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Heatmap: Cluster_13 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-1.04 -0.47 -0.12 -0.03 0.48 0.09 0.99 0.6 -0.04 -0.56 -0.71 -0.56
-0.29 -0.15 -0.3 -0.17 -0.48 -0.39 0.2 0.17 0.22 0.21 0.07 0.53
-1.39 1.03 -0.34 0.0 0.47 0.13 -0.44 -0.22 0.3 -0.19 -0.86 0.08
-0.49 -0.72 -0.89 -0.68 -0.76 -0.78 0.35 0.44 0.44 0.41 0.32 0.83
-0.24 0.17 -0.2 -0.17 -0.01 -0.01 0.51 0.23 0.12 -0.12 -0.36 -0.15
-0.96 -0.82 -1.04 -1.06 -0.32 -1.21 0.94 0.73 0.2 -0.21 0.19 0.99
0.02 -0.53 -0.64 -0.42 -0.22 -0.14 0.61 0.2 0.22 0.16 0.23 0.02
-2.79 -0.5 -1.3 -1.27 -0.54 -0.79 0.51 0.71 0.71 0.54 0.18 0.84
-3.23 -0.37 -0.88 -1.05 -0.02 -0.17 0.97 0.83 0.15 -0.15 0.46 0.13
-2.02 0.03 -0.96 -0.97 -0.21 -0.24 0.68 0.42 0.29 0.05 -0.05 0.87
-1.97 -1.69 -1.59 -0.99 -0.61 -0.75 1.22 1.0 0.49 0.27 -0.58 0.8
-0.12 -0.1 -0.13 -0.06 -0.23 -0.24 0.1 0.11 0.19 0.1 0.02 0.26
-2.06 -1.57 -1.42 -1.02 -1.1 -0.91 0.54 0.8 0.01 0.04 0.28 1.64
-1.74 0.23 -0.15 -0.23 0.23 0.17 0.82 0.4 0.25 -0.6 -0.3 -0.46
-0.1 -0.82 -0.86 -0.5 -0.23 -0.36 1.29 0.27 0.2 -0.06 0.28 -0.67
-2.5 -0.17 -0.88 -1.05 -0.26 -0.19 0.96 0.79 0.11 -0.07 0.41 0.2
-0.97 -1.41 -1.75 -1.33 -1.25 -1.45 0.27 0.87 0.5 0.26 0.25 1.49
-0.25 -0.1 -0.12 0.03 0.09 0.06 0.1 0.14 0.18 -0.04 -0.19 0.04
-1.31 -0.16 -0.65 -0.24 0.87 0.45 0.75 0.26 -0.05 -0.58 -0.25 -0.59
-4.31 -0.92 -1.31 -1.66 0.19 -1.15 0.93 1.0 0.28 0.22 -0.55 1.1
-0.34 -0.51 -0.36 0.16 0.59 0.18 0.49 0.02 0.06 -0.17 -0.72 0.04
-0.12 0.12 0.12 0.18 0.62 0.24 0.34 0.05 -0.21 -0.52 -0.98 -0.55
-0.95 -0.95 -1.14 -0.96 -0.81 -0.81 1.09 0.35 -0.07 -0.09 0.19 1.27
-2.7 -0.23 -0.62 -0.39 0.39 0.11 1.02 0.45 0.01 -0.31 -0.69 0.45
-0.71 -1.17 -1.45 -0.8 -1.32 -1.13 1.44 0.6 0.14 0.0 -0.02 0.86
-0.6 -0.66 -1.6 -1.18 -0.45 -0.4 0.62 0.43 0.52 0.38 0.3 0.66
-0.1 -0.12 -0.12 0.1 -0.08 -0.42 0.01 -0.03 0.17 0.05 -0.05 0.43
-2.43 -3.02 -2.96 -2.44 -2.45 -2.56 1.13 0.69 0.67 0.35 -0.0 1.74
-1.63 -1.96 -1.9 -1.45 -1.45 -1.31 0.98 0.59 0.49 0.29 0.01 1.54
-0.69 -0.3 -1.2 -1.04 -1.13 -1.06 -0.02 0.29 0.69 0.49 0.09 1.27
0.28 -0.44 -0.75 -0.48 -0.35 -0.11 0.35 -0.09 0.22 0.38 0.29 0.17
0.29 -0.29 -0.41 -0.46 -0.05 -0.01 0.58 0.08 -0.07 -0.07 0.27 -0.23
-1.65 -0.28 -0.17 -0.25 0.5 0.2 0.55 0.58 0.3 -0.23 -0.25 -0.54
0.13 -0.88 -1.37 -0.82 -0.46 -0.3 0.58 0.51 0.24 0.13 0.36 0.48
1.34 0.93 - - 0.85 0.92 0.78 1.1 - - - -
-0.84 0.22 -0.24 0.04 0.69 0.45 -0.07 0.16 0.09 -0.33 -0.43 -0.42
-0.32 0.04 -0.03 -0.05 0.45 0.18 0.45 0.22 -0.19 -0.39 -0.3 -0.42
-0.95 0.45 -0.64 -0.38 -0.08 -0.41 0.67 0.37 0.42 -0.12 -0.57 0.27
-0.67 1.08 -0.4 -0.52 -0.21 -0.36 0.54 0.12 0.17 -0.23 -0.72 0.03
- - - - - - - - - - 3.58 -
0.2 -0.21 -0.79 -0.74 -0.62 -0.53 0.03 0.17 0.2 0.17 0.33 0.84
-0.43 -0.41 0.13 0.82 0.66 0.15 0.67 0.27 -0.28 -1.04 -1.46 -1.07
-0.21 -0.3 -0.26 0.05 0.95 0.41 0.51 0.07 -0.27 -0.57 -0.69 -0.76
-0.12 0.02 -0.33 -0.63 -0.14 -0.32 0.35 0.32 0.07 -0.13 0.25 0.32
- - - - - 2.09 2.95 - - - - -
-2.67 -1.07 -0.74 -0.71 -1.79 -1.8 0.54 0.64 0.3 0.41 0.24 1.5
-2.79 -1.33 -0.82 0.23 0.45 0.18 1.34 0.72 0.22 -0.42 -1.23 -0.52
-0.01 -2.12 -3.02 -1.58 0.11 0.52 0.66 -0.3 0.24 0.35 0.95 0.03
- - - - - - 3.58 - - - - -
-1.77 -1.16 -1.17 -0.93 0.57 -0.93 0.96 1.12 1.11 -0.1 -0.96 -0.87
-2.11 -1.52 -1.36 -0.94 -0.81 -0.92 1.3 0.84 0.76 0.35 -0.06 0.29
-1.57 -0.32 -0.04 0.63 0.77 0.64 1.08 0.44 -0.82 -1.28 -1.35 -2.16
-2.27 -1.17 -0.36 0.21 1.12 0.54 1.16 0.42 -0.31 -1.29 -2.42 -0.31
-2.9 -1.06 -0.39 -0.18 -0.28 -1.41 0.59 0.57 0.2 -0.02 -0.18 1.34
- - - - - - 2.25 1.38 - - 2.22 -
-1.26 1.1 0.04 -0.19 0.26 -0.21 0.44 0.3 0.08 -0.9 -0.48 -0.79
-0.15 0.03 -0.65 -0.57 -0.28 -0.5 0.12 0.26 0.54 0.26 -0.27 0.56
0.19 -0.08 -0.56 -0.43 -0.4 -0.45 0.12 0.15 0.28 0.18 0.11 0.46
-2.16 -1.44 -1.48 -1.28 -1.67 -1.72 1.2 0.77 0.31 0.48 0.31 1.1
-2.6 -1.66 -1.3 -0.65 0.47 -0.72 1.1 0.83 0.32 -0.19 -0.69 0.87
-2.34 0.06 -0.89 -1.14 -0.54 -0.49 0.61 0.44 0.21 0.13 0.52 0.84
-1.22 -0.42 -0.68 -0.5 -0.25 -0.57 0.15 0.36 0.52 0.39 -0.32 1.02
-3.26 -3.51 -2.97 -2.87 -2.24 -1.32 0.92 1.04 0.47 0.44 0.8 1.32
-0.52 0.52 0.03 -0.26 0.18 -0.14 0.4 0.3 -0.36 -0.52 -0.51 0.3
-1.88 0.43 -0.43 -0.33 0.49 -0.05 0.38 0.74 0.6 -0.43 -0.78 -0.58
-1.65 -0.51 -1.67 -1.74 -1.94 -1.72 1.45 0.42 0.2 0.15 0.03 1.29
-0.76 0.49 0.32 0.57 1.15 0.09 0.36 -0.55 -1.05 -1.19 -1.09 -0.64
-0.11 -0.06 -0.22 -0.3 -0.38 -0.14 0.02 0.18 0.27 0.28 0.11 0.15
-0.91 -0.02 -0.85 -1.0 -0.7 -0.77 0.78 0.75 0.25 0.01 0.07 0.66
- - - - - - - - - - 3.58 -
0.3 -0.75 -2.06 -2.39 -2.56 -2.3 -0.63 0.33 0.64 0.52 0.73 1.5
-0.47 0.1 0.5 0.03 0.38 0.33 0.49 0.21 -0.08 -0.59 -0.93 -0.96
- - - - - - 3.58 - - - - -
-3.27 0.82 -0.36 -0.89 0.1 -0.26 1.06 0.77 0.34 -0.43 -0.56 -1.23
-0.74 0.37 -0.13 -0.57 0.06 0.0 0.64 0.51 -0.01 -0.53 -0.08 -0.2
0.36 0.5 -0.57 -0.55 0.15 -0.46 0.05 0.28 0.37 -0.21 -0.53 0.02
-0.35 -0.26 -0.29 -0.24 -0.45 -0.33 0.17 0.28 0.19 0.16 0.12 0.59
-1.61 -1.0 -0.83 -0.41 -0.2 -0.38 0.37 0.63 0.63 0.32 0.04 0.63
-1.1 -0.15 0.32 0.27 0.41 0.11 0.65 0.35 -0.42 -0.6 -0.67 -0.18
0.09 0.05 -0.39 -0.4 -0.32 -0.32 0.06 0.0 -0.11 0.04 -0.07 0.86
-1.36 -0.85 -1.03 -1.1 -0.2 -0.52 0.38 0.8 0.59 0.44 0.4 0.39
0.99 - 1.37 - 0.22 - 1.82 0.27 - 0.6 - -
-0.55 -0.24 -0.04 0.28 0.49 0.24 0.77 0.33 -0.15 -0.74 -1.02 -0.43
-0.77 -0.88 -0.33 0.14 -1.71 -3.05 1.48 0.81 -0.27 -0.44 -0.89 0.92
- - - - - - 3.58 - - - - -
- - - - - - 3.58 - - - - -
1.9 - - - 1.18 - 2.0 - - - 1.01 -
-0.31 0.21 0.09 0.08 0.72 0.26 0.38 0.24 -0.16 -0.55 -0.99 -1.0
-2.33 -1.64 -1.1 -0.04 0.16 -1.26 1.62 1.49 0.35 -0.84 -1.6 -1.16
-1.1 0.23 -0.82 -0.5 0.04 0.11 0.01 0.45 0.82 -0.03 -0.43 0.17
-0.91 -0.04 -0.51 -0.75 -0.71 -0.52 0.86 0.49 0.07 0.02 0.08 0.63
-1.17 -1.27 -2.36 -2.31 -1.5 -0.72 -0.4 0.9 0.99 0.98 0.35 0.95
-0.37 -0.22 -0.14 -0.12 -0.05 0.01 0.31 0.1 -0.07 -0.03 0.16 0.27
-1.17 -0.24 -0.39 -0.37 -0.61 -0.54 0.62 0.5 0.14 0.07 0.13 0.71
-1.1 -0.45 -0.13 0.0 0.98 0.68 -0.24 0.45 -0.11 -0.35 -0.26 -0.86
-0.74 -0.84 -1.25 -0.74 -0.54 -0.15 0.73 0.77 0.48 0.43 -0.32 0.42
0.37 0.03 -0.7 -0.62 -1.0 -0.67 0.05 -0.0 0.1 0.22 -0.02 1.02
-0.07 -0.83 0.18 0.12 0.22 0.1 1.01 0.49 -0.49 -0.96 -0.15 -1.07
-3.6 -1.91 -2.92 -3.16 -3.74 -3.38 0.7 0.53 0.51 0.79 0.77 1.72
0.19 -0.17 0.12 -0.12 0.2 0.13 0.6 0.35 -0.42 -0.82 -0.2 -0.43
-0.25 -0.14 -0.15 -0.11 -0.02 0.11 0.82 0.02 -0.27 -0.31 -0.04 -0.03
0.04 -0.25 -0.17 -0.26 -0.11 -0.15 0.07 0.08 -0.07 -0.01 0.62 -0.0
-0.88 -0.43 -0.73 -0.23 -0.12 -0.12 0.66 0.54 0.2 0.06 -0.54 0.59
-0.36 -0.09 -0.54 -0.45 -0.52 -0.13 -0.02 0.16 0.27 0.25 0.12 0.74
-0.15 -0.24 -0.37 -0.44 -0.47 -0.07 0.07 0.18 0.08 0.15 0.23 0.62
-4.53 -4.2 -4.81 -4.68 -4.84 -3.61 0.33 0.82 1.33 1.36 0.29 1.26
-0.32 -0.02 -0.09 0.09 0.12 0.05 0.1 0.52 0.4 -0.21 -0.56 -0.47
-0.27 -0.05 -0.02 -0.03 0.09 -0.03 0.08 0.32 0.11 -0.22 -0.15 0.06
-3.07 -2.27 -0.63 -0.19 -0.53 -0.87 0.86 1.17 0.47 0.06 -0.33 0.7
-2.72 -0.83 -0.23 0.51 1.43 0.35 1.1 0.35 -0.5 -1.32 -2.38 -1.65
-0.39 0.53 -0.18 -0.18 -0.01 -0.04 0.36 0.06 0.01 -0.14 -0.12 -0.16
0.54 1.09 - - 0.16 1.08 1.99 0.31 - - - -
-1.11 -0.63 -0.84 -0.54 0.55 0.4 0.26 0.87 0.71 0.15 -0.63 -1.18
-0.67 0.48 0.07 0.04 0.69 0.09 -0.45 -0.16 -0.14 -0.32 0.06 -0.23
-1.1 0.43 -0.35 -0.53 0.33 -0.39 0.35 0.6 0.37 -0.21 -0.05 -0.38
-2.75 0.05 -0.18 -0.37 -0.3 -0.51 1.15 0.6 -0.2 -0.54 -0.08 0.48
-2.04 -0.62 0.03 0.36 0.68 -0.14 1.18 0.38 -0.3 -0.85 -1.16 -0.15
-0.97 -1.71 -1.53 -0.81 -0.07 0.32 1.04 0.07 0.61 0.39 0.29 -0.16
-0.67 -0.03 -0.22 -0.06 1.38 0.53 0.71 -0.01 -0.39 -1.05 -1.79 -1.48
0.06 -0.29 -0.74 -0.42 -0.23 -0.35 0.37 0.12 -0.19 -0.23 -0.32 1.17
-3.18 -0.7 -1.1 -1.1 -0.28 0.46 0.76 0.33 -0.02 0.05 0.49 0.82
-1.6 -0.59 0.39 0.91 1.01 0.12 1.23 0.09 -0.68 -1.85 -2.4 -2.22
-1.02 -0.03 0.22 0.81 0.95 0.6 0.68 0.12 -0.58 -1.5 -2.72 -1.7
-2.86 -0.51 0.14 0.7 1.2 0.52 0.89 0.39 -0.54 -1.72 -1.96 -1.79
-1.99 -0.07 0.03 0.8 1.02 0.48 0.87 0.13 -0.76 -1.17 -2.18 -1.2
-1.08 -0.15 -0.39 -0.33 0.45 -0.1 0.86 0.53 0.19 -0.17 -0.77 -0.15
-2.26 -1.38 -0.94 0.32 1.93 0.64 0.78 0.22 -0.83 -1.54 -2.35 -1.82
-1.96 -1.2 -2.56 -2.67 -0.62 -1.89 0.59 0.97 1.14 0.73 -0.23 0.9
-1.66 -0.74 -0.29 -0.07 -0.83 -0.94 0.47 0.47 0.27 0.34 -0.06 1.03
-1.56 -0.56 -0.57 -0.26 0.42 0.03 1.62 0.81 0.19 -0.85 -1.95 -1.6
-0.83 -0.78 -0.87 -0.27 0.59 -0.03 0.4 0.27 0.31 0.24 -0.25 0.26
-0.4 -0.01 -0.3 -0.43 0.26 0.1 0.37 0.45 0.3 -0.29 -0.32 -0.13
-0.85 -0.37 0.13 0.25 0.75 0.28 0.76 0.34 -0.23 -0.91 -0.59 -1.03
-1.99 -2.02 -1.39 -0.83 0.53 0.41 1.59 1.13 -0.04 -0.75 -0.89 -1.09
-4.77 -3.04 -3.13 -3.11 -2.15 -1.75 0.67 0.76 0.64 0.66 0.63 1.64
1.19 - - - -0.53 - - 0.46 0.24 -0.4 1.62 1.39
-0.86 -0.41 -0.32 0.54 0.91 0.5 1.15 0.42 -0.82 -1.26 -2.3 -1.27
-1.61 -3.27 -1.5 -0.86 0.41 -0.82 1.03 0.95 1.06 0.06 -0.85 0.15
-1.44 -0.93 -0.17 0.09 1.03 0.56 1.18 0.49 -0.51 -0.73 -1.69 -1.53

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.