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Heatmap: Cluster_138 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.08 0.05 0.15 -0.31 -0.15 -0.29 -0.25 -0.06 0.05 0.03 0.36 0.3
-0.09 0.09 -0.15 -0.02 0.13 -0.71 0.28 0.04 0.16 0.09 -0.09 0.05
-0.59 -0.18 -0.22 0.61 -0.16 0.16 0.12 -0.15 -0.21 -0.17 -0.57 0.72
-0.03 -1.18 0.1 -1.05 0.25 -0.58 -0.07 0.92 -0.16 -0.34 -0.04 0.75
-0.34 -1.51 -0.19 0.23 -0.56 0.6 0.18 0.34 0.23 -0.45 -0.54 0.69
-0.59 -0.11 -0.13 0.02 -0.29 -0.33 0.32 0.44 0.2 0.2 -0.01 -0.04
-0.77 -0.17 0.07 0.14 0.02 -0.43 -0.22 0.32 -0.8 0.1 0.19 0.79
-0.16 -0.3 -0.24 -0.27 0.15 0.38 0.2 0.11 -0.05 -0.07 -0.37 0.36
-0.58 0.16 -0.08 0.04 -0.12 0.26 -0.01 0.16 -0.19 -0.01 -0.07 0.26
0.21 0.13 -0.22 -0.44 -0.06 0.08 -0.14 -0.2 -0.01 -0.02 -0.02 0.49
- - 0.38 - - - -2.29 -0.53 -0.61 -0.65 2.12 2.06
-0.45 -0.21 -0.05 0.07 -0.01 -0.01 -0.08 -0.04 0.12 0.18 0.22 0.14
- - 0.52 0.97 0.68 1.16 - - - - 2.26 -
-0.15 -0.01 0.03 0.01 -0.1 -0.15 0.1 0.04 0.03 0.03 0.06 0.1
0.06 0.06 -0.11 0.02 -0.01 -0.19 -0.01 -0.14 0.05 0.02 0.06 0.16
-0.1 -0.07 -0.01 -0.21 -0.11 -0.16 -0.26 -0.2 0.27 0.31 0.2 0.18
- - - 1.76 - - - 0.81 0.42 - 2.04 0.5
-2.75 -0.46 -0.57 -0.04 0.15 0.0 0.42 0.34 0.51 0.42 0.43 -0.61
-1.39 -0.37 0.02 -0.68 0.37 -0.85 0.05 -2.17 -0.02 -0.06 0.88 1.21
-0.01 -0.02 -0.04 -0.13 -0.06 0.0 -0.08 0.01 0.02 0.07 0.11 0.11
1.12 -0.07 -1.19 -0.35 0.29 -1.44 -0.65 0.35 -0.07 -0.03 -0.18 0.4
-0.39 -0.06 -0.15 -0.09 -0.1 -0.02 -0.12 0.08 0.06 0.14 0.26 0.27
-0.23 0.07 -0.06 0.04 -0.34 -0.46 -0.0 0.1 0.35 0.03 0.12 0.19
-0.08 -0.15 -0.14 0.02 0.17 -0.37 0.07 -0.1 0.2 0.09 0.1 0.08
-0.48 -2.15 -0.77 0.97 -0.35 -0.51 0.58 0.11 0.02 0.61 0.29 -0.52
0.12 -0.06 -0.15 0.03 0.02 -0.32 0.05 0.14 0.13 -0.0 -0.0 -0.01
-0.08 -0.14 -0.02 -0.04 0.07 0.01 -0.07 -0.02 0.12 -0.04 0.1 0.1
-0.57 -0.33 -0.11 0.08 -0.12 0.19 0.07 -0.19 0.1 -0.16 0.13 0.58
-0.38 -0.2 -0.11 0.06 0.07 0.19 0.04 -0.12 0.07 0.2 0.05 0.02
-0.52 0.2 -0.06 -0.07 0.03 -0.1 0.19 0.36 0.03 0.09 -0.17 -0.16
-0.14 -0.24 -0.35 -0.1 0.12 -1.1 0.36 0.05 0.25 0.04 0.31 0.27
- - -0.21 1.64 0.11 - -1.02 - 0.06 0.84 1.62 -0.88
0.09 -0.07 -0.5 -0.07 0.25 0.46 0.4 0.36 0.04 0.13 -0.78 -1.16
-0.33 -0.08 -0.15 -0.19 -0.02 -0.15 -0.07 0.02 0.19 0.05 0.24 0.34
-0.12 0.02 0.05 -0.12 -0.02 -0.0 0.06 0.01 0.14 -0.02 -0.05 0.04
-1.57 -1.53 0.22 1.01 -2.25 0.39 0.04 -0.43 -0.46 0.4 -0.95 1.19
-0.4 0.11 0.24 -1.15 -0.07 -0.1 0.55 -0.28 0.58 -0.05 -0.25 0.08
-0.82 -1.3 0.57 0.41 -0.25 0.12 0.53 -0.68 0.25 -0.5 -0.19 0.52
0.05 -0.14 -0.18 -0.08 0.06 -0.05 0.11 0.19 0.1 -0.0 -0.11 0.01
-0.11 0.02 -0.06 0.41 -0.0 0.23 -0.2 0.02 -0.43 -0.46 -0.2 0.47
-0.08 0.12 -0.11 0.01 0.04 -0.17 -0.13 0.11 -0.01 -0.12 0.0 0.28
0.14 -0.08 -0.06 0.04 0.09 -0.18 -0.06 0.04 -0.01 -0.03 -0.01 0.09
-0.23 -0.41 -0.02 0.01 -0.0 0.25 -0.11 -0.09 0.01 0.28 0.03 0.16
-0.36 -0.11 -0.04 0.02 0.03 -0.04 0.11 0.19 0.17 -0.02 0.01 -0.05
-0.36 -0.2 -0.07 0.07 0.11 -0.05 0.11 0.1 0.08 0.04 -0.02 0.11
0.24 -1.82 -0.97 - -1.78 -1.04 -0.06 0.21 -1.04 -0.05 1.75 1.22
-0.43 -0.67 -0.22 -0.44 0.42 -0.05 -0.55 -1.0 0.28 0.09 0.33 1.01
-1.05 -0.53 -0.39 0.09 0.43 0.6 -0.01 0.24 0.39 0.14 - 0.62
-0.52 0.09 -0.35 -0.5 -0.33 -0.14 -0.14 0.37 -0.04 0.07 0.7 0.26
-1.28 0.46 0.33 1.01 -0.48 -0.44 0.23 -0.86 -0.66 -1.53 0.84 -0.01
0.02 -0.35 -0.0 -0.35 -0.18 -0.18 -0.02 -0.02 0.27 -0.03 0.27 0.36
-0.73 0.2 -0.06 0.26 -0.09 -0.12 -0.03 -0.34 0.08 0.18 0.33 0.02
-0.83 -0.03 -0.2 0.69 -0.35 0.07 -0.71 -0.49 -0.2 0.34 -0.19 0.84
-1.58 0.33 -0.05 0.15 0.34 0.55 -0.53 -0.38 -0.65 -0.27 0.13 0.67
-1.05 0.22 -0.52 0.2 -0.31 0.02 0.15 -0.05 -0.21 0.11 0.49 0.32
-0.32 0.12 0.12 -0.05 0.05 -0.65 0.32 0.05 0.11 0.03 0.19 -0.23
-0.19 -0.2 -0.17 0.01 0.06 0.1 0.1 -0.03 -0.02 0.13 0.11 0.05
-0.29 -0.91 -0.42 -0.03 -0.22 0.07 0.31 0.04 0.12 0.18 0.29 0.4
-0.21 0.18 -0.11 -0.37 -0.22 0.08 -0.11 -0.35 -0.06 -0.11 0.4 0.56
-0.24 -0.14 -0.11 -0.3 0.0 -0.09 -0.06 -0.04 0.27 0.23 0.16 0.19
-1.21 -1.33 -0.26 0.7 -1.11 0.27 0.52 -0.33 -0.01 -0.25 0.34 0.78
- - - 2.25 - - - - 0.5 - 2.54 -
-0.91 0.17 -0.29 0.08 -0.1 0.13 -0.04 -0.33 0.19 0.09 0.11 0.47
-0.47 -0.18 -0.47 -0.18 -0.1 -0.16 0.11 0.05 -0.08 0.42 0.36 0.35
-0.93 0.62 -0.55 0.22 -0.03 0.3 0.08 -0.64 0.06 0.1 0.58 -0.77
- -0.69 -1.4 1.38 -0.16 - 0.12 0.2 - -0.28 2.15 -
-0.08 -0.34 -0.46 0.33 0.31 -0.6 0.07 -0.07 0.21 0.09 0.08 0.13
-0.65 -0.27 -0.24 0.09 -0.2 -0.12 0.24 0.38 -0.05 0.16 -0.17 0.46
-0.34 -0.13 -0.03 0.01 0.04 -0.05 -0.04 0.21 0.18 0.07 -0.03 0.01
0.1 0.06 -0.13 -0.07 0.03 -0.06 -0.15 -0.05 -0.02 0.04 0.05 0.17
- -0.39 0.3 0.78 -0.96 - 0.46 0.38 0.83 0.62 0.75 -3.19
0.44 - - - - - -0.72 - - 1.78 1.64 1.8
0.0 -0.12 -0.09 0.11 -0.04 -0.17 0.09 0.06 -0.06 -0.05 0.17 0.07
-1.11 -0.52 -0.22 0.38 -0.15 -0.64 0.42 0.33 0.99 -0.01 0.56 -3.35
0.12 0.16 -0.13 -0.04 -0.17 0.23 0.22 -0.26 -0.09 -0.01 0.15 -0.31
-0.26 0.06 0.01 0.22 -0.17 -0.1 0.19 0.14 0.11 -0.08 -0.33 0.1
-0.04 -0.1 -0.04 0.1 -0.0 -0.24 0.05 0.13 -0.12 -0.06 0.09 0.19
-0.11 0.29 -0.07 -0.28 -0.33 -0.2 0.22 0.13 -0.1 0.12 -0.55 0.52
-0.88 -0.38 0.32 -0.88 -0.12 -0.34 0.31 0.21 0.43 0.24 0.03 0.31
- -0.77 0.54 -0.05 0.12 0.59 -0.43 -0.18 -0.05 0.63 0.28 0.07
-0.75 -0.32 -1.4 0.22 0.07 -1.13 0.7 0.16 0.49 0.03 0.11 0.38

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.