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Heatmap: Cluster_112 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.88 -0.29 0.04 -0.39 0.05 0.33 -0.09 0.41 -0.01 -0.08 0.23 0.23
-0.58 -0.39 -0.27 0.04 0.17 0.42 0.01 -0.01 -0.02 0.13 0.07 0.18
-0.38 -0.28 -0.29 -0.15 0.11 -0.0 0.03 0.16 0.14 0.13 0.27 0.1
-0.4 -0.27 -0.13 -0.42 -0.03 0.45 0.16 0.11 0.01 0.16 0.11 0.02
- - - - - - 3.08 - - - - 1.83
0.08 -0.62 -0.22 -0.48 0.11 0.29 -0.09 -0.24 0.31 0.24 0.15 0.12
0.59 -0.44 -0.08 -0.11 -0.33 0.6 -0.83 -0.59 0.23 -0.9 0.33 0.47
-0.06 -0.31 -0.16 0.06 0.03 0.2 -0.01 0.04 0.08 0.08 0.05 -0.07
-0.67 -0.21 -0.23 -0.07 -0.12 0.31 0.08 0.18 0.14 0.19 0.15 -0.0
-0.63 -0.53 0.02 0.03 -0.1 0.32 0.12 0.08 0.23 0.01 0.13 0.04
-0.35 -0.15 -0.06 -0.01 0.12 0.21 0.25 0.05 0.21 0.16 -0.1 -0.55
-2.37 -0.93 -0.05 -0.45 0.45 0.83 0.52 -0.07 0.82 0.29 -0.47 -1.57
-0.72 -0.28 -0.22 -0.2 0.04 0.6 -0.0 -0.17 0.19 0.16 0.03 0.17
0.69 0.14 -0.29 -0.02 0.48 0.49 -1.06 -0.83 0.15 -0.02 -0.43 -0.3
-0.43 -0.48 -0.47 -0.06 0.22 0.32 0.11 0.08 0.25 0.15 0.06 -0.05
0.12 0.02 -0.09 -0.34 0.04 0.06 0.02 0.24 -0.08 0.16 -0.18 -0.07
-0.31 -0.09 -0.17 -0.22 -0.1 0.01 0.04 0.02 0.18 0.18 0.16 0.19
-0.03 -0.28 -0.21 -0.31 -0.06 0.15 -0.02 0.02 0.02 0.23 0.23 0.13
-0.41 -0.29 -0.08 -0.25 0.08 0.19 0.17 0.19 0.12 0.05 0.03 0.05
-0.17 -0.32 -0.11 -0.12 -0.03 0.21 0.13 -0.05 0.12 0.09 -0.11 0.24
-0.36 0.08 -0.36 -0.25 0.03 -0.1 -0.04 -0.14 0.16 0.07 0.41 0.29
-0.32 -2.2 -0.41 -1.74 -0.11 1.09 -0.21 0.16 -0.22 0.42 0.16 0.66
-0.32 -0.53 -0.27 -0.04 -0.02 0.26 -0.06 0.11 0.16 0.16 0.18 0.16
-0.34 -0.33 -0.2 -0.21 0.02 0.32 0.04 0.12 0.16 0.13 0.13 -0.01
-0.54 -0.84 -0.31 -0.04 0.02 0.19 0.16 0.07 0.25 0.29 0.03 0.29
-0.64 -0.23 -0.07 -0.45 -0.37 0.27 0.01 0.34 0.24 0.26 0.15 0.13
-1.09 -0.35 0.01 -0.54 0.26 0.38 -1.2 0.57 0.14 -0.33 -0.16 0.89
-0.02 -0.17 -0.17 -0.0 0.05 0.25 -0.13 0.16 -0.02 0.01 0.11 -0.13
-0.08 -0.02 -0.11 -0.19 -0.06 0.03 0.03 0.1 0.03 0.02 0.12 0.1
- - -0.94 - 0.13 0.84 2.56 - 0.07 - - 0.72
-0.18 -0.4 -0.1 -0.34 -0.03 0.35 0.15 0.12 0.11 0.06 -0.0 0.11
-0.15 -0.61 -0.29 -0.08 0.11 -0.05 -0.0 0.17 0.1 0.26 0.18 0.15
-0.28 -0.2 -0.12 -0.05 0.03 0.25 0.0 0.11 0.08 0.04 0.08 -0.03
-1.08 -0.52 -0.5 -0.87 -0.13 0.49 0.29 0.25 0.31 -0.18 0.48 0.41
-0.19 -0.53 -0.12 -0.29 -0.21 0.55 -0.03 0.34 0.04 -0.22 0.16 0.15
-0.12 -0.14 -0.28 -0.28 -0.05 0.21 -0.03 0.03 0.04 0.11 0.12 0.27
-0.21 -0.25 -0.2 0.0 0.06 0.16 0.01 0.12 0.11 0.1 0.1 -0.1
-0.47 -1.12 0.03 -0.56 -0.41 0.71 -0.16 0.43 0.38 0.06 -0.02 0.21
-0.16 -0.13 -0.23 -0.1 -0.06 0.1 -0.01 0.3 0.12 -0.09 0.08 0.1
-0.19 -0.39 -0.04 -0.05 0.05 0.18 0.13 0.02 0.06 0.04 -0.1 0.19
-1.1 -1.55 -0.99 -0.26 0.79 1.37 -0.41 -2.25 -0.12 -0.19 -0.05 0.87
-2.81 -0.02 -0.34 -0.06 -0.84 1.91 -0.05 -1.87 -0.59 -0.89 -0.79 0.84
-0.06 -0.67 -0.18 -0.52 0.1 0.63 0.01 0.14 0.01 0.31 -0.11 -0.09
-0.86 -0.2 -0.07 -0.1 -0.24 0.52 -0.08 -0.05 0.09 0.04 0.13 0.39
-0.31 -0.24 -0.17 -0.11 0.04 0.19 -0.03 0.17 0.09 0.13 0.07 0.07
-0.27 -0.33 0.03 -0.35 0.06 0.09 0.07 0.2 0.14 -0.16 0.23 0.13
-0.15 -0.28 -0.24 -0.03 0.03 0.14 -0.02 -0.06 0.06 0.12 0.28 0.06
-0.14 -0.15 -0.49 -0.36 -0.0 0.43 -0.06 0.27 -0.0 0.36 -0.01 -0.13
-1.18 -0.22 -0.23 -0.01 -0.17 0.48 0.23 -0.3 0.53 0.07 0.31 -0.24
-0.11 -0.13 -0.05 0.02 0.08 0.13 0.07 0.1 0.13 -0.07 -0.06 -0.15
-0.2 -0.2 -0.19 -0.17 -0.12 0.24 0.01 0.11 0.09 0.15 0.06 0.11
-0.13 -0.26 -0.17 -0.21 -0.01 0.34 -0.02 0.11 0.05 0.14 0.02 0.01
-0.14 -0.53 -0.45 -0.15 -0.0 0.19 -0.01 0.08 0.3 0.17 0.09 0.21
-0.22 -0.71 -0.53 -0.35 0.12 0.47 0.01 0.05 0.33 0.23 0.14 0.0
-0.13 -0.54 -0.32 -0.47 -0.03 0.45 0.04 0.15 -0.1 0.1 0.27 0.25
-0.35 -0.35 -0.12 -0.08 0.08 0.3 -0.13 0.03 -0.06 -0.08 0.27 0.31
-0.54 -0.34 -0.09 -0.21 0.02 0.45 -0.01 0.14 0.2 0.38 -0.11 -0.22
-0.24 -0.31 -0.4 -0.18 -0.03 0.12 0.1 0.18 0.15 0.17 0.21 0.05
-0.08 -0.3 -0.2 -0.25 -0.0 0.07 -0.01 0.16 0.07 0.17 0.15 0.13
-0.02 -0.12 -0.1 -0.12 -0.03 0.13 -0.01 0.16 0.17 -0.02 0.02 -0.13
-0.34 -0.13 -0.06 -0.05 0.02 0.16 -0.1 0.08 0.17 0.09 -0.04 0.12
-1.78 - 0.07 -2.68 -0.87 1.65 -1.27 0.66 -0.23 0.51 -1.1 1.06
-0.43 -0.84 0.06 -0.06 -0.08 0.7 -0.36 0.01 -0.21 -0.31 0.39 0.44
0.08 -0.25 -0.17 -0.07 0.0 0.15 0.03 0.06 0.09 0.03 -0.01 0.02
-0.09 -0.09 -0.15 -0.17 -0.01 0.04 0.0 0.07 0.04 0.08 0.1 0.14
-0.4 -0.28 0.04 -0.13 0.08 0.16 -0.08 0.17 0.04 0.21 0.09 -0.01
-0.87 -0.65 -0.09 -0.31 0.03 0.72 -0.29 0.25 0.15 0.08 -0.11 0.38
-0.26 -0.5 -0.32 -0.46 -0.03 0.5 0.12 0.17 0.29 0.09 0.17 -0.12
-0.5 -1.38 -0.29 0.19 0.53 0.54 0.18 -0.09 0.21 0.15 -0.25 -0.18
-0.46 -0.27 0.0 -0.11 -0.09 0.22 0.03 0.24 0.21 0.13 -0.06 0.0
-0.03 -0.17 -0.15 -0.04 0.01 0.08 -0.02 0.12 0.1 0.04 0.05 -0.03
-1.64 -1.57 -0.45 -1.13 -0.46 0.26 0.54 0.81 0.44 0.26 0.46 0.13
-0.81 -0.67 -0.92 -1.49 0.23 0.74 0.68 -0.16 0.09 0.22 -0.06 0.48
-0.17 -0.59 -0.17 -0.03 -0.27 0.26 -0.14 0.28 0.13 -0.07 0.05 0.43
-1.45 -0.94 -0.98 -0.03 0.41 0.57 0.11 0.2 0.28 0.1 0.29 0.1
-0.68 -0.87 -0.42 -0.01 0.31 0.44 0.11 -0.03 0.17 0.32 0.05 0.04
-0.12 -0.17 -0.12 -0.23 -0.08 0.07 -0.03 0.11 0.13 0.13 0.19 0.04
-0.23 -0.03 -0.27 0.01 -0.04 0.13 -0.09 0.23 0.11 -0.01 0.03 0.08
-0.51 -0.21 -0.09 0.13 -0.02 0.27 0.13 0.23 0.14 0.12 -0.11 -0.26
- - - - - - 2.07 - - 2.1 - 1.82
-0.06 -0.49 -0.18 -0.24 -0.0 0.35 0.0 0.1 0.19 0.1 -0.03 0.09
-0.17 -0.32 -0.19 0.01 0.0 0.13 0.01 -0.04 0.08 0.19 0.17 0.05
-0.17 -0.08 -0.18 0.0 -0.03 0.03 0.05 -0.01 0.14 -0.04 0.03 0.21
-0.14 -0.04 -0.03 -0.0 0.05 0.06 -0.03 0.09 0.14 0.02 -0.02 -0.11
-0.18 -0.06 -0.08 -0.23 -0.13 0.15 0.08 0.09 0.13 0.15 -0.01 0.02
-0.23 -0.17 -0.38 -0.48 0.05 0.4 0.15 0.01 0.14 0.02 0.12 0.14
-0.21 -0.52 -0.32 -0.2 0.09 0.31 0.01 0.11 0.2 0.18 0.14 -0.01
0.02 -0.22 -0.2 -0.22 0.14 0.41 -0.06 0.12 0.14 -0.08 0.01 -0.21
-0.3 -0.39 -0.19 -0.21 -0.07 0.2 0.26 0.06 0.2 0.15 0.07 0.05
-0.1 0.01 -0.17 -0.17 -0.0 0.11 0.0 -0.04 0.09 0.03 0.05 0.13
-0.15 -0.23 0.02 -0.21 0.03 0.14 -0.03 0.12 0.05 0.0 0.11 0.09
-0.76 -0.4 -0.51 -0.12 0.14 0.34 0.22 -0.03 0.04 0.21 0.25 0.2
-0.69 -0.28 -0.51 -0.12 0.1 0.28 0.06 0.12 0.29 0.3 0.07 0.01
-0.47 -0.19 -0.1 0.05 0.1 0.23 0.0 0.08 0.1 0.14 0.07 -0.14
-0.82 -1.75 -0.24 0.34 -0.14 0.74 0.17 0.34 -0.12 0.43 0.07 -0.44
-0.14 -0.28 -0.2 -0.11 -0.13 0.25 0.06 0.08 0.15 0.02 0.11 0.09
-0.29 -0.51 -0.05 -0.16 0.06 0.35 0.03 0.08 0.22 0.03 -0.11 0.15
0.07 -0.16 -0.09 -0.04 -0.02 0.01 0.03 0.17 0.02 -0.04 -0.06 0.08
-0.12 -0.45 -0.3 0.05 0.0 0.16 0.14 0.21 0.09 0.13 0.14 -0.22
-0.16 -0.26 -0.16 -0.24 0.01 0.19 -0.03 0.15 0.01 0.1 0.18 0.1
-0.4 -0.18 0.01 -0.19 0.01 0.31 0.16 0.12 0.22 0.01 -0.08 -0.15
-0.29 -0.68 -0.17 -0.03 -0.04 0.38 0.18 -0.0 0.1 -0.04 0.12 0.21
-0.48 -0.15 -0.41 -0.07 0.05 0.37 0.06 0.23 0.28 -0.0 0.04 -0.17
-0.06 -0.32 -0.75 -0.2 0.03 0.21 0.36 0.2 0.35 0.13 -0.55 0.14
-0.2 -0.17 -0.18 -0.07 0.08 0.18 -0.14 0.39 -0.03 -0.05 -0.05 0.13
-0.09 -0.32 -0.25 0.02 0.05 0.13 0.03 -0.17 0.15 0.16 0.22 -0.02
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-0.1 -0.32 -0.34 -0.08 0.1 0.19 0.09 0.23 0.06 -0.03 0.14 -0.07
-0.13 -0.39 -0.2 -0.22 0.04 0.15 0.05 0.01 0.14 0.05 0.13 0.25
-0.03 -0.53 -0.46 -0.28 -0.08 0.25 -0.19 0.1 0.29 0.36 0.26 -0.02
0.03 -0.12 -0.14 -0.06 0.04 0.0 0.11 0.09 0.08 0.01 -0.07 -0.01
- 0.37 -1.28 - -0.47 1.62 0.84 -1.77 1.43 -0.28 -0.63 -2.04
-0.45 -0.15 -0.17 -0.05 0.1 0.13 0.02 0.06 0.15 0.19 -0.03 0.08
-0.36 -0.17 -0.22 -0.1 0.02 0.16 0.03 0.16 0.08 0.12 0.07 0.1
-0.01 -0.01 -0.16 -0.54 -0.03 0.03 0.0 -0.17 0.13 0.2 0.19 0.2
-0.24 -0.67 -0.39 -0.78 0.21 0.55 0.09 -0.86 0.32 0.27 0.34 0.29
0.05 -0.16 -0.09 -0.21 -0.04 -0.01 -0.09 0.05 0.06 0.07 0.25 0.06
-0.07 -0.07 -0.19 -0.13 -0.1 0.09 -0.0 0.11 0.06 0.06 0.1 0.11
-0.27 -0.46 -0.39 -0.15 0.01 0.37 -0.07 0.02 -0.34 0.23 0.39 0.3
-1.54 -0.94 -0.76 0.05 0.11 0.54 0.46 0.51 0.06 0.22 0.45 -0.72
-0.42 -0.44 -0.21 -0.09 0.15 0.27 0.05 0.06 0.25 0.12 0.05 0.0
-0.44 -0.44 -1.19 -0.54 -1.04 -1.34 0.08 - -0.03 1.33 1.19 0.75
-0.13 -0.56 -0.11 -0.04 -0.03 0.41 -0.01 0.01 0.02 -0.0 0.17 0.09
-0.12 -0.4 -0.27 -0.42 0.03 0.04 -0.36 0.04 0.32 0.31 0.5 -0.01
-0.46 -0.37 -0.36 -0.54 -0.07 0.32 -0.16 -0.43 0.52 0.4 0.33 0.24
-0.23 -0.24 -0.08 -0.06 0.13 0.13 0.07 0.02 -0.03 0.03 0.09 0.1
-0.26 -0.48 -0.17 -0.41 0.08 0.29 0.18 0.11 0.07 0.13 -0.0 0.23
-0.28 -0.35 -0.16 -0.05 -0.02 0.38 0.03 0.05 0.11 0.08 -0.1 0.15
0.24 -0.17 -0.33 -0.2 -0.06 0.28 -0.09 0.12 0.09 -0.15 0.14 -0.0
0.02 -0.16 -0.11 -0.04 -0.07 0.13 0.01 0.09 0.05 0.04 0.09 -0.08
-0.17 -0.26 -0.16 -0.18 0.01 0.31 -0.0 0.15 -0.01 0.07 0.09 0.05
0.58 - - - 0.47 - 1.81 - -0.51 1.43 - 1.15
-0.41 -0.25 -0.39 -0.59 -0.06 0.07 -0.11 -0.1 0.22 0.43 0.48 0.26
-0.25 -0.15 0.02 -0.08 0.06 0.3 0.07 0.02 -0.03 -0.03 -0.09 0.09
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0.0 -0.2 -0.26 -0.17 -0.12 -0.01 0.09 0.17 0.13 0.11 0.06 0.13
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-0.13 -1.0 -0.55 -0.44 0.17 0.52 0.1 0.14 0.11 0.33 -0.18 0.28
-0.34 -0.37 -0.33 -0.36 0.11 0.27 0.18 -0.07 0.09 0.04 0.35 0.17
-0.68 -0.25 -0.23 0.08 -0.16 0.35 -0.18 0.02 0.24 0.04 0.38 0.08
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-1.81 -3.35 -1.88 -0.48 -1.22 1.02 -0.38 -0.13 0.6 0.8 0.34 0.97
-0.79 -0.53 -0.04 -0.29 -0.08 0.25 -0.07 0.36 0.22 -0.08 0.31 0.28
- - 0.69 - - - 2.5 - - - - 2.24
-0.4 -0.26 0.14 -0.03 0.17 0.11 0.23 -0.03 0.24 -0.03 -0.15 -0.13
-0.11 -0.14 -0.28 -0.3 0.02 0.06 -0.04 0.15 0.14 0.12 0.12 0.17
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-0.47 -0.37 -0.29 -0.3 0.05 0.24 0.06 0.21 0.29 0.04 0.1 0.19
0.02 -0.41 -0.33 -0.42 0.09 0.19 0.16 0.0 0.18 0.2 0.15 -0.03
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-1.63 - - - - 2.02 - 1.71 - - - 2.12
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-0.21 -0.12 -0.19 -0.23 0.09 0.29 -0.03 0.18 0.14 -0.02 -0.02 0.02
-0.17 -0.07 -0.33 -0.28 -0.17 0.15 -0.12 0.13 0.17 0.2 0.18 0.15
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-1.32 -0.95 -0.25 0.09 0.23 0.45 -0.04 0.37 0.24 0.09 0.04 0.13
-0.69 -0.08 -0.21 0.13 -0.11 0.46 -0.1 0.12 -0.04 -0.12 0.03 0.3
-0.17 -0.26 -0.23 -0.19 0.02 0.18 0.09 0.17 0.09 0.04 0.12 0.04
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0.02 -0.15 -0.3 -0.09 -0.09 0.09 -0.17 0.18 0.15 0.09 0.03 0.17
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-0.21 -0.67 -0.22 -0.49 -0.05 0.15 0.06 0.15 0.26 0.17 0.15 0.35
-0.4 -0.35 -0.2 -0.02 -0.06 0.33 -0.0 0.15 -0.08 0.05 0.05 0.32
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-0.21 -0.21 -0.11 -0.1 -0.04 0.14 0.0 0.17 -0.05 -0.06 0.22 0.15
-0.11 -0.3 -0.13 -0.07 -0.01 0.15 0.12 0.15 0.15 0.02 0.01 -0.05
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-2.62 -0.48 -1.43 -0.15 -0.23 0.8 -0.51 0.95 0.41 -0.11 0.17 0.32
-1.01 -1.43 -0.42 0.11 -0.09 0.45 0.06 0.14 0.42 0.33 0.34 -0.02
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-0.27 0.05 -0.31 -0.51 -0.17 0.13 -0.34 -0.02 -0.02 0.57 0.24 0.28
-0.22 -0.38 -0.11 -0.26 0.02 0.22 0.16 0.17 0.15 0.12 -0.12 0.09
-0.43 -0.16 -0.23 -0.25 -0.0 0.11 0.06 0.08 0.09 0.13 0.25 0.21
-2.73 -0.04 -1.29 0.34 -0.09 0.84 0.06 -0.33 0.24 0.09 0.53 -0.08
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-0.94 -0.7 -0.3 -0.34 0.23 0.37 0.02 -0.32 0.27 0.45 0.27 0.26
-3.32 -0.26 -1.99 -1.54 -0.07 1.49 0.47 0.13 0.71 -0.45 -0.64 0.28
-0.43 -0.87 -0.23 -0.06 0.32 0.32 -0.12 0.04 0.14 0.01 0.16 0.29
-0.18 -0.15 -0.04 -0.12 -0.06 0.15 -0.04 0.09 0.16 0.1 0.04 -0.0
0.04 -0.6 -0.31 -0.31 0.06 0.26 0.04 0.08 0.24 0.11 -0.0 0.16
-0.6 -0.36 -0.18 0.11 -0.01 0.12 0.1 0.16 0.26 0.12 0.09 -0.04
0.41 -2.56 -0.6 -0.77 -0.0 0.92 0.26 -0.07 -0.14 0.66 -0.71 0.17
-0.04 0.0 -0.14 -0.13 -0.04 0.1 -0.07 0.14 0.04 0.04 -0.01 0.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.