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Heatmap: Cluster_265 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.21 -0.31 -0.22 0.09 -0.01 -0.07 0.12 -0.11 0.25 0.05 0.03 0.28
0.05 -0.34 -0.15 -0.25 0.03 -0.18 0.03 0.28 0.25 0.16 0.01 -0.03
-0.09 0.05 0.06 -0.13 -0.12 -0.1 -0.14 0.02 0.27 0.12 0.02 0.0
0.14 -0.05 -0.15 -0.1 -0.14 -0.06 -0.01 -0.04 0.26 0.09 0.05 -0.02
0.14 -0.1 -0.19 -0.28 -0.05 -0.06 0.0 0.25 0.25 0.04 -0.04 -0.05
0.08 0.02 -0.03 -0.07 -0.24 -0.33 -0.12 -0.06 0.38 0.09 0.04 0.11
-0.11 -0.16 -0.2 -0.19 0.02 -0.16 0.06 0.0 0.25 0.18 0.09 0.14
0.01 -0.19 -0.16 -0.0 -0.03 -0.1 -0.02 0.11 0.19 0.11 0.01 0.02
0.06 -0.02 -0.11 -0.19 0.02 -0.09 -0.03 0.03 0.12 0.02 0.01 0.15
0.13 -0.17 -0.22 -0.13 0.08 -0.11 -0.09 0.12 0.12 0.22 -0.0 -0.02
- 0.95 0.48 - - - -0.47 - 2.69 - - 0.59
0.39 -0.05 -0.2 -0.23 -0.25 -0.41 -0.25 -0.01 0.11 0.22 0.14 0.29
0.1 -0.12 -0.06 -0.24 -0.04 -0.13 -0.07 0.02 0.04 0.11 0.15 0.17
-0.33 -0.13 0.12 0.03 0.25 -0.02 -0.04 -0.16 0.13 0.02 -0.08 0.12
0.01 -0.27 -0.19 -0.04 -0.01 0.0 0.04 0.01 0.27 0.11 0.02 -0.03
0.19 -0.05 -0.14 -0.09 -0.1 -0.19 0.06 -0.07 -0.0 0.11 0.1 0.14
-0.29 -0.18 0.03 -0.12 -0.05 -0.15 -0.08 -0.06 0.23 0.18 0.14 0.23
-0.04 -0.11 -0.13 -0.17 0.06 -0.19 0.02 0.17 0.17 0.1 0.06 0.02
-0.16 -0.07 -0.07 -0.12 -0.22 -0.03 0.01 0.11 0.34 0.06 0.05 0.02
-0.2 -0.16 -0.01 0.06 0.05 -0.01 -0.04 -0.1 0.23 0.07 0.05 0.01
0.43 -0.15 -0.02 -0.14 -0.18 -0.39 -0.31 0.1 0.3 -0.06 0.07 0.13
- - - - - - - - 3.58 - - -
0.01 -0.68 -1.09 -1.01 -0.31 -0.62 -0.04 0.09 0.73 0.36 0.4 0.73
0.0 -0.18 -0.21 -0.01 -0.09 -0.16 0.02 0.03 0.22 0.15 0.14 0.02
0.07 -0.14 -0.2 -0.02 -0.03 -0.13 -0.04 0.03 0.2 0.15 0.07 -0.02
0.09 0.16 -0.14 -0.32 -0.24 -0.27 -0.13 -0.05 0.49 0.3 -0.01 -0.11
0.11 0.01 -0.08 -0.27 -0.04 -0.11 -0.02 -0.04 0.39 0.14 -0.01 -0.2
0.19 -0.03 -0.11 -0.07 -0.01 -0.2 -0.06 -0.03 0.15 0.04 0.07 0.02
0.02 -0.22 -0.5 -0.22 -0.03 -0.12 0.04 0.4 0.37 0.12 0.07 -0.17
-0.01 -0.15 -0.18 -0.07 -0.18 -0.14 -0.13 -0.03 0.3 0.22 0.16 0.1
-0.09 -0.08 -0.33 -0.1 0.03 0.02 0.1 0.2 0.15 0.09 0.1 -0.15
0.01 -0.19 -0.25 -0.09 0.04 0.02 -0.02 0.04 0.26 0.05 -0.01 0.07
0.06 -0.04 -0.15 -0.11 -0.2 -0.09 -0.07 0.03 0.38 0.07 0.04 -0.01
0.18 -0.13 -0.13 -0.21 -0.15 -0.15 -0.31 -0.07 0.41 0.36 0.19 -0.23
-0.1 -0.17 0.0 0.01 -0.05 -0.11 0.01 0.01 0.28 0.08 -0.07 0.07
0.15 -0.1 -0.2 -0.15 -0.09 -0.13 0.11 -0.07 0.09 0.14 0.17 0.03
-0.03 -0.14 -0.1 -0.02 -0.05 -0.07 -0.01 0.08 0.16 0.06 0.08 0.02
-0.61 -0.13 -0.15 -0.02 -0.26 0.23 -0.09 0.05 0.41 0.29 -0.04 0.04
0.07 -0.04 -0.1 -0.13 -0.1 -0.16 -0.04 0.06 0.12 0.05 0.12 0.12
-0.1 -0.17 -0.03 -0.03 0.06 -0.02 -0.11 -0.08 0.25 0.12 0.04 0.02
0.14 -0.0 -0.07 -0.09 -0.02 -0.06 -0.09 0.01 0.01 0.08 0.06 0.02
0.25 -0.11 -0.53 -0.95 -0.2 -0.29 -0.48 0.09 0.73 0.67 0.37 -0.6
0.08 -0.08 -0.17 -0.23 -0.06 -0.11 0.01 0.27 0.25 0.11 -0.02 -0.15
0.18 -0.17 -0.17 -0.1 -0.08 -0.18 -0.16 -0.11 0.36 0.23 0.05 0.02
-1.96 -0.39 -1.61 -2.93 0.08 -0.15 0.26 -0.69 0.74 1.26 0.34 0.5
0.06 -0.22 -0.12 0.08 0.02 -0.03 -0.12 -0.02 0.19 0.11 0.02 -0.02
0.2 -0.27 -0.76 -0.05 -0.36 -0.17 -0.2 -0.06 0.37 0.23 0.35 0.3
0.26 -0.92 -0.78 -0.79 -0.14 -0.46 0.05 -0.15 0.6 0.56 0.52 0.16
- - -0.2 - 0.12 - -0.01 - 2.33 0.92 - 1.1
0.13 -0.36 -0.42 -0.1 -0.03 -0.03 0.08 -0.03 0.23 -0.03 0.24 0.16
0.04 0.02 -0.1 -0.24 -0.03 -0.05 0.07 0.17 0.22 -0.1 -0.07 0.01
- - - - - - - - 3.58 - - -
0.17 -0.04 -0.08 -0.19 -0.07 -0.16 -0.02 0.15 0.2 0.01 -0.0 -0.02
0.01 -0.09 -0.13 -0.17 -0.18 -0.08 0.03 0.08 0.4 0.05 -0.02 0.02
-0.5 -0.08 -0.53 -0.47 -0.81 -0.21 -0.48 0.36 0.27 0.3 0.74 0.47
- - - - - - - - 2.98 2.04 - -
-0.59 -0.16 0.02 -0.72 -0.29 -0.54 -0.08 -0.19 0.66 0.73 0.17 0.19
0.66 -0.49 -0.32 -0.39 -0.27 -0.64 -0.32 -0.03 0.27 0.29 0.3 0.3
-0.2 -0.06 -0.11 -0.17 -0.16 -0.11 0.02 0.08 0.13 0.09 0.21 0.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.