0.33 0.31 -0.34 0.38 0.03 -0.13 -0.26
0.18 -0.28 0.05 0.02 0.04 0.03 -0.07 0.27 0.1 0.09 -0.24 -0.3
-1.13 0.41 0.09 -0.04 -0.45 0.03 -0.66 0.56 0.31 -0.16 0.12 0.13
-1.5 -0.46 -0.11 1.06 0.24 1.27 -1.74 1.0 -0.68 -1.31 -0.17 -3.41
0.59 -1.51 -1.99 -0.37 0.05 1.06 0.21 0.33 -0.3 -0.15 0.91 -
-3.16 -0.66 -0.08 0.78 0.16 0.45 -0.51 -0.89 0.22 0.64 0.69 -0.87
-0.38 -0.31 0.77 -0.24 0.05 0.4 0.35 -0.41 0.05 0.05 -0.32 -0.68
0.11 0.2 -0.14 -0.17 0.05 0.15 0.02 -0.0 0.05 -0.03 -0.07 -0.24
-0.09 0.36 -0.88 -0.72 -0.6 0.55 0.27 0.46 -0.36 0.25 0.26 -0.4
0.07 -0.07 -0.08 -0.78 -0.29 0.25 0.24 0.14 0.21 0.06 0.12 -0.15
-0.05 0.22 0.29 -0.49 0.2 0.73 -1.11 0.6 0.09 -0.16 -0.18 -1.72
-0.53 0.27 0.09 -0.94 0.21 0.34 0.33 0.46 -0.2 0.19 -0.07 -0.98
0.12 -0.18 -0.09 -0.56 0.1 0.28 -0.12 -0.04 0.1 0.21 0.03 -0.04
-0.78 -0.15 -0.07 -0.1 -0.13 0.53 0.23 0.26 -0.06 -0.15 0.33 -0.39
-0.19 -0.72 -1.32 - 0.3 0.86 -0.33 0.74 1.11 -0.33 0.65 -3.62
0.82 -0.01 0.48 -0.07 0.15 0.36 -0.44 -0.22 -0.42 -0.48 0.16 -1.66
-0.32 -1.31 0.29 -0.22 0.64 0.84 -1.53 -0.02 -0.28 -0.47 0.84 -0.55
-0.11 0.03 -0.06 -0.08 0.05 -0.06 0.09 0.1 0.16 0.1 -0.01 -0.26
0.08 -0.01 -0.04 -0.1 -0.1 0.08 -0.03 0.02 0.07 0.01 0.02 -0.02
0.03 -0.03 -0.31 -0.3 -0.34 0.25 0.2 0.13 0.11 0.18 0.07 -0.15
- 0.35 0.15 0.75 -1.57 0.0 -4.0 0.28 -0.38 0.8 0.96 -0.21
0.14 0.03 0.42 -0.1 0.29 0.08 -0.4 0.26 -0.42 0.38 -0.24 -1.06
0.01 0.05 0.0 0.01 -0.19 -0.01 -0.11 0.01 -0.04 0.06 0.12 0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.