Heatmap: Cluster_275 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.57 -0.41 -0.26 -0.1 0.03 -0.02 0.14 0.05 0.32 0.27 0.2 0.08
-0.24 -0.15 -0.24 -0.22 -0.1 0.07 0.14 0.18 0.18 0.11 0.15 0.01
-0.43 -0.57 -0.43 -0.36 0.15 0.1 0.12 -0.04 0.17 0.41 0.42 0.05
-0.44 -0.34 -0.21 -0.17 0.15 -0.08 0.15 0.11 0.2 0.21 0.2 0.02
-0.43 -0.18 -0.24 -0.12 -0.01 0.06 0.07 0.1 0.1 0.21 0.23 0.07
-0.26 -0.33 -0.3 -0.23 -0.07 -0.1 0.17 0.14 0.29 0.26 0.16 0.08
-0.25 -0.2 -0.16 -0.23 0.01 -0.13 -0.0 0.13 0.29 0.27 0.2 -0.08
-0.37 -0.19 -0.17 -0.23 -0.08 -0.15 0.08 0.18 0.22 0.26 0.2 0.07
-0.24 -0.21 -0.12 -0.13 0.02 -0.07 0.06 0.13 0.17 0.18 0.11 0.01
-0.39 -0.26 -0.2 -0.12 0.12 -0.17 0.08 0.13 0.31 0.2 0.14 0.0
-0.4 -0.33 -0.19 -0.09 0.05 0.05 0.13 0.04 0.23 0.14 0.12 0.1
-0.27 -0.39 -0.23 -0.28 0.1 0.0 0.23 0.04 0.06 0.23 0.28 0.04
-0.26 -0.3 -0.09 -0.59 0.01 0.15 0.09 0.0 0.28 0.33 0.18 -0.05
-0.31 -0.24 -0.09 -0.11 0.07 0.06 0.07 -0.02 0.07 0.16 0.17 0.1
-0.12 -0.18 -0.08 -0.1 -0.01 -0.01 0.01 0.12 0.14 0.08 0.14 -0.04
-0.35 -0.26 -0.19 -0.04 0.04 0.02 0.02 0.14 0.29 0.17 -0.02 0.06
-0.22 -0.3 -0.17 -0.14 0.03 0.03 0.01 -0.1 0.12 0.26 0.23 0.13
-0.46 -0.43 -0.18 -0.18 0.01 0.17 0.03 0.24 0.14 0.21 0.26 -0.04
-0.72 -0.29 -0.1 -0.02 0.01 -0.14 0.03 0.09 0.51 0.24 0.19 -0.15
-0.14 -0.17 0.0 -0.15 -0.12 -0.1 -0.02 0.09 0.2 0.13 0.12 0.08
-0.46 -0.93 -0.42 -0.26 0.14 0.05 0.17 0.02 0.29 0.45 0.36 0.02
-0.38 -0.28 -0.11 -0.07 0.07 -0.01 0.1 0.13 0.17 0.18 0.09 -0.0
-0.39 -0.31 -0.12 -0.15 0.03 0.03 -0.01 -0.06 0.11 0.2 0.29 0.22
-0.22 -0.46 -0.14 -0.03 0.06 -0.04 -0.0 -0.02 0.21 0.13 0.16 0.2
-0.54 -0.27 -0.17 -0.09 -0.01 0.03 0.01 0.23 0.2 0.29 0.13 -0.01
-0.54 -0.41 -0.16 -0.07 0.07 0.14 0.13 -0.04 0.28 0.11 0.16 0.1
-0.53 -0.64 -0.17 -0.29 0.17 0.08 0.04 -0.13 0.24 0.45 0.22 0.17
-0.4 -0.28 -0.12 -0.3 0.15 -0.09 0.12 0.0 0.26 0.39 0.12 -0.07
-0.34 -0.38 -0.06 -0.1 0.02 0.03 0.08 -0.05 0.21 0.21 0.12 0.11
-0.21 -0.18 -0.07 -0.05 0.0 -0.06 0.1 0.13 0.09 0.12 0.13 -0.06
-0.47 -0.35 0.04 -0.04 0.18 0.03 0.14 0.01 0.08 0.06 0.25 -0.09
-0.32 -0.48 -0.2 -0.48 -0.07 -0.02 0.13 0.33 0.23 0.28 0.24 0.05
-0.31 -0.33 -0.28 -0.34 -0.13 0.08 0.21 0.24 0.29 0.26 0.17 -0.12
-0.35 -0.43 -0.13 -0.18 0.08 0.18 0.1 -0.09 0.2 0.16 0.17 0.11
-0.57 -0.4 -0.09 -0.25 0.02 -0.18 0.18 0.22 0.33 0.28 0.23 -0.05
-0.28 -0.32 -0.06 -0.18 0.03 -0.15 0.07 0.22 0.31 0.19 0.06 -0.04
-0.25 -0.23 -0.14 -0.07 -0.0 0.17 0.13 -0.01 0.18 0.0 0.05 0.1
-0.3 -0.35 -0.19 -0.19 0.09 -0.03 0.01 0.03 0.17 0.3 0.12 0.18
-0.1 -0.21 -0.19 -0.28 -0.02 0.14 -0.1 -0.07 0.17 0.18 0.15 0.21
-0.15 -0.25 -0.1 -0.13 0.09 0.2 0.06 -0.01 0.1 0.11 0.08 -0.08
-0.27 -0.19 -0.03 -0.06 -0.01 -0.02 0.1 0.1 0.16 0.16 0.05 -0.06
-0.34 -0.17 -0.12 -0.08 -0.07 0.09 0.1 0.08 0.15 0.13 0.09 0.06
0.15 -0.85 -0.72 -0.59 -0.22 -0.13 -0.13 -0.19 0.32 0.29 0.7 0.5
-0.47 -0.36 -0.07 0.03 0.12 -0.02 0.12 -0.05 0.21 0.15 0.21 -0.04
-0.18 -0.16 -0.2 -0.19 0.03 0.09 0.01 0.09 0.09 0.16 0.19 0.01
-0.42 -0.19 -0.08 -0.06 0.12 -0.03 -0.05 0.14 0.19 0.18 0.0 0.1
-0.45 -0.21 -0.19 -0.02 0.05 -0.0 -0.02 0.12 0.16 0.21 0.15 0.06
-0.16 -0.25 -0.23 -0.13 -0.05 -0.03 0.03 0.13 0.26 0.22 0.12 -0.01
-0.28 -0.5 -0.18 -0.02 0.08 0.07 0.03 0.14 0.14 0.09 0.25 0.01
-0.36 -0.36 -0.22 -0.38 0.1 0.02 0.04 0.18 0.23 0.26 0.24 0.02
-0.33 -0.34 -0.15 -0.08 -0.01 0.05 0.0 -0.09 0.13 0.19 0.21 0.26
-0.29 -0.29 -0.12 -0.21 0.06 0.1 0.07 0.02 0.23 0.16 0.13 0.02
-0.78 -0.27 0.03 0.12 0.16 -0.05 -0.09 -0.17 0.3 0.23 0.16 0.06
-0.31 -0.34 -0.0 -0.01 0.18 -0.02 0.01 0.06 0.15 0.07 0.18 -0.07
-0.22 -0.19 -0.12 -0.09 0.04 -0.02 0.06 0.11 0.17 0.18 0.11 -0.09
-0.71 -0.32 -0.35 -0.61 0.19 0.02 0.6 0.25 0.33 0.25 -0.03 -0.21
-0.26 -0.08 -0.16 -0.05 -0.1 0.06 0.09 0.05 0.19 0.13 0.1 -0.03
-0.54 -0.5 -0.24 -0.52 0.06 0.18 0.08 -0.15 0.2 0.32 0.32 0.37
-0.19 -0.16 -0.12 -0.13 0.08 -0.06 0.12 0.13 0.16 0.13 0.08 -0.11
-0.25 -0.41 -0.12 -0.19 0.2 0.11 -0.14 -0.21 0.07 0.31 0.21 0.22
-0.29 -0.36 -0.14 -0.06 -0.01 0.0 0.08 0.04 0.18 0.17 0.19 0.06
-0.33 -0.42 -0.12 -0.29 -0.03 0.16 0.09 -0.16 0.16 0.27 0.27 0.19
-0.36 -0.32 -0.15 -0.09 0.09 -0.05 0.11 0.05 0.09 0.17 0.2 0.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.