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Heatmap: Cluster_249 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.15 -0.16 -0.13 -0.08 0.02 -0.13 0.12 0.19 0.17 0.25 -0.01 -0.18
0.01 -0.09 -0.14 -0.34 -0.03 -0.09 0.03 0.23 0.2 0.13 0.13 -0.14
-0.45 -0.22 -0.11 -0.04 0.03 -0.15 0.19 0.11 0.27 0.06 0.07 0.09
-0.27 -0.4 -0.14 -0.28 0.09 -0.32 -0.03 0.2 0.33 0.32 0.17 0.09
-0.04 -0.01 -0.08 0.04 -0.08 -0.15 0.04 0.1 0.2 0.06 0.04 -0.17
-0.2 -0.12 -0.14 -0.24 -0.1 -0.04 0.08 0.22 0.33 0.09 0.09 -0.09
-0.24 -0.26 -0.07 -0.13 -0.04 -0.18 0.04 0.34 0.23 0.18 -0.03 0.03
-0.09 -0.21 -0.13 -0.23 0.02 -0.05 0.1 0.07 0.19 0.11 0.1 0.06
-0.08 0.01 -0.06 0.03 -0.08 -0.05 0.05 0.12 0.18 0.07 -0.01 -0.23
-0.25 -0.32 -0.32 -0.23 0.03 -0.11 0.14 0.29 0.36 0.14 0.11 -0.04
0.02 -0.05 -0.11 -0.21 -0.06 -0.08 0.01 0.11 0.13 0.19 0.09 -0.08
-0.13 -0.22 -0.12 -0.12 -0.02 -0.08 0.03 0.11 0.28 0.19 0.11 -0.11
-0.16 -0.09 -0.23 -0.05 0.1 0.12 0.02 0.16 0.08 0.1 0.05 -0.16
-0.09 -0.03 -0.03 -0.11 -0.01 -0.02 0.11 0.11 0.12 0.01 -0.0 -0.07
-0.14 -0.15 -0.05 -0.09 0.01 -0.05 0.06 0.09 0.16 0.11 0.07 -0.06
-0.13 -0.1 -0.14 -0.13 0.05 0.06 0.04 0.19 0.19 0.12 -0.06 -0.16
0.09 -0.34 -0.1 -0.36 -0.11 -0.25 0.13 0.42 0.25 0.25 0.03 -0.28
-0.34 -0.16 -0.17 -0.46 0.05 -0.02 0.17 0.32 0.17 0.06 0.13 0.05
-0.29 -0.27 -0.16 -0.07 -0.01 -0.03 0.17 0.2 0.21 0.04 0.07 0.05
0.11 -0.29 -0.21 -0.22 0.03 -0.18 0.0 0.3 0.14 0.24 0.12 -0.2
-0.2 -0.11 0.02 -0.32 -0.05 -0.13 -0.08 0.3 0.25 0.2 0.04 -0.04
-0.12 -0.06 -0.24 -0.24 -0.08 -0.09 0.02 0.09 0.19 0.17 0.17 0.1
-0.16 -0.22 -0.11 -0.23 0.02 -0.11 0.03 0.13 0.26 0.16 0.13 0.0
-0.15 -0.19 -0.2 -0.02 0.06 -0.1 -0.0 0.03 0.2 0.13 0.13 0.04
-0.39 -0.26 -0.17 -0.3 0.05 0.11 0.19 0.24 0.24 0.23 0.07 -0.22
0.09 -0.37 -0.27 -0.17 0.07 -0.12 0.05 0.06 0.21 0.33 0.05 -0.09
-0.15 -0.16 -0.16 -0.12 -0.05 -0.09 0.06 0.2 0.19 0.09 0.05 0.05
-0.05 -0.26 -0.24 -0.15 0.07 -0.19 -0.03 0.09 0.27 0.33 0.14 -0.12
-0.45 -0.14 -0.06 -0.05 0.11 0.03 0.07 0.14 0.09 0.11 0.03 0.02
-0.24 0.11 -0.07 -0.05 0.0 -0.15 0.09 0.19 0.18 0.18 -0.11 -0.22
-0.23 -0.2 -0.06 -0.3 -0.01 -0.06 0.07 0.15 0.13 0.17 0.15 0.1
-0.47 -0.85 -0.67 0.23 0.08 0.07 0.33 0.44 0.36 0.11 0.09 -0.37
-0.09 -0.05 -0.13 -0.04 -0.01 -0.08 0.01 0.04 0.18 0.03 0.06 0.03
-0.11 -0.18 -0.07 -0.24 0.1 -0.24 0.04 0.2 0.3 0.28 0.09 -0.33
0.04 -0.24 -0.15 -0.14 -0.14 -0.2 0.02 0.21 0.14 0.23 0.08 0.04
-0.34 -0.17 -0.07 -0.28 0.11 0.01 0.0 0.12 0.22 0.32 0.09 -0.16
-0.12 -0.2 -0.1 0.03 0.0 0.01 0.03 0.04 0.14 0.1 0.02 0.0
-0.1 -0.25 -0.2 -0.15 0.0 -0.08 0.11 0.33 0.21 0.07 0.04 -0.1
-0.2 -0.13 -0.03 -0.05 0.13 -0.14 0.02 0.1 0.2 0.2 0.0 -0.19
-0.53 -0.25 -0.18 -0.0 -0.02 -0.04 0.1 0.38 0.24 0.15 -0.02 -0.03
-0.26 -0.08 -0.08 -0.16 -0.04 -0.09 0.05 0.29 0.22 0.08 0.03 -0.04
-0.09 -0.22 -0.06 -0.13 -0.01 -0.06 0.03 0.07 0.19 0.18 0.1 -0.06
-0.11 -0.06 -0.06 -0.13 -0.07 -0.05 0.08 0.14 0.1 0.09 0.13 -0.1
-0.3 -0.21 -0.15 -0.13 0.02 -0.02 0.11 0.16 0.13 0.07 0.12 0.11
-0.6 -0.03 -0.14 -0.15 0.32 -0.69 0.13 0.52 0.43 0.37 -0.17 -0.69
-0.31 -0.33 -0.15 -0.31 0.12 -0.11 0.11 0.22 0.28 0.17 0.07 0.07
0.31 -0.23 -0.05 -0.43 0.08 -0.43 0.04 0.26 0.24 0.26 -0.01 -0.33
-0.29 -0.05 -0.07 -0.11 -0.03 -0.09 0.12 0.19 0.12 0.12 0.02 -0.01
-0.66 -0.3 -0.19 -0.06 0.07 -0.13 0.19 0.32 0.26 0.04 0.1 0.09
-0.54 -0.22 0.09 -0.05 -0.06 -0.35 -0.07 0.51 0.23 0.1 0.15 -0.07
-0.02 -0.14 -0.17 -0.28 -0.01 -0.02 0.02 0.06 0.22 0.11 0.11 0.04
-0.39 -0.39 -0.2 -0.17 -0.01 -0.28 -0.04 0.09 0.42 0.33 0.19 0.17
-0.3 -0.3 -0.16 -0.05 0.03 -0.15 0.07 0.09 0.23 0.18 0.19 0.02
-0.16 -0.29 -0.02 -0.19 -0.08 -0.11 0.11 0.41 0.27 0.18 -0.05 -0.27
-0.34 -0.09 -0.06 -0.11 0.02 0.02 0.11 0.15 0.05 0.05 0.09 0.05
-0.34 -0.29 -0.04 -0.01 0.13 -0.02 0.11 0.05 0.27 0.2 0.04 -0.23
-0.54 -0.23 0.12 -0.22 0.07 -0.25 0.09 0.19 0.27 0.16 0.14 -0.02
0.14 -0.2 -0.11 -0.28 0.07 -0.31 0.05 0.2 0.18 0.21 0.08 -0.17
-0.37 -0.14 -0.11 -0.04 0.06 0.06 -0.02 0.1 0.22 0.13 -0.02 0.04
-0.2 -0.02 -0.06 -0.3 -0.01 -0.08 0.08 0.16 0.19 0.13 0.13 -0.1
-0.07 -0.01 -0.02 -0.11 -0.04 -0.07 0.05 0.15 0.08 0.07 0.02 -0.07
-0.18 -0.1 -0.12 -0.13 -0.04 -0.12 0.03 0.19 0.24 0.17 0.06 -0.08
-0.02 -0.51 -0.04 -0.48 -0.02 -0.12 0.12 0.2 0.21 0.29 0.16 -0.02
-0.06 -0.36 -0.26 -0.54 -0.02 0.06 -0.07 0.19 0.32 0.28 0.23 -0.02
0.11 -0.23 -0.24 -0.06 -0.01 -0.19 0.07 0.25 0.17 0.22 0.0 -0.23
-0.37 -0.64 -0.09 -0.33 0.08 -0.26 -0.0 0.27 0.35 0.4 0.31 -0.14
-0.26 -0.15 -0.16 -0.18 -0.01 -0.16 0.02 0.24 0.31 0.13 0.07 0.02
-0.41 -0.19 -0.12 0.03 0.14 -0.02 0.19 0.22 0.19 0.03 0.04 -0.25
-0.6 -0.23 -0.34 0.09 0.01 -0.19 0.13 0.15 0.26 0.29 0.05 0.13
-0.53 -0.46 -0.09 -0.18 0.07 -0.13 0.15 0.33 0.31 0.18 0.0 0.07
-0.32 -0.29 -0.11 -0.1 -0.0 -0.08 -0.04 0.2 0.3 0.21 0.15 -0.04
-0.17 -0.12 -0.29 -0.39 -0.16 0.09 0.28 0.35 0.07 0.11 0.04 0.01
-1.26 - -0.06 - 0.19 - 0.79 1.31 -0.11 1.38 -0.43 0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.