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Heatmap: Cluster_64 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.14 -0.27 -0.15 0.14 0.43 0.67 0.12 0.17 0.11 -0.32 -0.43 -1.06
-0.19 -0.32 -0.29 0.11 0.1 0.22 -0.08 0.12 0.31 0.2 -0.15 -0.22
-0.06 0.03 -0.15 0.05 0.13 0.29 0.02 -0.09 0.12 -0.01 -0.21 -0.21
-0.13 0.01 -0.1 0.17 0.31 0.31 0.26 0.22 0.09 -0.28 -0.51 -0.76
-0.19 0.12 -0.14 -0.17 0.19 0.46 0.37 0.23 0.13 -0.2 -0.53 -0.73
-0.1 -0.18 -0.11 0.1 0.02 0.18 0.14 0.2 0.23 0.02 -0.26 -0.38
-0.05 -0.01 -0.16 0.07 0.11 0.31 -0.02 0.0 0.08 0.06 -0.18 -0.32
-0.29 0.01 -0.09 0.01 0.23 0.49 0.4 0.3 0.06 -0.16 -0.74 -0.82
-0.18 -0.15 0.08 0.16 0.02 0.33 -0.12 0.2 0.32 0.11 -0.38 -0.73
-0.01 -0.02 -0.04 0.1 0.16 0.33 0.1 0.1 0.09 -0.17 -0.27 -0.54
-0.16 0.03 -0.19 -0.28 0.08 0.39 -0.1 0.19 0.1 0.17 0.09 -0.54
0.04 -0.42 -0.11 0.14 0.65 0.7 0.16 0.34 0.06 -0.61 -0.65 -1.85
-0.22 -0.1 -0.18 0.11 0.2 0.43 0.15 0.12 0.17 0.0 -0.38 -0.62
0.04 0.09 -0.26 -0.01 0.21 0.58 -0.12 -0.22 0.22 0.12 -0.32 -0.74
0.02 -0.32 -0.47 -0.17 0.3 0.67 0.15 -0.28 0.19 0.0 -0.36 -0.15
-0.76 -0.31 -0.04 0.2 0.23 0.48 0.4 0.17 -0.07 -0.28 -0.31 -0.16
-0.49 -0.19 -0.18 0.32 0.11 0.37 0.3 -0.05 0.1 -0.1 -0.49 -0.02
-0.04 0.1 -0.22 0.1 0.17 0.26 0.17 0.14 0.1 -0.21 -0.35 -0.4
-0.56 -0.15 -0.14 0.15 0.2 0.34 0.11 0.16 0.18 0.11 -0.31 -0.38
-0.1 -0.28 -0.2 0.09 0.4 0.44 -0.02 0.25 0.22 -0.01 -0.51 -0.73
-0.05 0.03 -0.16 -0.02 0.04 0.29 -0.13 -0.09 0.13 0.21 -0.11 -0.24
-0.01 0.01 -0.11 0.11 0.11 0.24 0.02 -0.01 -0.01 -0.06 -0.18 -0.17
-1.53 0.07 -0.07 -0.25 0.42 0.76 0.43 0.39 0.2 -0.16 -0.6 -1.24
-0.36 -0.24 -0.15 -0.01 0.26 0.38 -0.16 0.34 0.24 0.25 -0.09 -1.0
-0.74 -0.14 -0.04 0.3 0.21 0.38 0.28 0.01 0.07 -0.18 -0.25 -0.24
0.04 0.06 -0.22 -0.01 0.26 0.4 0.32 0.26 -0.0 -0.29 -0.55 -0.68
-0.33 -0.28 -0.26 0.07 0.08 0.27 0.32 0.22 0.24 0.13 -0.28 -0.46
0.11 0.01 -0.12 -0.04 0.24 0.48 0.23 0.18 -0.06 -0.22 -0.38 -0.86
0.03 -0.02 -0.42 0.05 0.06 0.45 0.01 -0.07 0.24 0.1 -0.37 -0.31
0.04 0.02 -0.26 0.18 0.27 0.47 -0.04 -0.01 0.07 -0.06 -0.33 -0.67
-0.01 -0.13 -0.23 0.0 0.17 0.4 0.2 0.11 0.12 -0.1 -0.25 -0.49
0.05 -0.15 -0.11 0.09 0.22 0.47 0.02 -0.19 0.07 -0.07 -0.29 -0.3
-0.01 0.02 -0.25 0.05 0.22 0.5 0.15 0.13 0.12 -0.2 -0.48 -0.58
-0.06 -0.1 -0.19 0.06 0.45 0.49 0.12 0.14 0.05 -0.19 -0.63 -0.57
-0.21 -0.25 -0.37 -0.04 0.16 0.46 0.51 0.27 0.34 -0.07 -0.64 -0.81
-0.23 -0.05 -0.01 0.12 0.22 0.35 0.19 0.09 0.05 -0.15 -0.26 -0.55
0.0 -0.08 -0.77 -0.2 0.24 0.86 0.23 -0.22 0.16 0.13 -0.41 -0.72
-0.13 -0.06 -0.23 0.12 0.09 0.14 0.3 0.3 0.24 -0.12 -0.52 -0.4
-1.09 -0.61 -0.21 -0.04 0.21 0.59 0.32 -0.07 0.5 -0.11 -0.09 -0.17
-0.29 0.03 -0.05 0.01 0.13 0.23 0.12 0.16 0.06 -0.12 -0.13 -0.25
-0.1 -0.2 -0.16 0.09 0.41 0.46 0.24 0.08 0.03 -0.34 -0.46 -0.4
-0.48 -0.05 -0.21 0.05 0.26 0.57 0.38 0.17 0.12 -0.19 -0.52 -0.65
-0.3 0.02 -0.21 -0.06 0.16 0.36 0.23 0.18 0.3 -0.01 -0.35 -0.63
-0.56 -0.22 -0.03 0.17 0.12 0.34 0.11 0.04 0.07 -0.05 -0.09 -0.09
-0.63 -0.03 0.05 -0.22 0.45 0.57 0.1 0.1 0.13 -0.18 -0.27 -0.58
-0.28 -0.02 0.03 0.12 0.19 0.41 0.12 0.26 0.15 -0.23 -0.44 -0.68
-0.36 -0.04 0.16 0.15 0.25 0.17 0.03 0.12 -0.01 -0.06 -0.17 -0.4
0.12 0.04 -0.33 0.21 0.22 0.63 0.17 -0.09 0.13 -0.28 -0.4 -1.07
-0.26 -0.09 -0.29 0.07 0.25 0.45 0.15 0.05 0.11 0.04 -0.31 -0.43
-0.2 -0.03 -0.23 0.0 0.07 0.3 0.31 0.29 0.21 -0.09 -0.45 -0.47
-0.27 -0.18 -0.17 0.08 0.33 0.44 0.21 0.24 0.06 -0.15 -0.35 -0.6
-0.39 -0.32 -0.21 0.29 0.3 0.47 -0.04 -0.07 0.25 0.11 -0.29 -0.5
0.04 -0.04 -0.14 0.06 0.33 0.58 0.24 0.11 -0.05 -0.23 -0.54 -0.91
-0.31 -0.03 0.06 0.24 0.08 0.26 0.04 -0.03 0.06 -0.04 -0.31 -0.14
-0.06 0.02 -0.14 0.03 0.02 0.23 0.02 -0.08 0.07 0.09 -0.13 -0.11
0.17 0.05 -0.1 0.02 0.18 0.31 0.15 0.06 0.04 -0.12 -0.35 -0.63
-0.1 -0.11 -0.13 0.12 0.19 0.32 0.12 0.06 0.13 -0.11 -0.24 -0.4
-0.02 0.04 -0.39 -0.01 0.2 0.47 0.38 0.24 0.18 -0.15 -0.53 -1.02

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.