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Heatmap: Cluster_2 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.13 -0.05 0.16 0.44 0.15 0.18 -0.04 -0.07 -0.13 -0.32 -0.36 -0.33
0.08 -0.08 0.17 0.45 0.3 0.35 -0.19 -0.18 -0.16 -0.25 -0.37 -0.46
-0.04 -0.02 -0.06 0.46 0.19 0.33 -0.03 -0.13 0.14 -0.09 -0.51 -0.6
0.36 -0.18 1.33 1.78 0.92 -0.05 -0.96 -2.22 -2.98 -3.77 -4.2 -4.45
-0.06 0.08 0.28 0.4 0.36 0.23 0.0 -0.1 -0.26 -0.29 -0.45 -0.57
0.39 -0.14 0.13 0.66 0.47 0.6 -0.42 -0.56 -0.17 -0.32 -0.9 -0.86
0.13 -0.04 0.14 0.24 0.16 0.26 0.07 -0.03 -0.07 -0.21 -0.35 -0.51
-2.11 -0.76 0.26 1.06 0.58 0.74 0.53 0.4 -0.1 -1.04 -1.52 -2.33
0.12 0.12 0.11 0.57 0.18 0.23 -0.09 -0.23 0.21 -0.17 -0.78 -0.88
0.08 -0.11 0.05 0.43 0.32 0.28 -0.2 -0.05 -0.1 -0.21 -0.43 -0.3
-0.43 -0.17 0.05 0.51 0.38 0.37 -0.06 -0.2 0.08 -0.08 -0.46 -0.39
0.29 -0.0 0.31 0.9 0.43 0.22 -0.05 -0.3 -0.19 -0.78 -1.12 -1.07
-0.1 0.03 -0.03 0.39 0.16 0.26 -0.03 0.03 0.06 -0.13 -0.46 -0.43
0.32 0.08 0.23 0.53 0.16 0.17 -0.12 -0.37 -0.25 -0.38 -0.54 -0.26
-0.18 -0.11 0.0 0.25 0.31 0.34 0.03 0.06 0.05 -0.18 -0.36 -0.45
-0.62 -0.86 -0.09 0.9 0.58 0.36 -0.08 -0.2 0.36 -0.03 -0.71 -0.92
0.18 0.11 0.0 0.3 0.27 0.41 -0.04 -0.11 -0.15 -0.35 -0.24 -0.77
0.18 0.06 -0.1 0.33 0.07 0.07 -0.09 -0.08 0.26 -0.13 -0.38 -0.36
-0.62 -0.56 -0.26 0.87 0.55 0.52 0.25 0.19 0.3 -0.52 -1.38 -1.09
0.02 0.03 0.14 0.32 0.18 0.35 0.01 -0.06 -0.1 -0.3 -0.39 -0.46
-0.2 -0.1 -0.01 0.5 0.24 0.14 0.07 0.01 -0.01 -0.34 -0.55 -0.03
-0.13 -0.14 -0.05 0.37 0.38 0.51 -0.13 -0.32 -0.0 -0.08 -0.26 -0.48
0.51 0.02 0.14 0.5 0.22 0.3 -0.02 -0.27 -0.25 -0.55 -0.61 -0.6
-0.02 0.05 0.04 0.2 0.34 0.46 -0.02 -0.15 -0.17 -0.21 -0.24 -0.59
0.33 -0.09 0.01 0.74 0.46 0.43 -0.16 -0.4 0.1 -0.32 -1.06 -1.33
-0.36 -0.25 -0.04 0.7 0.61 0.58 -0.04 -0.36 0.05 -0.28 -0.78 -0.82
-0.41 -0.13 -0.06 0.53 0.37 0.3 0.1 0.05 0.24 -0.16 -0.73 -0.68
-0.3 0.01 0.13 0.35 0.56 0.66 -0.13 -0.29 -0.14 -0.3 -0.47 -0.79
0.07 0.1 0.07 0.44 0.26 0.3 -0.28 -0.23 0.19 -0.16 -0.58 -0.58
-0.55 -0.24 -0.17 0.59 0.39 0.51 0.27 0.06 0.19 -0.24 -0.83 -0.88
0.03 0.0 0.04 0.57 0.2 0.09 -0.3 -0.3 0.16 -0.02 -0.43 -0.37
-0.11 -0.07 -0.11 0.35 0.32 0.32 0.04 0.07 0.26 -0.1 -0.57 -0.91
0.09 -0.14 0.33 0.73 0.5 0.27 -0.03 -0.16 -0.27 -0.51 -0.88 -0.86
-0.09 -0.03 -0.04 0.35 0.22 0.25 -0.05 -0.08 0.17 -0.1 -0.43 -0.4
-0.35 -0.07 -0.11 0.45 0.24 0.28 0.1 -0.12 0.2 -0.04 -0.5 -0.41
-0.16 -0.03 0.06 0.63 0.15 0.14 -0.05 -0.23 -0.04 -0.23 -0.54 -0.01
0.26 0.33 0.65 1.1 0.36 -0.03 -0.32 -0.53 -0.45 -0.99 -1.45 -1.04
-0.1 -0.1 -0.1 0.22 0.21 0.25 0.06 0.08 0.11 -0.02 -0.36 -0.42
-0.08 -0.09 0.06 0.24 0.31 0.2 0.16 0.03 0.09 -0.14 -0.41 -0.65
0.08 -0.04 0.25 0.78 0.51 0.2 -0.13 -0.39 -0.27 -0.64 -0.98 -0.25
-0.26 -0.24 -0.0 0.43 0.37 0.36 0.09 0.03 0.25 -0.16 -0.57 -0.86
0.09 0.02 -0.11 0.32 0.14 0.2 -0.04 -0.06 0.1 -0.18 -0.34 -0.28
-0.07 -0.13 0.39 0.86 0.5 0.21 -0.23 -0.35 0.01 -0.37 -0.91 -1.03
-0.24 -0.14 0.0 0.36 0.29 0.31 0.14 0.01 0.13 -0.07 -0.47 -0.7
0.3 -0.02 -0.19 0.36 0.25 0.23 0.11 -0.07 0.15 -0.17 -0.7 -0.73
-0.03 0.03 -0.0 0.49 0.29 0.31 0.02 -0.1 0.09 -0.18 -0.65 -0.7
-0.35 -0.19 0.0 0.46 0.3 0.25 0.11 0.05 0.15 -0.1 -0.46 -0.61
0.01 -0.23 -0.01 0.39 0.46 0.45 -0.1 -0.33 0.25 -0.07 -0.67 -0.77
0.03 -0.2 0.15 0.59 0.29 0.08 -0.11 -0.14 -0.04 -0.2 -0.27 -0.49
-0.08 -0.22 -0.05 0.65 0.27 0.23 0.06 -0.1 0.06 -0.05 -0.71 -0.55
-0.18 -0.0 0.15 0.59 0.38 0.39 0.0 0.05 0.18 -0.39 -0.85 -1.28
0.22 0.14 0.02 0.44 0.06 0.14 -0.07 -0.23 0.27 -0.08 -0.66 -0.65
0.13 -0.23 0.09 0.81 0.28 0.13 -0.25 -0.3 0.13 -0.16 -0.63 -0.68
-0.33 -0.21 -0.25 0.43 0.51 0.66 0.03 -0.32 0.03 -0.1 -0.58 -0.52
0.07 0.12 0.02 0.34 0.05 0.14 -0.09 -0.12 0.19 -0.02 -0.47 -0.43
0.1 -0.06 0.15 0.38 0.24 0.17 -0.14 -0.07 0.07 -0.21 -0.39 -0.48
0.08 0.09 0.02 0.34 0.18 0.22 -0.14 -0.2 0.13 -0.02 -0.44 -0.51
-0.1 -0.15 0.03 0.38 0.3 0.3 -0.06 -0.22 -0.02 -0.04 -0.29 -0.36

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.