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Heatmap: Cluster_53 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.17 0.17 -0.25 0.05 -0.04 0.14 -0.12 -0.07 0.19 0.07 -0.42 -0.01
0.17 0.05 -0.27 0.07 0.02 0.34 -0.17 -0.08 0.11 0.15 -0.21 -0.34
0.09 0.04 -0.12 0.13 0.21 0.24 -0.2 -0.19 0.12 0.09 -0.22 -0.34
0.14 0.13 -0.22 0.09 -0.03 0.47 0.01 -0.22 0.12 0.0 -0.38 -0.33
0.15 0.05 -0.25 0.12 -0.01 0.08 -0.08 -0.01 0.31 0.19 -0.36 -0.36
0.02 0.11 -0.12 0.18 0.02 0.16 -0.01 -0.23 0.22 0.16 -0.46 -0.22
0.02 0.04 -0.16 0.3 -0.09 0.01 -0.2 -0.11 0.33 0.23 -0.37 -0.17
-0.03 0.14 -0.11 0.1 -0.08 0.01 -0.08 -0.09 0.2 0.14 -0.25 -0.03
0.15 -0.08 -0.26 0.37 0.08 -0.04 -0.03 -0.01 0.27 -0.07 -0.44 -0.13
-0.0 0.01 -0.31 0.13 0.04 0.27 -0.05 0.07 0.25 0.09 -0.39 -0.27
0.08 0.08 -0.23 0.24 -0.01 0.28 -0.08 -0.2 0.23 0.12 -0.48 -0.24
0.04 0.17 -0.14 0.12 -0.01 0.21 -0.13 -0.22 0.23 0.11 -0.31 -0.2
0.02 -0.01 -0.2 0.16 0.03 0.15 -0.06 -0.01 0.16 0.0 -0.17 -0.12
0.03 -0.02 -0.19 0.1 0.08 0.31 -0.02 0.03 0.19 -0.02 -0.18 -0.47
0.12 0.17 -0.19 0.15 -0.04 0.1 -0.07 -0.02 0.28 0.1 -0.39 -0.39
0.27 0.08 -0.19 0.14 -0.12 0.06 -0.07 -0.15 0.2 0.12 -0.29 -0.15
-0.09 0.0 -0.09 0.12 0.17 0.34 -0.25 -0.14 0.18 -0.0 -0.26 -0.12
0.0 0.04 -0.27 0.14 0.06 0.23 -0.05 -0.1 0.19 0.15 -0.28 -0.23
-0.06 -0.07 -0.11 0.18 0.2 0.25 -0.01 -0.07 0.18 0.04 -0.34 -0.34
0.09 0.08 -0.2 0.12 -0.09 0.08 -0.13 -0.02 0.28 0.15 -0.37 -0.1
0.07 0.04 -0.18 0.17 -0.08 0.0 -0.11 -0.02 0.2 0.22 -0.3 -0.11
0.09 0.15 -0.18 0.09 0.07 0.38 -0.1 -0.28 0.1 0.13 -0.32 -0.33
-0.03 -0.02 -0.18 0.21 0.11 0.29 -0.1 -0.18 0.21 0.11 -0.3 -0.27
0.15 -0.03 -0.14 0.38 -0.1 0.22 0.04 -0.12 0.16 0.03 -0.62 -0.21
0.03 0.12 -0.21 0.22 -0.14 0.14 -0.0 -0.12 0.28 0.12 -0.35 -0.23
0.26 0.06 -0.23 0.08 -0.18 0.07 -0.05 -0.02 0.26 0.2 -0.34 -0.27
-0.17 -0.09 -0.12 0.21 0.1 0.26 -0.09 -0.04 0.28 0.12 -0.26 -0.36
0.01 0.05 -0.24 0.03 -0.1 0.16 -0.11 -0.02 0.38 0.26 -0.33 -0.27
0.13 0.22 -0.09 0.1 -0.1 0.1 -0.08 -0.18 0.19 0.15 -0.37 -0.18
-0.02 -0.16 -0.27 0.1 -0.07 0.17 -0.05 -0.04 0.39 0.24 -0.28 -0.19
0.05 -0.03 -0.34 0.06 -0.03 0.19 0.09 0.03 0.17 0.03 -0.35 0.03
0.06 0.17 -0.18 0.05 -0.02 0.21 -0.06 -0.17 0.15 0.16 -0.27 -0.2
0.19 0.02 -0.33 0.16 -0.03 0.1 -0.05 -0.06 0.28 0.13 -0.36 -0.2
0.04 0.09 -0.04 0.26 0.02 0.1 -0.07 -0.22 0.09 0.04 -0.25 -0.15
-0.1 0.03 -0.23 0.05 -0.08 0.15 -0.13 -0.11 0.28 0.3 -0.16 -0.13
-0.03 0.06 -0.02 0.25 0.0 0.15 -0.16 -0.14 0.13 0.1 -0.23 -0.19
-0.17 -0.01 -0.22 0.14 -0.03 0.05 -0.15 -0.05 0.34 0.26 -0.21 -0.08
-0.01 0.07 -0.26 -0.03 0.01 0.22 0.15 0.0 0.09 0.07 -0.31 -0.1
-0.06 -0.04 -0.1 0.16 -0.07 0.05 0.03 0.04 0.23 0.13 -0.19 -0.26
-0.06 -0.15 -0.33 0.18 0.22 0.45 0.03 -0.13 0.24 0.13 -0.32 -0.57
-0.01 -0.09 -0.31 0.06 0.02 0.31 0.06 -0.1 0.16 0.14 -0.26 -0.11
0.13 0.04 -0.13 0.41 -0.04 0.15 -0.24 -0.31 0.21 0.07 -0.4 -0.1
0.01 0.05 -0.19 -0.03 -0.07 0.2 0.06 -0.02 0.17 0.1 -0.17 -0.18
0.18 -0.02 -0.29 0.34 0.03 0.15 -0.03 0.04 0.36 -0.04 -0.57 -0.46
-0.11 0.08 -0.16 0.22 0.27 0.39 -0.27 -0.27 0.17 0.16 -0.36 -0.4
-0.12 -0.11 -0.13 0.25 -0.05 0.03 -0.06 0.09 0.39 0.16 -0.32 -0.29
0.27 0.14 -0.25 0.16 -0.04 -0.04 -0.04 -0.03 0.23 0.05 -0.34 -0.25
-0.03 -0.05 -0.29 0.05 0.03 0.13 0.02 0.03 0.27 0.14 -0.25 -0.14
0.09 0.07 -0.25 0.08 -0.03 0.04 -0.08 -0.1 0.36 0.17 -0.32 -0.15
-0.12 0.11 -0.12 0.13 -0.06 0.1 -0.01 -0.05 0.22 0.1 -0.28 -0.07
0.01 0.19 -0.17 0.25 -0.1 0.12 -0.05 -0.17 0.33 0.11 -0.35 -0.35
0.21 0.12 -0.21 0.24 -0.01 0.03 -0.15 -0.09 0.33 0.08 -0.43 -0.3
-0.17 -0.07 -0.23 0.11 -0.02 0.09 0.01 0.12 0.24 0.11 -0.11 -0.15
0.14 0.18 -0.26 0.03 -0.18 0.07 -0.04 0.0 0.27 0.2 -0.3 -0.28
-0.0 0.02 -0.19 0.1 -0.09 -0.06 0.03 0.08 0.3 0.17 -0.26 -0.19
-0.14 -0.01 -0.15 0.22 -0.11 0.16 0.01 0.01 0.24 0.08 -0.34 -0.09
-0.09 0.01 -0.24 0.11 -0.01 0.13 0.09 -0.03 0.22 0.1 -0.31 -0.06
-0.23 -0.13 -0.21 0.08 0.12 0.18 0.03 -0.05 0.26 0.2 -0.17 -0.21
0.08 -0.05 -0.22 0.13 0.05 0.31 -0.01 0.02 0.26 0.09 -0.49 -0.35
0.03 -0.06 -0.14 0.07 0.01 0.21 -0.01 0.05 0.11 0.07 -0.14 -0.27
0.03 -0.04 -0.13 0.11 0.09 0.28 -0.15 -0.05 0.18 0.04 -0.17 -0.29
-0.0 0.05 -0.2 0.03 0.01 0.07 0.03 0.05 0.28 0.06 -0.25 -0.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.