Heatmap: Cluster_258 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.27 -0.12 -0.16 -0.0 0.04 0.02 0.02 0.02 0.08 0.14 0.05 0.12
-0.25 -0.25 -0.16 -0.15 0.02 -0.11 0.03 0.04 0.2 0.22 0.14 0.16
-0.33 -0.3 -0.43 -0.32 -0.07 -0.04 0.14 0.24 0.44 0.18 0.14 0.05
-0.01 -0.11 -0.13 0.04 0.09 -0.05 -0.06 -0.12 -0.0 0.05 0.1 0.16
-0.47 -0.4 -0.14 0.01 -0.02 0.04 0.01 0.1 0.34 0.24 0.08 0.0
-0.38 -0.36 -0.19 -0.03 0.09 0.06 -0.05 0.11 0.28 0.19 0.08 0.02
-1.61 -0.69 -0.38 0.03 -0.08 0.18 0.04 0.16 0.46 0.36 0.27 0.24
-0.36 -0.3 -0.15 0.01 0.02 -0.0 0.02 -0.01 0.15 0.11 0.15 0.24
-0.41 -0.49 -0.17 -0.05 0.08 0.11 0.16 0.02 0.24 0.18 0.0 0.11
-0.97 -0.49 -0.46 -0.26 0.1 0.09 0.02 0.1 0.42 0.42 0.42 -0.01
-0.28 -0.42 -0.19 -0.09 0.01 -0.01 0.05 0.04 0.23 0.12 0.16 0.23
-0.65 -0.37 -0.26 0.02 -0.11 0.13 0.15 0.11 0.22 0.19 0.23 0.08
-0.27 -0.18 -0.04 0.04 0.08 -0.02 0.02 -0.11 0.1 0.08 0.16 0.1
-0.36 -0.35 -0.21 -0.02 -0.03 0.01 0.07 -0.02 0.16 0.16 0.11 0.32
-0.4 -0.28 -0.21 -0.16 0.08 0.02 0.07 0.01 0.2 0.34 0.21 -0.06
-0.55 -0.26 -0.13 -0.24 0.05 0.0 0.11 -0.01 0.26 0.23 0.21 0.13
-0.3 -0.16 -0.1 0.0 0.02 -0.04 0.06 -0.04 0.12 0.06 0.11 0.2
-0.77 -0.21 -0.04 -0.05 0.12 -0.11 0.09 0.04 0.13 0.0 0.23 0.3
-0.1 -0.36 -0.43 -0.1 -0.23 -0.1 0.09 0.24 0.32 0.22 0.15 0.08
-0.19 -0.23 -0.23 -0.19 0.0 -0.01 0.1 0.18 0.25 0.2 0.08 -0.08
-0.33 -0.22 -0.13 0.0 0.01 -0.12 0.0 0.2 0.22 0.14 0.19 -0.08
-0.47 -0.27 -0.12 -0.08 0.08 -0.02 0.04 -0.02 0.2 0.12 0.13 0.26
-0.47 -0.17 -0.14 -0.08 -0.01 0.05 0.11 0.11 0.11 0.2 0.15 0.01
-0.93 -0.26 -0.28 -0.25 -0.14 0.08 0.2 0.1 0.53 0.41 0.15 -0.14
-1.07 -0.41 -0.03 -0.09 0.01 0.05 0.16 0.15 0.25 0.23 0.23 0.06
-0.32 -0.31 -0.14 -0.08 -0.01 0.07 -0.02 0.03 0.24 0.11 0.22 0.09
-0.31 -0.17 -0.33 -0.04 0.0 -0.08 -0.04 0.11 0.25 0.11 0.16 0.2
-0.23 -0.27 -0.04 -0.05 0.11 -0.04 -0.0 0.04 0.18 0.07 0.02 0.15
-0.27 -0.29 -0.22 -0.16 -0.07 -0.08 0.06 0.23 0.28 0.19 0.16 0.01
-0.43 -0.21 -0.13 -0.01 -0.0 -0.07 0.09 0.03 0.19 0.13 0.05 0.24
-0.3 -0.28 -0.14 -0.05 -0.1 -0.04 -0.02 0.17 0.22 0.2 0.16 0.06
-0.71 -0.71 -0.39 0.0 -0.13 0.03 0.19 0.16 0.42 0.39 0.2 0.02
-0.64 -0.45 -0.15 0.06 0.15 -0.04 0.05 0.12 0.25 0.18 0.13 0.08
-0.23 -0.18 -0.28 -0.09 -0.1 0.03 0.09 0.14 0.22 0.07 0.2 0.02
-0.38 -0.37 -0.12 -0.03 0.04 0.09 -0.0 -0.05 0.25 0.21 -0.09 0.28
-0.44 -0.3 -0.19 -0.06 0.11 -0.0 0.03 0.03 0.21 0.2 0.11 0.15
-0.46 -0.39 -0.21 -0.02 0.01 0.01 0.06 0.1 0.36 0.2 0.1 0.03
-0.65 -0.55 -0.3 -0.37 -0.03 -0.04 0.11 0.14 0.36 0.32 0.18 0.37
-0.67 -0.34 -0.29 -0.06 0.09 -0.13 -0.08 0.07 0.34 0.31 0.26 0.18
-0.51 -0.3 -0.12 -0.07 -0.01 0.02 -0.02 0.16 0.28 0.17 0.09 0.14
-0.52 -0.19 -0.14 -0.11 0.01 0.01 0.1 0.06 0.17 0.17 0.19 0.09
-0.55 -0.13 -0.06 0.0 0.05 0.03 -0.05 0.1 0.22 0.19 0.05 0.0
-0.63 -0.26 -0.25 -0.14 -0.03 -0.1 0.08 0.03 0.22 0.09 0.24 0.45
-0.68 -0.41 -0.2 0.08 -0.05 -0.16 -0.15 -0.06 0.26 0.24 0.35 0.41
-0.34 -0.17 -0.24 0.03 0.12 -0.11 -0.13 -0.06 0.15 0.21 0.11 0.28
-1.51 -0.52 -0.37 -0.13 -0.09 0.2 0.06 0.32 0.35 0.41 0.37 0.0
-0.05 -0.06 -0.08 -0.02 0.02 -0.02 -0.12 -0.02 0.01 0.06 0.09 0.16
-0.32 -0.25 -0.15 -0.12 0.01 -0.17 0.09 0.14 0.21 0.1 0.07 0.27
-0.41 -0.4 -0.31 -0.25 -0.05 0.18 0.14 -0.08 0.2 0.06 0.21 0.44
-0.51 -0.5 -0.25 -0.02 0.01 0.11 0.16 0.05 0.39 0.25 0.2 -0.19
-0.41 -0.23 -0.03 -0.02 0.19 0.01 0.09 -0.0 0.13 0.02 0.04 0.12
-0.38 -0.32 -0.2 -0.04 0.07 0.03 0.07 0.15 0.3 0.16 0.05 -0.04
-0.82 -0.59 -0.34 -0.23 0.02 0.21 0.15 0.12 0.55 0.32 0.01 0.06
-0.3 -0.31 -0.21 -0.06 0.02 0.04 0.05 0.11 0.15 0.1 0.12 0.18
-0.39 -0.21 -0.13 -0.05 0.04 0.02 0.06 0.1 0.14 0.17 0.11 0.05
-0.57 -0.48 -0.22 -0.09 0.09 0.2 0.08 0.03 0.23 0.13 0.07 0.27
-0.59 -0.47 -0.39 -0.24 -0.06 -0.13 0.31 0.29 0.46 0.25 0.22 -0.09
-0.2 -0.06 -0.01 0.01 -0.02 -0.1 -0.05 -0.02 0.1 0.1 0.1 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.