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Heatmap: Cluster_49 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.05 -0.01 -0.24 -0.05 -0.34 -0.13 -0.3 -0.15 0.33 0.37 0.02 0.31
-0.03 -0.17 -0.49 -0.04 -0.09 0.13 -0.24 -0.19 0.25 0.41 0.08 0.16
0.08 -0.02 -0.27 -0.09 -0.26 -0.07 -0.13 0.08 0.36 0.26 -0.01 -0.06
-0.03 -0.05 -0.23 -0.06 -0.17 0.0 -0.19 -0.05 0.24 0.28 0.03 0.14
0.03 -0.11 -0.43 -0.02 -0.18 0.14 -0.19 -0.15 0.34 0.31 -0.09 0.16
0.04 -0.01 -0.41 -0.1 -0.15 0.07 -0.08 -0.17 0.17 0.27 -0.05 0.26
-0.01 -0.0 -0.29 0.21 -0.2 -0.16 -0.29 -0.17 0.46 0.31 -0.14 0.05
0.1 -0.06 -0.38 -0.09 -0.25 -0.02 -0.07 -0.04 0.23 0.24 -0.05 0.25
0.39 -0.24 -0.67 -0.29 -0.29 -0.08 -0.37 -0.08 0.47 0.38 0.15 0.16
-0.03 -0.33 -0.67 -0.22 -0.31 0.07 -0.15 -0.1 0.37 0.46 0.19 0.31
-0.02 -0.1 -0.24 0.01 -0.22 -0.02 -0.19 -0.01 0.26 0.28 0.06 0.07
-0.03 -0.33 -0.94 -0.62 -0.49 -0.07 -0.34 -0.23 0.61 0.62 0.4 0.43
0.04 -0.05 -0.37 -0.04 -0.18 -0.03 -0.21 0.0 0.31 0.32 0.03 0.04
0.06 -0.11 -0.25 0.03 -0.26 -0.15 -0.18 0.08 0.39 0.27 -0.04 0.01
0.06 -0.16 -0.29 -0.13 -0.29 -0.23 -0.21 0.07 0.43 0.32 0.01 0.2
-0.04 -0.13 -0.24 -0.03 -0.15 -0.04 -0.04 0.12 0.27 0.18 -0.0 0.02
0.03 0.0 -0.29 0.03 -0.23 0.03 -0.07 -0.1 0.31 0.26 -0.16 0.05
0.11 0.05 -0.27 -0.05 -0.22 -0.11 -0.23 -0.01 0.26 0.19 0.02 0.15
-0.14 -0.11 -0.32 0.02 -0.21 -0.19 -0.14 0.09 0.42 0.32 0.01 0.07
-0.01 0.02 -0.4 0.04 -0.51 -0.32 -0.34 -0.11 0.59 0.48 -0.14 0.24
-0.11 -0.19 -0.28 -0.01 -0.12 0.01 -0.09 0.02 0.23 0.19 0.06 0.2
0.01 -0.06 -0.25 -0.02 -0.3 -0.02 -0.21 -0.21 0.35 0.3 0.09 0.16
0.05 -0.14 -0.55 -0.28 -0.27 0.02 -0.2 -0.12 0.39 0.51 0.15 0.1
-0.08 -0.35 -0.55 0.03 -0.26 -0.1 -0.26 -0.17 0.39 0.47 0.19 0.3
0.13 -0.07 -0.46 -0.19 -0.49 -0.22 -0.28 -0.05 0.45 0.49 0.03 0.26
0.03 -0.07 -0.35 -0.13 -0.23 -0.01 -0.15 0.03 0.22 0.31 0.04 0.18
0.18 0.03 -0.33 -0.09 -0.26 0.01 -0.18 -0.09 0.28 0.24 -0.03 0.09
0.04 -0.06 -0.32 -0.08 -0.32 -0.05 -0.14 -0.02 0.3 0.34 0.01 0.15
0.05 -0.27 -0.63 -0.34 -0.11 0.19 -0.34 -0.09 0.3 0.43 0.26 0.17
0.06 -0.06 -0.2 -0.02 -0.14 -0.03 -0.12 0.11 0.26 0.14 -0.02 -0.06
-0.07 -0.2 -0.42 -0.01 -0.2 0.08 -0.25 -0.23 0.4 0.34 0.03 0.28
0.03 -0.02 -0.32 0.03 -0.31 -0.07 -0.16 -0.06 0.36 0.28 -0.1 0.18
-0.09 -0.05 -0.3 -0.16 -0.33 -0.18 -0.17 0.03 0.42 0.39 0.11 0.1
0.18 -0.16 -0.17 -0.16 -0.26 -0.06 -0.3 -0.02 0.3 0.27 0.12 0.1
0.12 -0.02 -0.53 -0.12 -0.47 -0.24 -0.35 -0.13 0.49 0.44 0.1 0.28
0.05 -0.09 -0.52 -0.18 -0.46 0.0 -0.14 -0.01 0.43 0.3 0.11 0.23
-0.25 -0.14 -0.31 -0.07 -0.16 0.02 -0.27 0.02 0.38 0.41 0.16 0.0
-0.13 -0.32 -0.93 -0.42 -0.31 0.13 -0.34 -0.44 0.45 0.62 0.34 0.5
-0.07 -0.08 -0.17 -0.06 -0.21 -0.08 -0.24 -0.06 0.28 0.34 0.04 0.17
-0.06 -0.09 -0.27 0.03 -0.17 -0.05 -0.16 0.03 0.32 0.17 0.06 0.08
-0.2 -0.06 -0.42 -0.16 -0.17 0.08 -0.11 -0.05 0.33 0.33 -0.01 0.23
-0.07 -0.1 -0.26 0.14 -0.39 -0.16 -0.23 -0.21 0.41 0.37 -0.04 0.28
-0.1 -0.17 -0.46 -0.05 -0.12 0.09 -0.11 -0.04 0.3 0.27 0.01 0.21
0.05 0.05 -0.24 -0.05 -0.22 -0.06 -0.07 -0.04 0.2 0.22 0.01 0.07
0.02 -0.07 -0.21 0.04 -0.17 -0.06 -0.13 -0.0 0.23 0.21 -0.03 0.11
0.01 -0.12 -0.36 -0.04 -0.1 0.03 -0.19 -0.09 0.41 0.31 -0.09 0.06
0.14 -0.1 -0.41 -0.15 -0.36 -0.19 -0.17 -0.2 0.27 0.46 0.1 0.3
0.17 -0.0 -0.32 0.02 -0.31 -0.02 -0.44 -0.49 0.34 0.42 0.06 0.23
0.19 -0.02 -0.33 0.0 -0.42 -0.38 -0.14 -0.1 0.34 0.27 0.04 0.27
-0.02 -0.09 -0.44 0.09 -0.22 -0.02 -0.17 -0.09 0.46 0.27 0.02 -0.01
0.27 0.06 -0.47 -0.14 -0.63 -0.47 -0.5 -0.1 0.54 0.45 0.03 0.35
-0.06 -0.2 -0.5 -0.19 -0.2 0.22 -0.25 -0.0 0.41 0.47 0.02 -0.02
0.01 -0.05 -0.15 0.02 -0.14 -0.02 -0.04 0.04 0.17 0.15 -0.02 -0.0
0.22 -0.09 -0.41 -0.07 -0.37 -0.35 -0.28 -0.07 0.45 0.38 0.04 0.22
-0.02 -0.23 -0.47 -0.16 -0.25 -0.06 -0.17 -0.0 0.32 0.41 0.15 0.23
-0.02 -0.04 -0.3 -0.02 -0.23 0.08 -0.08 -0.0 0.23 0.22 -0.05 0.11
-0.27 -0.28 -0.43 0.06 -0.15 0.03 -0.11 -0.04 0.37 0.34 0.02 0.22
-0.22 -0.49 -0.87 -0.44 -0.81 0.06 -0.1 0.14 0.68 0.58 0.33 0.19
0.01 -0.25 -0.38 0.07 -0.13 -0.06 -0.46 -0.18 0.44 0.44 0.08 0.11
-0.01 -0.36 -0.64 -0.19 -0.26 0.15 -0.08 -0.06 0.42 0.36 0.1 0.22
-0.18 -0.19 -0.5 -0.01 -0.18 -0.03 -0.27 -0.09 0.38 0.37 0.04 0.36
-0.02 0.0 -0.23 0.06 -0.39 -0.15 -0.28 0.0 0.34 0.32 -0.06 0.21
-0.15 -0.16 -0.42 -0.06 -0.28 0.06 -0.15 -0.18 0.3 0.35 0.07 0.37
0.13 0.08 -0.36 -0.02 -0.36 -0.3 -0.38 -0.17 0.44 0.35 -0.04 0.3
-0.07 -0.28 -0.38 -0.08 -0.13 0.06 -0.37 -0.19 0.25 0.34 0.2 0.37
-0.07 -0.11 -0.31 0.01 -0.19 0.01 -0.26 -0.07 0.34 0.36 0.02 0.1
-0.21 -0.18 -0.39 -0.03 -0.24 0.03 -0.19 -0.01 0.49 0.48 0.0 -0.04
0.4 0.0 -0.53 -0.32 -0.45 0.02 -0.35 -0.38 0.36 0.48 0.14 0.14
-0.04 -0.11 -0.32 -0.09 -0.44 -0.12 -0.29 -0.05 0.42 0.42 0.2 0.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.