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Heatmap: Cluster_68 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.56 0.49 0.24 0.4 0.43 0.38 -0.42 -0.99 -0.5 -0.41 -0.74 -0.6
1.09 1.01 0.74 0.88 0.54 0.72 -0.51 -3.53 -3.15 -2.94 -3.35 -3.27
0.7 0.43 -0.02 0.35 0.27 0.19 -0.07 -0.4 -0.26 -0.52 -0.87 -0.65
0.64 0.45 0.06 0.09 0.09 0.37 -0.06 -0.29 -0.19 -0.38 -0.69 -0.81
1.23 0.28 0.57 1.24 0.89 0.43 -0.73 -2.07 -1.82 -2.72 -3.55 -4.79
0.63 0.23 0.23 0.97 0.52 0.27 -0.35 -0.94 -0.59 -0.8 -1.22 -0.88
0.62 0.42 -0.09 0.08 0.19 0.4 -0.2 -0.55 -0.2 -0.28 -0.56 -0.42
0.62 0.47 0.15 0.33 0.15 0.38 0.0 -0.43 -0.4 -0.5 -0.99 -0.77
0.56 0.4 0.16 0.17 0.35 0.67 -0.01 -0.3 -0.57 -1.01 -0.87 -0.79
0.67 0.79 0.57 0.48 0.61 0.62 -0.16 -0.66 -1.21 -1.64 -2.07 -2.13
0.57 0.33 0.05 0.24 0.22 0.49 -0.29 -0.62 -0.17 -0.2 -0.64 -0.74
0.72 0.51 0.06 0.29 0.31 0.5 -0.08 -0.39 -0.17 -0.62 -1.32 -1.48
0.69 0.9 0.53 0.41 0.52 0.79 -0.57 -1.77 -1.19 -1.12 -1.36 -1.58
1.0 0.69 0.45 0.43 0.45 0.65 -0.16 -0.75 -1.07 -1.58 -2.02 -2.44
0.89 0.31 0.7 0.69 1.02 0.95 -0.58 -2.75 -2.24 -2.11 -2.1 -2.35
0.73 0.51 0.08 0.58 0.22 0.5 -0.05 -0.69 -0.54 -0.7 -1.25 -1.07
0.82 0.51 0.05 0.27 0.26 0.35 0.01 -0.32 -0.14 -0.86 -1.26 -1.31
0.83 0.52 0.03 0.32 0.2 0.37 -0.27 -0.6 -0.21 -0.47 -0.97 -1.02
0.66 0.39 0.2 0.61 0.48 0.6 -0.17 -0.84 -0.61 -0.76 -1.37 -1.19
0.78 0.5 0.2 0.46 0.49 0.68 0.01 -0.66 -0.8 -0.92 -1.64 -1.9
0.78 0.53 0.24 0.34 0.16 0.26 -0.2 -0.58 -0.37 -0.54 -0.8 -1.01
0.59 0.06 0.36 0.65 0.73 0.69 -0.42 -0.99 -0.72 -0.85 -0.99 -1.31
0.78 0.22 0.2 0.56 0.72 0.66 -0.21 -0.99 -0.65 -1.08 -1.25 -1.45
0.64 0.18 0.07 0.38 0.45 0.38 -0.29 -0.72 -0.33 -0.29 -0.77 -0.58
0.44 0.32 0.13 0.46 0.27 0.46 -0.08 -0.49 -0.32 -0.45 -0.62 -0.97
0.52 0.26 0.02 0.42 0.35 0.56 -0.14 -0.5 -0.28 -0.42 -0.78 -0.98
0.77 0.63 0.22 0.34 0.52 0.76 -0.58 -1.68 -0.77 -0.6 -0.95 -1.21
0.96 0.61 -0.01 0.26 0.3 0.5 -0.07 -0.6 -0.32 -0.75 -1.49 -1.62
0.59 0.57 0.47 0.41 0.25 0.29 -0.22 -0.39 -0.54 -0.84 -0.96 -1.0
0.93 0.69 0.1 0.33 0.62 0.62 -0.28 -0.92 -0.74 -0.96 -1.57 -1.87
0.61 0.31 -0.01 0.38 0.14 0.12 -0.37 -0.45 -0.01 -0.03 -0.62 -0.68
0.3 0.24 0.21 0.38 0.17 0.13 -0.23 -0.22 -0.01 -0.2 -0.57 -0.57
0.32 0.64 0.52 0.64 0.63 0.57 -0.56 -2.11 -1.14 -0.49 -0.94 -0.79
0.36 0.33 0.34 0.7 0.27 0.39 -0.14 -0.57 -0.6 -0.67 -0.91 -0.61
0.29 0.35 0.38 0.37 0.33 0.12 -0.38 -0.5 -0.39 -0.34 -0.46 -0.31
0.45 0.25 0.21 0.4 0.18 0.25 -0.35 -0.32 -0.23 -0.42 -0.48 -0.45
0.4 0.26 0.07 0.43 0.14 0.2 -0.22 -0.36 0.03 -0.15 -0.7 -0.58
0.81 0.62 0.38 0.4 0.49 0.54 -0.33 -0.82 -0.58 -0.98 -1.5 -1.54
0.12 0.03 0.04 0.22 0.22 0.18 -0.21 0.0 0.13 -0.17 -0.21 -0.55
0.37 0.2 0.05 0.22 0.04 0.27 -0.23 -0.17 -0.03 -0.17 -0.38 -0.45
0.65 0.47 0.07 0.14 0.09 0.25 -0.03 -0.19 -0.22 -0.36 -0.88 -0.73
0.63 0.61 0.14 0.46 0.36 0.47 -0.23 -0.6 -0.43 -0.6 -1.16 -1.29
0.32 0.3 0.27 0.12 0.54 0.59 -0.61 -0.7 -0.43 -0.27 -0.25 -0.79
0.37 0.18 0.1 0.55 0.24 0.35 -0.19 -0.47 -0.17 -0.31 -0.7 -0.58
0.29 0.13 0.17 0.53 0.2 0.23 -0.28 -0.53 -0.17 -0.18 -0.46 -0.37
0.55 0.51 0.37 0.22 0.35 0.34 -0.41 -0.48 -0.45 -0.49 -0.63 -0.83
0.85 0.57 -0.05 0.13 0.31 0.61 -0.02 -0.72 -0.43 -0.49 -1.09 -1.41
0.32 0.43 0.19 0.14 0.22 0.31 -0.01 -0.25 -0.21 -0.45 -0.62 -0.58
0.64 0.62 0.43 0.35 0.38 1.03 0.03 -0.99 -1.08 -1.5 -1.66 -1.88
0.73 0.54 0.24 0.33 0.23 0.5 -0.15 -0.58 -0.37 -0.77 -1.13 -1.08
0.93 0.69 0.75 0.44 0.63 0.64 -0.49 -1.0 -1.01 -1.74 -1.98 -3.47
0.95 0.8 0.33 -0.0 0.32 0.4 -0.35 -0.6 -0.61 -0.77 -1.14 -1.45
0.64 0.29 0.13 0.47 0.17 0.32 -0.16 -0.59 -0.21 -0.32 -0.87 -0.76
0.68 0.54 0.61 0.35 0.8 0.67 -1.0 -1.75 -0.89 -0.95 -0.76 -1.45
0.56 0.38 0.31 0.32 0.16 0.32 -0.48 -0.87 -0.46 -0.33 -0.3 -0.37
0.23 0.27 0.06 0.2 0.15 0.36 -0.17 -0.41 -0.12 -0.14 -0.33 -0.38
0.28 0.19 0.31 0.22 0.63 0.68 -0.63 -0.9 -0.51 -0.31 -0.29 -0.76
1.17 0.77 -0.09 -0.04 0.46 0.95 -0.65 -2.0 -1.04 -0.86 -0.98 -1.35
0.61 0.38 -0.14 0.06 0.18 0.42 -0.04 -0.41 -0.1 -0.23 -0.73 -0.66
1.1 1.07 0.51 0.72 0.27 0.61 0.01 -1.26 -2.82 -3.28 -3.19 -2.56
0.78 0.41 0.04 0.36 0.12 0.25 -0.29 -0.46 -0.07 -0.26 -0.97 -0.97
0.83 0.36 -0.02 0.49 0.32 0.66 -0.13 -0.67 -0.39 -0.73 -1.31 -1.31
0.55 0.21 0.2 0.42 0.31 0.43 -0.22 -0.69 -0.33 -0.33 -0.62 -0.78
0.28 0.52 0.46 0.36 0.39 0.25 -0.45 -0.64 -0.3 -0.32 -0.63 -0.82
1.27 0.88 -0.23 -0.23 0.45 1.18 0.18 -0.96 -1.47 -2.18 -3.05 -4.04
0.65 0.41 0.1 0.73 0.29 0.47 -0.36 -1.19 -0.23 -0.38 -1.13 -1.1
0.71 0.46 0.23 0.52 0.35 0.54 -0.52 -1.17 -0.56 -0.38 -0.83 -0.98
0.28 0.16 0.08 0.13 0.29 0.46 -0.49 -0.63 -0.23 -0.01 -0.12 -0.32
0.85 0.58 0.52 0.52 0.54 0.59 -0.23 -0.76 -0.82 -1.33 -1.84 -2.42
0.84 0.47 0.27 0.44 0.25 0.63 -0.26 -0.99 -0.72 -0.73 -1.04 -1.06
0.31 0.12 0.06 0.33 0.13 0.14 -0.23 -0.12 0.1 -0.09 -0.43 -0.6
0.86 0.83 0.44 0.34 0.64 0.56 -0.54 -0.96 -0.66 -1.31 -2.0 -1.87
0.5 0.21 0.19 0.26 0.34 0.65 -0.35 -0.89 -0.13 -0.25 -0.96 -0.6
0.57 0.11 0.07 0.45 0.53 0.5 -0.29 -0.72 -0.23 -0.33 -0.83 -0.93
1.1 0.9 0.14 0.08 0.52 0.85 -0.03 -0.56 -1.09 -2.06 -2.79 -3.71
0.61 0.33 0.22 0.23 0.27 0.36 -0.4 -0.44 -0.31 -0.59 -0.37 -0.61
0.82 0.83 0.38 0.21 0.24 0.52 -0.25 -1.04 -0.62 -0.59 -1.16 -1.72
0.87 0.26 0.16 0.49 0.38 0.37 -0.25 -0.46 -0.27 -0.65 -1.06 -1.54
0.71 0.57 0.12 0.06 0.17 0.37 0.03 -0.07 -0.24 -0.57 -1.28 -1.23
0.54 0.32 -0.01 0.19 0.35 0.37 -0.27 -0.46 -0.13 -0.32 -0.5 -0.68
0.21 0.17 0.29 0.3 0.49 0.53 -0.28 -0.45 -0.37 -0.41 -0.37 -0.86
0.77 0.53 0.11 0.16 0.21 0.3 0.0 -0.27 -0.32 -0.63 -1.18 -0.89
0.57 0.27 0.05 0.52 0.52 0.57 -0.59 -0.77 -0.34 -0.46 -0.75 -0.85
0.58 0.37 0.06 0.38 0.31 0.5 -0.17 -0.64 -0.47 -0.49 -0.83 -0.53
0.45 0.73 0.54 0.51 0.44 0.62 -0.26 -1.17 -0.9 -0.8 -1.31 -1.27
0.61 0.31 0.03 0.24 0.12 0.37 -0.12 -0.29 -0.09 -0.34 -0.77 -0.74
1.11 0.86 0.35 0.73 0.52 0.64 -0.02 -1.08 -1.68 -2.47 -3.74 -3.81
1.24 0.78 0.28 0.66 0.59 0.7 -0.15 -1.14 -1.59 -2.41 -3.47 -4.57
0.69 0.44 0.17 0.45 0.45 0.49 -0.2 -0.56 -0.43 -0.64 -1.27 -1.25
-0.08 0.47 0.47 0.55 0.55 0.26 -0.45 -0.48 -0.42 -0.59 -0.7 -0.55
0.45 0.31 0.19 0.23 0.25 0.32 -0.25 -0.36 -0.32 -0.4 -0.41 -0.51
0.72 0.25 0.41 0.73 0.7 0.57 -0.4 -1.02 -0.79 -0.96 -1.37 -1.59
0.89 0.74 0.26 0.23 0.47 0.62 -0.14 -0.51 -0.66 -1.31 -1.77 -2.01
0.86 0.65 0.05 0.38 0.35 0.5 -0.07 -0.78 -0.61 -0.79 -1.49 -1.09
0.45 0.21 0.0 0.41 0.35 0.58 0.04 -0.39 -0.12 -0.39 -1.02 -1.26
0.65 0.55 0.08 0.05 0.06 0.38 0.15 -0.24 -0.21 -0.53 -1.02 -0.92
0.4 0.27 0.11 0.2 0.3 0.49 -0.13 -0.2 -0.3 -0.56 -0.52 -0.66
0.6 0.48 0.32 0.62 0.56 0.55 -0.43 -1.14 -0.56 -0.74 -1.05 -1.35
0.6 0.5 0.08 0.35 0.32 0.69 -0.14 -0.55 -0.48 -0.48 -1.2 -1.23
0.39 0.41 0.52 0.84 0.75 0.59 -0.24 -0.85 -0.81 -1.36 -1.65 -1.94
0.58 0.57 0.33 0.2 0.62 0.61 -0.5 -1.17 -0.87 -0.73 -0.61 -0.74
0.65 0.26 0.08 0.34 0.3 0.38 -0.15 -0.29 -0.28 -0.41 -0.83 -0.93
0.84 0.74 0.24 0.2 0.36 0.62 -0.6 -1.4 -0.64 -0.56 -0.89 -1.06
0.79 1.0 0.51 0.52 0.31 0.47 -0.33 -1.01 -0.88 -1.39 -1.81 -1.79
0.5 0.5 -0.05 0.24 0.23 0.39 -0.07 -0.24 -0.08 -0.38 -1.02 -0.92
0.97 0.6 0.29 0.44 0.24 0.41 -0.18 -0.56 -0.55 -0.86 -1.52 -1.75
0.36 0.49 0.25 0.35 0.4 0.74 0.11 -0.4 -0.65 -0.86 -1.17 -1.36
0.9 0.51 0.21 0.44 0.4 0.52 -0.47 -1.08 -1.01 -0.86 -0.91 -0.58
0.68 0.43 0.23 0.36 0.28 0.4 -0.43 -0.91 -0.35 -0.42 -0.65 -0.69
0.5 0.34 0.06 0.49 0.13 0.31 -0.27 -0.29 -0.05 -0.29 -0.85 -0.87
1.03 1.29 0.94 0.59 0.31 0.35 -0.84 -1.81 -2.28 -2.39 -2.35 -2.81
0.77 0.34 0.69 0.79 0.66 0.65 -0.45 -0.93 -1.13 -1.51 -2.11 -2.11
0.84 0.65 0.17 0.03 0.26 0.48 0.1 -0.37 -0.65 -0.85 -1.09 -1.27
0.79 0.53 0.26 0.4 0.47 0.54 -0.35 -0.78 -0.47 -0.72 -1.11 -1.66
0.27 0.37 0.14 0.27 0.3 0.32 -0.13 -0.19 -0.32 -0.39 -0.55 -0.56
0.83 0.47 0.12 0.41 0.07 0.22 -0.27 -0.44 -0.18 -0.5 -0.96 -0.88
1.07 0.96 0.61 0.52 0.15 0.22 -0.6 -1.14 -0.95 -1.13 -1.48 -1.87
0.78 0.62 0.42 0.48 0.24 0.35 -0.63 -1.25 -0.78 -0.51 -0.61 -0.85
0.11 0.11 0.24 0.56 0.29 0.36 -0.11 -0.25 -0.21 -0.48 -0.67 -0.5
0.62 0.18 0.15 0.46 0.46 0.57 -0.34 -0.73 -0.52 -0.64 -0.66 -0.74
0.5 0.29 -0.02 0.42 0.39 0.59 -0.55 -0.78 -0.31 -0.35 -0.56 -0.53
0.57 0.95 0.53 0.29 0.48 0.63 -0.43 -0.77 -0.7 -1.03 -1.73 -2.09
0.6 0.35 0.16 0.01 0.25 0.42 -0.22 -0.46 -0.37 -0.39 -0.38 -0.55
0.34 0.25 0.03 0.4 0.03 0.16 -0.1 -0.3 0.09 -0.13 -0.73 -0.47
0.55 0.3 0.36 0.51 0.34 0.3 -0.24 -0.62 -0.08 -0.63 -0.76 -1.28
1.09 0.65 0.41 0.73 0.41 0.48 -0.42 -1.17 -1.0 -1.42 -1.94 -1.9
0.23 0.45 0.47 0.36 0.43 0.22 -0.64 -0.67 -0.33 -0.3 -0.43 -0.58
0.67 0.6 0.22 0.31 0.35 0.53 -0.38 -0.6 -0.28 -0.6 -1.1 -1.34
0.47 0.61 0.43 0.68 0.32 0.39 -0.26 -0.78 -0.4 -0.96 -1.12 -1.27
0.16 0.51 0.48 0.37 0.51 0.35 -0.36 -0.6 -0.45 -0.52 -0.77 -0.72
0.87 0.58 0.09 0.45 0.57 0.71 0.2 -0.78 -0.94 -1.18 -2.03 -2.36
0.72 0.44 0.12 0.03 0.11 0.23 -0.13 -0.01 -0.09 -0.45 -0.87 -0.96
0.78 0.89 0.55 0.42 0.22 0.37 -0.06 -0.5 -0.9 -1.44 -1.8 -1.64
0.57 0.25 0.06 0.29 0.4 0.65 0.08 -0.43 -0.44 -0.62 -0.89 -1.2
0.31 0.6 0.51 0.6 0.56 0.35 -0.53 -0.92 -0.51 -0.65 -1.04 -0.97
0.48 0.4 0.0 0.3 0.42 0.43 -0.19 -0.64 -0.3 -0.36 -0.78 -0.57
0.14 0.06 0.03 0.06 0.4 0.46 -0.32 -0.4 -0.21 -0.12 -0.09 -0.3
0.73 0.59 0.13 0.46 0.3 0.55 -0.07 -0.95 -0.62 -0.87 -1.08 -0.92
0.54 0.44 0.41 0.41 0.54 0.55 -0.39 -0.82 -0.67 -0.62 -0.82 -1.17
0.31 0.13 0.11 0.6 0.17 0.2 -0.17 -0.46 -0.22 -0.34 -0.59 -0.21
0.64 0.51 0.48 0.89 0.34 0.47 -0.41 -1.24 -0.62 -0.87 -1.34 -1.49
0.62 0.56 0.55 0.69 0.48 0.33 -0.7 -1.14 -0.73 -0.72 -1.0 -1.07
0.29 0.13 0.03 0.15 0.29 0.39 -0.21 -0.37 -0.16 -0.06 -0.36 -0.42
0.69 0.36 0.16 0.37 0.25 0.4 -0.24 -0.51 -0.36 -0.5 -0.77 -0.84
0.59 0.39 0.15 0.15 0.17 0.41 -0.06 -0.31 -0.42 -0.55 -0.67 -0.55
0.93 0.49 0.09 0.66 0.71 0.78 0.07 -0.82 -1.15 -1.67 -2.93 -2.57
0.47 0.18 -0.0 0.32 0.14 0.12 -0.28 -0.24 0.05 -0.19 -0.5 -0.4
0.69 0.59 0.22 0.39 0.36 0.72 -0.29 -1.12 -0.56 -0.6 -1.05 -1.42
0.98 0.25 0.76 1.04 0.86 0.58 -0.72 -1.89 -1.59 -1.99 -2.35 -2.99
0.56 0.37 0.12 0.34 0.4 0.37 -0.28 -0.5 -0.3 -0.36 -0.69 -0.92
1.31 1.19 0.8 0.71 0.45 0.47 -0.81 -2.2 -2.34 -3.59 -4.56 -7.02
0.55 0.67 0.44 0.65 0.42 0.53 -0.17 -0.64 -0.58 -1.03 -1.77 -1.94
0.3 0.46 0.26 0.26 0.17 0.29 -0.15 -0.25 -0.23 -0.36 -0.57 -0.74
0.37 0.2 0.08 0.4 0.05 0.19 -0.22 -0.27 -0.18 -0.17 -0.29 -0.45
0.52 0.39 0.13 0.31 0.33 0.51 -0.12 -0.4 -0.27 -0.72 -0.92 -0.74
0.25 0.19 0.17 0.51 0.19 0.1 -0.19 -0.3 -0.04 -0.23 -0.56 -0.52
0.28 0.09 0.05 0.26 0.15 0.09 -0.33 -0.11 0.1 -0.09 -0.26 -0.41
0.53 0.55 0.26 0.21 0.21 0.46 -0.04 -0.32 -0.32 -0.65 -1.16 -0.88

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.