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Heatmap: Cluster_243 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.51 -0.49 -0.32 0.19 0.16 -0.85 0.51 -0.1 0.3 0.35 0.3 -2.72
0.11 -0.1 -0.42 0.15 0.26 -0.44 0.05 0.09 0.07 0.17 0.08 -0.22
0.11 0.73 -0.14 -0.02 0.24 -0.33 0.03 -0.08 0.31 -0.67 -0.02 -0.8
0.68 -0.62 0.31 0.25 -0.15 0.41 -0.8 -0.61 0.25 -0.02 -0.15 -0.37
0.15 0.36 0.18 -0.79 -0.48 0.24 0.29 0.03 0.28 -0.32 0.0 -0.43
0.13 0.41 -0.71 -0.35 -0.77 0.1 -0.52 1.06 0.02 0.19 0.27 -1.43
-0.63 -0.15 -0.07 0.01 0.04 -0.17 -0.04 0.25 0.3 0.13 0.15 -0.02
-0.62 -0.22 0.49 -2.61 -0.06 -0.23 0.09 0.28 0.62 0.65 -0.12 -0.32
0.27 0.09 -0.52 -0.01 -0.31 -0.99 -0.5 0.07 -0.18 0.14 0.89 0.18
0.25 - 0.3 0.49 0.33 -0.84 0.2 0.31 0.4 0.91 -0.36 -
- 1.94 - 1.62 -0.03 - - - 1.49 - 0.39 -
-0.53 0.39 0.49 0.17 0.58 -0.9 -0.04 0.2 0.32 -0.24 0.08 -2.55
- -1.25 -0.37 0.77 -0.63 -1.5 -0.09 0.73 0.71 0.43 1.15 -1.8
-0.07 -0.5 -0.31 -0.44 0.19 -0.05 0.08 0.1 0.16 0.3 0.22 0.07
0.17 -0.31 0.05 0.07 0.11 0.03 0.04 -0.16 0.05 0.01 -0.03 -0.1
-0.29 -1.26 -0.33 0.41 0.16 -0.99 -0.11 0.23 0.1 0.42 0.56 0.06
0.03 -0.02 0.07 -0.32 0.0 0.1 0.23 0.09 0.12 -0.08 -0.01 -0.3
- - - 1.37 1.27 0.93 0.7 - -1.49 -0.03 -0.59 0.56
0.04 0.0 0.25 -0.2 0.13 -0.2 -0.02 -0.01 -0.08 -0.01 0.18 -0.17
0.35 -0.79 0.03 0.15 -0.24 -0.34 0.2 -0.11 0.45 0.32 0.3 -1.1
-0.34 -0.62 -0.03 -0.18 0.5 -0.1 0.14 0.04 0.31 0.12 0.11 -0.29
-0.04 -0.26 0.18 0.23 -0.11 0.05 -0.13 -0.13 0.15 -0.04 0.18 -0.17
-0.5 -0.41 0.07 0.35 0.11 0.34 0.14 -0.39 -0.13 0.27 0.08 -0.27
0.0 -0.5 0.25 -0.35 0.49 0.13 0.06 0.43 -0.82 -0.33 0.49 -0.6
0.07 -0.3 0.11 0.06 0.02 -0.04 0.05 -0.01 0.19 0.02 -0.12 -0.11
1.16 -1.11 -3.4 -0.32 -0.29 0.45 -0.49 0.79 0.69 -1.29 0.82 -
0.2 -0.18 -0.66 -0.34 -0.35 -0.03 -0.14 0.31 0.03 0.18 0.51 0.07
0.02 -0.34 -0.13 0.2 0.13 0.06 -0.08 0.03 0.1 0.09 0.1 -0.29
-0.48 -0.31 -0.32 0.08 0.11 0.05 0.22 0.22 0.36 -0.11 0.15 -0.22
- - - - 1.65 - 1.75 - 0.56 2.01 - -
-0.18 -0.15 -0.35 0.57 -0.03 0.16 -0.02 -0.49 -0.36 0.83 -0.16 -0.51
-0.24 -0.3 -0.57 -0.28 0.18 0.33 -0.01 0.57 -0.04 0.29 0.27 -0.8
0.25 - -0.11 0.42 1.01 -0.46 -0.92 -0.66 -0.06 0.5 0.39 -0.05
-1.22 -0.53 -0.65 0.43 0.25 -0.23 0.14 -0.09 -0.2 1.01 0.37 -0.67
0.19 -0.6 0.03 -0.1 0.47 0.27 -0.23 -0.28 0.07 0.19 0.34 -0.96
-0.44 -0.32 0.02 0.21 0.3 -0.21 0.04 -0.02 0.18 0.15 -0.02 -0.06
0.82 - -0.16 1.23 0.78 0.8 -1.67 -1.23 0.57 -0.11 -1.39 -
-0.13 -0.21 0.02 -0.21 -0.09 -0.28 -0.01 0.31 0.18 0.28 0.33 -0.4
0.22 -0.5 -0.91 0.31 0.08 -4.1 0.36 0.44 0.76 -0.18 -0.02 0.07
0.06 -0.58 0.46 0.86 -0.58 0.2 0.33 -0.9 -0.23 -0.3 0.08 -0.38
0.26 -0.11 -0.14 -0.0 0.12 -0.27 0.05 0.03 -0.09 -0.07 0.21 -0.07
-2.06 2.04 0.94 0.98 -0.36 - -2.82 0.33 -0.06 -1.49 -2.66 -3.07
-0.42 -1.04 -0.12 0.56 0.16 0.38 0.18 -0.53 0.37 0.14 -0.01 -0.43
-0.91 0.12 0.63 0.5 -0.24 -0.2 0.3 -0.45 0.12 -0.44 -0.38 0.2
0.03 -0.26 -0.01 0.13 0.1 -0.09 0.0 -0.02 0.03 0.02 0.12 -0.09
0.09 -0.33 -0.21 -0.03 0.1 -0.41 -0.09 0.03 0.25 0.23 0.09 0.1
-1.18 0.29 1.22 0.36 -1.29 -0.34 0.28 -0.81 -0.59 0.42 0.6 -2.2
-0.03 -0.03 -0.01 -0.14 -0.07 -0.1 -0.03 0.21 0.27 -0.1 0.25 -0.32
-2.13 -1.77 -0.04 0.09 0.99 -0.61 0.17 0.13 -1.32 0.73 0.47 0.18
0.01 -0.12 -0.1 -0.09 -0.06 0.12 -0.03 0.15 0.06 0.09 0.13 -0.2
- - - - 2.69 - - - - 2.47 - -
- - 0.54 1.19 1.76 -0.14 - - - 1.99 - -
-1.9 - 0.4 2.07 1.32 -0.73 -0.16 - -1.03 -1.12 0.35 -
-1.05 0.17 0.04 -0.32 0.53 -0.42 0.02 0.2 0.21 0.08 0.08 -0.09
- - - - 1.81 - - 0.95 - 2.31 - 0.68
0.07 -0.58 -0.15 0.27 0.54 0.19 -0.36 0.21 -0.07 0.29 0.08 -1.32
-0.28 -0.17 0.1 0.2 -0.01 -0.37 0.23 0.1 0.14 0.21 -0.01 -0.33
-0.12 -0.17 -0.17 -0.03 0.1 -0.13 0.14 0.2 0.03 0.03 0.19 -0.15
0.37 -0.02 0.01 -0.02 0.11 -0.2 -0.05 -0.0 -0.17 -0.23 0.34 -0.32
0.33 -0.92 -0.92 -0.11 0.26 -0.25 0.09 0.71 -0.31 0.14 0.34 -0.23
-0.12 -0.26 0.01 -0.07 0.02 0.07 0.08 0.06 0.08 0.07 0.24 -0.23
0.19 - 0.76 -1.47 0.64 -0.51 -0.44 0.17 0.43 1.05 -0.13 -1.55
- - - - 2.35 - 1.94 - - 1.61 - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.