Heatmap: Cluster_33 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.79 0.1 0.31 0.36 0.31 0.22 0.2 0.17 0.25 0.23 0.37 0.26
0.18 0.15 0.66 0.77 0.27 0.09 0.74 0.34 0.24 0.87 0.47 0.0
3.15 4.24 4.04 4.16 3.11 2.32 4.73 3.57 4.41 4.03 2.29 2.94
0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0
2.42 0.89 1.63 1.62 1.94 1.94 1.51 1.84 2.23 2.38 1.85 2.63
0.51 0.04 0.3 0.25 0.48 0.23 0.04 0.0 0.09 0.03 0.15 0.07
0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.21 0.12 0.0 0.0 0.0 0.03
15.35 15.24 16.17 11.51 13.83 13.79 13.38 12.25 13.49 14.26 12.84 13.1
0.59 0.34 0.28 0.35 0.36 0.24 0.66 0.67 0.34 0.48 0.46 0.63
19.2 16.29 17.79 19.46 18.41 20.5 18.56 19.77 19.09 19.65 17.79 20.77
0.18 0.0 0.41 0.82 0.16 0.33 0.17 0.0 0.0 0.34 0.0 0.18
0.02 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.17 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0
0.39 0.1 0.8 0.76 0.55 0.21 1.31 0.24 0.06 0.33 0.6 0.28
9.23 8.17 10.73 6.01 9.79 8.73 7.23 7.64 6.02 7.4 6.45 6.19
0.14 0.51 0.42 0.94 0.4 0.36 0.38 0.33 0.5 0.2 0.19 0.3
0.0 0.04 0.18 0.0 0.07 0.0 0.19 0.0 0.0 0.03 0.12 0.0
0.42 2.29 4.92 2.97 2.74 0.87 5.9 3.97 3.23 2.37 4.36 0.21
2.22 1.83 2.26 2.62 2.86 1.88 1.92 2.43 2.74 2.56 2.55 2.3
0.07 0.1 0.6 0.85 0.75 0.17 0.96 0.28 0.34 0.43 0.0 0.0
0.96 4.53 3.06 3.39 4.83 2.57 5.28 4.15 1.84 2.77 2.33 1.4
0.0 0.0 0.07 0.74 0.0 0.0 0.69 0.0 0.14 0.31 0.36 0.16
0.07 0.04 0.09 0.62 0.25 0.23 0.08 0.14 0.15 0.66 0.22 0.16
0.56 0.7 1.13 0.2 0.67 0.3 1.31 0.26 0.55 0.56 0.46 0.73
0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.04 0.02 0.04 0.02 0.0 0.07 0.0
1.68 2.99 2.8 2.6 2.68 2.4 2.55 2.52 3.12 2.66 2.77 2.5
0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.21 0.08 0.0 0.0 0.47 0.21 0.0
0.28 0.08 0.4 0.33 0.26 0.14 1.07 0.5 0.3 0.18 0.26 0.11
0.18 0.08 0.03 0.23 0.18 0.31 0.0 0.0 0.24 0.47 0.0 0.12
0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
24.89 18.38 22.25 21.18 23.36 21.32 24.2 23.36 24.06 22.48 21.72 21.67
0.52 0.79 1.2 1.16 0.91 1.04 0.66 0.92 0.55 0.72 0.39 0.82
6.95 8.56 11.12 10.24 10.65 9.05 9.79 10.15 10.24 10.15 9.49 9.13
0.11 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.05 0.07 0.05
1.32 1.25 1.36 1.55 1.15 1.01 2.5 2.02 1.7 1.77 1.49 0.98
0.0 0.09 0.0 0.28 0.07 0.13 0.21 0.19 0.08 0.01 0.07 0.0
0.0 0.48 0.0 0.56 0.12 0.0 0.84 0.44 0.2 0.0 0.09 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.13 0.0 0.03 0.0 0.08 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0
4.51 4.25 6.07 5.73 7.01 4.33 5.28 4.34 5.59 4.63 5.7 4.6
0.13 0.02 0.03 0.12 0.11 0.02 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0
3.75 3.1 4.05 4.09 4.73 3.54 4.09 3.48 4.36 3.72 3.06 3.1
0.0 0.0 0.03 0.04 0.04 0.02 0.04 0.02 0.04 0.04 0.0 0.0
0.0 0.07 0.29 0.02 0.17 0.0 0.33 0.06 0.02 0.11 0.02 0.0
18.19 13.46 16.1 17.63 14.41 13.05 17.35 16.62 16.04 16.57 17.35 14.81
0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.11 0.1 0.53 0.34 0.33 0.13 0.47 0.23 0.28 0.38 0.42 0.14
0.32 0.37 0.73 0.86 0.85 0.53 1.13 0.87 0.56 0.98 0.98 0.37
12.54 14.51 14.73 16.81 17.88 15.33 13.89 15.04 15.71 13.87 16.86 14.79
0.0 0.07 0.08 0.0 0.09 0.0 0.12 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0
0.0 0.14 0.42 0.17 0.05 0.06 0.34 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 0.34 0.87 0.54 0.33 0.27 0.53 0.64 0.29 0.58 0.49 0.26
0.3 0.0 0.19 0.14 0.04 0.09 0.18 0.18 0.21 0.14 0.29 0.14
0.14 0.0 0.06 0.23 0.0 0.23 0.13 0.0 0.07 0.12 0.0 0.0
0.0 0.0 2.85 1.45 0.0 0.0 4.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.09
0.25 1.48 0.94 0.97 1.38 1.32 1.35 1.9 0.52 0.7 0.24 0.41
0.0 0.18 0.07 0.32 0.12 0.0 0.0 0.0 0.18 0.11 0.0 0.14
11.84 11.26 16.37 14.33 17.5 13.55 13.45 13.69 16.83 14.71 15.84 14.01
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.15 0.21 0.07 0.0 0.0 0.05 0.0 0.33 0.21 0.0
0.0 0.0 0.0 0.25 0.06 0.0 0.0 0.0 0.3 0.28 0.0 0.0
0.11 0.7 1.05 2.54 1.63 1.41 1.92 0.81 1.11 1.22 0.95 0.87
0.0 0.0 0.0 0.29 0.2 0.17 0.13 0.13 0.05 0.04 0.0 0.0
0.0 0.12 0.03 0.21 0.27 0.08 0.41 0.23 0.13 0.22 0.0 0.04
0.07 0.0 0.14 0.08 0.11 0.04 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04
0.04 0.02 0.06 0.13 0.02 0.13 0.09 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0
7.82 8.48 8.95 9.22 9.92 9.41 9.14 8.94 9.65 9.14 9.89 9.13
0.0 0.0 0.09 0.76 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41
2.51 2.07 2.52 3.64 3.34 3.24 3.32 2.63 3.16 3.47 3.9 2.39
0.0 0.0 0.18 0.0 0.05 0.02 0.21 0.0 0.1 0.02 0.12 0.05
0.21 0.66 0.71 0.87 1.24 0.49 1.28 1.64 1.41 1.13 1.69 0.46

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)