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Heatmap: Cluster_16 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.1 -0.32 -0.11 -0.27 0.05 0.17 0.14 0.33 -0.07 -0.12 0.3 -0.17
-0.45 -0.56 -0.36 -0.28 -0.19 0.0 0.03 0.3 0.3 0.27 0.39 0.16
-0.57 -0.08 0.51 -0.15 -0.15 -0.49 0.23 0.51 -0.12 -0.27 0.33 -0.26
-0.13 -0.83 -0.68 -0.79 -0.36 -0.32 0.15 0.51 0.1 0.2 0.9 0.18
0.01 -0.69 -0.59 -0.64 -0.6 -0.52 -0.24 0.42 0.33 0.3 0.86 0.3
-0.8 -0.65 -0.0 -0.52 -0.11 0.17 0.12 0.7 -0.26 -0.23 0.88 -0.31
-0.0 -0.56 -0.71 -0.69 -0.29 -0.06 0.26 0.46 0.12 0.08 0.57 0.16
-0.31 -0.48 -0.37 -0.54 -0.17 -0.21 0.05 0.32 0.07 0.13 0.64 0.35
0.12 -0.12 -0.23 -0.55 -0.49 -0.37 -0.95 0.03 0.0 0.26 0.85 0.51
-0.91 -1.0 -0.87 -1.33 -0.32 -0.01 0.09 0.37 -0.32 -0.23 1.41 0.65
-0.41 -0.19 -0.18 -0.35 -0.32 -0.3 0.17 0.46 0.1 0.03 0.53 0.07
-1.92 -1.14 0.02 -0.18 0.42 0.03 0.22 0.53 0.1 -0.0 0.5 -0.11
-0.11 -0.22 -0.4 -0.49 -0.35 0.05 0.12 0.21 0.1 0.12 0.39 0.29
-0.11 -0.39 -0.09 -0.17 -0.11 0.04 -0.0 0.33 0.11 0.02 0.28 -0.06
-0.75 -0.87 -0.29 -0.55 -0.37 -0.18 0.36 0.61 0.12 -0.09 0.74 0.24
-0.06 -0.44 -0.05 -0.32 -0.18 -0.2 -0.28 0.26 0.1 0.03 0.59 0.23
-0.48 -0.54 -0.3 -0.11 -0.13 0.27 0.31 0.52 0.05 -0.09 0.34 -0.28
-0.01 -0.25 -0.32 -0.44 -0.54 -0.32 -0.32 0.07 0.08 0.3 0.71 0.45
-0.12 -0.08 -0.04 -0.26 0.02 0.08 0.11 0.26 -0.04 -0.13 0.23 -0.12
0.54 0.29 0.28 -0.65 -0.3 -0.0 -0.7 -0.22 -0.72 -0.38 0.91 -0.1
-0.6 -0.67 -0.04 -0.2 0.24 -0.03 0.24 0.38 -0.01 -0.02 0.36 -0.05
0.14 -0.24 -0.01 -0.22 -0.27 -0.32 -0.09 0.19 -0.09 -0.04 0.46 0.27
-0.15 -0.47 -0.67 -0.59 -0.33 -0.05 -0.16 0.18 0.34 0.38 0.59 0.28
0.06 -0.31 -0.19 -0.34 0.12 0.19 0.07 0.3 -0.15 -0.14 0.21 0.03
-0.02 -0.4 -0.48 -0.46 -0.45 -0.26 -0.18 0.26 0.27 0.28 0.59 0.32
-0.14 -0.18 -0.1 -0.13 -0.12 -0.01 -0.19 -0.03 0.03 0.23 0.33 0.19
-0.04 -0.52 -0.24 -0.35 -0.01 -0.02 -0.07 0.35 -0.01 -0.17 0.71 -0.05
-0.08 -0.57 -0.38 -0.21 0.04 0.1 -0.06 0.02 -0.06 0.03 0.38 0.47
-0.33 -0.48 -0.4 -0.24 -0.24 -0.11 -0.03 0.26 0.33 0.33 0.4 0.13
-0.07 -0.47 -0.29 -0.35 -0.07 -0.11 -0.42 0.2 0.22 0.15 0.59 0.23
-0.01 -0.09 -0.01 -0.15 -0.1 0.03 0.06 0.14 0.06 -0.08 0.19 -0.08
-0.26 -0.25 -0.23 -0.32 0.01 0.31 0.26 0.29 0.01 -0.02 0.23 -0.26
-0.13 -0.53 0.21 -0.45 0.4 0.15 -0.63 -0.12 -0.98 -0.57 1.09 0.27
-0.93 -0.3 0.09 -0.01 -0.23 -0.06 0.34 0.44 -0.04 -0.18 0.31 0.11
0.15 -0.35 -0.22 -0.9 0.02 0.18 -0.08 0.33 -0.29 -0.13 0.85 -0.27
-0.13 -0.53 -0.4 -0.7 -0.45 -0.35 -0.07 0.41 0.27 0.14 0.81 0.24
-0.46 -0.5 -0.25 -0.29 -0.14 -0.02 0.02 0.39 0.1 0.09 0.52 0.16
-0.41 -0.63 -0.47 -0.51 -0.3 -0.05 0.2 0.49 0.22 0.15 0.54 0.17
-0.05 -0.46 -0.31 -0.35 -0.4 -0.26 -0.15 0.19 0.24 0.24 0.62 0.25
-0.29 -0.39 -0.23 -0.67 -0.46 -0.13 -0.15 0.34 0.04 0.02 0.71 0.53
-0.37 -0.8 0.23 -0.82 0.12 0.04 0.34 0.19 -1.21 -1.12 1.21 0.25
-0.45 -1.03 -1.02 -0.9 -0.56 -0.12 -0.13 0.44 0.38 0.49 0.89 0.4
-0.25 -0.4 -0.08 -0.29 0.04 0.03 0.08 0.26 -0.06 -0.02 0.41 0.09
-0.17 -0.32 -0.28 -0.23 -0.18 0.05 0.12 0.42 0.12 -0.09 0.38 -0.06
-0.08 -0.29 -0.1 -0.43 -0.14 -0.04 0.06 0.41 -0.11 -0.23 0.54 0.12
-0.03 -0.5 -0.35 -0.79 0.05 0.06 0.32 0.42 -0.12 -0.13 0.6 -0.1
-0.35 -0.26 -0.17 -0.32 -0.23 -0.04 0.12 0.46 0.12 0.0 0.41 -0.01
0.03 -0.19 -0.16 -0.25 -0.15 0.1 0.17 0.3 -0.01 -0.13 0.24 -0.08
0.05 -0.14 -0.09 -0.35 0.02 0.1 -0.08 0.23 -0.11 -0.17 0.38 0.02
-0.47 -0.74 -0.22 -0.25 0.25 0.27 0.25 0.34 -0.03 -0.15 0.31 0.02
-0.02 -0.25 -0.38 -0.38 -0.21 -0.0 -0.07 0.27 0.12 0.06 0.55 0.04
0.17 -0.46 -0.66 -0.75 -0.83 -0.59 -0.34 0.05 0.24 0.37 0.89 0.63
-0.31 -0.47 -0.36 -0.28 -0.07 -0.03 0.14 0.37 0.12 0.11 0.35 0.15
-0.27 -0.33 -0.23 -0.29 -0.23 -0.12 -0.11 0.17 0.25 0.21 0.46 0.21
-0.15 -0.5 -0.36 -0.63 0.2 0.34 0.21 0.43 -0.2 -0.09 0.47 -0.23
-0.26 -0.72 -0.29 -0.4 -0.04 0.0 0.1 0.36 0.01 -0.0 0.66 0.1
-0.1 -0.83 -1.35 -1.49 -1.04 -0.65 -0.84 0.33 0.56 0.8 1.06 0.6
-0.13 -0.14 -0.03 -0.12 -0.15 0.02 0.02 0.14 -0.07 -0.03 0.34 0.06
0.16 -0.14 -0.02 -0.19 -0.14 -0.09 -0.02 0.15 -0.14 -0.15 0.38 0.08
-0.63 -0.69 -0.53 -0.67 -0.14 -0.13 0.32 0.61 0.08 0.05 0.65 0.19
-0.27 -0.67 -0.38 -0.4 -0.21 -0.3 -0.0 0.43 0.32 0.2 0.6 0.11
-0.2 -0.47 -0.44 -0.42 -0.64 -0.41 -0.44 0.09 0.19 0.39 0.78 0.65
0.01 -0.22 -0.09 -0.14 0.07 0.01 -0.09 0.21 -0.05 0.05 0.24 -0.07
-0.34 -0.59 -0.64 -0.61 -0.32 -0.14 -0.21 0.14 0.29 0.43 0.73 0.43
-0.64 -0.98 -0.54 -0.86 -0.63 -0.49 -0.33 0.2 0.08 0.25 1.29 0.69
-0.25 -0.12 0.13 -0.19 0.01 0.02 0.03 0.27 -0.13 -0.12 0.24 0.02
-0.06 -0.54 -0.3 -0.72 -0.26 -0.26 0.37 0.44 -0.13 -0.11 0.72 0.17
-0.27 -0.31 -0.22 -0.32 -0.09 0.07 0.2 0.33 0.06 0.08 0.27 0.0
-0.8 -0.99 -0.51 -0.98 -0.64 -0.43 0.31 0.73 -0.02 0.1 1.15 0.2
-0.38 -0.58 -0.33 -0.29 0.16 0.08 0.01 0.48 0.2 -0.12 0.49 -0.15
-0.37 -0.37 -0.24 -0.37 -0.15 -0.03 0.08 0.48 0.1 0.09 0.44 0.02
-0.36 -0.41 -0.32 -0.19 -0.23 -0.07 0.1 0.31 0.23 0.19 0.34 0.13
-2.78 -1.6 -0.8 -1.38 -0.07 0.31 0.35 0.75 0.02 0.26 1.11 0.07
-0.2 -0.21 -0.15 -0.52 0.0 0.16 0.18 0.24 -0.18 -0.06 0.45 0.03
0.01 -0.16 -0.07 -0.32 0.04 -0.03 -0.01 0.33 -0.1 -0.09 0.35 -0.09
-0.63 -0.84 -0.19 -0.76 -0.22 -0.29 0.52 0.66 -0.16 -0.15 0.83 0.1
0.02 -0.18 -0.35 -0.62 -0.2 0.01 0.1 0.42 0.15 0.07 0.4 -0.14
-0.29 -0.47 -0.42 -0.4 -0.26 -0.05 -0.07 0.24 0.3 0.34 0.43 0.22
-0.17 -0.37 0.08 -0.32 -0.09 -0.03 -0.02 0.38 -0.18 -0.06 0.6 -0.15
-0.3 -0.62 -0.36 -0.63 -0.25 -0.19 -0.04 0.34 0.11 0.12 0.84 0.26
-0.86 -0.47 0.09 -0.1 0.02 0.06 0.15 0.47 -0.08 -0.11 0.43 -0.05
-0.2 -0.5 -0.3 -0.39 -0.5 -0.38 -0.95 -0.21 0.15 0.34 0.97 0.73
-0.31 -0.34 -0.07 -0.0 -0.02 0.02 0.1 0.21 0.09 -0.01 0.2 0.01
0.17 -0.65 -0.31 -0.27 -0.17 -0.31 -0.16 0.06 0.05 0.2 0.64 0.3
-0.27 -0.35 -0.12 -0.38 -0.04 0.07 0.17 0.52 -0.03 -0.08 0.47 -0.31
-0.34 -0.45 -0.53 -0.71 -0.3 0.03 0.05 0.39 0.28 0.25 0.56 0.15
-0.01 -0.22 -0.08 -0.13 0.06 0.15 0.06 0.27 -0.05 -0.18 0.32 -0.34
-0.3 -0.66 -0.58 -0.79 -0.43 -0.16 0.07 0.56 0.04 0.13 0.9 0.21
-0.22 -0.43 -0.26 -0.64 -0.29 -0.27 -0.04 0.3 -0.01 0.06 0.85 0.3
-1.34 -0.3 -0.11 -0.38 -0.63 -0.52 0.18 0.36 0.24 0.34 0.6 0.46
-0.5 -0.78 -0.36 -0.47 -0.35 -0.26 0.12 0.46 0.2 0.22 0.63 0.35
-0.64 -0.45 0.11 -0.05 0.02 0.01 0.11 0.4 0.04 -0.06 0.35 -0.17
-0.33 -0.27 -0.29 -0.34 -0.18 -0.14 -0.01 0.28 0.18 0.14 0.52 0.14
-1.55 -0.44 -0.02 -0.5 -0.57 -0.5 0.32 0.58 0.06 0.25 0.75 0.25
-0.13 -0.47 -0.1 -0.39 0.07 0.28 0.13 0.41 -0.2 -0.09 0.38 -0.2

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.