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Heatmap: Cluster_22 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.55 -0.38 -0.71 -0.91 -0.79 -0.72 0.03 -0.42 -1.0 -0.58 0.8 1.82
-0.27 -0.18 0.16 0.3 -0.02 0.01 0.24 0.2 -0.08 -0.38 -0.2 0.05
-0.45 -0.45 -0.25 0.13 -0.2 -0.27 0.24 0.14 0.27 0.01 -0.21 0.63
-0.3 -0.28 -0.27 0.23 -0.1 -0.19 0.13 0.18 0.27 0.04 -0.27 0.34
-0.11 -0.33 -0.28 0.18 -0.15 -0.13 -0.26 -0.4 -0.14 -0.14 0.1 1.02
0.04 -0.44 -1.09 -0.61 -0.9 -0.76 0.0 0.04 0.11 0.12 0.13 1.42
0.06 -0.29 -0.4 -0.42 -0.58 -0.34 0.13 0.14 -0.07 0.08 0.42 0.72
-0.2 -0.32 -0.3 -0.14 -0.72 -0.81 -0.48 -0.35 -0.13 -0.03 0.25 1.51
-0.15 -0.29 -0.55 -0.37 -0.51 -0.48 -0.34 -0.02 0.41 0.31 0.24 0.91
-0.77 -0.09 0.04 0.13 0.1 0.15 0.47 0.1 -0.16 -0.27 -0.23 0.18
-0.34 -0.27 -0.17 0.19 -0.01 -0.06 0.27 0.14 0.02 -0.02 -0.07 0.18
0.28 -0.13 0.05 -0.05 -0.53 -0.64 0.76 0.44 -0.4 -0.81 -0.21 0.37
-1.92 -0.34 -0.1 0.01 -0.6 -0.42 0.47 0.58 0.23 -0.0 0.06 0.59
-0.23 -0.25 -0.53 -0.18 -0.61 -0.5 -0.37 -0.41 -0.09 0.15 0.46 1.27
-0.22 -0.38 -0.67 -0.34 -0.35 -0.15 -0.36 -0.26 0.13 0.3 0.45 0.96
-0.83 -0.68 0.01 -0.11 -0.29 -0.64 -0.79 -0.55 -0.47 0.1 1.09 1.16
-0.08 -0.3 -0.29 -0.0 -0.0 -0.1 0.28 0.15 0.03 -0.21 -0.11 0.44
-0.08 0.04 -0.45 -0.52 -0.78 -0.64 0.44 0.36 -0.8 0.24 0.58 0.58
-2.7 -2.25 -1.95 -0.48 0.17 -0.06 1.2 0.77 -0.22 -0.45 -0.21 1.08
0.24 0.2 -0.88 -0.93 -0.81 -0.67 0.33 0.27 0.15 0.32 0.37 0.38
-0.51 0.01 -0.41 -0.78 -0.19 -0.2 0.18 -0.02 -0.21 0.91 0.11 0.33
0.29 -0.11 -0.1 -0.2 -0.03 -0.13 0.24 0.14 -0.02 -0.18 -0.06 0.07
-0.31 -0.25 -0.31 -0.07 -0.58 -0.43 -0.28 -0.02 0.25 0.4 0.38 0.64
-0.6 -0.61 -0.05 0.07 -0.04 -0.12 0.01 0.14 0.02 -0.02 0.36 0.47
-0.12 -0.09 -0.57 -0.88 -0.63 -0.66 0.72 0.36 -0.09 -0.06 0.61 0.37
-0.75 -0.56 -0.14 0.13 -0.1 -0.08 0.2 0.29 0.06 0.1 0.24 0.24
-1.42 0.09 -0.53 -0.38 -0.24 -0.13 -0.01 -0.05 0.23 0.26 0.23 0.88
-1.25 -0.48 -0.16 -0.65 -1.17 -0.62 0.76 0.55 -0.02 -0.12 0.67 0.67
-1.03 -0.63 0.32 -0.01 0.07 -0.34 0.11 0.21 -0.26 -0.19 0.45 0.56
-0.23 -0.68 -1.03 -0.77 -0.95 -0.63 -0.8 -0.87 -0.37 0.19 0.77 1.83
-0.07 -0.11 -0.13 -0.19 -0.01 0.11 0.47 0.14 -0.43 -0.56 0.18 0.28
-0.74 -0.51 0.54 0.11 -0.27 -0.6 0.7 0.51 -0.63 -0.74 0.18 0.33
-0.6 -1.21 -1.69 -1.65 -1.64 -1.53 -1.52 -1.49 -0.71 0.0 0.9 2.44
0.2 -0.09 -0.23 -0.69 -1.12 -0.91 0.34 0.42 0.09 -0.02 0.4 0.56
-0.4 -0.21 -0.19 0.05 -0.11 0.05 0.48 0.34 -0.16 -0.31 -0.28 0.4
-0.21 -0.36 -0.26 0.1 -0.2 -0.23 -0.32 -0.3 -0.14 0.06 0.21 1.0
- - - - - - 2.46 - - - - 2.7
-1.06 -0.97 -1.18 -0.99 -1.33 -1.29 -1.05 -0.54 -0.18 0.41 0.77 2.06
-0.16 0.0 -0.4 -0.11 -0.42 -0.2 -0.1 -0.13 0.25 0.21 -0.02 0.71
0.09 -0.17 -0.7 -0.37 -0.74 -0.54 -0.5 -0.32 0.32 0.45 0.23 1.05
-0.41 -0.12 -0.03 -0.37 0.12 0.18 0.42 0.27 -0.28 -0.45 0.21 0.14
-0.05 -0.33 -0.68 -0.28 -0.28 0.0 -0.55 -0.62 -0.15 -0.01 0.37 1.29
-2.4 -0.34 0.3 0.46 0.06 -0.18 0.3 0.16 -0.04 -0.23 -0.31 0.6
-0.86 -0.6 -0.32 0.23 0.12 0.01 0.36 0.33 0.15 -0.02 -0.25 0.32
0.16 -0.47 -1.8 -2.99 -4.0 -2.82 -2.97 -2.51 -0.86 0.37 1.2 2.35
0.31 -0.18 -0.43 -0.33 -0.31 -0.28 -0.14 -0.72 -1.33 -1.05 0.32 1.61
0.15 -0.11 -0.35 0.03 -0.25 -0.29 -0.63 -0.98 -0.87 -0.72 0.01 1.67
-0.07 -0.4 -0.38 -0.4 -0.4 -0.25 -0.09 0.04 0.03 0.14 0.48 0.75
0.04 -0.41 -1.81 -3.03 -3.93 -2.81 -3.09 -2.4 -0.92 0.45 1.27 2.32
0.24 -0.01 -0.42 -1.01 -0.88 -0.38 0.44 0.24 -0.35 0.17 0.35 0.63
0.19 0.13 -0.47 -0.94 -0.73 -0.57 0.3 0.22 -0.26 0.3 0.31 0.62
0.17 -0.03 -0.41 -0.77 -0.75 -0.54 0.37 0.27 -0.28 0.16 0.21 0.75
-1.33 -0.38 -0.74 -1.12 -0.25 -0.64 0.05 -0.62 -0.89 -0.22 0.73 1.83
-1.01 0.12 -0.03 -0.25 -0.24 -0.26 0.27 0.12 -0.13 -0.09 0.22 0.69
-0.61 -1.39 -0.06 -0.18 -0.26 -0.8 -0.15 -0.15 -0.57 -0.4 1.13 1.2
-1.12 -0.31 0.01 -0.4 -0.57 -0.79 -0.09 -0.03 -0.2 0.08 0.91 0.99
-0.53 -0.61 -0.76 -0.35 -0.62 -0.43 0.13 0.15 0.35 0.29 0.3 0.97
-0.95 -0.42 -0.09 0.18 -0.09 -0.11 0.05 0.13 0.21 0.13 0.13 0.39
-0.63 -0.4 -0.21 -0.08 -0.18 -0.04 0.19 0.21 0.23 0.09 0.16 0.35
-0.98 -0.86 0.38 0.31 -0.49 -1.58 0.94 0.56 -0.46 -0.74 -0.05 0.72
-5.58 -4.79 -3.64 -1.83 -1.54 -1.82 0.71 0.83 0.23 0.28 0.69 1.82
-0.12 -0.2 -0.06 -0.05 -0.16 -0.16 0.05 0.05 0.02 -0.03 0.24 0.32
-0.82 -1.06 -0.8 -0.9 -0.76 -0.73 0.2 0.19 -0.32 -0.08 0.99 1.39
-0.96 -0.87 -0.08 0.37 -0.4 -0.57 0.7 0.42 -0.02 -0.46 -0.15 0.77
- - - - 1.97 - 1.89 - - - - 2.13
0.05 -0.17 -0.54 -0.24 -0.56 -0.35 -0.53 -0.32 0.08 0.2 0.34 1.08
-0.86 -0.05 0.0 0.25 -0.32 -0.22 0.45 0.17 -0.06 -0.18 -0.0 0.38
0.39 -0.09 -0.47 -0.26 -0.52 -0.6 -0.84 -0.9 -0.58 -0.16 0.33 1.54
-0.29 -0.39 -0.53 -0.21 -0.51 -0.51 -0.41 -0.27 0.05 0.23 0.46 1.2
-0.39 -0.45 -0.17 0.08 -0.1 -0.02 0.09 0.15 0.2 0.05 0.22 0.16
0.06 -0.0 -0.59 -0.04 -0.43 -0.33 -0.12 -0.37 0.04 0.09 0.05 0.98
0.15 -0.38 -0.81 -1.6 -3.35 -3.77 -4.53 -3.36 -0.8 0.31 1.3 2.21
-0.52 -0.37 -0.11 0.21 -0.14 -0.18 0.16 0.26 0.17 0.11 0.02 0.18
-0.29 -0.22 -0.07 0.28 -0.02 -0.16 0.3 0.15 0.02 -0.15 -0.22 0.21
-0.87 -1.14 -1.2 -1.19 -1.14 -0.95 -0.52 -0.48 -0.53 -0.12 1.01 2.04
0.01 -0.43 -0.44 -0.27 -0.46 -0.34 -0.17 0.12 -0.04 0.07 0.53 0.79
-0.12 0.05 0.09 -0.01 -0.3 -0.44 -0.02 0.18 0.06 -0.01 0.11 0.26
-0.67 -0.2 0.05 0.29 0.1 0.1 0.37 0.15 -0.11 -0.31 -0.24 0.15
-1.26 -1.52 -1.61 -1.85 -2.84 -3.41 -4.25 -5.07 -5.48 -4.31 0.21 3.18
-1.13 -0.33 -0.56 -0.72 -0.72 -0.41 0.3 0.28 0.0 0.13 0.46 1.12
-0.96 -0.73 -0.05 0.48 -0.5 -1.17 0.66 0.56 0.01 -0.39 -0.31 0.8
0.01 -0.26 -0.07 -0.17 -0.49 -0.47 0.01 -0.07 -0.34 -0.36 0.36 1.05
-0.68 0.17 0.27 -0.25 -0.25 0.11 0.42 -0.25 -1.0 -1.01 0.28 0.92
-0.55 -0.02 -0.17 -0.13 -0.32 -0.17 0.31 0.19 -0.08 -0.01 0.08 0.54
-2.36 -1.52 -1.07 -1.2 -2.85 -2.89 0.02 0.61 0.34 0.32 0.73 1.83
- - 1.35 - - - 1.57 - - - 1.58 1.81
-0.87 -0.99 -0.77 -0.97 -0.58 -0.76 0.47 0.25 -0.41 -0.32 1.02 1.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.