Heatmap: Cluster_58 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.13 -0.18 -0.17 -0.03 0.01 0.23 0.13 0.16 0.15 -0.01 -0.09 -0.14
-0.14 -0.08 -0.44 -0.14 0.24 0.44 0.05 0.02 0.23 0.09 -0.25 -0.28
-0.18 -0.2 -0.11 -0.08 0.03 0.14 0.05 0.2 0.1 0.12 0.06 -0.2
0.11 -0.04 -0.35 -0.12 0.05 0.18 0.17 0.27 0.11 -0.09 -0.2 -0.21
0.15 -0.12 -0.19 -0.07 0.1 0.12 0.09 0.11 0.16 -0.02 -0.18 -0.22
-0.03 0.02 -0.15 -0.04 -0.0 0.01 0.02 0.15 0.13 0.16 -0.07 -0.24
-0.06 -0.15 -0.16 0.03 -0.01 0.16 0.09 0.19 0.12 -0.04 -0.01 -0.23
-0.29 -0.05 -0.11 -0.04 0.06 0.31 0.0 -0.02 0.2 0.11 -0.1 -0.17
-0.16 -0.1 -0.22 0.05 -0.0 -0.01 0.24 0.22 0.18 -0.05 -0.08 -0.16
0.01 0.08 -0.2 -0.14 0.18 0.38 0.05 0.1 0.14 -0.09 -0.26 -0.42
-0.34 -0.06 -0.44 -0.35 0.16 0.67 0.22 -0.16 0.14 0.11 -0.25 -0.09
0.06 -0.01 -0.2 0.11 -0.05 0.15 0.07 0.02 0.24 0.07 -0.2 -0.37
-0.74 -0.12 -0.4 -0.28 0.19 0.53 -0.06 -0.09 0.28 0.42 -0.01 -0.22
-0.21 -0.2 -0.39 -0.23 0.08 0.34 0.05 0.29 0.27 0.12 -0.01 -0.36
-0.12 -0.08 -0.22 -0.2 0.01 0.31 0.15 0.15 0.11 0.06 0.01 -0.29
0.01 -0.03 -0.25 -0.08 0.13 0.28 0.23 0.25 -0.01 -0.01 -0.31 -0.4
-0.17 -0.1 -0.22 -0.0 0.08 0.24 -0.06 -0.01 0.14 0.22 -0.06 -0.16
-0.18 -0.06 -0.1 0.02 -0.0 0.22 0.15 0.16 0.19 -0.13 -0.15 -0.21
-0.1 -0.06 -0.14 0.06 -0.05 0.12 0.07 0.12 0.23 0.07 -0.12 -0.26
-0.16 -0.19 -0.25 -0.04 -0.01 0.2 0.06 0.28 0.21 0.15 -0.13 -0.25
-1.07 0.03 -0.28 -0.29 0.45 0.82 0.46 0.21 -0.0 -0.3 -0.59 -0.45
-0.21 -0.34 -0.22 -0.03 0.13 0.32 0.13 0.2 0.1 0.02 -0.08 -0.17
0.21 0.0 -0.09 -0.0 0.02 -0.01 -0.13 0.13 0.2 0.16 -0.18 -0.43
0.14 -0.0 -0.22 -0.06 -0.04 0.17 0.13 0.08 0.14 0.08 -0.16 -0.34
-0.1 -0.16 -0.07 -0.06 0.13 0.18 0.13 0.15 -0.0 -0.06 -0.09 -0.1
0.39 0.12 -0.12 -0.06 -0.11 0.1 0.11 0.04 0.01 -0.09 -0.2 -0.32
-0.14 0.0 -0.15 -0.04 -0.05 0.13 0.17 0.17 0.21 0.1 -0.18 -0.3
-0.04 -0.01 -0.19 -0.12 -0.05 0.09 0.08 0.13 0.21 0.15 -0.09 -0.23
-0.22 -0.21 -0.14 -0.24 0.08 0.41 0.28 0.19 0.11 0.03 0.04 -0.62
0.03 -0.1 -0.21 0.02 0.06 0.13 0.11 0.16 0.12 0.03 -0.17 -0.25
-0.01 -0.02 -0.18 -0.18 -0.02 0.32 0.12 0.11 0.08 0.07 -0.13 -0.27
-0.11 -0.12 -0.18 -0.02 0.0 0.13 0.07 0.17 0.27 0.02 -0.09 -0.23
-0.19 0.09 -0.17 -0.13 0.05 0.37 0.02 0.22 0.26 0.16 -0.32 -0.66
-0.1 -0.11 -0.11 0.01 -0.06 0.11 0.09 0.19 0.11 0.01 -0.05 -0.14
0.3 0.05 -0.21 -0.05 -0.18 0.04 0.08 0.14 0.13 0.1 -0.25 -0.27
0.05 -0.12 -0.25 -0.02 0.16 0.21 0.2 0.22 0.05 -0.15 -0.21 -0.28
-0.22 -0.26 -0.39 0.02 0.13 0.33 0.16 0.12 0.28 0.15 -0.24 -0.31
-0.47 -0.23 -0.86 -0.74 0.3 0.87 0.22 -0.01 0.23 0.28 -0.08 -0.47
-0.11 -0.13 -0.11 0.02 -0.13 0.11 0.11 0.14 0.19 0.17 -0.17 -0.19
-0.25 -0.08 -0.11 0.08 0.05 0.04 0.1 0.18 0.23 0.11 -0.16 -0.31
0.15 0.01 -0.33 -0.23 0.17 0.46 -0.14 -0.2 0.02 0.17 -0.11 -0.19
-0.3 -0.17 -0.47 -0.3 0.38 0.84 0.01 -0.33 -0.46 0.29 0.05 -0.2
-0.81 0.15 -0.46 -0.11 0.37 0.79 0.44 -0.05 0.2 -0.17 -0.96 -0.38
-0.29 -0.08 -0.09 0.13 -0.05 0.08 0.11 0.29 0.17 0.09 -0.16 -0.33
-0.18 -0.21 -0.1 0.14 0.08 0.2 0.17 0.1 0.21 -0.05 -0.16 -0.33
-0.22 -0.11 -0.15 -0.0 -0.04 0.16 0.07 0.25 0.15 0.1 -0.09 -0.19
-0.17 -0.2 -0.12 0.13 0.08 -0.01 0.06 0.17 0.31 0.12 -0.21 -0.28
-0.13 -0.07 -0.15 -0.06 0.02 0.24 0.1 0.17 0.15 -0.01 -0.12 -0.22
-0.05 0.05 -0.8 -0.51 0.45 1.04 -0.22 -2.19 -0.38 0.45 0.23 -0.13
0.12 0.16 -0.08 -0.06 0.02 0.16 -0.05 0.15 0.11 0.03 -0.3 -0.37
-0.23 -0.07 -0.36 -0.09 0.14 0.34 -0.08 -0.2 0.21 0.25 -0.03 -0.07
-0.13 -0.11 -0.23 -0.01 0.09 0.21 0.09 0.24 0.27 0.03 -0.2 -0.39
0.18 0.12 -0.42 -0.25 0.43 0.61 -0.24 -0.49 -0.04 -0.05 -0.17 -0.1
-0.17 -0.21 -0.19 0.07 0.06 0.29 0.14 0.13 0.2 0.03 -0.22 -0.26
-0.47 -0.21 -0.31 -0.14 0.14 0.41 0.19 0.18 0.31 0.17 -0.25 -0.36
0.0 0.02 -0.11 0.0 0.09 0.31 -0.07 0.12 0.06 0.03 -0.2 -0.34
-0.25 0.04 -0.2 -0.1 0.12 0.39 0.03 0.07 0.13 -0.03 -0.09 -0.25
-0.17 -0.08 -0.07 0.05 -0.04 0.13 0.13 0.14 0.17 -0.07 -0.16 -0.08
-0.12 -0.03 -0.19 -0.06 -0.02 0.17 0.07 0.15 0.19 0.03 -0.09 -0.17
0.1 0.01 -0.17 -0.09 0.23 0.37 -0.12 -0.06 0.02 0.01 -0.16 -0.25

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.