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Heatmap: Cluster_59 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.71 -0.09 -0.12 -0.04 -0.08 -0.04 0.03 0.24 0.4 0.23 -0.01 -0.09
-0.29 -0.21 -0.33 -0.12 -0.07 0.03 0.14 0.29 0.38 0.24 -0.09 -0.17
-2.27 -1.05 -1.01 -0.53 -0.73 -0.54 0.25 1.07 1.01 0.69 -0.29 0.12
-1.53 -0.62 -0.3 0.17 -0.16 -0.27 0.12 0.63 0.59 0.46 -0.02 -0.26
-1.22 -0.68 -0.47 -0.11 -0.1 -0.1 0.35 0.62 0.49 0.42 -0.0 -0.18
-0.38 -0.11 -0.3 -0.05 -0.14 -0.02 0.28 0.44 0.49 0.16 -0.35 -0.4
-0.37 -0.15 -0.2 -0.01 0.06 0.1 0.08 0.15 0.3 0.15 -0.08 -0.15
-0.42 0.01 -0.44 -0.53 -0.26 0.03 -0.17 0.3 0.5 0.48 0.16 -0.12
0.12 0.01 -0.17 0.03 -0.04 -0.18 0.1 0.26 0.37 0.12 -0.33 -0.52
-0.07 -0.09 -0.26 -0.02 -0.01 -0.04 0.09 0.22 0.29 0.14 -0.14 -0.22
-0.28 -0.15 -0.22 -0.08 -0.09 0.01 0.11 0.17 0.3 0.22 -0.03 -0.1
-2.18 -1.33 -0.84 -0.36 -0.16 0.19 0.04 0.6 0.92 0.79 0.26 -0.64
-0.73 -0.72 -0.72 -0.35 -0.26 0.1 -0.07 0.22 0.9 0.87 0.07 -0.63
-0.53 -0.14 -0.12 0.06 0.03 0.15 0.31 0.32 0.3 0.04 -0.3 -0.41
-1.24 -0.06 -0.28 -0.25 -0.11 0.2 0.27 0.36 0.51 0.27 -0.27 -0.11
0.08 -0.14 -0.41 -0.15 -0.06 0.04 0.11 0.23 0.21 0.14 -0.1 -0.06
-0.37 -0.13 -0.07 -0.07 -0.21 0.09 0.24 0.19 0.17 0.06 -0.09 0.05
-0.26 -0.26 -0.32 0.0 -0.07 0.02 0.02 0.28 0.4 0.26 -0.09 -0.18
-0.12 -0.15 -0.2 -0.08 -0.18 0.0 0.08 0.25 0.32 0.18 -0.05 -0.18
-0.25 -0.05 -0.22 -0.05 -0.12 0.0 0.26 0.25 0.19 0.11 -0.14 -0.09
-0.87 -0.05 -0.44 -0.31 -0.14 0.12 0.16 0.29 0.45 0.34 -0.15 0.11
-0.44 -0.2 -0.29 -0.05 -0.04 0.11 0.21 0.23 0.38 0.17 -0.26 -0.06
-0.51 -0.27 -0.3 -0.03 0.02 0.03 0.13 0.2 0.3 0.29 -0.09 0.02
-0.88 -0.6 -0.48 0.01 -0.17 0.08 -0.03 0.28 0.56 0.5 0.19 -0.14
-0.3 -0.24 -0.29 0.08 -0.04 0.08 0.19 0.21 0.26 0.1 -0.09 -0.09
-0.14 -0.19 -0.21 0.01 -0.13 -0.1 0.02 0.15 0.22 0.2 0.04 0.04
-0.25 -0.25 -0.3 -0.03 -0.2 0.04 0.24 0.22 0.35 0.21 -0.22 -0.02
0.1 -0.08 -0.15 0.01 -0.28 0.13 0.11 0.22 0.24 0.16 -0.34 -0.28
-0.12 0.06 -0.12 -0.03 -0.31 -0.08 0.12 0.33 0.44 0.2 -0.43 -0.34
-0.81 -0.54 -0.37 -0.03 -0.06 -0.08 0.19 0.41 0.49 0.35 -0.01 -0.09
-0.54 -0.12 -0.37 -0.14 -0.14 0.05 0.43 0.48 0.39 0.19 -0.33 -0.38
-0.83 -0.33 -0.33 -0.08 -0.11 0.14 0.45 0.43 0.45 0.11 -0.21 -0.23
-0.18 -0.14 -0.5 -0.53 -0.2 0.18 0.46 0.44 0.32 0.11 -0.21 -0.17
-0.33 -0.26 -0.37 -0.09 -0.03 0.1 0.07 0.19 0.37 0.18 0.05 -0.05
-0.4 -0.26 -0.23 -0.0 -0.12 0.01 0.22 0.27 0.28 0.12 -0.04 -0.04
-0.33 -0.22 -0.25 0.01 -0.05 0.06 0.17 0.2 0.24 0.19 -0.04 -0.12
-0.51 -0.2 -0.33 -0.05 -0.14 0.06 0.14 0.25 0.39 0.27 -0.19 0.05
-0.1 -0.14 -0.39 -0.09 -0.26 -0.07 -0.0 0.39 0.5 0.23 -0.27 -0.1
-0.91 -0.31 -0.4 -0.1 -0.04 0.15 0.09 0.25 0.68 0.53 -0.14 -0.56
-1.23 -0.7 -0.25 0.06 -0.04 -0.08 -0.22 0.34 0.65 0.58 0.09 -0.14
-1.56 -0.93 -0.87 -0.3 -0.16 -0.03 0.31 0.43 0.67 0.54 0.17 0.19
-1.06 0.04 -0.35 -0.22 -0.15 0.18 0.48 0.65 0.44 0.11 -0.61 -0.4
-0.37 -0.13 -0.01 -0.01 -0.08 0.06 0.03 0.08 0.3 0.16 -0.03 -0.1
-0.37 -0.07 -0.2 -0.01 -0.12 -0.11 0.01 0.21 0.3 0.23 -0.08 0.08
-0.52 -0.27 -0.45 -0.19 -0.2 0.28 0.48 0.71 0.18 0.02 -0.29 -0.36
-0.79 -0.22 -0.14 0.07 -0.18 -0.11 -0.03 0.22 0.46 0.25 0.02 0.1
-0.25 -0.17 -0.17 0.02 -0.02 0.01 -0.07 0.21 0.35 0.23 -0.09 -0.17
-0.4 -0.47 -0.55 -0.28 -0.16 -0.13 -0.27 0.24 0.62 0.64 0.3 -0.21
-0.96 -0.54 -0.75 -0.54 -0.77 -0.13 0.19 0.68 0.8 0.65 0.04 -0.1
-1.0 -0.81 -0.82 -0.12 -0.32 0.01 0.44 0.44 0.58 0.47 -0.02 0.08
-0.49 -0.3 -0.78 -0.5 -0.67 0.38 0.43 0.72 0.37 0.23 -0.13 -0.18
-0.66 -0.05 -0.31 -0.41 -0.14 0.25 0.28 0.59 0.38 0.01 -0.15 -0.28
0.07 0.05 -0.25 -0.07 -0.34 -0.28 0.16 0.28 0.32 0.15 -0.2 -0.08
-0.6 -0.12 -0.21 0.03 -0.05 0.04 0.28 0.25 0.24 0.17 -0.16 -0.1
-0.08 -0.22 -0.38 -0.09 -0.06 0.07 0.18 0.24 0.23 0.1 -0.04 -0.09
-0.92 -0.75 -0.55 0.08 -0.27 -0.3 0.15 0.4 0.61 0.45 0.05 0.2
-0.08 -0.17 -0.15 -0.01 -0.03 0.09 -0.05 0.17 0.26 0.2 -0.04 -0.29
-0.34 -0.22 -0.36 -0.14 -0.38 -0.1 0.12 0.34 0.41 0.31 0.1 -0.05
-0.22 -0.03 -0.35 -0.09 -0.22 -0.08 0.34 0.38 0.39 0.11 -0.25 -0.28
-0.35 -0.35 -0.2 0.16 -0.12 -0.05 0.14 0.19 0.27 0.17 -0.06 0.03
-0.25 -0.3 -0.26 -0.07 -0.06 0.1 0.08 0.32 0.4 0.2 -0.1 -0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.