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Heatmap: Cluster_58 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.41 -0.67 -0.48 0.04 -0.43 -1.31 -1.57 0.27 -0.63 0.85 0.57 1.18
- - -0.79 - -1.04 -2.32 -0.79 1.28 0.22 -1.76 -0.64 2.49
-0.03 0.04 -0.25 -0.3 -0.13 0.05 0.02 0.12 0.05 0.08 0.11 0.17
0.14 -0.24 -0.19 -0.03 0.0 -0.16 0.02 -0.06 0.16 -0.01 0.09 0.21
- -0.66 0.03 -2.09 -0.17 -1.46 -1.04 -0.04 0.19 -0.17 1.05 1.73
-0.23 -0.04 -0.06 0.05 -0.02 -0.38 -0.17 0.0 0.07 0.17 0.19 0.29
-1.26 -2.17 -0.5 - -0.17 -0.62 0.02 -0.13 0.54 0.38 1.21 1.09
-0.02 0.03 -0.1 -0.18 -0.01 0.08 -0.01 -0.06 0.07 0.04 -0.05 0.17
0.11 -0.18 -0.04 -0.01 0.08 0.01 -0.06 0.04 -0.04 0.03 0.1 -0.04
-0.1 -0.28 -0.05 0.34 -0.23 0.02 -0.2 -0.31 0.08 0.03 0.02 0.46
-0.71 -0.45 0.21 -0.08 -0.23 -0.27 -1.66 0.19 0.6 -0.27 0.56 0.67
-0.49 -0.58 -0.05 -0.61 -0.1 -0.03 -0.18 0.09 0.06 0.08 0.39 0.78
-0.78 0.54 -0.39 -0.81 0.43 - 0.99 - 0.29 -1.36 0.01 1.43
0.63 -0.71 -0.52 -0.14 0.15 0.03 -0.92 0.25 -0.74 0.17 0.29 0.53
- -2.74 -0.85 0.37 0.48 -0.12 0.36 -0.79 -0.2 0.64 0.91 0.6
-0.31 0.06 -0.06 -0.16 -0.02 0.17 -0.09 -0.07 0.07 -0.01 0.13 0.21
-0.83 -0.2 -0.37 -0.69 0.06 -0.45 0.19 0.22 0.35 0.27 -0.23 0.81
0.49 -0.38 -0.64 -0.14 -0.14 -0.91 -0.16 -0.8 -0.05 0.16 1.08 0.23
0.27 -2.78 -1.48 0.71 0.81 -1.01 -0.07 0.64 -0.71 -1.08 -0.86 1.18
-0.19 -0.18 -0.32 0.51 0.25 -1.38 0.03 -0.99 -0.45 -1.63 1.27 0.54
0.28 -1.95 -0.82 - -0.8 -1.21 0.07 -0.31 0.66 0.69 -1.21 1.8
-0.43 -0.12 -0.02 -0.01 0.28 -0.33 0.02 0.08 0.19 0.01 0.07 0.12
-0.07 -0.21 -0.23 -0.19 -0.14 0.05 0.05 0.06 0.07 0.15 0.1 0.27
0.3 -0.84 -0.66 -0.74 -0.51 -0.71 -0.91 -1.84 0.58 0.58 1.08 0.8
-0.25 -0.07 -0.24 0.02 0.01 0.03 -0.12 0.06 -0.01 0.1 0.16 0.23
-0.88 -0.74 -0.35 -0.29 0.43 -0.14 -0.05 0.2 0.19 0.04 0.41 0.48
-0.21 0.06 -0.09 -0.2 0.01 -0.1 -0.03 -0.12 -0.14 0.02 0.26 0.39
-0.43 - -1.06 1.41 -1.35 -0.64 -2.09 0.32 -1.39 - -1.07 2.25
-0.01 -0.15 -0.24 0.07 -0.02 -0.11 0.11 -0.05 -0.07 0.02 0.16 0.24
0.09 -0.46 -0.64 -0.24 0.19 -0.01 -0.14 0.11 -0.01 0.28 0.2 0.32
- - 0.64 1.56 -0.28 -0.12 -2.38 0.08 - - -2.12 2.09
-0.35 0.01 -0.02 -0.1 -0.06 -0.25 0.02 0.23 0.01 0.16 0.03 0.21
-2.07 -0.04 -1.99 0.12 0.3 -0.62 -0.69 0.46 -0.34 0.53 0.49 0.95
-0.05 -1.34 -0.21 0.31 0.42 -1.07 -0.33 0.1 -0.02 -0.61 0.74 0.63
0.16 -0.02 -0.2 -0.27 -0.12 -0.16 -0.09 -0.07 0.06 -0.16 0.2 0.49
0.05 0.11 -0.21 -0.22 -0.17 -0.01 -0.08 0.0 -0.05 -0.15 0.2 0.41
0.24 -0.07 -0.14 -0.19 0.03 -0.14 -0.04 -0.01 0.03 -0.05 0.05 0.23
0.01 -0.15 -0.29 0.02 -0.25 -0.11 -0.16 -0.16 0.0 0.27 0.18 0.44
-0.11 -0.46 -0.34 -0.07 -0.38 -0.19 -0.18 0.1 0.1 0.17 0.09 0.81
0.04 -0.24 -0.21 -0.1 -0.12 0.06 -0.24 0.1 -0.1 0.21 0.47 -0.06
-0.22 0.28 -0.07 0.04 -0.05 -0.31 0.0 -0.23 0.09 -0.07 0.28 0.13
-0.41 -0.62 0.02 0.36 0.05 -0.53 -0.26 0.06 -0.23 0.24 0.23 0.58
-0.07 -0.24 -0.15 -0.27 -0.06 -0.2 0.03 0.31 -0.01 0.08 0.06 0.37
0.09 0.17 -0.32 -0.1 -0.17 -0.44 -0.28 -0.01 0.07 -0.25 0.07 0.77
0.13 0.08 -0.11 -0.14 -0.06 -0.11 0.05 -0.07 0.04 -0.12 0.12 0.15
0.11 0.06 -0.21 -0.38 -0.19 0.01 0.02 0.06 0.06 0.06 0.16 0.14
-0.11 -0.39 -0.12 -0.11 -0.04 -0.13 0.01 0.06 -0.06 0.38 0.16 0.22
-0.37 -0.9 0.06 -0.02 0.22 -0.34 0.36 -0.13 0.04 -0.16 0.1 0.6
-0.55 0.1 0.18 -0.24 0.2 -0.59 0.0 0.12 0.03 -0.15 0.11 0.46
- - - - -0.29 - 0.39 - 1.35 0.32 -0.01 2.35
-0.06 -0.14 0.0 -0.19 0.05 -0.04 -0.02 0.06 0.11 0.09 0.01 0.08
-0.27 -0.05 -0.21 -0.46 -0.25 0.31 0.03 0.17 0.09 0.16 0.15 0.13
-0.1 -0.06 -0.33 -0.29 -0.22 0.11 -0.04 0.11 0.05 0.21 0.07 0.35
-0.2 0.03 -0.05 -0.16 -0.0 0.09 -0.02 -0.11 0.12 0.11 0.05 0.1
-0.09 0.41 -0.55 -0.3 0.44 -0.25 -0.34 -0.62 0.28 -0.03 -0.13 0.58
-0.28 -1.08 -0.92 0.04 -0.22 -0.91 0.25 -0.04 0.04 0.64 0.41 0.75
-0.25 -0.06 -0.1 -0.04 0.1 -0.11 -0.05 -0.14 0.12 0.16 0.14 0.16
-0.13 0.02 -0.05 -0.1 -0.04 -0.08 0.11 0.01 -0.11 0.07 0.07 0.19
0.03 -0.39 -0.09 -0.03 0.03 -0.12 -0.09 -0.07 0.11 0.07 0.02 0.4
-0.06 0.09 -0.15 -0.16 -0.02 0.02 -0.03 0.03 0.06 0.07 0.03 0.1
-0.71 -0.99 0.28 0.11 0.66 -0.33 -0.02 -0.65 0.35 0.17 0.04 0.23
0.07 -0.63 -0.36 -0.77 -0.2 0.03 0.12 -0.31 0.24 0.46 0.25 0.49
- - -0.4 1.72 - - - - - - - 2.99
-1.07 0.47 -0.27 -0.13 0.23 -0.41 0.1 -0.42 0.42 -0.21 -0.02 0.54
-0.52 -0.16 -0.18 -0.05 -0.14 0.08 0.05 -0.01 -0.06 0.08 0.33 0.38
- - -0.11 - 0.61 -0.79 1.16 -0.48 -0.18 -1.12 1.09 1.35
0.1 0.07 -0.12 -0.16 -0.08 -0.04 0.01 0.06 0.06 -0.02 0.01 0.09
-0.16 -0.19 -0.11 0.18 -0.09 -0.09 -0.01 -0.0 -0.02 0.11 0.17 0.16
-0.02 -0.13 -0.11 -0.01 0.08 -0.13 -0.08 0.05 0.06 0.04 0.07 0.16
-0.07 -0.39 -0.31 -0.03 -0.0 -0.53 -0.16 0.07 0.22 0.26 0.21 0.42
-0.51 -0.54 0.18 0.2 -0.47 -0.72 -0.29 0.52 0.22 -1.05 0.39 0.84
-1.56 -0.7 -1.12 0.08 0.5 -0.58 0.51 -1.16 0.02 0.42 0.4 0.92
0.04 0.08 -0.19 -0.22 -0.05 -0.03 0.03 0.08 0.03 -0.0 0.01 0.18
-0.35 -0.81 -0.13 -1.64 -0.08 0.39 -0.01 -0.11 0.35 0.16 0.33 0.66
-0.17 -0.62 -0.68 0.05 -0.01 0.17 0.07 -0.11 -0.47 0.06 0.62 0.49
0.04 -1.73 - 1.06 -2.15 -1.86 -2.12 - -1.02 -1.23 1.64 1.93
0.02 -0.09 -0.1 -0.01 0.06 -0.09 -0.16 -0.02 0.07 -0.01 0.12 0.19
-0.3 -0.46 -0.2 0.1 0.08 -0.04 0.07 -0.03 0.13 0.06 0.15 0.27
- - - 1.0 - - 0.96 - -0.78 1.47 - 2.23
-0.86 -0.43 -0.69 0.71 -0.76 -0.96 0.22 0.74 -1.16 -0.02 0.35 0.85
-0.22 0.23 -0.32 -0.41 -0.04 -0.66 -0.15 -0.25 0.15 0.2 0.23 0.73
-0.36 0.14 -0.05 0.18 -0.05 -0.36 -0.1 -0.18 -0.11 0.14 0.08 0.46
0.06 -0.11 -0.18 -0.09 0.11 -0.38 -0.02 0.01 0.09 0.16 0.08 0.18
0.03 -0.52 0.14 0.08 -0.25 -0.22 -1.02 -0.96 0.04 0.06 0.89 0.58
0.16 -0.71 -0.06 0.21 -0.81 -0.26 0.42 -0.42 0.21 0.16 -0.07 0.52
0.1 0.11 -0.27 -0.17 -0.17 -0.21 -0.37 0.01 0.12 0.12 0.07 0.45
-0.05 -1.61 0.21 -1.23 -0.22 0.09 -0.08 -0.77 0.35 0.22 0.45 0.9
-0.78 -0.37 -0.13 -0.72 0.32 -0.16 0.11 -0.0 0.21 0.66 0.06 0.17
-0.68 -0.67 -0.39 0.05 0.15 -0.52 0.32 0.28 -0.08 -0.03 -0.28 0.95
-0.18 -0.95 -0.05 0.77 -1.25 -0.58 -0.06 0.04 -0.43 0.26 0.55 0.54
0.6 -0.73 -0.48 -0.78 -0.18 -0.87 0.06 0.16 0.22 0.42 0.37 0.24
-0.13 -0.14 -0.61 0.31 0.52 -0.12 0.0 0.01 -0.12 -0.49 0.05 0.32
- -0.83 0.35 -3.34 -0.0 -0.73 -0.38 -0.32 0.11 0.02 0.35 1.82
0.05 -0.11 -0.18 -0.01 -0.14 -0.12 -0.17 0.06 0.07 0.04 0.16 0.27
-0.09 -0.17 -0.02 -0.32 0.02 -0.12 0.0 0.07 0.16 0.16 0.13 0.1
-0.14 -0.13 -0.12 -0.08 -0.05 0.06 -0.03 0.01 0.09 0.07 0.11 0.17
-1.47 0.23 0.53 - 0.08 -1.18 -1.5 -0.8 -0.86 -0.14 1.32 1.4
-0.85 -0.07 -0.44 -0.4 0.1 0.16 0.01 -0.08 0.4 0.48 0.06 0.14
-0.16 -0.04 -0.11 -0.04 -0.05 -0.24 -0.26 0.08 0.04 0.15 0.4 0.09
0.15 0.04 -0.13 -0.21 -0.08 -0.06 -0.06 -0.0 0.09 0.04 0.06 0.13
-0.18 -0.21 -0.19 -0.11 0.1 -0.08 -0.05 -0.2 0.06 0.21 0.3 0.22
-0.97 -0.84 -1.32 0.46 0.21 -1.47 -0.41 0.62 0.24 0.59 -0.09 0.78
-0.0 -0.06 -0.04 -0.18 -0.12 0.07 0.02 0.09 -0.05 -0.0 0.17 0.08
- 0.98 -0.64 0.55 -0.75 - - 1.11 -2.4 - -2.07 2.24
-0.25 -0.37 -0.2 0.06 -0.02 -0.03 0.15 -0.1 0.04 0.21 0.04 0.32
-0.09 -0.21 -0.22 -0.35 -0.18 0.16 -0.02 -0.0 0.17 0.19 0.21 0.2
-0.22 -0.49 -0.19 0.2 0.03 -0.34 -0.1 -0.14 0.07 0.18 0.38 0.35
-2.02 1.38 -1.79 0.93 -1.35 -0.65 -3.18 -0.44 -1.1 -0.36 -0.33 1.6
-0.21 -0.11 -0.44 -0.63 -0.22 -0.23 0.41 -0.34 0.45 0.29 0.19 0.35
-0.79 -2.35 -0.18 -2.01 -0.51 -1.58 0.89 -1.55 1.09 0.62 0.56 0.79
-0.49 0.32 -0.84 0.14 0.07 -0.8 0.11 0.47 0.21 0.07 -0.16 0.26
-0.26 -0.76 -0.48 -1.31 0.08 -2.45 0.44 -0.87 0.48 0.89 0.23 0.92
-0.19 -0.04 -0.09 -0.41 -0.2 -0.17 -0.03 0.07 0.19 0.26 0.12 0.32
0.06 -0.5 -0.24 -0.03 -0.06 -0.11 -0.05 0.0 0.1 0.17 0.2 0.29
0.12 -0.04 -0.23 -0.37 -0.08 -0.11 0.04 0.09 0.12 -0.11 0.15 0.28

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.