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Heatmap: Cluster_48 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
1.04 0.24 -0.63 -0.24 -0.64 -0.3 -0.83 -1.23 -0.2 0.23 0.22 0.7
-0.04 0.15 -0.04 -0.05 -0.21 -0.08 -0.29 -0.1 0.07 0.17 0.13 0.2
0.11 0.01 -0.13 0.09 -0.32 -0.33 -0.53 -0.32 0.28 0.32 0.1 0.39
0.0 0.08 -0.13 -0.01 -0.33 -0.32 -0.32 0.02 0.38 0.31 -0.03 0.14
0.38 -0.01 -0.25 -0.13 -0.31 -0.12 -0.25 0.11 0.07 -0.0 0.23 0.12
1.13 0.0 -1.49 -1.66 -1.85 -1.59 -1.75 -1.48 -1.27 -0.58 1.01 1.91
0.47 0.04 -0.36 -0.25 -0.15 -0.03 -0.2 -0.09 -0.14 -0.21 -0.03 0.61
- - 1.38 - - - - - - - - 3.23
1.37 -0.08 -1.05 -1.76 -1.08 -0.59 -0.97 -0.01 -0.28 -0.15 1.09 0.26
0.2 0.03 -0.34 -0.2 -0.08 0.12 -0.25 -0.08 0.12 0.04 0.06 0.25
0.71 0.49 0.12 -0.21 -1.23 -1.48 -1.73 -1.69 -1.02 -0.27 0.66 1.44
0.65 0.34 -0.07 -0.32 -0.61 -0.73 -0.49 -0.19 -0.09 0.1 0.11 0.56
-0.32 -0.58 -0.74 -0.53 -0.47 -0.23 -0.29 -0.25 0.08 0.43 0.58 1.09
1.46 0.68 -0.51 -1.76 -1.34 -1.21 -0.89 -0.5 -0.34 0.03 0.62 0.29
0.68 0.13 -0.22 -0.21 -0.89 -0.46 -1.21 -0.83 0.29 0.2 0.61 0.51
0.03 -0.09 -0.2 0.13 -0.2 -0.25 0.09 0.09 0.2 -0.04 -0.14 0.27
0.24 -0.31 -0.38 -0.02 -0.17 -0.03 -0.8 -0.79 -0.01 0.16 0.38 0.86
0.43 0.48 0.08 0.07 -0.28 -0.13 -0.51 -0.42 -0.05 0.08 -0.19 0.1
-0.49 -0.55 -0.36 -0.15 -0.16 -0.02 -0.15 0.08 0.15 0.18 0.37 0.64
-1.4 -0.29 -0.67 -2.14 -2.91 -2.65 -1.42 -0.66 -0.07 0.82 1.29 1.8
-0.09 -0.13 -0.31 -0.08 -0.62 -0.52 -0.95 -0.85 -0.07 0.37 0.54 1.18
0.53 0.3 -0.07 0.12 -0.23 -0.19 -0.55 -0.43 0.08 0.15 -0.15 0.1
0.43 -0.19 -0.8 -0.43 -0.41 -0.18 -0.66 -0.56 -0.01 0.21 0.38 1.04
0.01 0.13 0.0 0.16 -0.12 -0.2 -0.42 -0.1 0.29 0.22 -0.17 0.04
-0.29 0.14 -0.24 -0.13 -0.07 0.06 0.17 -0.0 0.08 0.04 -0.22 0.33
1.56 0.34 -0.38 -0.75 -0.84 -1.21 -1.43 -2.06 -1.52 -0.7 0.4 1.35
0.2 0.03 -0.2 0.27 -0.17 -0.16 -0.3 -0.28 0.03 -0.1 -0.16 0.57
0.55 0.29 -0.13 -0.01 -0.5 -0.43 -0.8 -0.63 0.24 0.31 0.05 0.36
0.18 0.01 -0.28 0.05 -0.3 -0.16 -0.44 -0.35 0.22 0.31 0.04 0.43
0.36 0.21 0.13 -0.19 -0.52 -0.77 -0.39 -0.17 -0.31 -0.07 0.38 0.67
0.25 0.3 0.08 0.05 -0.09 -0.1 -0.58 -0.21 0.23 0.13 -0.19 -0.11
0.49 0.28 0.31 0.18 -1.46 -1.94 -1.5 -1.03 -0.6 -0.27 0.7 1.28
-0.22 0.1 0.1 0.14 -0.09 -0.14 -0.14 -0.09 0.06 0.17 -0.04 0.09
0.44 -0.16 -0.76 -0.39 -0.81 -0.56 -1.26 -1.54 -0.1 0.24 0.43 1.55
1.17 0.59 0.31 -0.04 -2.02 -1.56 -1.15 -0.97 -1.09 -0.79 0.37 1.11
1.46 0.64 0.03 0.04 -3.79 -4.59 -2.59 -1.4 -0.51 -0.47 -0.01 1.35
0.34 0.27 0.02 0.08 -0.28 -0.26 -0.34 -0.18 0.18 0.11 -0.23 0.09
- - - - - - - - - 1.16 - 3.29
-0.49 -0.89 -1.51 -1.14 -1.6 -1.25 -0.79 -0.9 0.16 0.57 1.22 1.66
0.84 0.15 -0.42 -0.35 -0.68 -0.42 -0.37 -0.59 -0.4 -0.22 0.03 1.09
0.05 0.38 0.11 -0.04 -0.4 -0.24 -0.45 -0.15 0.22 0.16 -0.1 0.21
-0.74 -1.3 -2.73 -3.21 -3.26 -2.62 -2.02 -1.67 -0.48 0.73 1.43 2.28
0.38 -0.14 -0.26 -0.14 -0.83 -0.89 -0.76 -0.41 0.07 0.27 0.55 0.9
0.43 0.61 0.22 -0.2 -0.63 -0.45 -1.17 -1.63 -1.66 -0.74 0.43 1.42
1.86 0.49 -0.9 -0.91 -1.48 -0.87 -2.09 -2.82 -1.62 -0.81 0.44 1.24
0.14 0.01 -0.17 -0.03 -0.28 -0.16 -0.4 -0.18 0.18 0.29 0.1 0.3
-0.43 -0.4 -0.66 -0.4 -0.67 -0.48 -0.33 -0.19 0.2 0.62 0.28 1.13
0.09 -0.07 -0.24 -0.22 -0.75 -0.53 -0.6 -0.38 0.18 0.39 0.46 0.8
-0.32 -0.28 -0.24 -0.17 -0.17 -0.03 -0.36 -0.15 0.19 0.42 0.4 0.38
0.35 0.31 0.25 0.33 -0.09 0.1 -0.78 -0.7 -0.11 0.04 -0.23 0.03
0.38 -0.54 -1.66 -1.42 -1.36 -0.92 -0.8 -0.24 0.24 0.54 0.7 1.45
0.23 -0.01 -0.36 0.05 -0.26 -0.11 -0.33 -0.28 0.23 0.12 -0.11 0.54
0.21 0.22 -0.01 0.12 -0.27 -0.16 -0.56 -0.35 0.07 0.2 -0.01 0.3
-0.19 -2.12 -2.38 -2.54 -2.8 -2.82 -1.64 -0.8 -0.88 0.27 0.89 2.52
0.95 0.32 -0.46 -0.92 -1.02 -0.28 -1.02 -0.64 -0.32 0.02 1.06 0.28
0.65 -0.02 -0.36 0.02 -0.08 -0.07 -0.5 -0.3 -0.04 -0.02 0.04 0.31
0.06 0.15 -0.03 -0.12 -0.27 -0.12 -0.54 -0.18 0.21 0.36 0.05 0.22
0.07 0.27 0.14 -0.07 -0.31 -0.25 -0.38 -0.2 0.1 0.24 0.07 0.15
-0.25 -0.53 -0.74 -0.6 -0.42 -0.51 0.35 0.27 -0.11 -0.2 0.27 1.18
-0.54 -0.1 0.09 0.12 -0.05 -0.35 0.08 0.3 0.01 0.03 -0.04 0.26
-0.11 0.05 -0.21 -0.03 -0.17 -0.0 0.04 0.01 0.24 -0.0 -0.16 0.26
-0.58 -1.19 -1.43 -1.12 -1.11 -1.02 -1.2 -0.46 0.32 0.7 0.97 1.64
-0.2 -0.28 -0.47 -0.03 -0.16 -0.17 0.28 0.18 0.16 0.08 -0.12 0.46
0.71 0.1 -0.62 -0.5 -0.7 -0.19 -1.13 -0.65 0.02 0.13 0.36 0.97
0.64 -0.2 -0.72 -0.66 -1.23 -1.02 -0.09 0.05 0.09 0.12 0.25 1.07
0.07 0.27 -0.03 0.08 -0.24 -0.02 -0.37 -0.27 0.14 0.2 -0.05 0.07
-0.3 -0.32 -0.25 0.03 -0.37 -0.25 0.02 0.01 0.16 0.19 0.27 0.51
0.44 0.2 -0.15 -0.12 -0.19 -0.25 -0.28 -0.12 -0.02 -0.01 -0.06 0.35
0.24 0.06 0.01 0.12 -0.36 -0.44 -0.16 -0.01 0.0 -0.1 -0.27 0.6
0.33 -0.13 -0.31 -0.42 -0.13 0.16 -0.57 -0.43 0.06 0.19 0.49 0.31
-0.19 0.15 -0.05 -0.01 -0.15 -0.18 0.18 0.17 0.01 -0.01 -0.18 0.19
-0.58 0.24 0.03 -0.15 -0.6 -0.45 -0.51 -0.14 0.2 0.32 0.05 0.84
1.75 0.58 -0.64 -0.41 -0.77 -0.68 -1.63 -3.58 -2.35 -1.28 -0.31 1.45
0.79 0.18 -0.07 0.04 -0.33 -0.35 -1.36 -2.15 -0.84 -0.49 0.24 1.33
0.22 -0.04 -0.05 0.21 -0.08 -0.31 -0.28 -0.22 0.08 0.06 -0.03 0.3
-1.89 -1.64 -1.49 -1.68 -2.43 -2.45 0.8 0.96 0.4 0.17 0.83 1.3
0.42 0.27 -0.21 -0.25 -0.5 -0.16 -0.62 -0.35 0.22 0.29 0.14 0.28
- - - - - - - - - - - -
-0.45 0.18 0.19 0.08 -0.18 -0.19 -0.35 -0.07 0.26 0.27 -0.09 0.13
0.3 0.07 -0.29 -0.07 -0.44 -0.24 -0.39 -0.67 0.15 0.32 0.01 0.69
0.67 0.24 -0.31 -0.29 -0.87 -0.84 -1.0 -0.95 -0.4 0.1 0.41 1.21
0.57 0.03 -0.27 -0.05 -0.31 -0.17 -0.98 -1.02 -0.31 0.14 0.42 0.81
-0.03 0.3 -0.04 0.11 -0.26 0.04 -0.09 -0.17 0.08 0.05 -0.36 0.23
0.65 -0.06 -0.32 -0.23 -0.07 -0.16 -0.33 -0.34 -0.09 0.04 0.23 0.32
0.15 0.45 0.04 0.24 -0.27 0.11 -0.01 -0.37 0.02 -0.12 -0.41 -0.05
- - - - - - - - - - 2.41 2.74
0.25 -0.9 -0.84 -0.65 -0.64 -0.88 -1.45 -1.04 -0.85 -0.18 1.44 1.53
- - -0.81 - 0.48 - -0.2 -0.42 1.12 1.34 0.72 1.04
-2.24 -1.85 -1.85 -1.46 -0.7 -0.16 0.38 0.26 0.17 0.15 0.59 1.64
0.31 -0.06 -0.06 0.16 0.01 -0.23 -0.3 -0.29 -0.0 0.01 -0.02 0.31
0.61 0.05 -0.47 -0.47 -1.0 -0.67 -0.43 -0.06 0.28 0.27 -0.11 0.86
0.18 0.43 0.16 -0.09 -0.39 -0.2 -0.52 -0.27 0.05 0.24 0.02 0.1
0.47 0.14 0.03 -0.15 -0.9 -1.0 -0.87 -0.73 -0.47 0.11 0.61 1.05
-0.26 -0.07 -0.02 0.04 -0.08 -0.03 0.0 0.06 -0.02 -0.08 0.14 0.26
-0.24 -0.6 -0.6 -0.22 -0.33 -0.15 -0.7 -0.84 -0.11 0.47 0.51 1.24
0.89 0.61 0.21 -0.4 -0.79 -0.83 -1.05 -0.32 0.04 0.28 0.03 0.03
0.15 -0.1 -0.05 -0.05 -0.07 -0.05 -0.43 -0.24 0.04 0.13 0.2 0.32
0.35 0.24 -0.09 -0.05 -0.17 -0.09 -0.62 -0.38 0.26 0.28 -0.06 0.02
-0.33 -0.13 -0.01 0.18 -0.16 -0.01 0.01 0.05 0.06 0.01 -0.03 0.27
0.2 -0.14 -0.22 0.05 -0.13 -0.08 -0.4 -0.3 0.2 0.15 0.15 0.32
0.14 0.13 -0.04 -0.11 -0.27 -0.21 -0.21 -0.09 0.1 0.2 0.08 0.17
-0.98 -0.88 -0.6 -0.42 -0.1 -0.15 -0.55 -0.11 0.33 0.55 0.77 0.74
-0.59 -0.32 -0.38 -0.01 -0.15 0.01 -0.02 0.11 0.32 0.24 -0.08 0.52
0.18 -0.04 -0.33 -0.72 -0.27 0.19 -0.59 -0.41 -0.06 0.2 0.74 0.4
0.35 0.12 -0.14 -0.18 -0.43 -0.19 -0.42 -0.16 -0.12 0.05 0.18 0.59
-0.35 -0.11 -0.18 0.02 -0.1 -0.0 -0.09 -0.05 0.21 0.28 -0.04 0.28
-0.41 -0.25 -0.65 -0.82 -0.72 -0.25 -1.25 -1.34 -0.32 0.54 0.87 1.51
0.42 -0.01 -0.39 0.08 -0.25 -0.16 -0.53 -0.48 0.1 0.18 0.02 0.57
0.41 -0.18 -0.54 -0.49 -0.4 -0.13 -0.93 -0.62 -0.29 -0.04 0.65 1.14
-0.07 0.03 -0.41 -0.5 -0.48 -0.04 0.38 0.16 0.18 0.13 -0.36 0.54
-0.24 0.4 0.24 -0.22 -0.52 -0.41 -0.64 -0.15 0.31 0.5 0.05 0.15
-0.05 -0.12 -0.35 0.2 -0.49 -0.13 -0.1 0.66 0.3 -0.37 0.27 -0.26
0.16 -0.15 -0.43 -0.19 -0.28 -0.08 -0.15 0.04 0.1 0.15 0.11 0.48
-0.13 -0.01 -0.32 0.03 -0.14 -0.08 0.16 0.04 0.26 0.11 -0.24 0.21
0.04 -0.08 -0.26 -0.35 -0.34 0.01 -0.73 -0.37 0.03 0.21 0.57 0.66
-0.51 -0.42 -0.26 -0.02 -0.02 -0.14 0.2 0.09 -0.05 -0.03 0.2 0.62
0.52 0.38 -0.74 -0.79 -0.79 -0.49 -0.93 -0.51 -0.19 0.05 0.31 1.28
-0.21 -0.04 -0.19 -0.0 -0.11 -0.17 0.13 0.06 0.13 -0.01 -0.23 0.48
-0.08 -0.15 -0.56 -0.27 -0.44 -0.29 0.2 0.11 0.34 0.23 -0.06 0.55
0.53 0.4 0.33 0.03 -0.03 -0.37 -1.5 -1.68 -1.16 -0.39 0.32 1.06
0.16 -0.09 -0.18 0.13 -0.29 -0.16 -0.27 -0.28 0.12 0.15 0.1 0.42
0.37 0.0 -0.03 0.09 -0.17 -0.23 -0.49 -0.4 0.1 0.05 0.12 0.32
0.33 0.3 -0.1 0.1 -0.32 -0.29 -0.61 -0.43 0.17 0.26 -0.04 0.26
-0.38 -0.58 -0.87 -0.23 -0.66 -0.5 0.08 -0.04 0.54 0.52 -0.09 0.97
0.16 0.11 -0.13 -0.14 -0.05 -0.08 -0.31 -0.16 0.09 0.12 0.12 0.17
0.3 0.07 -0.08 0.31 -0.09 -0.16 -0.84 -0.79 0.06 0.24 0.01 0.41
0.27 0.09 -0.16 -0.11 -0.36 -0.22 -0.75 -0.43 0.18 0.37 0.21 0.44
0.12 -0.18 -0.1 0.05 0.04 0.05 -0.39 -0.3 0.06 0.19 0.24 0.09
0.35 0.49 0.12 0.15 -0.17 -0.21 -0.27 -0.5 -0.01 0.04 -0.35 0.04
1.29 0.61 -0.42 -1.22 -2.31 -1.88 -3.36 -5.85 -2.47 -0.74 0.66 1.96
0.42 0.29 0.1 0.27 -0.18 -0.2 -0.64 -0.71 -0.06 0.14 -0.15 0.27
0.3 0.11 -0.21 -0.02 -0.54 -0.55 -0.87 -0.6 0.32 0.54 0.19 0.5
0.03 0.09 -0.04 0.08 -0.54 -0.51 -0.53 -0.32 0.17 0.3 0.19 0.59
0.17 0.23 -0.07 0.02 -0.36 -0.2 -0.67 -0.51 0.19 0.46 0.06 0.26
0.22 -0.38 -0.26 0.19 -0.09 -0.53 -0.77 -0.98 -1.18 -0.85 0.06 1.74
0.12 -0.1 -0.25 -0.26 -0.14 0.0 -0.12 -0.09 -0.32 -0.25 0.27 0.75
1.28 0.8 0.14 -0.72 -0.95 -0.76 -1.4 -0.41 -0.17 0.01 0.15 -0.19
-0.02 -0.31 -0.32 -0.04 -0.3 -0.03 -0.09 0.06 0.15 0.18 0.15 0.39
0.6 0.28 -0.55 -0.79 -1.11 -0.94 -1.64 -1.61 -1.07 -0.55 0.48 1.94
0.09 -0.05 -0.16 -0.0 -0.34 -0.33 0.1 0.21 0.15 0.04 -0.23 0.35
-0.32 -0.16 -0.32 -0.15 -0.2 -0.05 0.09 0.11 0.21 0.19 -0.01 0.41
0.55 0.07 -0.18 -0.54 -0.37 -0.38 -0.43 -0.0 -0.12 0.14 0.5 0.27
0.58 0.04 -0.26 -0.45 0.03 0.13 -0.46 -0.54 -0.41 -0.18 0.37 0.53
0.28 -0.03 0.12 0.06 0.1 -0.11 -1.01 -0.77 -0.21 0.09 0.27 0.54
-0.14 -0.36 -0.34 0.04 -0.34 -0.23 -0.25 -0.07 0.17 0.25 0.32 0.57
0.82 0.33 -0.43 -0.59 -1.79 -1.54 -1.2 -0.51 0.4 0.35 0.38 0.93
0.24 0.15 -0.2 -0.17 -0.51 -0.41 -0.26 -0.23 0.04 0.13 0.17 0.63
0.76 0.16 -0.41 -0.67 -0.3 -0.1 -0.86 -0.56 -0.15 0.25 0.54 0.36
0.23 0.16 0.04 0.13 -0.19 -0.23 -0.57 -0.86 -0.71 -0.34 0.32 0.99
0.12 0.18 -0.22 -0.04 -0.29 -0.3 -0.59 -0.39 0.28 0.4 0.02 0.42
0.43 0.16 0.03 -0.12 -0.66 -0.44 -0.22 -0.26 -0.25 -0.05 -0.06 0.82
0.94 0.02 -0.47 -0.64 -0.74 -0.47 -0.51 -0.03 -0.04 0.16 0.43 0.34
0.37 -0.08 -0.37 -0.34 -0.27 -0.23 0.08 0.09 -0.12 -0.12 0.17 0.52
-2.05 -0.87 -1.88 -1.02 -2.88 -1.23 -0.14 0.1 0.72 1.04 0.87 1.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.