Heatmap: Cluster_130 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.09 -0.15 -0.04 -0.01 0.02 -0.02 -0.06 -0.06 0.03 0.0 0.02 0.15
0.21 0.09 0.08 -0.18 -0.14 -0.23 -0.05 -0.08 0.28 0.02 -0.13 0.03
-0.38 -0.47 -0.32 -0.22 0.24 -0.11 0.1 0.09 0.39 0.45 0.06 -0.18
-0.06 -0.11 -0.02 -0.0 0.02 -0.08 0.01 0.02 0.1 0.04 0.12 -0.05
0.07 -0.01 -0.05 -0.0 -0.1 -0.05 -0.04 -0.13 0.0 0.04 0.11 0.14
0.22 0.11 0.14 0.15 -0.11 -0.49 0.05 -0.08 0.01 -0.06 -0.16 0.08
-0.07 -0.36 -0.07 0.13 -0.19 -0.2 0.02 0.08 0.16 0.1 0.29 -0.02
0.11 -0.02 -0.08 -0.21 -0.08 -0.07 -0.05 -0.03 0.14 0.11 0.02 0.11
0.22 -0.19 -0.32 -0.18 -0.04 -0.11 0.0 0.01 0.15 0.09 0.08 0.18
0.24 -0.3 0.03 0.03 -0.04 -0.3 -0.03 0.06 0.15 0.12 -0.04 -0.04
0.13 -0.13 -0.36 -0.21 -0.31 -0.05 -0.09 -0.02 0.26 0.19 0.09 0.31
-0.05 -0.1 -0.17 -0.16 0.05 -0.25 0.05 -0.03 0.2 0.25 0.15 -0.05
0.21 -0.06 -0.18 -0.23 -0.1 -0.22 0.16 0.07 0.16 0.09 0.03 -0.02
0.02 -0.12 -0.12 -0.27 -0.05 -0.0 -0.01 -0.03 0.1 0.13 0.14 0.14
0.18 -0.05 -0.07 -0.14 0.01 -0.18 -0.03 0.0 0.13 -0.01 0.05 0.07
0.14 -0.05 -0.06 -0.05 -0.05 -0.09 -0.08 -0.06 0.02 0.02 0.07 0.16
-0.02 -0.07 -0.19 -0.25 0.03 -0.14 0.03 0.13 0.23 0.22 0.01 -0.07
0.18 -0.25 -0.24 -0.09 -0.06 -0.24 -0.14 0.08 0.2 0.21 0.24 -0.03
0.26 -0.22 -0.39 -0.42 -0.12 -0.14 -0.06 0.05 0.31 0.24 0.23 0.01
-0.11 -0.48 -0.13 0.05 0.16 -0.05 0.02 -0.05 0.26 0.2 0.04 -0.04
0.2 -0.07 -0.07 0.01 -0.02 -0.13 -0.04 -0.1 0.06 0.01 -0.0 0.1
-0.06 -0.06 -0.1 -0.17 -0.01 -0.16 0.11 -0.01 0.38 0.06 -0.1 0.04
-0.04 -0.1 0.04 -0.06 -0.03 -0.03 -0.07 -0.01 0.12 0.05 0.08 0.03
0.76 -0.22 -0.25 -0.88 -0.11 -0.44 -0.18 -0.24 0.31 0.43 0.15 -0.04
0.19 0.03 -0.04 -0.02 -0.05 -0.09 -0.05 -0.1 0.03 -0.02 0.08 0.02
0.78 0.19 -0.34 -0.97 -0.44 -0.44 -0.02 0.11 0.25 0.1 0.02 0.02
0.55 0.04 -0.23 -0.04 -0.22 -0.25 -0.16 -0.19 -0.01 -0.0 0.12 0.18
-0.1 -0.38 -0.66 -0.04 0.26 -0.21 -0.11 -0.01 -0.1 0.35 0.36 0.28
0.12 0.09 -0.01 -0.09 -0.01 -0.35 -0.18 0.02 0.25 0.03 0.05 0.0
0.03 -0.07 -0.05 -0.15 -0.02 -0.13 0.03 -0.02 0.18 0.03 0.13 0.01
0.07 -0.25 -0.24 -0.08 0.04 -0.03 -0.15 -0.23 0.3 0.16 0.09 0.2
0.16 -0.09 -0.06 -0.1 0.03 -0.08 -0.08 0.04 0.08 -0.01 0.03 0.06
0.08 -0.07 -0.09 -0.0 -0.05 -0.11 -0.03 0.0 0.05 0.03 0.05 0.13
-0.03 -0.26 -0.24 0.07 0.06 -0.04 0.0 0.12 0.06 0.19 0.04 -0.03
0.09 -0.05 -0.08 -0.08 -0.02 -0.07 -0.06 -0.01 0.08 0.0 0.04 0.14
0.07 -0.11 -0.04 -0.05 -0.01 -0.13 -0.02 -0.02 0.08 0.06 0.08 0.07
-0.03 -0.29 -0.28 -0.18 -0.04 -0.04 -0.01 0.16 0.08 0.2 0.17 0.16
0.17 -0.11 0.01 -0.05 -0.04 -0.05 -0.09 -0.12 0.1 -0.01 0.05 0.1
0.18 -0.13 0.04 -0.08 -0.35 -0.29 -0.21 -0.47 0.35 0.18 0.22 0.29
0.08 -0.28 -0.21 -0.37 -0.04 -0.08 -0.04 -0.19 0.45 0.25 0.06 0.15
-0.04 -0.05 -0.06 -0.22 -0.02 -0.26 0.04 -0.05 0.27 0.16 0.07 0.08
-0.04 0.01 -0.08 -0.14 0.01 -0.21 0.09 0.18 0.08 0.06 -0.03 0.04
0.01 - -2.92 - -2.76 -2.1 -1.4 -1.28 0.34 1.66 1.42 1.38
0.18 -0.09 -0.1 -0.06 0.02 -0.1 0.0 -0.09 0.12 -0.04 -0.0 0.13
0.9 0.2 -0.33 -0.39 -0.54 -0.27 -0.16 -0.46 -0.07 0.08 0.35 0.01
0.21 -0.05 -0.11 -0.14 0.05 -0.14 -0.12 -0.06 0.09 0.12 0.1 -0.0
0.01 -0.46 -0.15 -0.18 0.16 -0.36 0.11 -0.03 0.21 0.13 0.28 0.09
0.23 -0.11 -0.11 0.02 0.01 -0.08 -0.02 -0.15 0.02 -0.02 0.0 0.17
-0.96 -1.25 0.03 -0.81 -0.17 -1.44 -0.44 0.14 -0.51 0.8 1.1 0.84
0.11 -0.23 -0.21 -0.39 -0.0 -0.07 0.01 -0.01 0.21 0.16 0.22 0.07
0.16 0.18 -0.08 0.01 -0.23 -0.06 -0.41 -0.45 -0.12 0.06 0.18 0.48
0.17 -0.01 -0.02 0.11 -0.04 -0.14 -0.02 -0.04 -0.01 -0.04 -0.01 0.03
0.25 -0.09 0.02 -0.21 -0.13 -0.12 0.13 -0.21 0.01 -0.06 0.19 0.13
0.19 -0.1 -0.04 -0.01 -0.02 -0.17 0.07 -0.07 0.06 -0.03 -0.06 0.12
0.1 -0.04 -0.04 -0.12 -0.11 -0.19 -0.0 0.02 0.04 0.14 0.1 0.06
0.16 -0.02 -0.06 -0.1 -0.1 -0.11 -0.09 -0.05 -0.01 0.07 0.12 0.15
0.46 -0.22 -0.08 -0.55 -0.4 -1.22 -0.02 -0.91 -0.03 0.52 0.55 0.63
-0.12 -0.17 -0.12 0.02 0.14 0.04 0.07 0.12 0.05 0.11 0.05 -0.24
0.0 -0.07 -0.09 -0.14 -0.01 -0.07 0.01 0.09 0.13 0.08 0.02 0.03
0.16 -0.08 -0.08 -0.03 -0.12 -0.05 -0.1 -0.08 0.09 0.05 0.08 0.12
0.14 -0.0 -0.08 -0.14 -0.1 -0.12 0.01 0.02 0.09 0.07 0.08 -0.0
0.12 -0.13 -0.11 -0.28 -0.06 -0.21 -0.06 -0.05 0.15 0.19 0.17 0.16
0.22 0.03 -0.03 -0.03 0.03 -0.12 -0.01 -0.1 0.06 -0.05 0.03 -0.05
0.19 -0.01 -0.13 -0.28 0.01 -0.39 0.04 -0.08 0.12 0.06 0.02 0.3
0.45 0.11 -0.15 -0.21 -0.25 -0.08 -0.06 -0.06 -0.07 -0.01 0.09 0.09
0.56 0.06 -0.04 -1.01 0.05 -0.08 -0.01 0.03 0.16 0.16 0.09 -0.48
0.1 -0.02 -0.14 0.05 -0.11 -0.1 -0.1 -0.0 0.06 0.12 0.1 0.01
-0.09 -0.12 -0.19 -0.32 -0.05 0.02 0.02 -0.0 0.45 0.04 0.08 0.01
-0.02 -0.26 -0.2 -0.13 0.04 -0.02 0.1 -0.03 0.18 0.1 0.1 0.08
0.13 -0.12 -0.13 -0.03 0.06 -0.21 0.0 -0.05 0.08 0.05 0.11 0.07
0.07 -0.02 -0.03 -0.06 -0.03 -0.09 -0.03 -0.02 0.01 0.05 0.12 0.03
0.16 0.13 -0.12 -0.35 -0.18 -0.11 0.01 -0.08 -0.07 0.06 0.17 0.27
0.07 -0.15 -0.21 -0.31 -0.0 -0.08 -0.04 0.01 0.14 0.13 0.24 0.11
0.5 -0.47 -0.38 -0.56 -0.03 -0.35 0.32 -0.01 0.14 0.3 0.16 -0.05
0.07 -0.07 -0.09 -0.01 -0.05 -0.04 -0.03 -0.0 0.06 0.05 0.03 0.07
-0.03 -0.1 -0.16 -0.1 0.0 -0.16 -0.02 0.03 0.22 0.12 -0.01 0.17
0.11 -0.12 -0.11 -0.06 -0.04 -0.05 -0.0 -0.1 0.13 0.04 0.07 0.12
0.04 -0.26 -0.21 -0.16 0.13 -0.06 0.04 -0.08 0.22 0.03 0.07 0.16
0.31 -0.22 -0.59 -0.39 -0.29 0.03 -0.02 0.04 0.27 0.2 -0.02 0.36
0.16 -0.02 -0.12 0.02 -0.03 -0.15 -0.1 -0.11 0.04 0.09 0.04 0.14
0.18 -0.02 -0.08 -0.03 -0.07 -0.18 -0.09 -0.05 0.1 0.06 0.06 0.07
0.15 -0.1 -0.09 -0.06 0.01 -0.14 -0.04 -0.04 0.01 0.03 0.1 0.13
0.11 -0.03 -0.05 -0.04 -0.08 -0.08 -0.07 -0.04 0.06 0.01 0.11 0.08
0.29 0.04 -0.1 -0.01 -0.04 -0.25 -0.14 -0.12 0.02 0.01 0.08 0.14
0.06 -0.31 -0.24 -0.06 0.08 -0.14 0.12 -0.04 0.22 0.1 0.08 0.04
0.03 -0.17 -0.11 -0.02 -0.05 -0.12 0.07 -0.13 0.31 0.21 0.04 -0.16
0.14 -0.04 -0.06 -0.03 -0.06 -0.11 -0.05 -0.03 -0.01 0.03 0.11 0.1
0.08 -0.03 -0.08 -0.05 -0.06 -0.08 0.02 0.03 0.12 0.03 -0.01 0.01
0.15 -0.11 -0.12 -0.12 -0.06 0.01 -0.01 -0.04 0.11 -0.01 -0.04 0.19
0.2 0.13 -0.27 -0.34 -0.18 -0.13 -0.02 -0.08 -0.01 0.2 0.19 0.17
0.15 -0.02 -0.07 -0.06 -0.06 -0.1 -0.09 -0.09 0.05 0.03 0.09 0.14
-0.0 -0.05 -0.15 -0.12 -0.03 -0.1 -0.03 0.04 0.22 0.12 0.03 0.03
0.2 -0.07 -0.03 -0.08 -0.03 -0.07 -0.05 -0.09 0.04 0.05 0.05 0.05
0.1 -0.06 -0.09 -0.05 -0.09 -0.04 -0.04 -0.03 0.04 0.09 0.1 0.04
0.15 0.01 -0.11 -0.04 -0.0 -0.04 -0.08 -0.08 0.01 0.0 0.05 0.09
0.14 -0.08 -0.15 -0.31 -0.1 -0.22 0.07 0.05 0.26 0.14 0.1 0.01
0.16 0.0 -0.06 -0.2 -0.08 -0.11 -0.07 -0.01 0.15 0.11 0.03 0.03
0.17 0.03 -0.0 0.09 -0.03 -0.2 -0.06 -0.12 -0.05 0.01 0.08 0.04
-0.0 0.0 -0.07 -0.02 -0.06 0.04 -0.04 0.01 0.1 0.01 0.06 -0.05
0.2 -0.13 0.02 -0.05 -0.02 -0.24 0.0 -0.09 0.06 0.02 0.08 0.1
0.15 -0.17 -0.15 -0.13 -0.08 -0.06 -0.06 -0.08 0.13 0.07 0.18 0.15
0.01 -0.16 -0.2 -0.07 -0.03 -0.15 0.08 0.09 0.14 0.23 0.08 -0.09
0.32 -0.69 -0.34 -0.33 -0.17 -0.5 -0.21 0.08 0.25 0.27 0.15 0.62
0.1 -0.09 -0.13 -0.1 -0.03 -0.08 -0.08 -0.06 0.14 0.13 0.12 0.05
0.11 -0.08 -0.05 -0.15 -0.07 -0.05 -0.05 -0.01 0.07 0.03 0.07 0.15
0.15 -0.11 -0.39 -0.74 -0.06 -0.26 0.14 0.13 0.5 0.29 0.1 -0.14
0.57 0.19 -0.12 -0.17 -0.39 -0.2 -0.1 -0.16 0.04 0.09 0.05 -0.02
0.21 -0.05 -0.07 -0.19 -0.07 -0.24 0.07 0.1 0.12 0.04 0.02 -0.0
0.15 -0.29 0.59 -0.05 -0.16 -0.69 -0.51 0.16 0.11 0.45 0.51 -1.37
0.12 -0.08 -0.11 -0.09 0.08 -0.23 -0.09 -0.04 0.15 0.1 0.16 -0.02
0.16 -0.09 -0.06 -0.09 -0.04 -0.2 -0.04 -0.01 0.13 0.15 0.08 -0.05
0.09 -0.13 -0.06 0.04 -0.04 -0.12 -0.13 -0.02 0.05 0.07 0.13 0.1
0.84 -0.65 0.4 -0.08 -0.06 -0.4 0.49 -1.01 -0.5 -1.3 -0.42 0.87
0.34 -0.08 -0.13 -0.02 -0.22 -0.14 -0.07 -0.1 0.18 0.08 0.16 -0.11
-0.09 -0.3 -0.21 -0.39 0.05 0.04 -0.07 0.04 0.22 0.1 0.28 0.15
0.06 -0.31 -0.19 -0.04 -0.16 0.12 -0.06 -0.04 -0.06 0.14 0.43 -0.02
0.15 -0.17 -0.06 -0.07 0.04 -0.04 -0.09 -0.04 0.04 0.04 0.1 0.07
0.09 -0.09 -0.02 -0.04 0.11 -0.09 -0.06 -0.06 0.06 -0.02 -0.02 0.11
0.07 -0.11 -0.15 -0.12 -0.08 -0.01 -0.01 -0.09 0.12 0.09 0.13 0.13
-0.04 -0.01 -0.04 -0.09 0.01 0.0 0.07 -0.03 0.13 0.09 -0.01 -0.1
0.08 0.1 -0.31 -0.11 0.08 -0.18 0.0 0.02 0.2 0.1 0.01 -0.06
0.04 -0.06 0.0 -0.19 0.07 -0.31 -0.0 -0.07 0.12 0.1 0.16 0.08
0.21 -0.23 -0.03 -0.09 -0.31 -0.11 -0.16 -0.11 0.13 0.14 0.1 0.32
0.03 -0.01 -0.11 -0.13 -0.0 -0.03 -0.15 0.04 -0.01 0.08 0.13 0.12
0.35 0.1 -0.14 -0.19 -0.34 -0.07 0.06 -0.06 -0.03 0.04 0.07 0.09
0.09 0.01 -0.17 -0.21 -0.05 -0.2 0.02 0.09 0.16 0.12 0.02 0.06
0.09 0.02 -0.19 -0.23 -0.06 -0.17 -0.08 -0.24 0.07 0.16 0.23 0.28
-0.23 -0.28 -0.05 -0.32 0.1 -0.27 0.03 0.07 0.3 0.4 -0.04 0.09
-0.09 -0.03 -0.11 -0.29 0.0 -0.43 0.17 0.09 0.23 0.3 -0.09 0.09
0.12 -0.09 -0.1 0.08 0.03 -0.03 -0.07 -0.08 0.01 -0.0 0.05 0.06
0.13 -0.06 -0.12 -0.23 -0.05 -0.24 0.07 0.09 0.21 0.16 -0.01 -0.02
0.14 -0.04 -0.21 -0.2 0.06 -0.27 -0.17 -0.15 0.17 0.05 0.24 0.24
0.01 -0.06 -0.1 -0.14 -0.08 -0.05 -0.09 0.02 0.05 0.17 0.12 0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.