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Heatmap: Cluster_23 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.15 -0.23 -0.01 -0.25 0.04 0.21 0.39 0.48 -0.13 -0.32 0.12 -0.51
-0.32 -0.39 -0.32 -0.21 -0.04 -0.14 0.24 0.47 0.27 -0.05 0.17 0.03
-0.14 -0.36 0.02 -0.14 0.06 0.12 0.19 0.51 -0.25 -0.39 0.4 -0.37
-0.24 -0.32 -0.35 -0.22 0.11 0.13 0.21 0.39 0.13 0.02 0.09 -0.14
-0.85 -1.16 -0.48 -0.71 -0.38 -0.52 0.78 0.86 -0.01 -0.08 0.67 0.19
-0.7 -0.42 -0.02 0.05 0.12 0.05 0.3 0.43 0.1 -0.06 -0.01 -0.18
-0.64 -0.77 -0.03 -0.17 0.22 0.17 0.63 0.62 -0.02 -0.43 0.13 -0.51
-0.45 -0.73 -0.09 -0.6 0.28 -0.06 0.66 0.68 -0.32 -0.54 0.6 -0.51
-0.22 -0.7 -0.37 -0.37 -0.13 0.27 0.57 0.69 0.01 -0.14 0.17 -0.47
-0.41 -0.68 -0.33 -0.74 -0.24 -0.21 0.46 0.76 0.06 -0.05 0.65 -0.2
-0.37 -0.51 -0.34 -0.16 0.04 0.12 0.18 0.46 0.11 0.11 0.12 -0.05
-0.88 -1.04 -0.36 -0.33 0.09 -0.09 0.61 0.97 0.1 -0.16 0.25 -0.39
-0.27 -0.29 -0.1 -0.23 -0.04 0.11 0.3 0.39 0.03 -0.04 0.13 -0.19
-0.26 -0.28 0.1 -0.21 0.23 -0.0 0.39 0.5 -0.11 -0.36 0.04 -0.36
-0.31 -0.27 -0.12 -0.15 -0.21 0.14 0.24 0.47 0.03 -0.16 0.36 -0.31
-0.17 -0.46 0.01 -0.09 0.2 0.18 0.33 0.38 -0.06 -0.14 0.06 -0.52
-0.15 -0.43 -0.1 -0.11 0.07 0.0 0.34 0.41 -0.07 -0.1 0.12 -0.19
-0.07 -0.2 -0.23 -0.04 0.07 -0.01 0.24 0.34 0.13 -0.06 -0.09 -0.2
-0.59 -1.17 -0.07 -0.75 0.25 0.03 0.81 0.88 -0.54 -0.73 0.71 -0.71
-0.25 -0.4 -0.0 -0.32 0.21 0.24 0.29 0.42 -0.2 -0.25 0.31 -0.4
-0.51 -0.53 -0.13 -0.24 0.07 0.15 0.54 0.51 -0.0 -0.36 0.4 -0.47
-0.41 -0.59 -0.21 -0.2 0.11 0.14 0.42 0.5 -0.03 -0.1 0.2 -0.23
-0.33 -0.37 -0.14 -0.05 0.11 0.1 0.31 0.41 0.05 -0.16 0.11 -0.28
-0.43 -0.47 -0.02 -0.38 0.24 0.24 0.41 0.57 -0.2 -0.45 0.33 -0.44
-0.74 -0.57 -0.3 -0.2 -0.21 0.22 0.4 0.45 0.25 0.09 0.16 -0.08
-0.05 -0.24 -0.15 -0.23 -0.01 0.04 0.2 0.36 0.1 -0.05 0.1 -0.19
-0.58 -0.49 0.44 -0.35 0.47 0.04 0.72 0.87 -0.54 -1.86 0.35 -1.53
-0.27 -0.23 -0.18 -0.03 -0.03 0.08 0.18 0.33 0.15 0.13 -0.04 -0.23
-0.16 -0.32 -0.27 -0.31 -0.11 -0.07 0.25 0.39 0.25 0.07 0.22 -0.18
-0.66 -0.32 -0.15 -0.25 0.17 0.25 0.4 0.44 0.1 -0.16 0.02 -0.25
-0.64 -0.58 -0.43 -0.46 -0.17 -0.06 0.32 0.5 0.2 0.07 0.48 0.14
-0.32 -0.13 -0.08 -0.17 -0.0 0.11 0.32 0.3 -0.04 -0.14 0.07 -0.04
-0.55 -0.26 -0.3 -0.56 -0.11 -0.15 0.64 0.56 0.11 -0.18 0.27 -0.06
-0.29 -0.28 -0.11 -0.31 0.05 0.14 0.46 0.41 0.05 -0.25 0.01 -0.16
-0.25 -0.12 0.03 0.0 0.11 0.12 0.25 0.32 -0.02 -0.19 -0.0 -0.41
-0.19 -0.19 0.0 -0.28 -0.08 -0.17 0.34 0.49 0.03 -0.14 0.12 -0.14
-0.27 -0.22 -0.11 -0.21 0.02 0.09 0.25 0.44 0.08 -0.07 0.05 -0.25
-0.29 -0.22 -0.16 -0.34 0.07 0.32 0.41 0.58 0.01 -0.18 0.02 -0.72
-0.01 -0.12 0.22 -0.25 0.11 0.03 0.35 0.53 -0.08 -0.64 0.15 -0.81
-0.44 -0.44 -0.1 -0.58 0.21 0.14 0.43 0.68 -0.3 -0.34 0.45 -0.43
-0.63 -0.83 -0.37 -0.43 -0.3 -0.02 0.55 0.64 0.08 -0.05 0.48 0.05
-0.22 -0.45 -0.36 -0.15 0.18 0.07 0.2 0.43 0.22 -0.07 0.13 -0.24
-0.24 -0.23 -0.17 -0.1 -0.02 -0.03 0.23 0.41 0.1 -0.0 0.04 -0.13
-0.11 -0.27 -0.17 -0.23 0.02 0.21 0.48 0.37 -0.0 -0.15 -0.06 -0.34
-0.27 -0.44 -0.23 -0.23 -0.02 0.08 0.3 0.37 0.22 -0.02 0.13 -0.14
-0.41 -0.63 -0.13 -0.67 0.39 0.19 0.44 0.63 -0.35 -0.37 0.56 -0.54
-0.44 -0.44 0.02 -0.35 0.22 0.14 0.38 0.59 -0.23 -0.4 0.34 -0.37
-0.55 -0.73 -0.52 -0.79 -0.04 0.33 0.74 0.73 -0.04 -0.26 0.45 -0.48
-0.48 -0.58 -0.29 -0.46 0.09 0.04 0.58 0.61 -0.03 -0.16 0.27 -0.19
-0.22 -0.16 0.06 0.01 0.02 0.11 0.28 0.41 -0.07 -0.2 0.02 -0.48
-0.22 -0.24 -0.04 -0.09 -0.05 0.09 0.38 0.36 0.08 -0.1 -0.02 -0.36
-0.32 -0.31 -0.06 -0.12 0.23 0.35 0.41 0.37 -0.07 -0.26 -0.21 -0.32
-0.57 -0.3 0.11 -0.3 0.02 0.13 0.37 0.57 -0.18 -0.19 0.36 -0.54
-0.49 -0.43 -0.39 -0.47 -0.19 -0.09 0.62 0.5 0.14 -0.04 0.38 -0.12
-0.41 -0.73 -0.28 0.02 0.15 0.03 0.33 0.53 0.22 0.15 -0.05 -0.44
-2.13 -0.38 -0.55 -0.56 0.57 0.22 0.65 0.73 0.1 -0.15 0.1 -0.49
-0.3 -0.17 -0.12 -0.1 -0.1 -0.11 0.25 0.37 0.17 0.07 0.08 -0.22
-0.57 -0.4 -0.14 -0.28 0.0 -0.06 0.4 0.54 0.14 -0.04 0.25 -0.25
-1.71 -0.47 -0.04 -0.99 0.44 0.39 1.11 0.9 -0.47 -0.87 0.16 -1.28
-0.08 -0.23 -0.17 -0.4 -0.05 -0.01 0.32 0.43 0.09 -0.04 0.06 -0.12
-0.68 -0.53 -0.3 -0.14 0.1 0.05 0.32 0.44 0.29 0.06 0.18 -0.21
-0.26 -0.2 -0.12 -0.13 0.09 0.18 0.28 0.39 0.07 -0.08 -0.1 -0.31
-0.62 -0.49 -0.01 -0.39 0.09 0.02 0.52 0.74 -0.04 -0.31 0.26 -0.44
-0.17 -0.29 -0.02 -0.04 0.09 0.15 0.3 0.37 0.07 -0.21 -0.0 -0.45
-0.31 -0.43 0.09 -0.37 0.26 0.33 0.53 0.6 -0.33 -0.5 0.1 -0.73
-0.19 -0.28 -0.02 -0.15 0.18 0.21 0.32 0.27 -0.02 -0.17 0.05 -0.41
-0.13 -0.21 -0.1 -0.05 -0.0 0.04 0.19 0.25 0.09 -0.01 -0.03 -0.09
-1.61 -1.8 -1.69 -1.31 0.02 0.43 0.8 1.08 0.41 0.04 0.4 -0.38
-0.73 -0.56 -0.19 -0.17 0.08 0.05 0.49 0.71 -0.0 -0.18 0.19 -0.3
-0.28 -0.26 -0.15 -0.23 0.08 0.25 0.39 0.45 0.11 -0.05 -0.04 -0.62
-0.47 -0.65 -0.4 -0.29 0.34 0.2 0.41 0.44 0.04 -0.15 0.06 -0.01
-1.28 -1.32 -0.53 -0.87 -0.11 -0.32 0.75 0.94 0.05 -0.01 0.62 0.06
-0.44 -0.44 -0.14 0.03 0.08 0.14 0.28 0.39 0.08 -0.07 0.04 -0.19
-0.22 -0.74 -0.52 -0.54 0.24 0.56 0.75 0.51 -0.11 -0.4 0.11 -0.67
-0.13 -0.3 -0.09 0.03 0.11 0.19 0.17 0.32 0.06 -0.11 0.01 -0.39
-0.63 -0.55 -0.3 -0.46 -0.31 -0.14 0.35 0.6 0.2 0.13 0.47 0.01
-0.23 -0.34 -0.23 -0.49 -0.25 -0.19 0.33 0.49 0.08 0.07 0.38 -0.0
-0.68 -0.59 0.03 0.09 0.2 0.14 0.13 0.41 0.13 -0.06 0.17 -0.35
-0.46 -0.55 -0.07 -0.51 0.07 0.16 0.37 0.61 -0.16 -0.2 0.52 -0.41
-0.5 -0.39 -0.02 -0.46 0.1 0.11 0.64 0.65 -0.17 -0.49 0.23 -0.39
-0.42 -0.73 -0.69 -0.8 -0.39 -0.26 0.57 0.78 0.2 0.08 0.57 -0.07
-1.5 -1.29 -0.09 -1.18 -0.02 -0.16 1.28 1.13 -0.89 -1.04 0.82 -0.8
-0.2 -0.48 -0.19 -0.17 -0.03 -0.01 0.26 0.48 0.16 -0.07 0.12 -0.11
-0.32 -0.33 -0.33 -0.37 -0.21 0.01 0.4 0.46 0.05 0.04 0.26 -0.0
-0.39 -0.23 -0.26 -0.25 -0.07 0.01 0.25 0.44 0.22 0.16 0.13 -0.26
-0.3 -0.35 -0.27 -0.06 0.01 0.06 0.31 0.46 0.19 -0.13 0.01 -0.19
-0.06 -0.36 0.05 -0.05 0.08 0.16 0.29 0.39 -0.08 -0.23 0.04 -0.46
-0.27 -0.25 -0.1 -0.18 0.2 0.28 0.4 0.41 -0.0 -0.21 -0.11 -0.48
-0.24 -0.25 -0.06 -0.24 0.06 0.19 0.63 0.4 -0.21 -0.37 -0.02 -0.27

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.