Heatmap: Cluster_76 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.81 -0.89 -0.66 -0.22 -0.49 -0.64 0.07 0.47 0.65 0.54 0.33 0.41
-0.56 -0.52 -0.57 -0.21 -0.45 -0.3 0.48 0.55 0.43 0.31 -0.08 0.21
-0.34 -0.51 -0.58 -0.18 -0.16 -0.09 0.25 0.32 0.36 0.36 0.09 0.08
-0.38 -0.33 -0.57 -0.18 -0.74 -0.21 0.18 0.43 0.57 0.39 0.16 0.03
-0.4 -0.55 -1.12 -0.77 -0.75 -0.01 0.36 0.48 0.58 0.48 0.36 0.11
-0.11 -0.29 -0.48 -0.16 -0.33 -0.27 0.1 0.29 0.32 0.27 0.05 0.29
-0.23 -0.36 -0.48 -0.2 -0.29 -0.06 -0.01 0.15 0.43 0.38 0.21 0.14
-0.28 -0.33 -0.32 -0.24 -0.06 0.13 0.22 0.29 0.19 0.12 0.12 -0.01
-0.75 -0.79 -0.89 -0.44 -0.51 -0.11 0.26 0.5 0.79 0.49 0.2 0.04
-0.22 -0.2 -0.39 -0.36 -0.09 0.1 0.24 0.38 0.36 0.2 0.0 -0.31
-1.52 -1.07 -0.83 -0.48 -0.96 -0.41 0.69 0.57 0.45 0.42 0.46 0.52
-0.4 -0.5 -0.52 -0.26 -0.21 -0.08 0.19 0.36 0.34 0.24 0.2 0.24
-0.28 -0.35 -0.56 -0.44 -0.14 0.2 0.23 0.2 0.24 0.27 0.2 0.08
-0.69 -0.46 -0.33 -0.08 -0.24 -0.0 0.39 0.35 0.29 0.22 0.04 0.11
-0.47 -0.69 -1.08 -0.66 0.09 0.51 0.37 0.53 0.44 0.28 0.15 -0.61
-0.22 -0.26 -0.5 -0.26 -0.26 0.1 0.01 0.01 0.27 0.33 0.15 0.34
-0.41 -0.35 -0.43 -0.21 -0.11 0.05 0.25 0.4 0.4 0.28 0.03 -0.27
-0.04 -0.27 -0.48 -0.02 -0.43 -0.36 0.11 0.21 0.36 0.3 0.05 0.24
-0.49 -0.6 -0.55 -0.37 -0.31 -0.11 0.33 0.62 0.64 0.28 0.02 -0.21
-0.83 -0.81 -0.9 -0.66 -0.44 -0.14 0.04 0.82 0.76 0.58 0.27 -0.2
-0.54 -0.35 -0.43 -0.21 -0.5 -0.31 0.07 0.45 0.48 0.34 0.14 0.3
-1.26 -0.99 -0.96 -0.7 -0.44 0.16 0.46 0.36 0.59 0.57 0.28 0.3
-0.16 -0.32 -0.27 -0.11 0.04 0.17 0.21 0.29 0.2 0.11 -0.07 -0.25
-0.36 -0.45 -0.48 -0.22 -0.3 -0.12 0.05 0.57 0.52 0.38 0.09 -0.22
-0.2 -0.2 -0.33 -0.1 -0.16 0.01 0.02 0.08 0.22 0.25 0.08 0.19
-0.89 -0.77 -0.76 -0.3 -0.44 0.13 0.26 0.56 0.65 0.41 0.26 -0.19
-1.13 -1.3 -0.8 -0.29 -1.4 -0.3 0.03 0.73 0.96 0.52 0.33 0.29
-0.16 -0.33 -0.52 -0.1 -0.16 -0.1 0.02 0.08 0.36 0.26 0.13 0.28
-0.52 -0.37 -0.42 -0.33 -0.31 -0.09 0.23 0.34 0.31 0.34 0.27 0.12
-0.74 -0.74 -0.96 -0.69 -0.44 0.05 0.06 0.23 0.63 0.64 0.47 0.24
-0.45 -0.29 -0.42 -0.35 -0.06 0.1 0.36 0.55 0.22 0.12 0.07 -0.26
-0.34 -0.15 -0.33 -0.17 -0.15 -0.04 0.14 0.22 0.29 0.22 0.13 0.01
-0.22 -0.38 -0.55 -0.24 -0.16 -0.05 0.06 0.21 0.32 0.2 0.17 0.33
-0.62 -0.44 -0.43 -0.25 -0.31 -0.19 0.08 0.49 0.47 0.42 0.16 0.06
-0.69 -0.68 -0.78 -0.21 -0.1 0.04 0.01 0.32 0.54 0.51 0.19 0.1
-0.88 -0.96 -0.91 -0.37 0.15 0.37 0.49 0.56 0.39 0.19 0.07 -0.22
-0.59 -0.5 -0.48 -0.07 -0.31 -0.19 0.45 0.33 0.29 0.3 0.07 0.2
-0.18 -0.11 -0.38 -0.26 -0.37 -0.04 -0.05 0.1 0.24 0.36 0.21 0.25
-0.81 -1.48 -1.29 -0.76 -1.59 -0.37 0.56 0.9 0.66 0.37 0.58 0.32
-1.47 -1.22 -1.06 -0.47 -0.4 0.04 0.26 0.56 0.81 0.71 0.24 -0.02
-0.55 -0.43 -0.48 -0.15 -0.35 -0.18 0.26 0.3 0.45 0.33 0.13 0.21
-0.6 -0.51 -0.4 -0.21 -0.26 -0.02 0.24 0.39 0.34 0.3 0.19 0.1
-0.53 -0.25 -0.5 -0.49 -0.31 -0.12 0.23 0.62 0.53 0.36 0.08 -0.26
-0.23 -0.23 -0.38 -0.29 -0.34 -0.22 0.15 0.29 0.36 0.26 0.23 0.12
-0.03 -0.48 -0.64 -0.35 -0.04 0.35 0.25 0.43 0.26 0.05 -0.01 -0.2
-0.81 -0.94 -1.1 -0.58 -0.27 0.22 0.45 0.47 0.58 0.43 0.27 -0.04
-1.77 -2.06 -1.63 -1.14 -0.03 0.45 0.74 0.97 0.81 0.51 0.05 -1.01
-0.16 -0.47 -0.54 -0.13 -0.14 -0.07 0.12 0.16 0.28 0.33 0.11 0.22
-0.03 -0.23 -0.36 -0.01 -0.08 -0.04 -0.11 -0.01 0.22 0.14 0.1 0.3
-0.39 -1.12 -2.02 -1.17 -0.93 0.06 0.06 0.3 0.95 0.93 0.45 0.08
-1.11 -0.73 -0.46 -0.15 -0.24 0.07 0.14 0.5 0.51 0.41 0.26 -0.07
-0.26 -0.33 -0.34 -0.11 0.04 0.28 0.27 0.18 0.15 0.1 -0.04 -0.14
-0.27 -0.65 -0.87 -0.25 -0.66 -0.68 0.23 0.57 0.71 0.4 0.02 0.34
-0.09 -0.22 -0.38 -0.23 -0.19 -0.05 0.06 0.11 0.2 0.22 0.15 0.25
-0.33 -0.26 -0.56 -0.26 -0.42 0.01 0.28 0.17 0.34 0.3 0.03 0.31
0.04 -0.28 -0.31 -0.01 -0.47 -0.31 0.05 0.11 0.37 0.33 0.04 0.17
-0.43 -0.51 -0.68 -0.35 -0.61 -0.07 0.35 0.46 0.46 0.31 0.23 0.13
-0.68 -0.36 -0.48 -0.19 -0.29 -0.11 0.35 0.45 0.48 0.25 0.09 -0.02
-1.54 -0.96 -0.98 -0.68 -0.63 -0.05 0.54 0.71 0.59 0.34 0.51 0.15
-0.73 -0.63 -1.03 -0.73 -0.64 -0.32 0.14 0.68 0.76 0.65 0.27 0.05
-0.47 -0.36 -0.51 -0.01 -0.11 0.04 0.15 0.09 0.36 0.25 0.04 0.24
-0.7 -0.77 -1.16 -0.59 -0.08 0.29 0.27 0.51 0.67 0.58 0.05 -0.4
-0.93 -1.0 -1.06 -0.45 -0.02 0.23 0.57 0.76 0.49 0.07 -0.03 -0.01
-0.86 -0.64 -0.92 -0.79 -0.92 -0.11 0.53 0.69 0.74 0.44 0.23 -0.03
-0.86 -0.98 -0.99 -0.4 -0.85 -0.66 0.3 0.66 0.76 0.55 0.24 0.43
-0.68 -0.4 -0.65 -0.16 -0.39 -0.02 0.31 0.14 0.38 0.43 0.09 0.35
-0.55 -0.54 -0.66 -0.36 -0.48 -0.06 0.32 0.37 0.44 0.42 0.19 0.23
-3.26 -3.38 -2.67 -1.86 -2.32 -2.01 0.48 1.13 1.26 0.98 0.58 0.56
-1.41 -0.84 -0.61 -0.08 -0.11 -0.1 0.55 0.49 0.42 0.24 -0.12 0.38
-0.29 -0.39 -0.71 -0.35 -0.22 0.08 0.08 0.19 0.35 0.41 0.18 0.23
-0.22 -0.48 -0.46 -0.12 -0.54 -0.26 0.27 0.36 0.34 0.29 0.16 0.21
-0.64 -0.5 -0.33 -0.19 -0.42 -0.34 0.26 0.44 0.45 0.29 0.18 0.21
-0.78 -0.62 -0.53 -0.12 0.12 0.25 0.31 0.44 0.44 0.18 -0.03 -0.32
-2.16 -1.86 -1.62 -0.96 -1.42 -0.15 0.73 0.9 0.77 0.57 0.53 0.3
-0.38 -0.4 -0.45 -0.27 -0.12 0.07 0.41 0.59 0.4 0.18 -0.08 -0.49
-0.38 -0.42 -0.62 -0.01 -0.09 -0.14 -0.14 -0.03 0.46 0.38 0.13 0.42
-0.06 -0.46 -0.75 -0.38 -0.33 0.02 0.14 0.24 0.27 0.23 0.26 0.36

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.