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Heatmap: Cluster_286 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.09 0.64 0.52 0.02 -0.13 0.41 0.58 0.39 -1.07 -1.31 -1.59 -0.59
-0.08 0.21 -0.18 0.42 0.01 0.18 0.52 0.47 -1.21 -1.07 -0.28 -0.03
0.27 -0.53 -0.55 0.86 -0.87 -0.37 -0.19 0.18 0.05 -0.37 0.4 0.2
-0.1 0.04 0.06 0.14 -0.09 -0.07 0.06 0.08 -0.02 -0.06 -0.01 -0.03
-0.32 0.14 0.03 0.04 -0.09 0.14 0.01 -0.2 -0.13 -0.09 0.04 0.32
-0.38 0.64 0.63 0.28 -0.03 0.03 -0.09 1.24 -0.15 -2.49 -1.5 -2.48
0.03 -0.03 0.07 0.26 -0.08 -0.24 -0.01 0.01 0.08 -0.04 0.11 -0.22
- -0.84 0.54 0.84 0.19 -0.57 -0.9 0.63 -1.55 0.26 0.91 -0.18
0.12 -0.05 0.0 0.03 -0.12 -0.06 0.04 0.01 0.08 0.11 -0.02 -0.16
-0.93 0.32 0.44 0.3 0.34 -0.16 0.02 0.24 -0.0 -0.75 -0.47 -0.05
0.21 -0.42 -0.36 0.21 0.03 -0.81 -0.07 0.11 0.03 0.34 0.25 0.09
0.04 -0.22 0.2 0.65 -0.01 -0.17 0.28 0.04 -0.45 -0.08 -0.36 -0.29
0.1 0.11 -0.12 -0.09 -0.01 0.04 -0.05 0.02 -0.0 0.04 -0.1 0.04
0.11 0.06 -0.68 0.79 -0.57 -0.6 -0.54 0.5 -0.16 -0.31 0.4 0.08
0.0 -0.54 -0.13 0.4 0.08 -1.14 -0.23 0.32 0.05 0.47 0.17 -0.13
-0.18 -0.24 -0.25 0.07 -0.14 0.01 0.01 0.0 0.2 0.29 0.05 0.08
-0.18 -0.07 0.1 0.09 0.13 -0.03 0.05 -0.0 0.06 -0.11 -0.14 0.07
0.05 0.14 -0.13 0.3 -0.04 -0.21 0.16 0.08 -0.03 -0.28 -0.19 0.03
-0.1 -0.05 0.2 0.24 0.13 -0.17 -0.12 0.02 -0.04 -0.07 -0.06 -0.05
-0.55 -0.56 0.19 0.99 -0.38 -0.43 -0.03 0.05 -0.39 -0.28 0.4 0.1
-0.23 -0.17 0.02 0.23 0.06 0.15 -0.13 0.13 -0.06 -0.06 0.17 -0.2
-0.1 -0.04 0.03 0.16 -0.04 0.04 0.05 0.13 0.04 -0.1 -0.1 -0.11
-0.11 -0.14 0.13 0.21 -0.03 0.11 -0.11 0.24 -0.07 -0.09 -0.18 -0.04
-0.28 0.22 0.4 -0.13 -0.04 -0.21 0.05 0.11 0.24 -0.23 -0.14 -0.18
-0.04 -0.04 0.03 0.06 -0.01 0.05 0.12 0.13 0.04 -0.1 -0.14 -0.12
- - -1.01 1.42 0.89 - 1.12 - -0.82 -0.49 1.16 0.36
-0.03 0.07 0.08 0.09 0.04 -0.18 0.14 -0.0 -0.14 -0.02 -0.24 0.13
-0.17 -0.52 -0.02 0.27 0.04 0.15 0.21 -0.35 -0.27 0.11 0.54 -0.36
-0.21 -0.07 0.31 0.2 -0.14 -0.04 0.19 0.08 -0.32 -0.29 -0.04 0.17
-2.31 -0.43 -0.4 1.05 -0.83 -1.56 0.73 0.61 0.19 -0.32 -0.04 0.3
0.12 0.16 -0.14 -0.09 -0.1 0.13 -0.29 0.02 -0.0 0.09 0.01 0.03
-0.24 0.69 0.13 0.0 0.01 -0.6 -0.39 0.24 0.15 -0.27 -0.23 0.06
-3.27 0.63 0.48 -0.69 0.39 0.04 -0.4 0.07 1.05 -0.46 -1.4 0.01
0.06 -0.1 -0.08 0.23 0.1 -0.0 0.09 -0.0 -0.01 -0.12 -0.18 -0.04
0.08 -0.13 -0.23 -0.09 -0.05 -0.1 0.01 0.07 0.08 0.13 0.15 0.04
- - -0.9 2.42 - - 0.03 - - - 1.76 0.76
1.44 -1.43 0.47 0.88 -1.67 0.85 -0.1 -1.8 -0.68 -1.68 0.28 -2.31
-1.89 0.76 0.25 0.11 0.03 -0.78 -0.88 0.15 -0.91 -0.66 0.38 1.04
0.39 -0.66 -0.0 0.44 0.39 0.11 -0.41 -0.02 -0.14 -0.35 0.27 -0.57
-0.4 0.37 -0.33 0.19 -0.55 -0.03 -0.81 -0.4 0.35 0.5 0.33 0.12
-0.0 -0.05 0.02 0.23 -0.11 -0.24 0.17 -0.22 0.04 0.14 0.18 -0.29
0.23 0.5 -0.02 0.1 -0.12 -0.09 0.19 0.28 -0.2 -0.15 -0.36 -0.8
0.18 0.07 0.04 0.07 -0.05 0.07 0.03 0.14 -0.1 -0.06 -0.1 -0.36
-0.47 -0.01 0.5 0.53 0.14 -0.84 -0.21 -0.24 -0.05 0.28 -0.56 0.25
-0.11 -0.06 0.06 0.19 -0.05 0.13 0.04 0.15 -0.0 -0.11 0.02 -0.32
0.06 -0.13 0.08 0.08 -0.05 -0.18 0.01 0.13 -0.04 0.08 -0.03 -0.06
- -3.9 -0.78 0.77 0.31 0.13 1.18 -0.11 -0.15 -0.71 -0.61 0.97
0.1 -0.17 0.41 0.12 0.21 -0.28 0.08 0.03 0.3 -0.46 -0.27 -0.37
-0.16 0.05 0.2 0.15 0.1 0.1 -0.29 -0.07 -0.14 -0.15 0.27 -0.18
-0.1 0.05 0.19 0.1 -0.05 -0.2 -0.06 0.13 0.05 -0.04 -0.14 0.02
0.1 -0.22 -0.21 0.04 -0.03 -0.11 0.06 -0.12 0.12 0.2 0.14 -0.04
-0.04 0.11 0.05 0.1 -0.11 -0.33 -0.02 0.09 -0.02 0.03 0.07 0.03
-0.28 -0.04 0.13 0.07 -0.21 0.12 0.2 0.21 -0.14 -0.08 -0.04 -0.03
0.16 -0.05 0.12 0.34 -0.01 -0.11 -0.02 -0.08 -0.09 -0.24 -0.09 -0.01
1.01 -0.39 -0.66 0.49 0.26 -1.64 -0.16 -0.35 -0.41 0.11 0.46 -0.36
0.01 -0.06 -0.06 0.01 -0.11 -0.09 -0.06 -0.04 0.17 0.18 -0.0 0.01
0.24 0.01 0.05 -0.14 0.15 0.0 0.2 0.18 -0.11 -0.27 -0.21 -0.2
-0.13 -0.48 0.38 -0.0 -0.03 -0.35 0.42 0.19 -0.42 -0.06 0.05 0.12
-0.11 0.03 0.12 0.17 -0.03 0.03 -0.01 0.06 0.0 -0.12 -0.06 -0.14
-0.18 -0.11 0.07 0.42 -0.25 0.36 0.2 0.18 -0.2 0.02 -0.51 -0.31
-0.53 0.58 -1.79 0.92 -0.54 0.76 -1.55 0.72 -1.61 -1.49 -0.32 0.83
0.48 -0.16 -0.61 1.19 -0.52 -0.42 0.72 - - 0.52 0.65 -0.54
-0.0 0.3 0.01 0.69 -0.12 -1.38 0.11 -0.05 -0.08 -0.51 -0.5 0.53
-0.08 0.15 0.09 -0.0 0.01 0.08 -0.0 0.11 -0.01 -0.15 -0.16 -0.08
0.32 -0.17 -0.1 0.19 -0.17 -0.5 -0.26 0.57 0.04 0.14 -0.1 -0.3
-2.22 0.62 -0.67 0.42 0.05 0.3 -1.21 0.1 -0.11 0.11 0.16 0.47
0.18 -0.18 -0.57 0.39 -0.35 -0.3 -0.35 0.1 0.06 0.51 0.17 -0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.