Heatmap: Cluster_225 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.33 -0.38 -0.21 0.05 0.09 0.23 0.13 0.02 0.24 0.09 0.02 -0.12
-0.51 -0.51 -0.03 -0.14 0.06 0.31 0.17 -0.01 0.42 0.21 0.0 -0.29
-0.13 -0.09 -0.12 -0.07 0.0 0.07 0.0 0.18 0.12 0.06 0.07 -0.12
-0.22 -0.14 -0.21 -0.08 0.11 0.21 0.18 0.14 0.12 0.05 -0.06 -0.18
-0.23 -0.25 -0.14 -0.0 0.14 0.09 0.16 0.06 0.19 0.11 -0.07 -0.13
-0.03 -0.38 -0.3 -0.08 0.05 0.09 0.13 0.11 0.24 0.15 0.04 -0.13
-0.27 -0.64 -0.25 -0.17 0.05 0.13 0.2 0.3 0.34 0.08 0.07 -0.12
-0.42 -0.37 -0.14 -0.04 -0.02 0.2 0.02 0.21 0.33 0.03 0.03 -0.01
-0.01 -0.29 -0.26 -0.32 -0.05 -0.01 0.16 0.08 0.2 0.39 0.07 -0.13
-0.03 -0.21 -0.09 -0.06 0.05 0.19 -0.0 0.12 0.23 0.11 -0.09 -0.3
-0.23 -0.19 -0.12 -0.19 -0.1 -0.02 0.14 0.11 0.18 0.17 0.15 0.02
-0.02 -0.21 -0.15 -0.09 0.01 -0.03 -0.01 0.06 0.2 0.14 0.03 0.01
-0.06 -0.09 -0.2 -0.14 -0.01 0.04 0.04 0.13 0.23 0.12 0.02 -0.15
-0.14 -0.27 -0.19 -0.3 0.05 0.12 -0.01 0.17 0.21 0.09 0.24 -0.09
-0.18 -0.22 -0.2 -0.23 -0.08 0.07 0.07 0.16 0.04 0.12 0.23 0.11
-0.65 -0.32 -0.22 0.09 -0.01 0.13 0.21 0.39 0.26 0.13 -0.09 -0.23
0.06 -0.27 -0.34 -0.08 -0.23 -0.12 0.09 0.11 0.15 0.29 0.21 -0.02
-0.02 -0.33 -0.33 -0.35 -0.03 0.23 0.09 0.16 0.22 0.1 0.11 -0.01
-0.33 -0.23 -0.05 -0.11 0.09 -0.02 0.05 0.17 0.23 0.08 0.0 0.02
-0.15 -0.28 -0.51 -0.14 -0.07 0.02 0.14 0.03 0.18 0.33 0.28 -0.04
-0.26 -0.3 -0.21 -0.05 -0.06 -0.11 0.02 0.13 0.23 0.17 0.2 0.1
-0.09 -0.19 -0.0 -0.14 0.0 0.01 0.06 0.09 0.1 0.09 0.07 -0.04
-0.87 -0.9 -0.18 0.13 0.02 0.58 0.02 -0.61 0.18 0.39 0.29 0.14
-0.18 -0.33 -0.23 0.06 -0.06 0.05 -0.13 -0.09 0.25 0.26 0.2 0.05
-0.22 -0.21 -0.12 -0.1 -0.08 0.08 0.04 0.15 0.24 0.15 -0.03 0.02
-0.41 -0.37 -0.25 0.12 0.12 0.11 0.12 0.21 0.3 0.04 -0.04 -0.13
-0.2 -0.37 -0.23 0.04 0.01 0.08 0.0 0.04 0.16 0.24 0.22 -0.13
0.02 -0.18 -0.16 -0.19 0.01 0.1 0.08 0.13 0.18 0.12 0.02 -0.19
-0.24 -0.27 -0.21 -0.17 0.08 0.17 0.24 0.32 0.23 -0.01 -0.15 -0.18
-0.21 -0.26 -0.04 -0.09 -0.1 0.21 0.09 0.09 0.19 0.09 -0.01 -0.05
-0.59 -0.49 -0.26 -0.19 0.05 0.38 0.18 0.41 0.17 -0.09 0.12 -0.06
-0.41 -0.43 -0.21 0.05 0.05 0.28 0.03 0.29 0.25 0.1 -0.02 -0.18
-0.31 -0.38 -0.21 -0.16 0.03 0.13 0.07 0.21 0.26 0.12 0.04 0.06
-0.92 -0.51 -0.18 -0.15 0.22 -0.0 0.15 0.34 0.27 0.27 0.18 -0.15
-1.34 -1.29 -0.53 0.0 0.3 0.34 0.34 0.25 0.53 0.21 0.02 -0.09
-0.41 -0.24 -0.06 0.12 0.19 0.09 0.11 0.18 0.2 0.05 0.02 -0.44
0.11 -0.32 -0.27 -0.23 -0.02 -0.18 0.18 0.14 0.25 0.19 -0.04 0.04
-0.4 -0.26 -0.17 -0.13 0.02 0.03 -0.06 0.23 0.28 0.31 0.22 -0.28
-0.47 -0.52 -0.25 -0.01 0.18 0.38 0.16 -0.1 0.14 0.16 0.14 -0.07
-0.43 -0.04 0.05 0.16 0.04 0.05 0.05 0.11 0.21 -0.01 -0.06 -0.23
-0.08 -0.31 -0.17 -0.05 0.02 0.0 0.08 0.14 0.22 0.08 0.08 -0.08
-0.09 -0.4 -0.16 -0.13 0.08 -0.05 0.15 0.25 0.14 0.17 -0.13 0.03
-0.3 -0.36 -0.14 0.01 -0.0 0.1 0.17 0.12 0.27 0.02 0.06 -0.08
-0.33 -0.42 -0.1 -0.19 0.02 0.06 0.07 0.31 0.18 0.18 0.14 -0.1
-0.38 -0.43 -0.15 -0.03 0.11 0.13 0.23 0.25 0.16 0.19 -0.05 -0.26
-0.31 -0.03 0.01 0.2 0.04 -0.02 -0.05 0.06 0.16 0.07 0.04 -0.26
0.05 -0.37 -0.25 -0.26 -0.13 -0.08 0.21 -0.01 0.29 0.25 0.16 -0.03
-0.22 -0.16 -0.08 -0.08 -0.04 0.03 0.09 0.13 0.22 0.06 0.04 -0.05
-0.24 -0.5 -0.1 -0.09 -0.02 0.11 0.16 0.22 0.25 0.03 0.06 -0.04
-0.23 -0.23 -0.2 -0.03 0.02 0.08 0.05 0.22 0.2 0.08 0.04 -0.08
-0.13 -0.66 -0.15 -0.14 -0.05 0.19 0.24 0.34 0.42 0.04 -0.13 -0.3
-0.38 -0.48 -0.14 -0.09 0.08 0.13 0.25 0.35 0.26 0.1 -0.14 -0.18
-0.18 -0.32 -0.17 -0.08 -0.01 0.1 0.02 0.15 0.18 0.18 0.07 -0.04
-0.14 -0.3 -0.21 -0.1 0.01 0.02 0.04 0.09 0.18 0.22 0.14 -0.05
-1.36 -0.39 -0.24 0.03 0.24 -0.02 -0.32 -0.04 0.17 0.53 0.02 0.54
-0.14 -0.6 -0.17 -0.21 -0.11 0.35 0.26 0.17 0.17 0.31 -0.02 -0.34
-0.35 -0.38 -0.23 -0.13 -0.06 -0.11 0.06 0.23 0.27 0.21 0.2 0.1
-0.18 -0.43 -0.24 -0.01 0.13 0.2 0.15 0.12 0.26 0.01 -0.03 -0.13
-0.23 -0.52 -0.03 -0.11 0.09 0.11 0.22 0.25 0.13 0.17 -0.06 -0.2
-0.05 -0.21 -0.19 -0.21 -0.09 0.08 0.03 0.14 0.12 0.14 0.12 0.05
-0.12 -0.2 -0.2 0.01 0.01 0.04 -0.08 -0.04 0.12 0.14 0.06 0.2
-0.12 -0.24 -0.33 -0.22 -0.01 0.26 0.18 0.15 0.22 0.0 0.05 -0.08
-0.53 -0.44 -0.22 -0.12 0.22 0.12 -0.01 0.17 0.3 0.45 0.07 -0.39
-0.25 -0.24 -0.08 -0.12 0.1 -0.0 0.07 0.16 0.19 0.01 0.08 0.01
-0.61 -0.13 -0.13 -0.15 0.09 -0.03 0.06 0.06 0.22 0.21 0.17 0.06
-0.17 -0.22 -0.17 -0.01 0.06 0.09 0.1 0.2 0.18 -0.01 -0.03 -0.09
-0.33 -0.41 -0.24 -0.09 0.07 0.21 0.09 0.23 0.22 0.03 0.04 0.01
-0.15 -0.11 -0.09 -0.07 0.03 0.01 0.1 0.08 0.09 0.08 0.0 -0.01
-0.14 -0.1 -0.07 0.02 -0.07 0.07 0.02 0.04 0.27 0.12 -0.15 -0.07
-0.33 -0.18 -0.11 -0.05 -0.04 0.29 0.14 0.28 0.18 0.01 -0.04 -0.29
-0.14 -0.14 -0.05 -0.14 0.03 0.05 0.09 0.08 0.11 0.06 0.03 -0.01
-0.11 -0.25 -0.22 -0.16 0.04 0.12 0.09 0.03 0.18 0.08 0.06 0.07
-0.34 -0.24 -0.19 -0.09 0.1 0.0 0.05 0.12 0.22 0.07 0.2 -0.01
-0.41 -0.28 -0.23 0.07 0.09 0.14 0.16 0.14 0.21 0.04 -0.04 -0.03
-0.5 -0.36 -0.05 -0.05 0.05 -0.1 -0.06 0.21 0.25 0.27 0.14 -0.01
-0.34 -0.27 -0.18 -0.15 0.06 0.0 0.2 0.2 0.25 0.14 0.18 -0.28
-0.31 -0.3 -0.02 0.15 0.07 0.07 -0.03 0.11 0.31 0.11 -0.0 -0.31
-0.64 -0.63 -0.25 -0.01 0.02 0.32 0.12 0.02 0.26 0.12 0.22 0.08
-0.1 -0.23 -0.24 -0.17 -0.12 0.15 0.06 0.13 0.16 0.15 0.07 0.07
-0.39 -0.03 -0.11 0.2 0.1 0.04 0.05 0.05 0.36 -0.05 0.03 -0.43
-0.43 -0.43 -0.19 0.08 0.01 0.1 0.14 0.27 0.28 0.13 0.05 -0.25
-0.31 -0.36 -0.21 -0.07 -0.11 0.18 0.04 0.2 0.22 0.18 0.09 -0.0
-0.16 -0.4 -0.29 -0.24 0.11 0.11 0.23 0.33 0.26 0.0 -0.07 -0.08
-0.33 -0.4 -0.25 -0.21 0.07 0.21 0.02 0.17 0.41 0.25 -0.1 -0.07
-0.25 -0.38 -0.13 -0.12 0.1 0.15 0.06 0.14 0.17 0.23 0.03 -0.11
-0.16 -0.31 -0.18 -0.09 0.01 0.1 0.07 0.13 0.12 0.11 0.07 0.07
-0.17 -0.36 -0.28 -0.28 -0.08 0.22 0.11 0.16 0.16 0.28 0.17 -0.1
-0.46 -0.26 -0.13 0.0 -0.07 0.17 0.1 0.12 0.28 0.19 0.11 -0.22
-1.0 -1.13 -0.3 0.11 0.21 0.62 0.25 0.54 0.22 -0.0 -0.15 -0.4
-0.39 -0.51 -0.02 0.02 0.13 0.04 0.05 0.34 0.22 0.15 0.09 -0.37
-0.22 -0.18 -0.28 -0.19 0.02 0.05 0.18 0.11 0.18 0.36 0.1 -0.3
-0.44 -0.65 -0.37 -0.12 0.13 0.23 0.16 0.17 0.24 0.16 0.05 0.13
-0.51 -0.43 0.02 0.0 0.16 0.2 0.12 0.18 0.09 0.12 0.07 -0.24
-0.15 -0.17 -0.11 0.02 0.02 0.02 0.12 0.13 0.2 0.12 -0.06 -0.18
-0.46 -0.43 -0.16 -0.11 0.13 -0.02 0.17 0.25 0.17 0.15 0.22 -0.13
-0.4 -0.37 -0.05 -0.13 -0.01 0.24 0.04 0.15 0.24 0.05 0.14 -0.06
-0.44 -0.31 0.0 0.13 -0.07 0.17 0.17 0.28 0.19 0.04 -0.15 -0.18
-0.49 -0.7 -0.08 -0.33 0.14 0.1 0.21 0.31 0.27 0.24 0.05 -0.11
-0.36 -0.4 -0.37 0.05 0.11 0.01 0.12 -0.04 0.28 0.08 0.21 0.12
-0.85 -0.28 -0.05 0.05 -0.08 0.13 0.04 0.02 0.32 0.19 0.16 0.05
-0.75 -0.32 -0.11 -0.16 0.16 0.11 0.22 0.11 0.23 0.2 0.11 -0.1
-0.45 -0.52 -0.13 -0.1 -0.1 0.07 0.14 0.35 0.27 0.16 0.14 -0.1
-0.31 -0.32 -0.14 -0.04 0.12 0.15 0.18 -0.0 0.28 0.18 -0.0 -0.25
-0.27 -0.25 -0.13 -0.0 -0.01 0.15 0.15 0.04 0.15 0.1 0.06 -0.07
-0.29 -0.67 -0.34 -0.07 0.18 0.32 0.36 0.16 0.14 0.01 0.02 -0.15
-0.25 -0.34 -0.07 -0.04 0.02 0.04 0.19 0.16 0.23 0.09 0.02 -0.17
-0.28 -0.22 -0.05 -0.02 -0.04 0.02 0.05 0.25 0.38 0.12 0.04 -0.46
-0.52 -0.14 0.03 0.07 -0.04 -0.07 -0.02 -0.03 0.12 0.17 0.08 0.2
-0.27 -0.09 -0.01 0.03 -0.08 0.02 0.11 0.25 0.11 0.11 -0.06 -0.2
-0.58 -0.75 -0.44 -0.13 0.17 0.38 0.17 0.32 0.51 0.21 -0.06 -0.42
-0.4 -0.22 -0.11 -0.06 -0.01 0.14 0.11 0.12 0.19 0.19 0.12 -0.2
-0.27 -0.06 -0.16 -0.05 -0.15 -0.06 -0.05 0.27 0.16 0.19 0.12 -0.05
-0.41 -0.38 -0.11 -0.03 0.17 -0.08 0.07 0.21 0.21 0.11 0.14 -0.07
-0.66 -0.2 -0.02 0.16 0.06 0.08 0.16 0.15 0.19 0.1 -0.03 -0.19
-0.29 -0.33 -0.12 0.1 -0.04 0.11 0.19 0.22 0.17 -0.06 0.03 -0.12
-0.48 -0.37 -0.09 -0.03 0.01 0.25 -0.07 0.06 0.26 0.24 0.09 -0.06
-0.21 -0.13 -0.16 -0.21 0.06 -0.06 0.11 0.14 0.21 0.1 -0.04 0.1
-0.32 -0.65 -0.16 0.02 0.05 0.08 0.2 0.21 0.36 0.1 -0.06 -0.09
-0.45 -0.23 -0.23 -0.03 -0.04 -0.06 0.11 0.19 0.23 0.25 0.12 -0.01
-0.08 -0.12 -0.08 -0.13 0.0 0.02 0.1 0.06 0.13 0.02 0.05 0.0
-0.53 -0.28 -0.07 0.03 0.15 0.1 0.14 0.0 0.2 0.14 0.04 -0.08
-0.22 -0.39 -0.16 -0.05 0.14 0.1 0.11 0.13 0.2 0.07 0.08 -0.12
-0.25 -0.35 -0.15 -0.13 0.06 0.19 0.24 0.18 0.26 0.1 -0.03 -0.31
-0.89 -0.07 -0.27 0.07 0.04 -0.11 -0.13 -0.01 0.4 0.52 0.34 -0.43
-0.27 -0.46 -0.33 -0.3 0.0 0.14 0.13 0.2 0.35 0.19 0.13 -0.03
-0.7 -0.11 -0.19 0.14 0.06 0.28 -0.04 -0.36 0.05 0.27 0.31 -0.02
-0.24 -0.27 -0.18 -0.02 -0.0 0.29 0.09 0.01 0.13 0.11 0.01 -0.03
-0.33 -0.22 -0.17 -0.17 -0.0 0.01 0.0 0.01 0.25 0.36 0.24 -0.15
-0.64 -0.15 -0.19 0.28 0.25 0.02 -0.04 0.04 0.26 0.09 0.05 -0.22
-0.26 -0.28 -0.2 -0.11 -0.02 0.07 0.06 0.2 0.12 0.19 0.16 -0.05
-0.15 -0.37 -0.2 -0.08 0.1 0.07 0.18 0.22 0.21 0.08 0.09 -0.29
-0.45 -0.3 -0.13 -0.14 0.09 0.11 0.15 0.31 0.14 0.2 -0.07 -0.11
-0.42 -0.16 -0.23 -0.3 0.08 0.0 0.03 0.18 0.33 0.13 0.14 0.04
-0.34 -0.11 -0.07 -0.06 0.06 0.1 0.16 0.08 0.2 0.03 0.06 -0.2
-0.25 -0.14 -0.12 -0.21 -0.1 0.05 0.17 0.04 0.26 0.12 0.08 0.01
-0.62 -0.68 -0.12 0.01 0.02 0.45 0.18 0.35 0.14 0.13 -0.02 -0.28
-0.44 -0.26 -0.09 0.1 0.08 0.18 0.08 -0.12 0.08 0.21 0.03 0.02
-0.38 -0.42 -0.26 -0.11 0.01 0.26 0.19 0.22 0.23 0.14 0.07 -0.18
-0.34 -0.36 -0.2 -0.16 0.03 0.11 0.09 0.18 0.3 0.1 0.08 0.0
-0.11 -0.09 -0.11 -0.05 -0.06 0.13 -0.0 0.09 0.11 0.11 0.02 -0.06
-0.04 -0.18 -0.16 -0.31 0.1 0.16 0.04 0.19 0.23 0.15 -0.07 -0.24
-0.26 -0.23 -0.06 -0.05 0.06 0.17 0.09 0.16 0.11 0.02 0.03 -0.12
-0.12 -0.15 -0.08 -0.3 0.08 -0.08 0.04 0.09 0.22 0.24 0.12 -0.18
- -2.37 -1.29 -2.49 0.4 1.4 1.43 0.97 0.67 -0.62 -1.69 -4.19
-0.16 -0.23 -0.12 -0.03 0.1 0.16 0.16 0.07 0.21 -0.04 -0.04 -0.17
-0.85 -0.11 -0.13 0.01 -0.0 0.03 0.01 -0.13 0.16 0.23 0.3 0.18
-0.35 -0.22 -0.15 -0.19 0.0 0.17 0.14 0.1 0.17 0.14 0.09 -0.02
-0.28 -0.23 -0.22 -0.25 0.03 -0.01 0.25 0.19 0.21 0.18 -0.05 0.02
-0.28 -0.3 -0.21 -0.28 0.01 0.04 0.13 0.18 0.27 0.16 0.02 0.11
-0.44 -0.32 -0.15 0.1 0.1 0.21 0.07 0.03 0.1 0.11 0.1 -0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.