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Heatmap: Cluster_36 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.3 0.1 -0.22 0.15 -0.06 0.02 -0.36 -0.27 0.21 0.17 -0.17 -0.04
0.28 0.17 -0.47 0.11 -0.19 0.15 -0.16 -0.35 0.3 0.27 -0.28 -0.09
-0.07 -0.04 -0.25 0.37 0.05 0.09 -0.19 -0.24 0.22 0.18 -0.21 -0.07
-0.47 0.09 -0.14 0.11 -0.15 -0.03 -0.22 -0.07 0.45 0.36 -0.13 -0.03
-0.36 -0.36 -0.15 0.44 0.2 0.25 -0.26 -0.13 0.38 0.25 -0.23 -0.4
0.02 0.13 -0.21 0.05 -0.13 0.09 0.05 -0.08 0.11 0.17 -0.19 -0.05
0.14 0.07 -0.3 0.06 -0.25 -0.1 -0.34 -0.22 0.32 0.31 -0.08 0.18
0.15 0.18 -0.12 0.19 -0.08 0.08 -0.23 -0.32 0.26 0.18 -0.32 -0.15
0.16 0.07 -0.29 -0.03 -0.13 0.1 -0.19 -0.18 0.26 0.22 -0.11 -0.02
0.02 0.17 -0.13 0.22 -0.14 -0.02 -0.29 -0.17 0.15 0.16 -0.09 0.03
-0.09 -0.22 -0.26 0.06 -0.11 0.21 -0.27 -0.23 0.14 0.22 0.09 0.28
0.21 0.04 -0.12 0.31 -0.24 0.05 0.04 -0.03 0.09 -0.04 -0.26 -0.15
-0.01 0.02 -0.3 -0.0 -0.05 0.14 -0.1 -0.21 0.11 0.18 -0.13 0.24
0.06 0.02 -0.15 0.17 -0.25 0.06 -0.33 -0.23 0.19 0.15 -0.02 0.21
0.38 0.15 -0.03 0.18 -0.15 -0.11 -0.43 -0.3 0.24 0.14 -0.17 -0.11
0.13 0.16 -0.15 0.1 -0.22 0.08 -0.1 -0.22 0.24 0.18 -0.17 -0.14
0.08 0.04 -0.27 -0.18 -0.18 0.19 -0.22 -0.16 0.32 0.3 0.06 -0.14
0.22 0.06 -0.29 -0.06 -0.29 0.07 -0.24 -0.27 0.31 0.33 -0.07 0.01
0.0 -0.11 -0.3 0.08 -0.22 -0.02 -0.29 -0.09 0.24 0.23 0.02 0.3
0.38 0.21 -0.08 -0.05 0.0 0.2 -0.62 -0.8 -0.09 0.2 0.1 0.14
-0.04 0.14 -0.24 -0.03 -0.12 0.05 -0.2 -0.17 0.4 0.33 -0.02 -0.27
0.04 -0.11 -0.17 0.13 -0.09 0.03 -0.09 -0.09 0.21 0.06 -0.09 0.11
-0.15 -0.09 -0.3 0.1 -0.05 -0.0 -0.27 -0.2 0.43 0.3 -0.08 0.12
0.04 0.16 -0.11 0.12 -0.12 0.12 -0.19 -0.32 0.24 0.19 -0.27 0.01
0.01 0.01 -0.07 0.12 -0.14 0.01 -0.22 -0.13 0.19 0.23 -0.05 -0.03
-0.33 -0.2 -0.24 -0.01 -0.09 0.14 0.02 -0.26 0.21 0.23 0.06 0.28
-0.21 -0.15 -0.45 0.1 -0.18 -0.1 -0.16 -0.04 0.36 0.38 -0.07 0.28
-0.02 -0.11 -0.31 0.14 -0.08 -0.06 -0.12 -0.16 0.25 0.25 -0.16 0.24
-0.06 0.04 -0.12 0.06 -0.12 -0.07 -0.13 -0.1 0.21 0.19 0.01 0.05
0.07 0.0 -0.23 0.05 -0.18 -0.0 -0.13 -0.08 0.24 0.09 -0.08 0.17
-0.08 0.08 -0.21 0.17 -0.26 -0.01 -0.14 -0.26 0.25 0.26 -0.11 0.18
0.09 0.05 -0.3 0.06 -0.34 -0.01 -0.25 -0.38 0.3 0.4 -0.06 0.2
0.02 -0.12 -0.18 0.26 -0.03 0.08 -0.27 -0.27 0.12 0.22 -0.09 0.13
0.23 0.17 -0.13 0.03 -0.24 0.07 -0.34 -0.32 0.04 0.14 -0.02 0.23
0.32 0.18 -0.13 0.24 0.02 0.08 -0.63 -0.62 0.03 0.18 -0.15 0.16
0.18 0.18 -0.25 0.25 -0.04 0.07 -0.06 -0.41 0.14 0.13 -0.3 -0.05
-0.35 0.12 -0.03 0.08 0.06 0.13 0.1 0.06 0.23 -0.02 -0.22 -0.29
-0.16 0.03 -0.11 0.08 -0.22 -0.08 -0.07 -0.08 0.31 0.23 -0.06 0.03
-0.25 -0.26 -0.25 0.29 0.04 0.07 -0.13 -0.08 0.25 0.15 -0.1 0.15
0.15 0.31 -0.33 0.14 -0.24 -0.05 -0.57 -0.43 0.19 0.42 0.09 -0.03
0.21 0.04 -0.25 0.14 -0.35 -0.23 -0.34 -0.32 0.28 0.34 -0.01 0.23
0.34 -0.02 -0.27 0.06 -0.12 -0.17 -0.2 -0.1 0.24 0.14 -0.12 0.08
0.18 -0.23 -0.37 0.07 -0.12 0.02 -0.13 -0.25 0.29 0.19 0.07 0.13
0.18 0.2 -0.16 0.04 -0.29 -0.18 -0.08 -0.17 0.27 0.22 -0.29 0.09
-0.95 0.42 0.06 0.08 0.42 -0.15 0.41 0.08 0.51 -0.1 -1.45 -0.54
-0.36 -0.19 -0.26 0.2 -0.04 0.16 0.02 -0.06 0.49 0.31 -0.19 -0.35
0.06 -0.04 -0.2 0.04 -0.04 0.14 -0.23 -0.23 0.19 0.19 -0.02 0.06
0.1 0.17 -0.11 0.09 -0.23 0.04 -0.1 -0.15 0.12 0.16 -0.2 0.04
-0.21 -0.18 -0.23 0.24 -0.11 0.03 -0.04 -0.07 0.24 0.19 -0.09 0.13
0.26 0.01 -0.34 0.15 -0.26 -0.16 -0.14 -0.21 0.33 0.23 -0.34 0.24
0.05 -0.04 -0.2 0.05 -0.15 -0.03 -0.18 -0.09 0.29 0.25 -0.1 0.06
-0.63 -0.39 -0.63 -0.04 0.05 0.32 -0.21 -0.33 0.39 0.49 0.1 0.31
-0.07 -0.02 -0.36 0.04 -0.06 0.18 -0.27 -0.38 0.31 0.38 -0.09 0.11
0.05 -0.22 -0.21 0.06 -0.05 0.13 -0.42 -0.38 0.15 0.26 0.17 0.26
0.16 0.04 -0.25 0.08 -0.21 -0.13 -0.2 -0.07 0.32 0.25 -0.13 0.01
0.03 0.04 -0.13 0.05 -0.14 -0.11 -0.3 -0.15 0.29 0.18 -0.02 0.16
0.06 0.08 -0.26 -0.01 -0.14 0.08 -0.09 -0.03 0.21 0.19 -0.18 0.0
0.04 0.01 -0.49 -0.19 0.05 0.13 -0.16 -0.25 0.29 0.29 -0.13 0.22
0.05 -0.01 -0.19 0.08 -0.12 0.05 -0.22 -0.12 0.22 0.16 -0.06 0.1
0.06 0.03 -0.02 0.36 -0.1 0.02 -0.28 -0.19 0.17 0.1 -0.24 -0.03
0.04 -0.36 -0.38 0.04 -0.16 -0.02 -0.59 -0.28 0.23 0.4 0.28 0.41
0.03 -0.02 -0.39 0.47 -0.06 -0.09 -0.39 -0.52 0.32 0.23 -0.05 0.13
0.24 -0.02 -0.27 0.04 0.03 0.14 -0.13 -0.21 0.06 0.11 -0.11 0.04
0.15 -0.14 -0.34 0.09 -0.11 0.03 -0.3 -0.34 0.26 0.35 0.01 0.13
0.04 0.19 -0.18 0.06 -0.1 0.06 -0.05 -0.16 0.12 0.13 -0.34 0.13
0.47 0.1 -0.21 0.01 -0.32 0.21 -0.39 -0.76 0.16 0.11 0.09 0.14
-0.2 -0.13 -0.19 0.32 -0.11 -0.07 -0.34 -0.18 0.43 0.39 -0.02 -0.16
-0.11 0.25 -0.2 0.06 -0.06 0.15 -0.1 -0.3 0.26 0.17 -0.33 0.05
-0.13 -0.23 -0.27 0.24 0.02 0.09 0.0 -0.12 0.12 0.2 -0.07 0.05
0.16 0.13 -0.17 0.23 -0.19 -0.0 -0.38 -0.36 0.3 0.21 -0.22 0.07
0.12 0.0 -0.18 -0.07 -0.21 -0.02 -0.06 -0.05 0.16 0.03 0.0 0.21
0.02 -0.15 -0.23 -0.06 -0.15 0.09 -0.1 -0.03 0.17 0.18 0.02 0.15
0.25 0.03 -0.2 0.09 -0.11 -0.01 -0.18 -0.11 0.04 0.08 -0.05 0.09
0.08 -0.12 -0.17 0.21 -0.14 -0.1 -0.22 -0.19 0.17 0.18 0.0 0.18
-0.04 0.25 -0.07 0.03 -0.15 0.14 -0.13 -0.25 0.26 0.05 -0.23 0.04
0.21 0.18 -0.13 -0.04 -0.29 -0.15 -0.3 -0.23 0.28 0.32 -0.19 0.15
0.5 0.2 -0.29 0.16 -0.29 -0.11 -0.37 -0.39 0.18 0.21 -0.24 0.12
0.21 -0.13 -0.24 0.08 -0.26 -0.03 -0.51 -0.41 0.19 0.29 0.19 0.32
0.12 -0.32 -0.34 0.28 -0.0 0.08 -0.56 -0.57 0.3 0.24 0.11 0.27
0.07 -0.09 -0.36 0.27 -0.1 -0.12 -0.31 -0.28 0.24 0.19 -0.05 0.32
-0.06 -0.29 -0.22 0.12 0.03 0.03 -0.42 -0.22 0.18 0.44 -0.01 0.2
-0.3 0.13 -0.12 0.07 0.11 0.28 -0.03 -0.0 0.34 0.05 -0.3 -0.44
0.03 0.13 -0.28 0.12 -0.31 -0.05 -0.26 -0.25 0.38 0.31 -0.16 0.13
-0.01 -0.3 -0.32 0.14 -0.17 0.09 -0.2 0.06 0.49 0.28 -0.18 -0.12
0.21 0.16 -0.02 0.19 -0.1 0.04 -0.26 -0.3 0.12 0.16 -0.25 -0.08
0.01 -0.09 -0.13 0.06 -0.08 0.05 -0.28 -0.24 0.12 0.2 0.14 0.14
-0.07 -0.03 0.03 0.35 0.25 0.24 -0.3 -0.48 -0.15 0.05 -0.09 0.01
-0.02 -0.01 -0.09 -0.06 -0.11 0.02 -0.31 -0.36 0.04 0.25 0.15 0.35
0.1 0.13 -0.06 0.46 -0.11 -0.01 -0.08 -0.3 -0.05 0.0 -0.34 0.09
-0.3 -0.09 -0.15 0.15 0.1 0.02 -0.16 -0.08 0.25 0.24 -0.1 -0.01
0.12 0.1 -0.24 0.09 -0.14 -0.01 -0.23 -0.29 0.13 0.25 -0.13 0.22
0.21 0.07 -0.33 -0.04 -0.12 0.16 -0.18 -0.23 0.19 0.17 -0.14 0.1
-0.26 0.09 -0.19 0.16 0.0 0.13 -0.23 -0.19 0.28 0.21 -0.1 -0.04
0.1 0.06 0.0 0.16 -0.14 -0.02 -0.23 -0.14 0.14 0.12 -0.12 0.0
-0.09 0.06 -0.17 0.2 -0.17 -0.08 -0.31 -0.18 0.34 0.32 -0.06 -0.01
-0.15 0.17 0.07 0.17 -0.08 0.1 -0.11 -0.35 0.36 0.33 -0.57 -0.21
0.22 0.2 -0.18 -0.06 -0.14 0.08 -0.42 -0.36 0.05 0.24 -0.02 0.21
0.25 -0.09 -0.22 0.2 -0.15 -0.15 -0.55 -0.38 0.39 0.31 -0.12 0.19
0.06 -0.08 -0.11 0.01 -0.17 0.01 -0.12 -0.04 0.07 0.13 0.03 0.17
0.16 0.07 -0.11 0.33 0.04 0.22 -0.44 -0.57 -0.01 0.11 -0.22 0.15
0.25 0.03 -0.24 -0.0 -0.08 -0.07 -0.61 -0.4 0.15 0.34 0.07 0.27
-0.07 -0.24 -0.49 0.09 -0.13 -0.11 -0.14 -0.07 0.39 0.41 -0.03 0.13
0.04 0.08 -0.02 0.31 0.3 0.46 -0.5 -0.83 -0.16 0.04 -0.19 0.02
0.29 0.17 -0.3 0.08 -0.23 0.04 -0.31 -0.18 0.27 0.2 -0.19 -0.02
0.02 0.13 -0.12 0.19 -0.22 0.06 -0.44 -0.23 0.18 0.15 -0.01 0.13
-0.02 0.15 0.02 0.1 -0.08 0.18 -0.11 -0.24 0.05 0.07 -0.11 -0.05
-0.08 0.12 -0.16 0.29 -0.03 0.01 -0.3 -0.37 0.27 0.28 -0.27 0.05
0.13 0.3 -0.13 -0.0 -0.15 0.04 -0.3 -0.4 0.07 0.24 -0.22 0.23
0.07 0.12 -0.21 0.12 -0.14 -0.0 -0.25 -0.39 0.26 0.3 -0.14 0.09
-0.13 -0.08 -0.18 0.25 0.11 0.14 -0.13 -0.19 0.22 0.19 -0.18 -0.13
-0.2 -0.21 -0.42 -0.05 -0.11 0.23 -0.16 -0.17 0.31 0.32 -0.02 0.26
0.11 0.06 -0.3 0.11 -0.02 0.18 -0.24 -0.17 0.2 0.17 -0.26 0.03
0.3 0.27 -0.24 -0.05 0.04 0.04 -0.3 -0.24 0.13 0.03 -0.28 0.13
-0.21 0.08 -0.53 0.22 -0.75 -0.42 0.16 -0.03 0.37 0.26 -0.14 0.48
0.31 0.15 -0.14 0.2 -0.19 -0.02 -0.37 -0.35 0.29 0.31 -0.16 -0.3
0.04 -0.05 -0.3 0.13 -0.15 -0.05 0.01 -0.07 0.16 0.14 -0.18 0.24
0.07 -0.01 -0.3 0.07 -0.11 -0.08 -0.1 -0.13 0.17 0.2 -0.1 0.22
-0.18 -0.09 -0.14 0.17 -0.06 0.02 -0.23 -0.21 0.26 0.24 -0.01 0.12
0.09 0.04 -0.24 0.17 -0.15 -0.14 -0.11 -0.12 0.3 0.15 -0.16 0.07
-0.01 0.05 -0.22 0.08 -0.25 -0.09 -0.09 -0.16 0.2 0.25 -0.09 0.22
0.36 0.04 0.03 0.51 0.05 0.04 -0.35 -0.4 0.08 0.0 -0.39 -0.31
0.16 -0.0 -0.17 0.19 -0.03 0.2 -0.25 -0.3 0.09 0.05 -0.1 0.07
0.16 0.15 -0.19 -0.0 -0.11 0.03 -0.12 -0.1 0.09 0.12 -0.21 0.12
-0.27 -0.2 -0.39 0.18 -0.12 0.06 -0.06 -0.12 0.22 0.19 0.06 0.29
-0.23 -0.23 -0.31 0.16 -0.06 0.01 -0.05 0.07 0.35 0.29 -0.12 -0.03
-0.45 0.2 -0.01 0.15 0.18 0.28 0.12 0.09 0.0 -0.11 -0.36 -0.3
-0.3 -0.03 -0.21 0.1 -0.07 -0.04 -0.15 0.04 0.37 0.31 -0.07 -0.11
0.01 -0.19 -0.37 0.1 -0.17 -0.1 0.05 -0.02 0.28 0.17 -0.13 0.24
-0.17 0.03 -0.06 0.16 -0.19 -0.03 -0.01 -0.03 0.17 0.14 -0.12 0.06
0.01 0.04 -0.17 0.21 0.21 0.26 -0.16 -0.24 -0.06 0.02 -0.19 -0.05
0.45 0.14 -0.31 -0.01 -0.26 0.01 -0.29 -0.41 0.06 0.21 -0.03 0.19
0.18 0.09 -0.12 0.08 -0.07 0.04 -0.35 -0.39 0.09 0.24 -0.05 0.12
0.21 0.12 -0.17 0.1 -0.15 0.06 -0.53 -0.61 0.21 0.29 -0.0 0.17
-0.07 -0.14 -0.08 0.18 0.08 0.26 -0.06 -0.12 -0.07 -0.01 -0.09 0.05
-0.11 -0.38 -0.39 0.06 -0.1 -0.19 -0.4 -0.26 0.34 0.33 0.27 0.45
-0.07 -0.19 -0.5 -0.05 -0.3 0.07 -0.19 -0.46 0.26 0.39 0.29 0.38
0.34 0.18 -0.25 0.02 -0.36 -0.16 -0.35 -0.19 0.25 0.26 -0.1 0.12
0.06 0.09 -0.09 0.01 -0.15 0.07 -0.14 -0.09 0.07 0.13 -0.09 0.1
-0.21 -0.07 -0.35 0.05 -0.04 0.03 -0.33 -0.41 0.31 0.44 -0.01 0.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.