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Heatmap: Cluster_45 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.29 -0.04 -0.21 0.07 0.51 0.92 -0.19 -0.76 -0.09 -0.23 -0.43 -0.78
0.48 0.02 0.05 0.66 0.96 1.02 0.0 -1.01 -1.14 -1.45 -1.66 -1.43
0.3 0.09 -0.21 0.07 0.36 0.51 -0.23 -0.36 -0.07 0.0 -0.35 -0.48
0.27 -0.03 0.01 0.26 0.33 0.48 -0.17 -0.44 -0.11 -0.14 -0.38 -0.44
0.28 0.1 0.08 0.58 1.0 1.28 0.09 -1.63 -1.39 -1.41 -1.86 -1.7
0.52 0.54 0.03 0.46 0.95 1.37 0.17 -1.54 -1.61 -2.23 -3.14 -3.74
-0.14 0.07 0.08 0.52 0.58 0.71 0.18 -0.43 -0.37 -0.53 -0.98 -0.82
0.54 -0.37 -1.22 -0.04 1.22 1.94 0.29 -3.01 -2.02 -1.62 -2.29 -3.85
-0.39 -0.25 -0.01 0.75 0.98 1.05 0.45 -0.21 -0.58 -1.17 -2.34 -2.78
0.09 0.12 0.01 0.25 0.78 1.02 -0.09 -0.37 -0.56 -0.75 -0.94 -1.32
0.41 0.07 -0.19 0.39 0.64 0.71 -0.17 -0.48 -0.04 -0.53 -0.92 -1.13
0.05 0.1 0.14 0.46 0.34 0.36 -0.27 -0.47 -0.22 -0.21 -0.27 -0.39
-0.16 0.24 0.16 0.47 0.89 1.03 -0.09 -0.88 -0.82 -0.99 -1.06 -1.03
-0.37 0.06 0.09 0.52 1.4 1.6 0.27 -1.57 -2.0 -3.05 -3.92 -4.73
0.47 0.28 -0.11 0.38 0.66 0.91 -0.12 -0.91 -0.46 -0.51 -1.08 -1.43
0.4 0.13 -0.1 0.37 0.43 0.66 -0.34 -0.9 -0.21 -0.12 -0.55 -0.64
0.14 0.11 0.02 0.43 0.35 0.43 -0.18 -0.57 -0.1 -0.22 -0.52 -0.35
-0.14 -0.09 -0.11 0.51 0.65 0.85 0.24 -0.4 -0.35 -0.51 -0.96 -1.02
0.06 -0.27 -0.29 0.27 0.76 1.06 -0.11 -0.81 -0.36 -0.31 -0.53 -0.9
0.07 -0.16 -0.26 0.33 0.68 0.96 -0.33 -0.84 -0.19 -0.1 -0.53 -0.82
-0.16 -0.26 -0.25 0.35 0.92 1.11 -0.24 -0.89 -0.13 -0.26 -0.75 -1.41
0.71 -0.01 -0.18 0.39 1.16 1.53 -0.11 -1.71 -1.77 -2.06 -2.3 -3.68
0.6 0.14 0.04 0.88 1.06 1.23 -0.04 -2.84 -1.6 -1.63 -2.35 -2.92
0.16 0.03 -0.23 0.34 0.47 0.76 0.33 -0.24 -0.35 -0.59 -0.87 -0.81
0.2 0.02 -0.05 0.27 0.78 0.93 -0.07 -0.37 -0.28 -0.58 -0.96 -1.63
-0.61 -0.23 0.1 0.46 1.06 1.34 0.28 -0.63 -0.81 -1.01 -1.63 -2.42
0.56 -0.16 0.13 0.56 1.24 1.2 -0.07 -1.15 -1.39 -1.88 -2.24 -2.87
0.01 -0.14 0.0 0.5 0.69 0.92 -0.01 -0.78 -0.35 -0.39 -0.86 -1.05
-0.17 -0.05 0.01 0.4 0.92 1.25 0.03 -0.8 -0.68 -0.88 -1.38 -1.29
0.21 -0.07 -0.33 0.43 0.43 0.55 0.02 -0.38 -0.11 -0.24 -0.73 -0.34
0.12 0.03 -0.04 0.21 0.61 0.72 -0.35 -0.52 -0.32 -0.22 -0.24 -0.76
0.09 0.28 0.11 0.33 0.86 1.15 -0.12 -0.84 -0.58 -0.8 -1.39 -1.96
-0.06 -0.15 -0.18 0.18 0.56 0.86 0.14 -0.27 -0.16 -0.34 -0.54 -0.89
0.29 0.12 -0.04 0.43 0.36 0.57 -0.21 -0.31 -0.19 -0.31 -0.71 -0.64
0.3 0.13 -0.1 0.23 0.24 0.36 -0.11 -0.21 0.02 -0.17 -0.52 -0.51
0.36 -0.04 -0.31 0.45 0.88 1.15 -0.15 -1.4 -0.46 -0.55 -1.05 -1.56
-0.18 0.0 0.16 0.5 0.99 1.26 0.21 -0.63 -0.84 -1.29 -1.8 -2.78
-0.39 -0.27 -0.06 0.25 0.69 0.6 -0.24 -0.47 -0.25 -0.03 -0.11 -0.28
-0.06 -0.18 -0.04 0.39 0.7 0.83 0.2 -0.12 -0.34 -0.71 -0.95 -1.07
0.26 -0.12 -0.08 0.44 0.55 0.61 -0.05 -0.39 -0.17 -0.34 -0.73 -0.79
0.49 0.04 -0.47 0.03 0.76 1.12 0.08 -0.68 -0.58 -0.59 -1.02 -1.17
0.01 -0.09 -0.08 0.17 0.56 0.85 0.01 -0.38 -0.22 -0.32 -0.54 -0.76
0.0 -0.03 -0.01 0.43 0.62 0.67 0.17 -0.27 -0.25 -0.45 -0.89 -1.02
0.04 -0.17 -0.28 0.3 0.5 0.77 -0.19 -0.45 -0.06 0.01 -0.49 -0.7
-0.59 -0.1 -0.21 0.03 0.67 0.83 -0.19 -0.35 -0.16 -0.19 -0.29 -0.16
0.01 -0.15 -0.34 0.36 0.66 0.8 0.13 -0.51 -0.28 -0.39 -0.79 -0.46
0.26 -0.12 -0.11 0.15 0.53 0.58 -0.15 -0.28 -0.2 -0.17 -0.38 -0.63
0.21 0.18 -0.03 0.3 0.53 0.85 -0.43 -1.2 -0.23 -0.03 -0.4 -1.02
0.09 0.1 -0.03 0.27 0.55 0.86 0.04 -0.41 -0.26 -0.44 -0.75 -1.15
0.55 0.2 -0.21 0.57 0.9 1.28 0.15 -1.65 -1.34 -1.41 -2.14 -1.65
0.26 0.02 -0.26 0.27 0.65 0.82 -0.27 -0.55 -0.17 -0.18 -0.59 -1.12
-0.47 -0.55 -0.37 0.66 1.31 1.56 0.52 -0.95 -1.18 -1.93 -3.32 -4.3
0.56 0.2 -0.21 0.39 0.92 1.17 -0.08 -1.46 -0.84 -0.89 -1.4 -1.84
0.28 0.2 -0.18 0.09 0.48 0.94 -0.1 -0.41 -0.08 -0.27 -0.86 -1.47
0.43 0.14 0.02 0.62 0.72 0.89 -0.16 -1.21 -0.69 -0.71 -1.17 -0.98
0.22 0.16 -0.24 0.11 0.32 0.58 -0.22 -0.53 0.02 0.03 -0.33 -0.59
-0.23 0.16 0.42 0.73 0.73 1.18 0.05 -0.72 -0.77 -1.29 -2.09 -2.09
-0.01 -0.17 -0.41 0.21 0.48 0.87 -0.08 -0.59 -0.03 -0.06 -0.35 -0.6
0.15 0.2 -0.04 0.33 0.7 0.85 -0.11 -0.62 -0.38 -0.35 -0.98 -1.16
0.21 0.06 -0.18 0.12 0.46 0.62 -0.06 -0.45 -0.07 -0.06 -0.48 -0.75
0.24 0.04 0.12 0.71 0.63 0.73 -0.15 -0.68 -0.34 -0.63 -1.1 -1.18
0.16 -0.12 -0.02 0.26 0.47 0.54 -0.31 -0.45 -0.24 -0.16 -0.18 -0.37
0.37 -0.12 -0.27 0.35 0.73 0.81 -0.02 -0.39 -0.33 -0.68 -0.95 -0.78
0.13 -0.02 -0.21 0.12 0.44 0.63 0.09 -0.12 -0.14 -0.32 -0.54 -0.56
0.2 0.19 0.17 0.47 0.61 0.88 -0.1 -0.96 -0.57 -0.4 -0.81 -1.36
0.34 -0.24 -0.11 0.61 0.93 0.88 0.35 -0.41 -0.63 -1.39 -1.48 -1.84
0.18 -0.03 -0.26 0.38 0.49 0.66 0.18 -0.23 -0.13 -0.4 -1.1 -0.66
0.23 0.22 -0.01 0.25 0.5 0.65 -0.0 -0.26 -0.19 -0.39 -0.88 -1.06
0.26 0.1 -0.04 0.3 0.31 0.49 -0.35 -0.61 -0.03 0.02 -0.37 -0.57
0.05 -0.3 -0.09 0.52 0.78 0.92 -0.05 -0.56 -0.3 -0.38 -0.84 -1.36
0.23 0.28 -0.02 0.3 0.8 0.91 -0.06 -0.58 -0.39 -0.75 -1.15 -1.61
-0.14 0.06 0.04 0.33 0.38 0.45 0.04 -0.18 -0.09 -0.16 -0.54 -0.59
0.54 0.16 -0.02 0.57 0.63 0.75 -0.34 -1.13 -0.54 -0.51 -0.81 -0.93
0.56 0.3 -0.04 0.78 1.14 1.39 -0.05 -2.45 -2.14 -2.61 -2.89 -3.15
-0.07 -0.1 -0.04 0.51 0.73 0.8 0.24 -0.36 -0.26 -0.51 -1.15 -1.42
0.88 0.3 -0.09 0.84 0.88 1.04 -0.29 -2.3 -1.16 -1.28 -1.98 -2.56
0.21 0.11 0.2 0.44 0.48 0.51 -0.48 -0.74 -0.4 -0.17 -0.45 -0.44
-0.85 0.35 0.42 0.87 1.27 1.57 0.11 -2.77 -3.12 -3.21 -3.42 -3.46
0.06 0.18 0.33 0.85 0.6 0.64 -0.27 -0.88 -0.5 -0.7 -1.02 -0.99
0.75 0.16 -0.22 0.69 0.85 1.36 0.17 -1.9 -1.29 -1.85 -3.07 -2.56
0.16 -0.01 -0.13 0.26 0.46 0.59 -0.22 -0.49 -0.07 -0.05 -0.47 -0.56
0.22 0.0 -0.14 0.88 1.01 0.97 -0.08 -1.23 -0.74 -1.06 -1.6 -1.62
-0.25 -0.27 -0.25 0.24 0.69 0.98 0.15 -0.21 -0.12 -0.33 -0.73 -1.22
-0.27 -0.29 -0.09 0.28 0.61 0.72 -0.21 -0.36 -0.09 -0.09 -0.34 -0.52
0.33 -0.22 -0.01 0.55 0.67 0.85 -0.28 -0.8 -0.24 -0.38 -0.72 -1.27
-0.09 -0.1 -0.65 0.2 0.87 1.3 0.26 -1.0 -0.44 -0.38 -1.06 -1.49
0.31 0.19 -0.27 0.2 0.63 1.24 0.02 -0.84 -0.38 -0.7 -1.28 -1.49
0.28 0.06 -0.1 0.21 0.37 0.4 0.08 -0.3 -0.13 -0.27 -0.54 -0.42
0.39 0.08 -0.27 0.33 0.77 1.2 0.15 -0.63 -0.45 -1.02 -1.53 -2.15
0.17 -0.05 -0.09 0.33 0.39 0.52 -0.17 -0.31 0.01 -0.17 -0.51 -0.55
-0.0 -0.38 -0.11 0.44 0.88 1.02 -0.03 -0.71 -0.36 -0.53 -0.78 -1.21
0.19 0.04 -0.12 0.13 0.38 0.66 -0.01 -0.25 -0.15 -0.22 -0.46 -0.71
-0.18 0.05 0.27 0.53 1.08 1.21 0.06 -0.92 -1.08 -1.41 -1.59 -1.95

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.