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Heatmap: Cluster_55 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.62 0.32 -0.02 0.43 -0.06 -0.13 -0.29 -0.4 0.14 -0.08 -0.7 -0.39
0.32 0.18 -0.16 0.11 -0.07 0.08 -0.17 -0.09 0.14 -0.03 -0.28 -0.15
0.55 0.26 -0.01 0.33 -0.0 -0.04 -0.31 -0.18 0.07 -0.17 -0.56 -0.32
0.62 0.31 0.12 0.17 0.09 -0.08 -0.25 -0.22 -0.07 -0.19 -0.56 -0.35
0.33 0.13 -0.29 -0.01 -0.08 0.07 -0.13 -0.15 0.1 0.18 -0.24 -0.02
0.28 0.21 -0.13 0.04 0.02 0.18 -0.12 -0.19 0.16 -0.05 -0.29 -0.24
0.38 0.2 -0.25 -0.11 -0.26 0.07 -0.06 -0.04 0.13 0.08 -0.29 0.0
0.51 0.23 -0.08 0.11 -0.05 0.05 -0.27 -0.26 -0.03 -0.06 -0.24 -0.11
0.25 0.11 -0.35 0.0 -0.16 0.05 -0.13 -0.05 0.29 0.22 -0.19 -0.19
0.69 0.34 -0.15 0.03 -0.13 0.01 -0.36 -0.43 0.14 0.01 -0.33 -0.23
0.21 0.15 -0.03 0.14 -0.05 0.03 -0.18 -0.12 0.18 0.02 -0.33 -0.1
0.53 0.18 -0.17 0.18 0.18 0.11 -0.19 -0.2 0.02 -0.21 -0.48 -0.24
0.39 0.26 -0.25 0.11 -0.02 0.0 -0.31 -0.23 0.21 0.16 -0.4 -0.17
0.59 0.1 -0.33 -0.09 -0.12 0.18 -0.29 -0.32 -0.09 -0.01 0.0 0.11
0.72 0.18 -0.34 -0.07 -0.04 0.17 -0.29 -0.56 -0.07 -0.03 -0.19 0.11
0.29 0.1 -0.11 0.25 0.03 0.02 -0.42 -0.33 0.17 0.05 -0.21 -0.03
0.52 0.09 -0.22 -0.04 -0.08 0.05 -0.1 -0.09 0.14 0.05 -0.25 -0.25
0.31 0.23 -0.17 0.02 -0.22 -0.14 -0.16 -0.01 0.23 0.11 -0.33 -0.02
0.53 0.36 -0.09 -0.03 -0.21 -0.04 -0.41 -0.27 0.24 0.17 -0.41 -0.18
0.45 0.19 -0.01 0.09 -0.09 0.12 -0.34 -0.23 0.0 -0.08 -0.22 -0.06
0.56 0.26 -0.22 0.15 -0.16 -0.15 -0.17 -0.13 0.13 0.01 -0.46 -0.1
0.67 0.28 -0.19 -0.26 -0.18 0.07 -0.21 -0.37 0.07 -0.02 -0.19 -0.0
0.57 0.35 -0.15 0.11 -0.2 -0.13 -0.15 -0.2 0.09 -0.1 -0.41 -0.06
0.4 0.14 -0.18 0.12 0.09 0.03 -0.22 -0.28 0.08 -0.06 -0.29 0.01
0.45 0.14 -0.2 0.05 -0.03 0.11 -0.06 -0.11 0.14 -0.17 -0.23 -0.26
0.54 0.29 -0.15 -0.06 -0.28 0.03 -0.32 -0.31 0.26 0.14 -0.27 -0.19
0.33 0.02 -0.18 0.03 -0.03 0.1 -0.08 -0.09 0.04 -0.04 -0.14 -0.04
0.48 -0.04 -0.31 0.12 -0.05 0.09 -0.43 -0.09 0.15 0.08 -0.14 -0.06
0.49 0.35 -0.14 0.17 -0.07 0.18 -0.17 -0.26 0.09 -0.02 -0.54 -0.44
0.28 0.18 0.05 0.11 -0.02 0.17 -0.26 -0.22 0.06 -0.04 -0.28 -0.16
0.57 0.09 -0.28 0.24 -0.16 -0.09 -0.24 -0.37 0.06 0.08 -0.29 0.1
0.28 0.09 -0.2 -0.07 -0.12 0.05 -0.11 0.06 0.31 0.1 -0.21 -0.33
0.8 0.16 -0.13 -0.18 0.22 0.18 -0.57 -0.54 -0.15 -0.05 -0.2 -0.07
0.84 0.23 -0.07 0.41 0.15 -0.02 -0.38 -0.43 0.01 -0.32 -0.74 -0.45
0.64 0.43 -0.23 -0.12 -0.25 -0.07 -0.14 -0.18 0.03 0.06 -0.35 -0.15
0.35 0.2 -0.17 -0.09 -0.17 0.1 -0.15 -0.08 0.14 0.08 -0.16 -0.17
0.35 0.14 0.04 0.21 -0.08 -0.09 -0.24 -0.21 0.09 -0.0 -0.24 -0.11
0.53 0.22 -0.13 0.16 -0.06 0.01 -0.18 -0.23 0.06 -0.05 -0.36 -0.21
0.35 0.3 -0.13 0.04 -0.29 -0.11 -0.17 -0.15 0.15 0.03 -0.3 0.1
0.4 0.22 -0.22 0.15 -0.17 0.19 -0.16 -0.45 0.06 0.06 -0.26 -0.04
0.56 0.15 -0.28 0.04 -0.15 0.0 -0.29 -0.27 0.09 0.07 -0.13 -0.04
0.26 0.21 -0.11 0.16 -0.17 -0.02 -0.24 -0.13 0.22 0.12 -0.29 -0.14
0.38 0.28 -0.09 0.18 -0.05 0.09 -0.2 -0.24 0.22 -0.0 -0.45 -0.39
0.5 0.18 -0.16 0.15 -0.13 -0.01 -0.33 -0.24 0.15 -0.03 -0.25 -0.04
0.56 0.33 -0.19 0.15 -0.17 0.03 -0.31 -0.16 0.23 0.01 -0.5 -0.34
0.53 0.23 -0.23 0.08 -0.11 0.09 -0.13 -0.12 0.13 0.08 -0.55 -0.3
1.06 0.53 -0.18 -0.08 -0.62 -0.24 -0.33 -0.11 0.22 -0.26 -1.03 -0.1
0.53 0.08 -0.24 0.15 -0.0 0.17 -0.17 -0.18 -0.03 -0.11 -0.29 -0.12
0.09 0.13 -0.13 0.13 0.0 0.21 -0.14 -0.09 0.09 0.03 -0.22 -0.16
0.27 0.13 -0.17 0.02 -0.12 0.1 -0.13 -0.12 0.23 0.06 -0.2 -0.18
0.25 0.14 -0.26 -0.07 -0.29 -0.01 -0.14 -0.01 0.27 0.19 -0.11 -0.1
0.37 0.27 -0.28 -0.16 -0.16 0.13 -0.11 -0.27 0.11 0.11 -0.08 -0.1
0.27 0.15 -0.1 0.02 -0.03 0.16 -0.07 -0.24 0.3 -0.01 -0.33 -0.29
0.23 0.21 -0.11 0.04 -0.04 0.08 -0.12 -0.09 0.02 0.01 -0.15 -0.14
0.56 -0.03 -0.28 0.02 0.1 0.31 -0.19 -0.2 -0.06 0.01 -0.21 -0.28
0.19 -0.06 -0.16 0.09 -0.08 0.03 -0.13 0.02 0.14 0.1 -0.12 -0.08
0.25 0.12 -0.25 0.13 -0.09 -0.05 -0.16 -0.1 0.28 0.08 -0.28 -0.07
0.71 0.34 -0.18 0.1 -0.1 0.02 -0.2 -0.24 -0.02 -0.15 -0.44 -0.24
0.3 0.19 -0.08 -0.0 -0.13 0.09 -0.28 -0.07 0.2 0.13 -0.22 -0.28
0.41 0.38 -0.24 0.0 -0.03 0.19 -0.04 -0.05 0.11 -0.18 -0.54 -0.31
0.16 0.06 -0.15 0.12 -0.24 -0.04 -0.02 -0.14 0.08 0.09 -0.11 0.11
0.3 0.23 -0.12 0.09 -0.16 0.02 -0.26 -0.05 0.14 0.07 -0.34 -0.05
0.76 0.08 -0.41 0.26 -0.17 -0.02 -0.06 -0.57 0.07 0.07 -0.48 -0.04
0.56 0.18 -0.23 0.2 -0.23 0.04 -0.22 -0.4 0.03 0.06 -0.33 0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.