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Heatmap: Cluster_54 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.45 -0.32 -0.41 -0.3 -0.4 -0.11 0.12 0.31 0.36 0.36 0.26 0.17
-0.63 -0.55 -0.81 -0.38 -0.23 0.06 -0.04 0.22 0.57 0.55 0.22 0.25
-0.44 -0.52 -0.5 -0.18 -0.26 -0.4 -0.11 0.25 0.38 0.38 0.11 0.66
-1.56 -1.22 -0.95 -0.35 -0.75 -0.93 -0.3 0.38 0.66 0.83 0.33 1.06
-0.63 -0.58 -0.91 -0.44 -0.41 -0.29 0.16 0.39 0.64 0.52 0.15 0.4
-0.49 -0.1 -0.31 -0.21 -0.29 -0.13 -0.04 0.21 0.38 0.35 0.16 0.19
-0.32 -0.31 -0.24 -0.15 -0.17 -0.29 -0.12 0.15 0.45 0.19 0.17 0.35
0.01 -0.23 -0.52 -0.22 -0.51 -0.23 -0.15 0.22 0.48 0.38 0.24 0.12
-0.88 -0.77 -0.85 -0.39 -0.61 -0.5 -0.03 0.44 0.8 0.8 0.26 0.23
-0.42 -0.58 -0.54 -0.19 -0.32 -0.17 0.09 0.34 0.6 0.36 0.25 0.02
-0.33 -0.15 -0.25 -0.17 -0.19 -0.05 -0.01 0.24 0.21 0.25 0.19 0.1
-0.67 -0.57 -0.5 -0.14 -0.23 -0.07 0.09 0.33 0.44 0.45 0.18 0.15
-0.58 -0.4 -0.4 -0.19 -0.3 -0.43 -0.18 0.32 0.47 0.45 0.22 0.42
-0.16 -0.29 -0.27 -0.08 -0.19 -0.08 -0.22 0.05 0.35 0.36 0.17 0.16
-0.28 -0.37 -0.44 -0.26 -0.36 -0.13 -0.06 0.33 0.42 0.41 0.32 -0.0
-0.21 -0.4 -0.36 -0.2 -0.3 -0.16 -0.06 0.23 0.39 0.35 0.25 0.16
-0.35 -0.34 -0.25 -0.1 -0.23 0.02 0.02 0.21 0.24 0.17 0.27 0.13
-0.58 -0.6 -0.4 0.0 -0.31 -0.29 -0.01 0.31 0.55 0.39 0.22 0.17
-0.2 -0.27 -0.71 -0.36 -0.27 -0.02 0.05 0.26 0.48 0.41 0.04 0.14
-0.11 -0.25 -0.24 -0.09 -0.16 -0.07 -0.15 0.11 0.36 0.25 0.13 0.09
-0.46 -0.34 -0.38 -0.24 -0.09 -0.06 0.12 0.27 0.38 0.21 0.14 0.16
-0.74 -0.77 -0.54 -0.01 -0.06 -0.18 -0.03 0.24 0.34 0.42 0.2 0.46
-0.28 -0.31 -0.53 -0.38 -0.38 -0.18 -0.06 0.23 0.54 0.43 0.3 0.13
-0.28 -0.18 -0.35 -0.19 -0.11 0.08 -0.01 0.01 0.18 0.29 0.14 0.25
-0.5 -0.34 -0.35 -0.28 -0.33 -0.05 -0.04 0.13 0.33 0.31 0.29 0.42
-0.34 -0.29 -0.43 -0.24 -0.25 0.05 -0.05 0.12 0.3 0.33 0.23 0.28
-0.35 -0.45 -0.63 -0.13 -0.14 0.02 -0.01 0.1 0.4 0.43 0.21 0.16
-0.55 -0.4 -0.45 -0.26 -0.22 0.06 -0.05 0.18 0.35 0.4 0.33 0.2
-0.13 -0.25 -0.29 -0.12 -0.19 0.05 -0.04 -0.03 0.16 0.28 0.24 0.18
-0.21 -0.27 -0.41 -0.1 -0.28 -0.11 -0.27 0.06 0.35 0.4 0.31 0.23
-0.75 -1.08 -1.61 -1.51 -0.71 0.08 0.03 0.34 0.62 0.8 0.72 0.46
-0.66 -0.38 -0.38 -0.2 -0.18 -0.1 -0.04 0.2 0.33 0.4 0.27 0.3
-0.15 -0.17 -0.27 -0.06 -0.26 -0.04 -0.1 0.12 0.25 0.25 0.1 0.19
-0.27 -0.28 -0.36 -0.31 -0.24 0.01 0.01 0.19 0.23 0.31 0.22 0.25
-0.16 -0.34 -0.38 -0.12 -0.21 -0.13 0.1 0.25 0.22 0.18 0.17 0.22
-0.46 -0.56 -0.62 -0.37 -0.35 -0.24 -0.26 0.26 0.41 0.53 0.38 0.51
-0.43 -0.34 -0.39 -0.28 -0.23 -0.13 -0.04 0.22 0.44 0.35 0.23 0.23
-1.05 -1.16 -1.43 -0.69 -0.56 -0.19 -0.43 -0.15 0.9 1.02 0.59 0.58
-0.65 -0.96 -0.8 -0.1 -0.25 -0.15 0.15 0.25 0.57 0.46 0.27 0.32
-0.41 -0.71 -0.78 -0.41 -0.37 0.08 -0.3 0.28 0.63 0.64 0.38 0.04
-0.53 -0.33 -0.63 -0.38 -0.48 -0.18 -0.05 0.43 0.56 0.56 0.22 0.09
-0.46 -0.38 -0.27 -0.06 -0.16 -0.01 -0.02 0.25 0.33 0.29 0.14 0.09
-0.38 -0.43 -0.42 -0.12 -0.18 -0.02 -0.07 0.15 0.31 0.33 0.3 0.22
-0.41 -0.49 -0.42 -0.15 -0.26 -0.13 -0.03 0.25 0.51 0.4 0.11 0.2
-0.16 -0.25 -0.34 -0.27 -0.2 0.04 -0.08 0.09 0.31 0.29 0.21 0.15
-0.42 -0.43 -0.57 -0.43 -0.63 -0.3 -0.36 0.11 0.72 0.61 0.41 0.35
-0.37 -0.49 -0.49 -0.27 -0.23 -0.12 -0.05 0.37 0.43 0.37 0.18 0.24
-0.45 -0.88 -0.94 -0.43 -0.5 -0.4 -0.2 0.34 0.91 0.78 0.35 -0.02
-0.56 -0.65 -0.55 -0.09 -0.25 -0.3 -0.27 0.14 0.53 0.51 0.37 0.39
-0.32 -0.45 -0.29 0.1 -0.1 -0.04 -0.26 -0.09 0.33 0.41 0.15 0.25
-0.27 -0.29 -0.29 -0.13 -0.24 -0.07 -0.06 0.14 0.23 0.26 0.18 0.34
-0.15 -0.27 -0.37 -0.05 -0.18 -0.11 0.01 0.19 0.31 0.18 0.13 0.15
-0.32 -0.33 -0.37 -0.18 -0.24 -0.09 -0.26 0.12 0.36 0.39 0.28 0.3
-0.45 -0.27 -0.48 -0.36 -0.27 0.01 0.19 0.25 0.25 0.32 0.26 0.19
-0.43 -0.36 -0.42 -0.32 -0.3 -0.03 -0.27 0.28 0.47 0.42 0.39 0.09
-0.61 -0.62 -0.73 -0.43 -0.41 -0.15 0.08 0.43 0.59 0.51 0.22 0.26
-0.56 -0.49 -0.72 -0.49 -0.37 -0.26 -0.1 0.41 0.63 0.55 0.28 0.25
-0.18 -0.37 -0.6 -0.39 -0.28 -0.15 0.02 0.31 0.39 0.41 0.17 0.23
-0.5 -0.5 -0.57 -0.31 -0.29 0.04 -0.07 0.09 0.39 0.47 0.32 0.38
-0.16 -0.29 -0.42 -0.07 -0.28 -0.05 -0.28 0.14 0.42 0.37 0.15 0.19
-0.15 -0.13 -0.32 -0.24 -0.37 -0.12 -0.12 0.19 0.32 0.36 0.21 0.13
-0.26 -0.34 -0.38 -0.1 -0.16 -0.03 -0.28 0.0 0.27 0.37 0.32 0.3
-0.34 -0.49 -0.45 -0.2 -0.09 -0.05 0.09 0.26 0.41 0.25 0.17 0.11
-0.34 -0.4 -0.35 -0.01 -0.23 -0.21 -0.01 0.13 0.25 0.25 0.25 0.39
-0.34 -0.66 -0.51 -0.09 -0.31 -0.35 -0.2 0.11 0.53 0.42 0.29 0.48
-0.82 -0.8 -0.95 -0.41 -0.35 -0.11 -0.16 0.4 0.71 0.76 0.4 0.01
-0.3 -0.36 -0.4 -0.05 -0.18 -0.26 -0.06 0.11 0.37 0.32 0.09 0.4
-0.19 -0.44 -0.5 -0.43 -0.36 -0.24 -0.32 0.1 0.55 0.52 0.42 0.26
-0.29 -0.23 -0.26 -0.08 -0.09 -0.1 0.09 0.17 0.27 0.18 0.12 0.09
-0.25 -0.36 -0.48 -0.19 -0.26 -0.02 -0.28 0.01 0.28 0.5 0.35 0.3
-0.23 -0.18 -0.45 -0.46 -0.47 -0.23 -0.06 0.23 0.42 0.44 0.36 0.17
-0.54 -0.38 -0.22 0.07 -0.13 -0.09 -0.06 0.02 0.22 0.28 0.18 0.38

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.