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Heatmap: Cluster_27 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.06 0.03 0.02 0.05 0.03 0.05 -0.14 0.05 0.05 0.07 -0.04 -0.14
-0.17 -0.15 -0.07 0.18 0.35 0.43 -0.07 -0.3 0.07 -0.01 -0.25 -0.21
-0.02 0.13 0.15 0.06 -0.11 0.12 -0.02 0.04 0.08 0.02 -0.05 -0.51
0.18 0.05 -0.14 0.04 0.02 0.24 0.14 0.15 0.07 -0.16 -0.36 -0.4
0.06 -0.06 -0.26 -0.11 0.02 0.26 0.12 0.16 0.16 -0.1 -0.13 -0.2
-0.0 -0.02 -0.63 -0.59 0.19 0.58 0.23 0.09 0.16 -0.1 -0.25 -0.09
-0.23 -0.33 -0.07 0.04 0.11 0.05 0.06 0.07 0.07 -0.01 0.12 0.05
-0.09 -0.04 0.14 0.08 0.19 0.07 -0.1 0.06 0.04 -0.03 -0.06 -0.33
0.17 -0.02 -0.13 0.13 0.06 0.07 0.04 0.15 0.04 -0.0 -0.37 -0.25
0.01 -0.1 0.02 -0.09 0.07 0.09 0.0 0.13 0.08 -0.27 -0.08 0.08
-0.19 0.05 0.08 -0.1 0.12 0.35 0.12 0.09 -0.09 -0.21 -0.14 -0.2
0.09 -0.27 -0.49 -0.12 -0.02 0.36 -0.16 -0.09 0.27 0.15 -0.01 0.09
0.1 0.05 -0.06 0.06 0.1 0.27 -0.12 -0.04 0.01 -0.13 -0.18 -0.13
0.34 0.05 -0.05 0.38 0.13 -0.25 0.1 -0.06 0.07 -0.15 -0.73 -0.14
0.11 -0.01 -0.15 -0.05 -0.02 0.22 0.05 0.05 0.06 -0.05 -0.14 -0.12
0.09 0.03 -0.05 0.07 0.02 0.12 -0.13 -0.18 0.08 0.01 -0.1 0.01
-0.23 0.09 -0.02 0.03 0.14 0.3 0.27 0.04 0.07 -0.17 -0.41 -0.27
0.1 -0.04 -0.17 -0.01 -0.19 0.07 -0.07 0.1 0.17 0.14 -0.11 -0.06
-0.1 -0.11 0.02 0.18 0.0 0.15 -0.0 0.04 0.1 -0.07 -0.11 -0.13
-0.15 -0.11 -0.0 -0.04 0.04 -0.04 -0.02 0.2 0.08 -0.09 0.12 -0.03
0.06 0.25 0.11 -0.14 -0.1 0.24 0.05 0.11 -0.16 -0.03 -0.11 -0.4
-0.17 -0.08 -0.11 0.14 0.03 0.23 0.12 -0.02 0.02 -0.03 -0.15 -0.03
-0.24 -0.35 -0.05 0.08 -0.01 -0.02 0.12 0.22 0.17 -0.03 0.11 -0.08
0.22 0.14 -0.09 0.09 -0.09 0.14 -0.08 0.06 0.06 0.0 -0.24 -0.31
-0.21 0.02 -0.23 -0.04 0.01 0.26 0.28 0.07 0.01 -0.03 -0.41 0.12
-0.04 -0.15 0.03 -0.0 0.05 0.11 -0.07 0.09 -0.01 0.0 0.05 -0.08
-0.2 -0.32 -0.12 0.06 -0.02 -0.03 -0.02 0.19 0.12 0.04 0.14 0.06
-0.08 -0.14 -0.35 0.32 0.24 0.37 -0.11 -0.39 0.21 0.15 -0.33 -0.16
-0.02 -0.06 -0.04 -0.03 0.01 0.32 0.02 0.07 0.12 0.01 -0.12 -0.36
-0.39 -0.19 0.09 0.38 0.17 0.16 -0.01 -0.11 0.19 -0.06 -0.29 -0.14
0.0 -0.12 -0.17 0.24 0.32 0.1 -0.1 -0.14 0.06 -0.05 -0.58 0.24
-0.24 -0.06 -0.11 -0.16 -0.19 -0.07 0.16 0.23 0.17 0.09 0.06 0.04
-0.01 -0.06 -0.08 -0.03 -0.1 0.04 0.03 0.15 0.01 0.05 0.0 -0.01
0.04 -0.28 -0.19 0.28 0.31 0.17 0.03 -0.22 0.01 -0.03 -0.4 0.11
-0.1 0.07 0.01 0.12 0.02 0.19 0.01 0.08 0.22 -0.13 -0.15 -0.47
0.05 0.01 -0.0 0.13 -0.02 0.14 0.06 -0.02 0.0 -0.06 -0.17 -0.16
0.07 0.07 0.15 0.34 0.02 -0.12 -0.05 0.01 0.02 -0.1 -0.41 -0.14
-0.27 -0.16 -0.17 0.27 0.25 0.15 -0.12 0.01 0.3 0.03 -0.31 -0.16
0.02 0.09 -0.21 0.18 -0.25 -0.1 0.04 -0.12 0.31 -0.02 -0.23 0.15
0.0 -0.05 -0.04 -0.05 0.3 0.21 -0.06 -0.05 -0.08 -0.07 -0.14 -0.05
-0.02 -0.01 -0.16 0.2 -0.17 0.07 0.06 -0.02 0.22 0.11 -0.24 -0.14
-0.02 0.02 -0.17 0.06 -0.13 0.01 -0.15 0.03 0.19 0.17 0.03 -0.09
0.3 0.12 -0.16 0.34 -0.08 -0.02 0.04 0.01 0.24 -0.11 -0.62 -0.34
-0.2 -0.09 -0.25 0.1 0.18 0.21 -0.1 0.02 0.22 0.13 -0.26 -0.07
-0.07 -0.0 -0.08 0.18 0.12 0.22 -0.23 -0.1 0.11 0.07 -0.16 -0.13
-0.07 -0.25 -0.21 0.2 -0.15 -0.14 0.04 0.1 0.21 0.01 0.05 0.14
-0.14 -0.2 -0.0 0.17 0.03 0.11 0.15 0.19 0.12 -0.08 -0.13 -0.34
0.05 -0.1 -0.03 0.27 -0.03 -0.05 -0.03 -0.01 0.09 -0.04 -0.17 0.0
0.13 -0.1 -0.09 0.41 -0.0 0.23 0.02 -0.03 0.26 -0.12 -0.46 -0.51
0.06 -0.01 -0.17 0.08 0.05 0.03 0.07 0.15 0.11 -0.06 -0.24 -0.12
0.34 0.24 -0.05 0.14 0.09 0.41 -0.15 -0.2 0.02 -0.27 -0.42 -0.46
0.17 0.33 0.1 0.26 0.17 0.16 -0.04 -0.33 -0.2 -0.32 -0.57 -0.01
0.09 0.01 -0.29 -0.08 -0.14 0.15 0.23 0.21 0.15 -0.1 -0.39 0.03
-0.17 -0.08 -0.04 0.01 -0.05 0.04 -0.09 0.12 0.19 0.12 0.04 -0.14
0.3 -0.16 -0.17 0.21 0.04 0.19 -0.3 -0.09 0.18 0.08 -0.17 -0.26
-0.13 -0.11 -0.15 0.09 -0.15 0.04 -0.01 0.13 0.22 0.12 -0.11 -0.01
-0.22 -0.06 -0.0 0.38 -0.09 0.1 -0.04 -0.03 0.24 0.13 -0.27 -0.28
0.03 0.1 0.07 0.21 0.16 0.17 -0.15 -0.26 -0.09 -0.1 -0.21 -0.03
0.04 -0.24 -0.37 0.19 0.26 0.37 -0.05 -0.1 0.16 0.02 -0.35 -0.16
0.04 -0.12 -0.2 0.38 0.24 0.19 0.01 0.11 0.18 -0.03 -0.47 -0.65
0.15 -0.16 -0.19 0.25 0.33 0.36 -0.12 -0.14 0.2 -0.16 -0.36 -0.42
-0.18 -0.09 -0.01 0.16 0.03 0.27 0.13 -0.04 -0.04 -0.04 -0.14 -0.12
-0.13 -0.16 -0.18 0.13 -0.06 0.04 -0.0 0.15 0.19 0.08 -0.04 -0.08
-0.23 -0.0 0.05 0.24 0.17 0.17 0.18 0.01 -0.09 -0.14 -0.36 -0.12
0.1 -0.13 -0.11 -0.05 -0.13 0.06 0.02 0.19 0.05 -0.05 -0.02 0.03
-0.24 -0.21 -0.07 0.05 0.0 0.08 -0.02 0.22 0.25 0.06 0.05 -0.28
-0.07 -0.07 -0.18 0.08 -0.09 -0.07 -0.14 0.15 0.22 0.14 -0.09 0.06
0.24 -0.0 -0.09 0.2 -0.09 0.05 -0.09 -0.03 0.16 -0.04 -0.15 -0.23
0.39 0.04 -0.11 0.2 -0.09 0.2 -0.29 -0.2 0.08 0.13 -0.15 -0.4
0.03 -0.06 -0.11 0.05 -0.2 0.02 0.02 0.16 0.11 -0.0 -0.19 0.13
-0.1 0.14 0.05 0.06 0.06 0.19 0.22 0.13 -0.08 -0.25 -0.49 -0.08
0.02 0.08 -0.04 0.38 0.02 0.01 -0.01 -0.04 0.07 -0.07 -0.4 -0.15
-0.67 0.2 0.02 0.29 0.43 0.09 0.35 0.06 -0.18 -0.28 -0.59 -0.17
-0.2 -0.22 -0.17 0.15 0.03 -0.0 0.13 0.1 0.22 0.17 -0.1 -0.21
-0.09 0.2 0.0 0.28 -0.04 0.1 0.02 0.05 0.22 -0.04 -0.5 -0.41
0.07 0.16 -0.21 -0.07 0.07 0.18 -0.05 -0.16 0.15 -0.06 -0.17 0.02
-0.03 0.0 -0.02 0.32 -0.08 0.02 -0.18 -0.07 0.28 0.12 -0.22 -0.27
0.13 0.15 0.1 0.43 0.06 0.01 -0.01 0.12 0.02 -0.33 -0.69 -0.3
0.19 0.18 0.21 0.32 0.36 0.26 -0.28 -0.39 -0.25 -0.47 -0.36 -0.13
-0.13 0.04 0.22 0.25 0.1 0.09 -0.2 -0.17 -0.08 -0.01 -0.08 -0.11
0.32 0.14 -0.11 0.22 -0.01 -0.03 -0.11 -0.02 0.2 -0.15 -0.36 -0.27
-0.24 -0.37 -0.37 0.18 0.06 0.08 0.03 0.11 0.31 0.18 -0.19 0.03
0.16 -0.04 -0.26 -0.02 0.0 0.04 -0.13 -0.0 0.26 0.07 -0.16 0.01
-0.04 -0.02 -0.06 -0.08 -0.23 -0.24 -0.03 0.19 0.21 0.16 0.19 -0.14
-0.06 -0.06 0.03 0.11 -0.06 0.15 -0.07 0.06 0.09 -0.02 0.01 -0.24
0.07 0.02 -0.02 0.16 -0.06 0.14 -0.02 -0.01 0.1 0.01 -0.13 -0.33
0.08 -0.03 -0.25 -0.09 0.11 0.27 0.02 0.07 -0.08 -0.08 -0.1 0.01
0.25 -0.05 -0.08 0.21 -0.0 0.15 -0.27 -0.18 -0.04 0.14 -0.18 -0.04
0.0 0.05 -0.14 -0.08 -0.12 -0.13 -0.0 0.13 0.09 0.05 -0.04 0.15
-0.1 0.05 -0.06 0.15 0.08 0.19 0.15 0.16 -0.02 -0.12 -0.33 -0.24
-0.56 -0.23 -0.13 -0.05 0.04 -0.02 0.21 0.39 0.26 -0.06 0.18 -0.3
-0.32 -0.21 -0.12 -0.03 0.1 0.01 0.07 0.29 0.22 0.01 0.06 -0.2
0.37 -0.03 -0.4 0.21 0.24 0.19 -0.24 -0.47 -0.11 0.15 -0.47 0.23
-0.07 -0.24 -0.24 0.28 0.06 0.03 -0.06 0.02 0.34 0.13 -0.29 -0.1
-0.08 0.21 -0.15 0.13 0.16 0.14 0.19 -0.08 0.02 -0.11 -0.64 0.02
0.11 -0.06 -0.07 0.11 -0.03 0.1 0.02 0.02 0.06 -0.04 -0.12 -0.13
0.06 0.06 0.08 0.04 0.07 0.03 -0.18 -0.01 0.08 -0.04 -0.14 -0.11
-0.03 0.17 -0.01 -0.04 -0.23 0.06 0.15 0.13 0.11 -0.01 -0.23 -0.14
0.25 0.25 -0.07 -0.02 -0.07 0.16 0.02 0.21 0.02 -0.18 -0.35 -0.4
-0.54 -0.1 0.08 0.47 0.16 0.21 0.27 -0.02 -0.21 -0.36 -0.68 0.27
0.48 0.2 -0.03 0.06 -0.03 0.23 -0.32 -0.3 0.01 -0.01 -0.17 -0.37
-0.22 -0.11 -0.09 0.1 -0.01 0.16 0.1 0.02 0.13 0.04 -0.06 -0.09
0.02 -0.11 -0.1 0.21 0.05 0.08 -0.01 -0.03 0.14 -0.08 -0.21 -0.01
-0.17 0.07 -0.1 -0.01 -0.15 0.07 0.2 0.03 0.11 0.08 -0.18 -0.0
0.15 -0.04 -0.06 0.07 -0.09 0.16 0.05 0.07 0.07 -0.07 -0.21 -0.15
0.3 0.15 0.35 0.15 0.56 0.21 -0.06 -0.44 -0.41 -0.65 -0.45 -0.25
0.03 -0.15 -0.16 0.09 -0.03 0.06 -0.08 0.06 0.2 0.13 -0.07 -0.14
-0.03 0.16 0.07 0.15 -0.09 0.03 0.18 -0.01 0.0 -0.05 -0.26 -0.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.